More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3717 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_1613  acriflavin resistance protein  42.41 
 
 
1041 aa  819    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4494  acriflavin resistance protein  45.81 
 
 
1049 aa  848    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.45729 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1268  acriflavin resistance protein  42.13 
 
 
1058 aa  835    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0971  NolG efflux transporter  42.12 
 
 
1036 aa  817    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4164  acriflavin resistance protein  55.41 
 
 
1040 aa  1108    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0666932  normal  0.648782 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3708  acriflavin resistance protein  44.11 
 
 
1063 aa  857    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2809  cation efflux protein  60.49 
 
 
1050 aa  1272    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.354726  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0608  acriflavin resistance protein  45.21 
 
 
1059 aa  878    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0300308  normal  0.48397 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3717  acriflavin resistance protein  100 
 
 
1055 aa  2107    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.530646  normal  0.0294121 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1842  acriflavin resistance protein  41.01 
 
 
1058 aa  816    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.844387  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1675  acriflavin resistance protein  42.36 
 
 
1034 aa  835    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.640028  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2558  acriflavin resistance protein  41.79 
 
 
1048 aa  777    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.181919  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2664  acriflavin resistance protein  52.56 
 
 
1039 aa  1073    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1045  acriflavin resistance protein  42.15 
 
 
1046 aa  778    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.061236  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2817  acriflavin resistance protein  43.37 
 
 
1053 aa  845    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2024  acriflavin resistance protein  34.62 
 
 
1058 aa  580  1e-164  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000109059  normal  0.508224 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  33.33 
 
 
1050 aa  570  1e-161  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  33.53 
 
 
1034 aa  556  1e-157  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0965  AcrB/AcrD/AcrF family protein  33.17 
 
 
1024 aa  548  1e-154  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00708155  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0160  acriflavin resistance protein  33.4 
 
 
1033 aa  548  1e-154  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  31.06 
 
 
1470 aa  528  1e-148  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  31.78 
 
 
1038 aa  527  1e-148  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6213  acriflavin resistance protein  32.28 
 
 
1055 aa  526  1e-148  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717195  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0763  acriflavin resistance protein  32.07 
 
 
1039 aa  525  1e-147  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  31.19 
 
 
1496 aa  520  1e-146  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  32.42 
 
 
1011 aa  516  1.0000000000000001e-145  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0248  acriflavin resistance protein  32.85 
 
 
1054 aa  518  1.0000000000000001e-145  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0237  acriflavin resistance protein  32.85 
 
 
1054 aa  516  1.0000000000000001e-145  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  31.98 
 
 
1043 aa  519  1.0000000000000001e-145  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1043  nodulation protein precursor  31.78 
 
 
1069 aa  516  1e-144  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  31.29 
 
 
1044 aa  515  1e-144  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0226  acriflavin resistance protein  32.76 
 
 
1054 aa  511  1e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.38584  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2349  acriflavin resistance protein  30 
 
 
1070 aa  511  1e-143  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.253914  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6179  acriflavin resistance protein  31.83 
 
 
1065 aa  507  9.999999999999999e-143  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160015  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2982  acriflavin resistance protein  30.74 
 
 
1028 aa  509  9.999999999999999e-143  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.05054  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2480  acriflavin resistance protein  32.35 
 
 
1028 aa  506  9.999999999999999e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1667  acriflavin resistance protein  30.32 
 
 
1095 aa  505  1e-141  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0752  acriflavin resistance protein  31.1 
 
 
1071 aa  500  1e-140  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2392  acriflavin resistance protein  31.95 
 
 
1028 aa  499  1e-140  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.430925  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2518  acriflavin resistance protein  31.64 
 
 
1041 aa  497  1e-139  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00118511  normal  0.514323 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0815  acriflavin resistance protein  30.45 
 
 
1036 aa  494  9.999999999999999e-139  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3955  acriflavin resistance protein  30.74 
 
 
1075 aa  493  9.999999999999999e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.542775  normal  0.203686 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0354  acriflavin resistance protein  31.47 
 
 
1101 aa  493  9.999999999999999e-139  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00649102  unclonable  0.0000000737583 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0165  acriflavin resistance protein  30.16 
 
 
1032 aa  494  9.999999999999999e-139  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0540  AcrB/AcrD/AcrF family protein  29.68 
 
 
1049 aa  489  1e-136  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0238  acriflavin resistance protein  32.21 
 
 
1067 aa  488  1e-136  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1383  acriflavin resistance protein  31.7 
 
 
1022 aa  488  1e-136  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1937  acriflavin resistance protein  29.62 
 
 
1034 aa  479  1e-134  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.256217  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2601  acriflavin resistance protein  30.11 
 
 
1066 aa  480  1e-134  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2099  acriflavin resistance protein  30.5 
 
 
1043 aa  481  1e-134  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1682  acriflavin resistance protein  29.89 
 
 
1064 aa  482  1e-134  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.377778  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2950  acriflavin resistance protein  31.21 
 
 
1044 aa  478  1e-133  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2283  acriflavin resistance protein  29.54 
 
 
1051 aa  474  1e-132  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2131  AcrB/AcrD/AcrF family protein  30.34 
 
 
1024 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1816  acriflavin resistance protein  30.62 
 
 
1023 aa  470  1.0000000000000001e-131  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.742902  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4303  acriflavin resistance protein  31.14 
 
 
1177 aa  469  1.0000000000000001e-131  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.763591  normal  0.628382 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0979  acriflavin resistance protein  29.92 
 
 
1009 aa  468  9.999999999999999e-131  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.650548  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0960  acriflavin resistance protein  30.98 
 
 
1047 aa  467  9.999999999999999e-131  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2783  acriflavin resistance protein  31.12 
 
 
1045 aa  466  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0544081  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3964  acriflavin resistance protein  29.66 
 
 
1035 aa  464  1e-129  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000156628 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1183  acriflavin resistance protein  30.65 
 
 
1038 aa  460  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.317348  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1476  acriflavin resistance protein  31.29 
 
 
1028 aa  460  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.30053  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3902  acriflavin resistance protein  30.49 
 
 
1044 aa  461  9.999999999999999e-129  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.263563  normal  0.110043 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3179  acriflavin resistance protein  30.28 
 
 
1023 aa  456  1e-127  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000434633  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4170  acriflavin resistance protein  30.31 
 
 
1171 aa  457  1e-127  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00460578  normal  0.0104573 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2688  acriflavin resistance protein  30.84 
 
 
1044 aa  458  1e-127  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.405984  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1989  acriflavin resistance protein  28.75 
 
 
1031 aa  457  1e-127  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4104  acriflavin resistance protein  29.72 
 
 
1031 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3296  acriflavin resistance protein  29.74 
 
 
1006 aa  456  1.0000000000000001e-126  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0229109  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0559  acriflavin resistance protein  28.91 
 
 
1062 aa  452  1e-125  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0030  acriflavin resistance protein  29.63 
 
 
1027 aa  449  1.0000000000000001e-124  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0439457  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1922  acriflavin resistance protein  29.81 
 
 
1022 aa  449  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.209297  normal  0.294162 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0894  acriflavin resistance protein  29.89 
 
 
1060 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0211  acriflavin resistance protein  29.54 
 
 
1026 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.824478 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1579  acriflavin resistance protein  29.49 
 
 
1046 aa  448  1.0000000000000001e-124  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1968  acriflavin resistance protein  30.76 
 
 
1025 aa  447  1.0000000000000001e-124  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.904496 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3888  acriflavin resistance protein  30.05 
 
 
1048 aa  446  1.0000000000000001e-124  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.471381  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0175  acriflavin resistance protein  30.03 
 
 
1046 aa  446  1e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.481543 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1907  acriflavin resistance protein  30.68 
 
 
1051 aa  446  1e-123  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0495674  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0806  acriflavin resistance protein  30.82 
 
 
1042 aa  446  1e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.326964 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0778  acriflavin resistance protein  29.88 
 
 
1040 aa  446  1e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.21707  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3031  acriflavin resistance protein  29.35 
 
 
1042 aa  440  9.999999999999999e-123  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.050113  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2815  acriflavin resistance protein  29.56 
 
 
1051 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.874616  normal  0.995091 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0902  acriflavin resistance protein  30.32 
 
 
1029 aa  442  9.999999999999999e-123  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.621432  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01735  RND family efflux transporter  28.86 
 
 
1035 aa  442  9.999999999999999e-123  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1942  acriflavin resistance protein  29.75 
 
 
1040 aa  440  9.999999999999999e-123  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.211904  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2083  RND superfamily multidrug efflux system protein  29 
 
 
1036 aa  438  1e-121  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.334854  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1892  acriflavin resistance protein  29.34 
 
 
1031 aa  437  1e-121  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2094  acriflavin resistance protein  30.71 
 
 
1037 aa  438  1e-121  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01445  hypothetical protein  28.94 
 
 
1037 aa  438  1e-121  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2180  acriflavin resistance protein  28.78 
 
 
1030 aa  437  1e-121  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000146343  normal  0.137669 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3610  acriflavin resistance protein  29.71 
 
 
1040 aa  437  1e-121  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.35819  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1146  acriflavine resistance protein  29.06 
 
 
1026 aa  437  1e-121  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.199335  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3207  acriflavin resistance protein  29.81 
 
 
1037 aa  437  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0543905  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004021  RND multidrug efflux transporter  29.55 
 
 
1037 aa  439  1e-121  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0276647  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1732  acriflavin resistance protein  30.54 
 
 
1027 aa  433  1e-120  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3023  acriflavin resistance protein  30.31 
 
 
1027 aa  434  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.904124 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1006  acriflavin resistance protein  29.47 
 
 
1058 aa  433  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00411218  normal  0.136084 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2399  acriflavin resistance protein  27.71 
 
 
1032 aa  434  1e-120  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.774253  normal  0.772443 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2556  acriflavin resistance protein  29.8 
 
 
1051 aa  436  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>