171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3046 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3046  Aldose 1-epimerase  100 
 
 		 345 aa  707    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.813423  normal  0.148483 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5039  Aldose 1-epimerase  39.24 
 
 		 312 aa  228  1e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0656  aldose-1-epimerase  31.31 
 
 		 314 aa  143  4e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.629793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0225  galactose mutarotase  25.7 
 
 		 314 aa  109  8.000000000000001e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00000500571  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1585  Aldose 1-epimerase  30.89 
 
 		 305 aa  107  3e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.92898  normal  0.309256 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27460  galactose mutarotase-like enzyme  28.52 
 
 		 334 aa  103  3e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0426  aldose 1-epimerase  28.06 
 
 		 308 aa  102  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1930  Aldose 1-epimerase  26.97 
 
 		 316 aa  102  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.263285  normal  0.479856 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2454  aldose 1-epimerase  28.62 
 
 		 307 aa  101  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2973  Aldose 1-epimerase  29.04 
 
 		 303 aa  99.8  7e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000377273  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0726  Aldose 1-epimerase  27.86 
 
 		 328 aa  99  1e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0044  Aldose 1-epimerase  26.57 
 
 		 311 aa  98.6  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8681  Aldose 1-epimerase  29.02 
 
 		 303 aa  96.7  6e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.626175  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0702  Aldose 1-epimerase  27.95 
 
 		 318 aa  94.7  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1225  Aldose 1-epimerase  27.04 
 
 		 302 aa  95.1  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12920  galactose mutarotase-like enzyme  27.33 
 
 		 321 aa  94  3e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0901551  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1278  Aldose 1-epimerase  26.16 
 
 		 307 aa  94.4  3e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.265427  normal  0.286232 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2997  Aldose 1-epimerase  27.62 
 
 		 302 aa  94  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0040024 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2489  Aldose 1-epimerase  23.91 
 
 		 308 aa  93.6  5e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0514  aldose 1-epimerase  28.73 
 
 		 327 aa  93.6  5e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.165305  decreased coverage  0.000622322 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3398  aldose 1-epimerase  28.52 
 
 		 294 aa  93.2  7e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.226465  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0226  galactose mutarotase  26.38 
 
 		 318 aa  91.7  2e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00706113  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1836  Aldose 1-epimerase  26.85 
 
 		 315 aa  91.3  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1019  Aldose 1-epimerase  26.74 
 
 		 299 aa  91.3  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.584137  hitchhiker  0.000443551 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0523  Aldose 1-epimerase  29.5 
 
 		 290 aa  89  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33650  galactose mutarotase-like enzyme  25.46 
 
 		 318 aa  87.8  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0866  Aldose 1-epimerase  26.61 
 
 		 306 aa  87.8  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.104082  normal  0.0514904 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1267  Aldose 1-epimerase  27.74 
 
 		 301 aa  88.2  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.560353  hitchhiker  0.00115827 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0559  Aldose 1-epimerase  27.24 
 
 		 262 aa  87.8  3e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.480763  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1674  aldose 1-epimerase  31.36 
 
 		 325 aa  87.4  3e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.416242  hitchhiker  0.00123529 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1083  putative aldose-1-epimerase  28.83 
 
 		 305 aa  87  4e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.145719  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1235  Aldose 1-epimerase  26.79 
 
 		 319 aa  86.7  6e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000417318 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1897  aldose 1-epimerase  27.34 
 
 		 290 aa  85.1  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2241  Aldose 1-epimerase  25.55 
 
 		 291 aa  85.1  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.61015 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4402  aldose-1-epimerase family protein  26.92 
 
 		 300 aa  85.5  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0696  Aldose 1-epimerase  27.27 
 
 		 306 aa  84  0.000000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00129327 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2182  Aldose 1-epimerase  27.64 
 
 		 299 aa  83.2  0.000000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000157648 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3760  Aldose 1-epimerase  25.22 
 
 		 290 aa  83.2  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00879497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4277  aldose 1-epimerase  27.5 
 
 		 289 aa  82  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.436668 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1163  aldose 1-epimerase  26.01 
 
 		 323 aa  82.4  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.887027  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3707  Aldose 1-epimerase  24.93 
 
 		 290 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4435  Aldose 1-epimerase  27.87 
 
 		 303 aa  81.3  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.340797 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1522  Aldose 1-epimerase  26.75 
 
 		 293 aa  81.3  0.00000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2023  aldose 1-epimerase  26.54 
 
 		 298 aa  80.5  0.00000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5326  aldose-1-epimerase family protein  26.54 
 
 		 300 aa  80.5  0.00000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.6155 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03764  predicted aldose-1-epimerase  26.15 
 
 		 308 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4107  Aldose 1-epimerase  26.15 
 
 		 308 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4408  aldose-1-epimerase family protein  27.06 
 
 		 280 aa  79.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03713  hypothetical protein  26.15 
 
 		 308 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2432  aldose 1-epimerase  26.32 
 
 		 301 aa  79  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0573284  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4230  aldose-1-epimerase family protein  26.67 
 
 		 280 aa  78.2  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4343  aldose-1-epimerase family protein  27 
 
 		 295 aa  77.8  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4252  aldose-1-epimerase family protein  27 
 
 		 295 aa  77.8  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4297  aldose-1-epimerase family protein  27 
 
 		 295 aa  77.8  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2057  aldose 1-epimerase  24.16 
 
 		 305 aa  76.6  0.0000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.107394  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1127  aldose 1-epimerase  25.58 
 
 		 269 aa  76.3  0.0000000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0176464  normal  0.584187 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3303  putative aldose-1-epimerase  27.11 
 
 		 297 aa  76.3  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.575493 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3963  aldose 1-epimerase  25.15 
 
 		 286 aa  75.1  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.87118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4264  aldose-1-epimerase family protein  25.28 
 
 		 299 aa  73.9  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0628  aldose 1-epimerase  23.7 
 
 		 282 aa  70.1  0.00000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.48408  normal  0.247972 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0324  Aldose 1-epimerase  24.46 
 
 		 299 aa  69.3  0.00000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.296431 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0149  Aldose 1-epimerase  27.61 
 
 		 336 aa  67  0.0000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0125238 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0854  Aldose 1-epimerase  25.9 
 
 		 300 aa  66.2  0.0000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0393175  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1210  aldose 1-epimerase  28.01 
 
 		 347 aa  65.9  0.000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00282737  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1458  aldose 1-epimerase  24.9 
 
 		 263 aa  65.1  0.000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0761  aldose 1-epimerase  26.5 
 
 		 299 aa  63.5  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05040  galactose mutarotase-like enzyme  25.76 
 
 		 323 aa  62  0.00000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.556037  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0469  aldose 1-epimerase  24.07 
 
 		 300 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.799033  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0480  aldose 1-epimerase  24.07 
 
 		 300 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6249  Aldose 1-epimerase  25.8 
 
 		 296 aa  61.6  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.783578 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2029  aldose 1-epimerase  23.84 
 
 		 311 aa  61.2  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.99913  normal  0.429541 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0456  aldose 1-epimerase  24.07 
 
 		 300 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1083  hypothetical protein  23.28 
 
 		 323 aa  60.8  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000316766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1761  Aldose 1-epimerase  31.5 
 
 		 286 aa  60.5  0.00000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5648  Aldose 1-epimerase  25.09 
 
 		 327 aa  59.7  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2372  aldose 1-epimerase  24.59 
 
 		 309 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0156  hypothetical protein  22.85 
 
 		 284 aa  59.7  0.00000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.42374  normal  0.0793834 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0630  aldose 1-epimerase  31.68 
 
 		 356 aa  59.3  0.00000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0655  aldose 1-epimerase  31.68 
 
 		 356 aa  59.3  0.00000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4338  hypothetical protein  22.86 
 
 		 310 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1886  aldose 1-epimerase  23.01 
 
 		 382 aa  58.5  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.369459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2702  aldose 1-epimerase  22.39 
 
 		 301 aa  57.8  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.932168 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0739  Aldose 1-epimerase  24.6 
 
 		 276 aa  57  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.220443  normal  0.0861855 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0950  Aldose 1-epimerase  22.9 
 
 		 311 aa  57  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0322782 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1015  Aldose 1-epimerase  22.43 
 
 		 311 aa  56.2  0.0000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2660  aldose 1-epimerase  25.17 
 
 		 306 aa  56.2  0.0000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0844306  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0383  Aldose 1-epimerase  23.13 
 
 		 302 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1269  Aldose 1-epimerase  25.42 
 
 		 414 aa  55.5  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0872441  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4461  aldose 1-epimerase  25.32 
 
 		 303 aa  54.7  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.259661  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00230  aldose 1-epimerase  24.4 
 
 		 340 aa  54.7  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1989  aldose 1-epimerase  24.77 
 
 		 304 aa  55.1  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0186  hypothetical protein  20.68 
 
 		 282 aa  54.3  0.000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0142  aldose 1-epimerase  25.4 
 
 		 353 aa  54.7  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0625  aldose 1-epimerase  25.4 
 
 		 353 aa  54.7  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.417593  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0535  aldose 1-epimerase  27.56 
 
 		 341 aa  54.7  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0136204 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0900  aldose 1-epimerase  24 
 
 		 305 aa  53.9  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0870744 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2838  Aldose 1-epimerase  25.68 
 
 		 323 aa  53.9  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0834033 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0526  aldose 1-epimerase  25.32 
 
 		 353 aa  53.5  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1637  Aldose 1-epimerase  25.72 
 
 		 312 aa  53.5  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12181  normal  0.595367 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0550  aldose 1-epimerase  25.32 
 
 		 353 aa  53.5  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0177374  normal  0.655719 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>