66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_3022 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_3022  SapC family protein  100 
 
 		 229 aa  473  1e-133  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0318248  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3512  hypothetical protein  85.15 
 
 		 229 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1173  SapC family protein  65.5 
 
 		 228 aa  321  6e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.282711  normal  0.903795 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0940  hypothetical protein  47.6 
 
 		 230 aa  227  1e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00274123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1307  SapC family protein  37.28 
 
 		 238 aa  144  9e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.537479 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1210  SapC family protein  32.26 
 
 		 239 aa  137  1e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.007094  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3218  SapC family protein  34.96 
 
 		 234 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1114  SapC family protein  33.19 
 
 		 239 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1137  SapC family protein  34.51 
 
 		 234 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.134042  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1077  SapC family protein  34.51 
 
 		 234 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2701  SapC  34.51 
 
 		 236 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0135847  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2877  SapC family protein  35.84 
 
 		 233 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.193841  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1024  hypothetical protein  33.18 
 
 		 233 aa  132  5e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3681  SapC  31.25 
 
 		 258 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1099  SapC family protein  30.21 
 
 		 242 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.693688  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3054  hypothetical protein  32.43 
 
 		 236 aa  124  9e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000693301 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2392  SapC related protein  31.88 
 
 		 241 aa  124  2e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00276727 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0151  hypothetical protein  31.51 
 
 		 259 aa  122  7e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.681081  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0613  SapC-related protein  31.72 
 
 		 244 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.397522  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03269  SapC  27.63 
 
 		 256 aa  116  3e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2202  SapC family protein  28 
 
 		 264 aa  112  4.0000000000000004e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.504396  normal  0.230762 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2545  SapC  30.6 
 
 		 238 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0240  hypothetical protein  30.77 
 
 		 242 aa  109  4.0000000000000004e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03901  SapC related protein  28.82 
 
 		 244 aa  107  2e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3179  SapC family protein  31.11 
 
 		 240 aa  106  3e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0187288 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1142  SapC family protein  32.49 
 
 		 240 aa  105  5e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1211  SapC family protein  31.14 
 
 		 240 aa  105  8e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.552472  normal  0.532412 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1123  SapC family protein  32 
 
 		 240 aa  104  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1399  hypothetical protein  28.05 
 
 		 238 aa  103  3e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129541 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1178  SapC family protein  30.8 
 
 		 240 aa  102  4e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.701461  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2830  SapC related protein  29 
 
 		 242 aa  102  5e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.525847  hitchhiker  0.000912858 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1311  SapC family protein  30.28 
 
 		 240 aa  100  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2181  SapC family protein  29.33 
 
 		 240 aa  100  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000117047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1605  SapC  26.96 
 
 		 240 aa  98.6  7e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.944293  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1261  VCBS  32.66 
 
 		 257 aa  98.6  7e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000118793 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0026  SapC  28 
 
 		 264 aa  95.9  4e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3684  hypothetical protein  28.26 
 
 		 254 aa  92.8  4e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4287  SapC  27.88 
 
 		 244 aa  92  6e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2386  SapC family protein  26.09 
 
 		 264 aa  90.9  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02804  SapC  25.43 
 
 		 233 aa  89.4  4e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0305  SapC family protein  26.99 
 
 		 255 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785352 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3838  SapC family protein  29.78 
 
 		 242 aa  87.4  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0655  SapC family protein  27.27 
 
 		 237 aa  86.3  3e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.44406  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3347  SapC family protein  27.07 
 
 		 255 aa  85.5  6e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.652681 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0084  SapC family protein  26.52 
 
 		 273 aa  85.5  7e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0659  SapC protein, putative  27.35 
 
 		 239 aa  84.7  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0131187  normal  0.604941 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2408  SapC family protein  26.41 
 
 		 266 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0580  SapC family protein  26.15 
 
 		 283 aa  83.6  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.132466 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3736  hypothetical protein  24.67 
 
 		 243 aa  84  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2367  SapC family protein  25.54 
 
 		 266 aa  82.4  0.000000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1947  SapC family protein  28.12 
 
 		 251 aa  81.6  0.000000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.257156  normal  0.0836073 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1708  hypothetical protein  25.78 
 
 		 461 aa  76.3  0.0000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02200  SapC superfamily  23.93 
 
 		 264 aa  76.3  0.0000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4693  SapC family protein  26.46 
 
 		 264 aa  75.1  0.0000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1102  SapC related protein  27.65 
 
 		 235 aa  73.2  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1851  SapC family protein  24.46 
 
 		 242 aa  73.6  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.755163 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2408  SapC family protein  27.57 
 
 		 225 aa  72.4  0.000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000000281595  normal  0.323308 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0137  SapC family protein  28.07 
 
 		 258 aa  70.1  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.459538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0916  SapC  23.85 
 
 		 238 aa  68.9  0.00000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1963  SapC  24.17 
 
 		 245 aa  63.2  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.78249  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0460  SapC  30.43 
 
 		 380 aa  62.8  0.000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0614463  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1289  SapC  24.12 
 
 		 259 aa  62  0.000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.369266  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1048  SapC  25.11 
 
 		 259 aa  60.8  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0951508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0596  SapC family protein  21.74 
 
 		 261 aa  60.5  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00347217 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0303  hypothetical protein  24.66 
 
 		 234 aa  48.5  0.00008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000548607  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0917  hypothetical protein  23.01 
 
 		 247 aa  47  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>