More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1811 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1811  ABC transporter related protein  100 
 
 		 251 aa  505  9.999999999999999e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.52551 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2985  ABC-type organic solvent transporter, ATP-binding protein  71.14 
 
 		 257 aa  368  1e-101  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.444132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0796  ABC transporter related  71.43 
 
 		 255 aa  365  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0189  ABC transporter related  71.14 
 
 		 254 aa  362  2e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0746681  normal  0.958869 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5282  ABC transporter related  64.08 
 
 		 248 aa  320  1.9999999999999998e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.17632 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3315  ABC transporter related  52.85 
 
 		 258 aa  273  2.0000000000000002e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000690504 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4315  ABC transporter related  54.39 
 
 		 259 aa  261  6.999999999999999e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.696843  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0706  ABC transporter related protein  47.3 
 
 		 258 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.613257  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0677  ABC transporter related  45.12 
 
 		 255 aa  218  1e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2380  ABC transporter  43.5 
 
 		 257 aa  204  1e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.83089  normal  0.615068 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1066  ABC transporter related  44.17 
 
 		 248 aa  204  1e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.161782  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2596  ABC transporter related protein  43.15 
 
 		 260 aa  203  3e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.256414  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0407  ABC transporter component  43.93 
 
 		 257 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0015  ABC transporter related  43.46 
 
 		 252 aa  200  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0891779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1977  ABC transporter related  42.86 
 
 		 248 aa  197  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.28613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1887  ABC transporter related protein  42.8 
 
 		 296 aa  197  1.0000000000000001e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0561  ABC transporter related  44.35 
 
 		 248 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000384868  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2458  ABC transporter, ATPase subunit  43.33 
 
 		 248 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.227376  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2083  ABC transporter related  42.45 
 
 		 248 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2343  ABC transporter related protein  43.88 
 
 		 252 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1862  ABC transporter, ATPase subunit  42.86 
 
 		 248 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.634035  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1998  ABC transporter-related protein  42.45 
 
 		 248 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1121  ABC transporter related  43.33 
 
 		 248 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.418609  normal  0.298779 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0379  ABC transporter related  41.53 
 
 		 262 aa  196  2.0000000000000003e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3182  ABC transporter related  42.62 
 
 		 250 aa  194  1e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0816  ABC transporter, ATP-binding protein  42.19 
 
 		 248 aa  194  2e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1328  ABC transporter related  44.54 
 
 		 256 aa  194  2e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0917234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1040  ABC transporter related  42.68 
 
 		 248 aa  192  3e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1851  ABC transporter related  41.63 
 
 		 263 aa  192  4e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0787  ABC transporter-related protein  42.19 
 
 		 248 aa  192  6e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1737  ABC transporter related  46.64 
 
 		 245 aa  191  8e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0169856  normal  0.620791 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1781  ABC transporter related  42.8 
 
 		 252 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.122728 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3704  ABC transporter related  40.25 
 
 		 265 aa  189  4e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.307132  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2869  ABC transporter related  42.28 
 
 		 261 aa  187  1e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3442  ABC transporter related protein  40.51 
 
 		 246 aa  185  5e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.123967  normal  0.0228809 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3484  ABC transporter related  39.51 
 
 		 257 aa  182  4.0000000000000006e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1621  ABC transporter related protein  41.67 
 
 		 363 aa  182  6e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.966929  normal  0.960092 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0328  ABC transporter related  43.28 
 
 		 249 aa  181  1e-44  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.673492  normal  0.624259 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5159  ABC transporter related protein  42.13 
 
 		 248 aa  180  2e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.364497 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0700  ABC transporter related  40.08 
 
 		 333 aa  180  2.9999999999999997e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1578  ABC transporter related  40.66 
 
 		 260 aa  179  4.999999999999999e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.292703 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07670  ABC transporter, ATP-binding protein  37.08 
 
 		 254 aa  179  4.999999999999999e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0821592  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1611  ABC transporter related  40.98 
 
 		 295 aa  176  2e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2513  ABC transporter related  39.67 
 
 		 259 aa  176  3e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0824022  normal  0.0374707 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1557  ABC transporter related protein  39.18 
 
 		 273 aa  176  3e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2343  ABC transporter related  38.87 
 
 		 275 aa  176  4e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464868 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3963  ABC transporter related  40.47 
 
 		 248 aa  175  5e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.764757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0100  ABC transporter related  38.62 
 
 		 278 aa  175  5e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.106893  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1127  ABC transporter related protein  38.98 
 
 		 421 aa  175  5e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1743  ABC transporter-related protein  42.37 
 
 		 271 aa  175  7e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4349  ABC transporter related protein  39.67 
 
 		 359 aa  174  8e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1227  ABC transporter, ATP-binding protein  42.37 
 
 		 272 aa  174  9e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03690  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents, ATPase component  40.34 
 
 		 378 aa  174  9e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.839011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2449  ABC transporter related  38.43 
 
 		 268 aa  174  9e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0855  ABC transporter related protein  39.66 
 
 		 273 aa  174  9.999999999999999e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.795905 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0071  ABC transporter-related protein  39.75 
 
 		 279 aa  174  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1498  ABC transporter related  37.97 
 
 		 256 aa  174  1.9999999999999998e-42  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0160  ABC transporter related  38.91 
 
 		 272 aa  173  2.9999999999999996e-42  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.609677 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2292  ABC transporter related  41.1 
 
 		 279 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0169  ABC transporter related  36.99 
 
 		 292 aa  172  5e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0997  ABC transporter-like protein protein  39.76 
 
 		 260 aa  172  5e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0883738  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0314  ABC transporter ATP-binding protein  36.59 
 
 		 298 aa  172  5.999999999999999e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6635  ABC transporter related  40 
 
 		 363 aa  172  5.999999999999999e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0176  ABC transporter related  36.99 
 
 		 292 aa  171  6.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0888  ABC transporter related  38.91 
 
 		 273 aa  171  7.999999999999999e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00820574  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2065  ABC transporter related protein  39.92 
 
 		 273 aa  171  7.999999999999999e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1321  ABC transporter related protein  41.01 
 
 		 259 aa  171  9e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.627863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1395  ABC transporter related  39.06 
 
 		 337 aa  171  1e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2743  ABC transporter related  39.02 
 
 		 272 aa  171  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.132977 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0996  ABC transporter related  39.08 
 
 		 361 aa  170  2e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4114  ABC transporter related  36.89 
 
 		 268 aa  170  2e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0512527  normal  0.918883 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0968  ABC transporter related  38.66 
 
 		 361 aa  170  2e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.51873  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0644  ABC transporter, ATP-binding protein  37.97 
 
 		 318 aa  170  2e-41  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0986  ABC transporter related  38.66 
 
 		 361 aa  170  2e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.401008 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0961  ABC transporter, ATP-binding protein  36.51 
 
 		 352 aa  169  3e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2810  ABC transporter, ATPase subunit  39.27 
 
 		 257 aa  169  3e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.66283  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1488  ABC transporter related  39.27 
 
 		 257 aa  169  3e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.437472 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2316  ABC transporter related  39.42 
 
 		 258 aa  169  3e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.184477  normal  0.382014 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1254  ABC transporter-related protein  39.08 
 
 		 357 aa  169  4e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0999833 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0902  ABC transporter, ATP-binding protein  36.51 
 
 		 352 aa  169  5e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.693076  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0480  ABC transporter related  40.33 
 
 		 292 aa  169  5e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.104959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3036  ABC transporter related  37.7 
 
 		 261 aa  169  5e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.845975 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1074  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents ATPase component-like protein  37.92 
 
 		 333 aa  169  5e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2195  ABC transporter, ATP-binding protein  36.71 
 
 		 248 aa  168  6e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00836348 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5099  ABC transporter related  38.66 
 
 		 362 aa  168  6e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0528619 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3691  ABC transporter related  38.24 
 
 		 245 aa  169  6e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.896312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2164  ABC transporter related  37.55 
 
 		 261 aa  168  7e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22670  putative ATP-binding component of ABC transporter  38.43 
 
 		 264 aa  168  7e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420242 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10668  ribonucleotide transport ATP-binding protein ABC transporter mkl  39.08 
 
 		 359 aa  168  8e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.139977  normal  0.579373 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2886  ABC transporter, ATPase subunit  37.71 
 
 		 275 aa  168  9e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.21978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0450  ABC transporter related  37.13 
 
 		 254 aa  168  9e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1586  ABC transporter related  35.37 
 
 		 355 aa  167  1e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0448  ABC-type transport system, ATPase component  38.64 
 
 		 266 aa  167  1e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000392883  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2367  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  38.56 
 
 		 359 aa  167  1e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0612638  normal  0.765055 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1427  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  36.63 
 
 		 254 aa  167  1e-40  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.798316  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2806  ABC transporter related  37.66 
 
 		 257 aa  167  1e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2413  ABC transporter related  36.89 
 
 		 266 aa  167  1e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.104352 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0479  ATPase  38.14 
 
 		 244 aa  167  2e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.119209  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3808  ABC transporter related  40.73 
 
 		 262 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.140241  normal  0.926814 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1719  ABC transporter related  38.55 
 
 		 257 aa  167  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0483086  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>