More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_3728 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_4113  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  80.65 
 
 		 527 aa  791    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3924  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  95.83 
 
 		 527 aa  993    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0226  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  80.27 
 
 		 527 aa  813    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.16836 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3728  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 		 527 aa  1060    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.436185 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4233  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  80 
 
 		 525 aa  798    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000524679 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3799  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  99.05 
 
 		 527 aa  1051    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2783  methyl-accepting chemotaxisprotein  49.72 
 
 		 690 aa  302  1e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.468562 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1498  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.84 
 
 		 687 aa  300  5e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000111484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2554  chemotaxis sensory transducer  49.25 
 
 		 663 aa  295  1e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.486048 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3237  methyl-accepting chemotaxis protein  45.19 
 
 		 771 aa  290  3e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4216  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.48 
 
 		 647 aa  288  2e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0237  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.7 
 
 		 632 aa  284  3.0000000000000004e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.997473 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02418  hypothetical protein  43.49 
 
 		 578 aa  281  2e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2544  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.18 
 
 		 633 aa  276  8e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00517521  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3044  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.84 
 
 		 688 aa  264  3e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0962  methyl-accepting chemotaxis protein  42.16 
 
 		 643 aa  263  8e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000917898  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0808  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.74 
 
 		 554 aa  261  2e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0987  methyl-accepting chemotaxis protein  42.37 
 
 		 554 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3839  methyl-accepting chemotaxis protein  45.51 
 
 		 636 aa  253  4.0000000000000004e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.406017  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3200  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.98 
 
 		 554 aa  252  1e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3532  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.53 
 
 		 555 aa  252  1e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3299  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.05 
 
 		 554 aa  252  1e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0581  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.19 
 
 		 554 aa  249  6e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1023  methyl-accepting chemotaxis protein  41.87 
 
 		 578 aa  248  1e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3199  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.76 
 
 		 554 aa  249  1e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.927661 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4711  methyl-accepting chemotaxis protein  43.59 
 
 		 633 aa  248  2e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0824  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.48 
 
 		 554 aa  248  2e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00067966 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0837  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.02 
 
 		 554 aa  248  3e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0870  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.68 
 
 		 554 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0571565  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3617  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.68 
 
 		 554 aa  246  8e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.964358 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3494  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.68 
 
 		 554 aa  246  8e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3422  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  40.68 
 
 		 554 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2880  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.21 
 
 		 558 aa  243  6e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0630  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.03 
 
 		 554 aa  241  2e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3491  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.73 
 
 		 554 aa  240  5e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3323  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.73 
 
 		 554 aa  239  6.999999999999999e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3759  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.42 
 
 		 554 aa  239  6.999999999999999e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0990388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0641  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.73 
 
 		 568 aa  239  1e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3666  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.73 
 
 		 554 aa  238  2e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3789  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.73 
 
 		 554 aa  238  2e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3601  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  42.73 
 
 		 554 aa  238  2e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3052  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.23 
 
 		 554 aa  236  6e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001822  methyl-accepting chemotaxis protein  36.34 
 
 		 557 aa  231  2e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000124429  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2596  methyl-accepting chemotaxis protein  36.21 
 
 		 564 aa  228  3e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000057467  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1098  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.31 
 
 		 637 aa  224  2e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0167241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5070  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.76 
 
 		 638 aa  224  4e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0949  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.79 
 
 		 636 aa  221  3e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0451727 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1674  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.98 
 
 		 543 aa  220  3.9999999999999997e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5020  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.46 
 
 		 638 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4894  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.46 
 
 		 638 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.291281  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3379  methyl-accepting chemotaxis protein  38.4 
 
 		 559 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0732  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.94 
 
 		 555 aa  213  7.999999999999999e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.177926 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2548  putative chemotaxis transducer  38.48 
 
 		 561 aa  211  2e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.271227  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3948  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.15 
 
 		 658 aa  211  2e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4463  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.89 
 
 		 552 aa  211  2e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.43301 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29800  putative chemotaxis transducer  38.48 
 
 		 561 aa  211  4e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00431462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0445  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.55 
 
 		 638 aa  209  7e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.455391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1939  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.44 
 
 		 638 aa  209  8e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.573171  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0619  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.42 
 
 		 634 aa  208  2e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1672  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.3 
 
 		 544 aa  207  3e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2346  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.62 
 
 		 564 aa  206  6e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3705  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.08 
 
 		 541 aa  206  6e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0963791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2650  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.99 
 
 		 568 aa  206  6e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2000  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.6 
 
 		 560 aa  206  7e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0144557  normal  0.0324669 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4895  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.95 
 
 		 739 aa  206  7e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.247309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5071  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.87 
 
 		 647 aa  206  9e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0808  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.92 
 
 		 541 aa  205  2e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1586  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.3 
 
 		 626 aa  205  2e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3768  chemotaxis sensory transducer  39.94 
 
 		 560 aa  205  2e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3809  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.87 
 
 		 547 aa  204  3e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1713  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40 
 
 		 666 aa  204  3e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000425798  normal  0.0665929 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4053  methyl-accepting chemotaxis protein  37.5 
 
 		 634 aa  204  4e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3098  methyl-accepting chemotaxis protein  37.39 
 
 		 642 aa  204  4e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.398555  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2814  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.55 
 
 		 702 aa  203  6e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.650804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01753  hypothetical protein  37.17 
 
 		 545 aa  202  8e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2130  methyl-accepting chemotaxis protein  32.26 
 
 		 546 aa  202  8e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.665531  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3424  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.14 
 
 		 674 aa  202  9e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.560716  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1963  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.82 
 
 		 637 aa  202  9e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.870205  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5021  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.12 
 
 		 647 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0828859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0905  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  32.97 
 
 		 640 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.746842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3611  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.74 
 
 		 634 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3827  methyl-accepting chemotaxis transducer  37.54 
 
 		 695 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000221184 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0876  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.99 
 
 		 674 aa  201  3e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2263  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.05 
 
 		 541 aa  201  3e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26280  putative chemotaxis transducer  37.58 
 
 		 545 aa  201  3e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.917899 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0380  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  35.31 
 
 		 638 aa  201  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4192  chemotaxis sensory transducer  36.59 
 
 		 654 aa  201  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1059  methyl-accepting chemotaxis protein  36.81 
 
 		 629 aa  200  5e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67010  putative chemotaxis transducer  36.36 
 
 		 647 aa  200  6e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2845  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.82 
 
 		 549 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000597879  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2316  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.69 
 
 		 548 aa  199  1.0000000000000001e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0208981 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1254  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.14 
 
 		 639 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.523103  normal  0.0331864 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3311  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.17 
 
 		 547 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.691655  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1041  methyl-accepting chemotaxis protein  34.88 
 
 		 541 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.893443  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4528  methyl-accepting chemotaxis protein  39.43 
 
 		 672 aa  198  2.0000000000000003e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2492  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.09 
 
 		 572 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1030  methyl-accepting chemotaxis protein  35.49 
 
 		 549 aa  197  3e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0851  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.94 
 
 		 674 aa  197  3e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.244273  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06314  histidine kinase  39.63 
 
 		 623 aa  197  4.0000000000000005e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3864  methyl-accepting chemotaxis protein  35.49 
 
 		 568 aa  197  5.000000000000001e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>