114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4731 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4731  WD40 domain protein beta Propeller  100 
 
 		 509 aa  1040    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6060  WD40 domain protein beta Propeller  52.2 
 
 		 510 aa  520  1e-146  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2352  fibronectin, type III domain-containing protein  31.03 
 
 		 494 aa  275  2.0000000000000002e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4531  serine/threonine protein kinase  40 
 
 		 646 aa  67.8  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.114343  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3484  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  25.81 
 
 		 367 aa  65.5  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.774244  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0025  tolB protein  29.44 
 
 		 432 aa  64.3  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0382531  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0977  WD40 domain-containing protein  32.12 
 
 		 316 aa  63.9  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4532  serine/threonine protein kinase  32.81 
 
 		 642 aa  62.8  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000271647  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0136  WD40 domain protein beta Propeller  25.74 
 
 		 419 aa  61.2  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2178  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  30.39 
 
 		 292 aa  58.2  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2007  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  22.91 
 
 		 720 aa  58.2  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00565221 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0022  fibronectin type III domain-containing protein  36.19 
 
 		 730 aa  57.4  0.0000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0168573  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1098  amidohydrolase  24.14 
 
 		 1078 aa  57  0.0000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2975  TolB protein  27.09 
 
 		 443 aa  56.6  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.508751  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0013  amidohydrolase  26.48 
 
 		 1067 aa  56.2  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6416  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  24.56 
 
 		 362 aa  56.2  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1915  WD40 domain-containing protein  26.25 
 
 		 567 aa  56.2  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00146751  unclonable  0.0000119274 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03499  amidohydrolase  27.36 
 
 		 1111 aa  56.2  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0068  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  25.91 
 
 		 422 aa  56.2  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0067  tol-pal system beta propeller repeat protein TolB  25.91 
 
 		 422 aa  56.2  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.518188  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1154  WD40-like beta propeller protein  26.04 
 
 		 416 aa  55.8  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4129  WD40 domain-containing protein  24.9 
 
 		 572 aa  56.2  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000900599 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0925  WD40 domain protein beta Propeller  39.19 
 
 		 629 aa  55.5  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.775889  normal  0.417234 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3933  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  23.48 
 
 		 298 aa  54.7  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.560245 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0391  Pyrrolo-quinoline quinone  34.31 
 
 		 486 aa  54.7  0.000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00019845  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0924  WD40 domain protein beta Propeller  44.07 
 
 		 618 aa  54.7  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0358135  normal  0.463223 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4589  Periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  32.89 
 
 		 305 aa  54.7  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.519629  normal  0.731459 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3323  WD40 domain-containing protein  27.31 
 
 		 435 aa  53.9  0.000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000401957  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0859  WD40 domain-containing protein  27.56 
 
 		 442 aa  53.5  0.000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.318178  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5592  serine/threonine protein kinase  24.82 
 
 		 721 aa  53.1  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.294025 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3513  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  26.64 
 
 		 407 aa  53.1  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000266488  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2714  translocation protein TolB  28.63 
 
 		 441 aa  51.6  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0459045  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0203  WD40 domain-containing protein  28.17 
 
 		 427 aa  51.2  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000381605  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3729  WD40 domain protein beta Propeller  36.27 
 
 		 354 aa  50.8  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.135548  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1458  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  24.62 
 
 		 367 aa  51.2  0.00005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0940503  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0028  amidohydrolase  24.81 
 
 		 1062 aa  50.8  0.00005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.847177  hitchhiker  0.00656795 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0016  WD40 domain-containing protein  25 
 
 		 445 aa  50.8  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0011  amidohydrolase  25 
 
 		 1062 aa  50.8  0.00006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1910  TolB protein, putative  26.81 
 
 		 440 aa  50.4  0.00007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2397  WD40 domain-containing protein  21.6 
 
 		 352 aa  49.7  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000884296 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3582  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  27.05 
 
 		 407 aa  49.7  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3925  WD40 domain protein beta Propeller  40.51 
 
 		 647 aa  49.3  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.329588  normal  0.518781 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0114  peptidase S9, prolyl oligopeptidase  23.39 
 
 		 674 aa  49.3  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0975  translocation protein TolB  25.9 
 
 		 445 aa  49.3  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0670772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0011  amidohydrolase  22.3 
 
 		 1065 aa  48.9  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000114616  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0009  amidohydrolase  26.1 
 
 		 1062 aa  48.9  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1111  translocation protein TolB  27.8 
 
 		 446 aa  48.9  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00131159  normal  0.386204 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0747  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  26.58 
 
 		 444 aa  48.9  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000257607  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0015  amidohydrolase  26.15 
 
 		 1062 aa  48.9  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000711997 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0132  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  23.39 
 
 		 674 aa  49.3  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5512  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  24.73 
 
 		 634 aa  49.3  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.398053  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2573  amidohydrolase family protein  24.6 
 
 		 1071 aa  48.5  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.186395  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0017  amidohydrolase  24 
 
 		 1049 aa  48.5  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2206  translocation protein TolB  25.99 
 
 		 427 aa  48.1  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00281817 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0392  WD40-like beta propeller protein  32.1 
 
 		 354 aa  48.5  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0745  amidohydrolase  24.4 
 
 		 1005 aa  48.5  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0776  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  26.11 
 
 		 395 aa  48.5  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.605794  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2952  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.46 
 
 		 695 aa  48.1  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.232589 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0009  amidohydrolase  24.38 
 
 		 1060 aa  48.1  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0015  amidohydrolase  26.67 
 
 		 1062 aa  48.1  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0180602 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3540  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  27.71 
 
 		 429 aa  47.4  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000000000050948  normal  1 
 
 
 
NC_008577  Shewana3_0019  amidohydrolase  25 
 
 		 1062 aa  47.4  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000934915 
 
 
-
 
NC_002950  PG0724  prolyl oligopeptidase family protein  25.2 
 
 		 648 aa  47.4  0.0007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.866947 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0650  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like  24.6 
 
 		 648 aa  47  0.0007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.78996 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0011  amidohydrolase  25 
 
 		 1062 aa  47  0.0007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000193716 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1114  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.48 
 
 		 701 aa  47  0.0007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.131603 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3394  translocation protein TolB  24.91 
 
 		 441 aa  47  0.0007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0076717 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4391  serine/threonine protein kinase  25.45 
 
 		 915 aa  47  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0010  amidohydrolase  24.91 
 
 		 1066 aa  47  0.0008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0015  amidohydrolase  24.9 
 
 		 1069 aa  47  0.0008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000661642 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1346  translocation protein TolB  24.4 
 
 		 421 aa  47  0.0009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2041  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system  26.6 
 
 		 277 aa  47  0.0009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.365131  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0935  hypothetical protein  35.63 
 
 		 498 aa  46.2  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.421015  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1155  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  24.82 
 
 		 407 aa  46.6  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0755  TolB domain-containing protein  29.71 
 
 		 457 aa  46.2  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.242927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0140  WD40 domain protein beta Propeller  29.29 
 
 		 970 aa  46.6  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0012  WD40 domain-containing protein  33.33 
 
 		 620 aa  46.2  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3470  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  34.12 
 
 		 430 aa  47  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0247936  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0248  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  22.91 
 
 		 631 aa  46.2  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1627  hypothetical protein  31.94 
 
 		 615 aa  45.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1818  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  21.18 
 
 		 692 aa  45.4  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0201758  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1680  amidohydrolase  26.25 
 
 		 1062 aa  45.8  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.345185  normal  0.0835555 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0125  hypothetical protein  24 
 
 		 714 aa  45.8  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1561  WD40 domain-containing protein  22.9 
 
 		 375 aa  45.8  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4427  translocation protein TolB  24.41 
 
 		 441 aa  45.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.500534 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0121  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  22.58 
 
 		 674 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1039  WD40 domain-containing protein  24.86 
 
 		 379 aa  45.1  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0466  amidohydrolase  26.58 
 
 		 1113 aa  45.1  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.83396  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0011  amidohydrolase  24.61 
 
 		 1062 aa  45.1  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0957331 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3088  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  33.33 
 
 		 661 aa  45.1  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.350788 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0633  fibronectin, type III domain-containing protein  36.96 
 
 		 317 aa  45.1  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.314723 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0018  amidohydrolase  25 
 
 		 1081 aa  45.1  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000272228 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3158  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.31 
 
 		 668 aa  45.4  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1901  amidohydrolase  24.58 
 
 		 1084 aa  45.1  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1229  translocation protein TolB  29.73 
 
 		 424 aa  44.7  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.910184  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2230  hypothetical protein  24.84 
 
 		 1042 aa  44.7  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.752909  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2339  TolB-like protein  26.05 
 
 		 415 aa  44.7  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000041462  normal  0.0677463 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2365  translocation protein TolB  26.19 
 
 		 441 aa  44.7  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1775  amidohydrolase  25.49 
 
 		 1010 aa  44.7  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0563559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1552  fibronectin type III domain-containing protein  23.81 
 
 		 1131 aa  44.7  0.004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0138471  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>