More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1376 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1376  HRDC domain protein  100 
 
 		 829 aa  1707    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4935  5'-3' DNA helicase  41.85 
 
 		 734 aa  457  1e-127  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0999  AAA ATPase  34.18 
 
 		 759 aa  450  1e-125  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.428029  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0207  AAA ATPase  41.36 
 
 		 764 aa  430  1e-119  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.195447 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0257  AAA ATPase  40.85 
 
 		 747 aa  421  1e-116  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.166241  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3653  helicase-related protein  41.58 
 
 		 738 aa  419  1e-116  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2047  helicase, putative  40.1 
 
 		 761 aa  412  1e-113  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000160392 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0435  AAA ATPase  42.27 
 
 		 639 aa  410  1e-113  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0062  TPR domain-containing protein  41.18 
 
 		 680 aa  370  1e-101  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0527  AAA ATPase  44.06 
 
 		 517 aa  372  1e-101  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.55626  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3066  AAA ATPase  38.74 
 
 		 438 aa  297  7e-79  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1164  hypothetical protein  40.88 
 
 		 445 aa  286  1.0000000000000001e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5152  AAA ATPase  38.29 
 
 		 779 aa  283  7.000000000000001e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.430692 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0861  ATPas  39.05 
 
 		 782 aa  282  2e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0878  AAA ATPase  39.05 
 
 		 782 aa  282  2e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0867  AAA ATPase  39.05 
 
 		 782 aa  281  4e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1180  AAA ATPase  36.53 
 
 		 782 aa  272  2e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.247835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2564  hypothetical protein  37.29 
 
 		 431 aa  267  7e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.507022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2072  TPR domain-containing protein  36.91 
 
 		 493 aa  245  3e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.402208  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0815  ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) alpha subunit - helicase superfamily I member-like protein  31.36 
 
 		 614 aa  183  1e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1560  AAA ATPase  32.3 
 
 		 659 aa  175  2.9999999999999996e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000170714  unclonable  0.00000000068929 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1611  DNA helicase: AAA ATPase  31.33 
 
 		 653 aa  175  3.9999999999999995e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.77045 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1080  hypothetical protein  31.43 
 
 		 485 aa  174  5.999999999999999e-42  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02480  mitochondrial DNA repair and recombination protein PIF1 precursor, putative  30.77 
 
 		 691 aa  174  6.999999999999999e-42  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.255709  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1416  hypothetical protein  33.66 
 
 		 442 aa  173  1e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1843  ATPase  31.15 
 
 		 646 aa  173  1e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.581865 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1901  ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) subunit alpha  31.74 
 
 		 472 aa  170  1e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1075  hypothetical protein  31.99 
 
 		 439 aa  168  5e-40  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000929546  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0522  conserved hypothetical protein, possible helicase  33.24 
 
 		 420 aa  167  5.9999999999999996e-40  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0941  TPR domain-containing protein  30.29 
 
 		 445 aa  165  3e-39  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.994783  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0573  TPR domain-containing protein  31.5 
 
 		 435 aa  164  9e-39  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.526626  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1023  hypothetical protein  32.5 
 
 		 447 aa  162  3e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.218006  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0969  hypothetical protein  32.5 
 
 		 447 aa  162  3e-38  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1779  ATPase  30.77 
 
 		 422 aa  161  5e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1856  glycosysltransferase  30.23 
 
 		 438 aa  160  8e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02830  DNA repair and recombination protein pif1, mitochondrial precursor, putative  27.73 
 
 		 669 aa  153  1e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.577209  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06895  helicase (Eurofung)  30.59 
 
 		 661 aa  135  3.9999999999999996e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.264873 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15917  predicted protein  26.89 
 
 		 628 aa  134  6e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0744  hypothetical protein  41.88 
 
 		 130 aa  99  3e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.762104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1151  ATP-dependent DNA helicase RecQ  26.37 
 
 		 714 aa  77  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2808  ATP-dependent DNA helicase RecQ  26.04 
 
 		 705 aa  73.6  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0446  RecD/TraA family helicase  25.97 
 
 		 735 aa  73.6  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000295111  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2403  helicase, RecD/TraA family  25.97 
 
 		 747 aa  72.4  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.934653 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3839  helicase, RecD/TraA family  25.82 
 
 		 750 aa  72  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0839164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4296  ATP-dependent DNA helicase RecQ  27.67 
 
 		 715 aa  70.5  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0839194  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1757  helicase, RecD/TraA family  26.17 
 
 		 746 aa  67.4  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0269  RecD/TraA family helicase  25.17 
 
 		 742 aa  66.2  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.130609 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0011  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  27.62 
 
 		 793 aa  66.6  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00580778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1864  RecD/TraA family helicase  24.94 
 
 		 728 aa  66.6  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2928  ATP-dependent DNA helicase RecQ  24.88 
 
 		 728 aa  65.9  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000212564  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1753  helicase RecD/TraA  26.74 
 
 		 736 aa  65.9  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.473009  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1686  putative ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) alpha subunit  26.43 
 
 		 907 aa  66.2  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.169345  normal  0.175397 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2446  ATP-dependent DNA helicase RecQ  28.14 
 
 		 739 aa  66.2  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.772322  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3541  RecD/TraA family helicase  27.99 
 
 		 731 aa  65.9  0.000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3273  RecD/TraA family helicase  27.34 
 
 		 731 aa  65.5  0.000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2618  ATP-dependent DNA helicase RecQ  26.18 
 
 		 705 aa  65.1  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00666767  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1261  ATP-dependent DNA helicase RecQ  23.28 
 
 		 707 aa  65.1  0.000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.850947  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4487  Exodeoxyribonuclease V  25.11 
 
 		 738 aa  64.7  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00100877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0993  helicase, RecD/TraA family  26.12 
 
 		 728 aa  64.3  0.000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0989  helicase, RecD/TraA family  25.41 
 
 		 738 aa  64.3  0.000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0847  helicase RecD/TraA  25.12 
 
 		 738 aa  64.7  0.000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05278  conserved hypothetical protein  22.94 
 
 		 1579 aa  63.5  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2658  Exodeoxyribonuclease V  24.12 
 
 		 659 aa  63.9  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0285632  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6026  helicase, RecD/TraA family  26.93 
 
 		 742 aa  63.9  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.143293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0213  helicase, RecD/TraA family  24.36 
 
 		 740 aa  63.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.629499  normal  0.0445082 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2842  ATP-dependent DNA helicase RecQ  25.65 
 
 		 705 aa  63.2  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0115008  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2627  ATP-dependent DNA helicase RecQ  25.65 
 
 		 705 aa  63.2  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2865  ATP-dependent DNA helicase RecQ  25.65 
 
 		 705 aa  63.2  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000591362  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2818  ATP-dependent DNA helicase RecQ  25.65 
 
 		 705 aa  63.2  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.01256  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2466  ATP-dependent DNA helicase RecQ  26.29 
 
 		 705 aa  63.5  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.425923  normal  0.631246 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0230  RecD/TraA family helicase  24.44 
 
 		 741 aa  63.2  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0523048 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2825  ATP-dependent DNA helicase RecQ  25.65 
 
 		 705 aa  62.8  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000139283 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2543  ATP-dependent DNA helicase Q  25.65 
 
 		 705 aa  62.4  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2826  ATP-dependent DNA helicase RecQ  26.29 
 
 		 705 aa  62.8  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0035  ATP-dependent DNA helicase RecQ  26.47 
 
 		 707 aa  62.8  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.142382  normal  0.0608085 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1425  helicase, RecD/TraA family  26.54 
 
 		 737 aa  62  0.00000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2820  helicase, RecD/TraA family  25.61 
 
 		 754 aa  61.6  0.00000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00387787  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4247  RecD/TraA family helicase  23.24 
 
 		 736 aa  61.6  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.320311 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0995  helicase RecD/TraA  25.42 
 
 		 727 aa  61.2  0.00000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0231069  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1645  hypothetical protein  30.69 
 
 		 353 aa  60.8  0.00000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000324872  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1608  hypothetical protein  30.69 
 
 		 353 aa  60.8  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000412262  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1366  hypothetical protein  30.69 
 
 		 353 aa  60.8  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000129131  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1365  hypothetical protein  30.69 
 
 		 353 aa  60.8  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000244018  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1578  hypothetical protein  30.69 
 
 		 353 aa  60.5  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.87864e-41 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0327  ATP-dependent DNA helicase RecQ  23.9 
 
 		 724 aa  60.5  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.946569  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0328  ATP-dependent DNA helicase RecQ  23.41 
 
 		 721 aa  60.5  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4756  helicase, RecD/TraA family  22.88 
 
 		 735 aa  60.8  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00416284  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1919  ATP-dependent DNA helicase RecQ  24.21 
 
 		 706 aa  60.1  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.77164  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2576  ATP-dependent DNA helicase (RecQ)  25.13 
 
 		 705 aa  59.7  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.238404  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3806  hypothetical protein  30.69 
 
 		 353 aa  59.7  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000646407  hitchhiker  9.69016e-19 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1931  ATP-dependent DNA helicase RecQ  25.58 
 
 		 711 aa  59.7  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161576  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3229  Exodeoxyribonuclease V  24.75 
 
 		 637 aa  59.7  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.115754  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf852  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  31.15 
 
 		 732 aa  58.9  0.0000003  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1393  hypothetical protein  30.69 
 
 		 357 aa  58.9  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000020757  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6207  helicase, RecD/TraA family  25.11 
 
 		 725 aa  59.3  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4923  RecD/TraA family helicase  26.34 
 
 		 744 aa  59.3  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.478208  normal  0.0184045 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1504  hypothetical protein  30.69 
 
 		 353 aa  58.9  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000086272  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5543  RecD/TraA family helicase  25.88 
 
 		 744 aa  58.9  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4672  putative deoxyribonuclease  26.12 
 
 		 372 aa  59.3  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.186884 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1539  hypothetical protein  30.69 
 
 		 353 aa  58.9  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000431521  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>