More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_2522 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_2522  ATPase central domain-containing protein  100 
 
 		 324 aa  657    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0747  AAA ATPase central domain protein  53.87 
 
 		 335 aa  357  9.999999999999999e-98  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.425262  normal  0.978944 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0097  ATPase central domain-containing protein  51.06 
 
 		 338 aa  343  2e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.622643  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2659  AAA ATPase central domain protein  51.23 
 
 		 322 aa  328  6e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000788626  hitchhiker  0.00386241 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4460  ATPase central domain-containing protein  50.79 
 
 		 320 aa  328  6e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1467  AAA ATPase, central region  50.79 
 
 		 332 aa  325  5e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1490  ATPase central domain-containing protein  50.79 
 
 		 332 aa  325  5e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5573  AAA ATPase, central region  48.58 
 
 		 323 aa  311  9e-84  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.292045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5976  ATPase central domain-containing protein  48.58 
 
 		 323 aa  311  9e-84  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3822  ATPase central domain-containing protein  47.52 
 
 		 322 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0247422 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5901  AAA ATPase central domain protein  47.37 
 
 		 352 aa  300  2e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.777397 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3109  putative ATPase  49 
 
 		 366 aa  250  2e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.351146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3321  AAA family ATPase  40.62 
 
 		 326 aa  209  5e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.81305  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0522  ATPase central domain-containing protein  41.41 
 
 		 391 aa  190  2e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2677  ATPase central domain-containing protein  33.23 
 
 		 328 aa  171  2e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.681731 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1692  putative ATPase  34.83 
 
 		 322 aa  170  3e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.593174 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4229  ATPase central domain-containing protein  32.68 
 
 		 328 aa  166  5e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2857  ATPase central domain-containing protein  31.74 
 
 		 328 aa  165  6.9999999999999995e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3503  AAA ATPase, central region  32.67 
 
 		 348 aa  162  7e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.238924 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4892  AAA ATPase central domain protein  35.71 
 
 		 326 aa  162  9e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3794  AAA ATPase, central region  40.89 
 
 		 369 aa  157  2e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.437647  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3059  ATPase central domain-containing protein  34.45 
 
 		 363 aa  157  2e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.96383  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0086  ATPase  33.83 
 
 		 335 aa  156  4e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.244566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1291  ATPase central domain-containing protein  34.63 
 
 		 328 aa  156  6e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.262565  normal  0.0615786 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5327  ATPase central domain-containing protein  33.67 
 
 		 327 aa  155  9e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.449619  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3863  ATPase central domain-containing protein  32.82 
 
 		 329 aa  154  1e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000266484 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1585  AAA ATPase, central domain-containing protein  32.82 
 
 		 329 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0386  AAA ATPase central domain protein  33.95 
 
 		 327 aa  153  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.156492 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3852  AAA ATPase central domain protein  33.09 
 
 		 335 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10210  AAA+ family ATPase  34.35 
 
 		 336 aa  151  2e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.954892  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0449  AAA ATPase, central region  35.79 
 
 		 335 aa  148  1.0000000000000001e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4417  ATPase central domain-containing protein  33.46 
 
 		 327 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4276  ATPase central domain-containing protein  33.46 
 
 		 327 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0291  AAA ATPase  32.64 
 
 		 370 aa  147  2.0000000000000003e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00325104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2097  AAA ATPase central domain protein  36.78 
 
 		 369 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4145  ATPase central domain-containing protein  31 
 
 		 388 aa  147  3e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0147452 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0513  AAA ATPase, central region  32.58 
 
 		 401 aa  146  5e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4803  ATPase central domain-containing protein  33.73 
 
 		 328 aa  146  5e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4254  AAA ATPase central domain protein  35.32 
 
 		 332 aa  145  8.000000000000001e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.656455  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3536  ATPase central domain-containing protein  34.43 
 
 		 336 aa  142  6e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.22928 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2089  AAA ATPase  30.79 
 
 		 336 aa  142  6e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.765117 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3738  ATPase central domain-containing protein  36.41 
 
 		 387 aa  142  8e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3671  ATPase central domain-containing protein  32.68 
 
 		 330 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1971  ATPase central domain-containing protein  35.89 
 
 		 390 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.68669  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5696  AAA ATPase, central region  32.33 
 
 		 389 aa  140  3e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.352624 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00636  ATPase, AAA family  35.44 
 
 		 325 aa  140  3e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.113631  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2442  ATPase central domain-containing protein  35.78 
 
 		 388 aa  139  8.999999999999999e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1081  AAA ATPase, central region  36.24 
 
 		 360 aa  139  8.999999999999999e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6418  AAA ATPase, central region  39.9 
 
 		 405 aa  137  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.255051  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5489  AAA ATPase central domain protein  33.6 
 
 		 336 aa  137  2e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.243939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2775  ATPase central domain-containing protein  30.34 
 
 		 325 aa  137  2e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.36839  normal  0.706454 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2640  ATPase central domain-containing protein  32.74 
 
 		 332 aa  137  4e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.288063  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0961  ATPase central domain-containing protein  33.6 
 
 		 336 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1642  AAA-family ATPase  31.38 
 
 		 308 aa  136  6.0000000000000005e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.722719  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2108  AAA ATPase central domain protein  31.16 
 
 		 367 aa  135  9.999999999999999e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.347982  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2822  AAA ATPase central domain protein  30.32 
 
 		 239 aa  135  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7319  ATPase central domain-containing protein  34.33 
 
 		 355 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.415671  normal  0.136646 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2254  ATPase of the AAA+ class  28.79 
 
 		 321 aa  124  2e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1073  AAA ATPase central domain protein  35.64 
 
 		 328 aa  124  3e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.984194  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2298  ATPase central domain-containing protein  37.57 
 
 		 345 aa  124  3e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00265806 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1301  AAA ATPase central domain protein  30.62 
 
 		 493 aa  118  9.999999999999999e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2215  AAA ATPase central domain protein  33.19 
 
 		 451 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0998186  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1955  AAA ATPase  35.96 
 
 		 430 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2583  AAA ATPase central domain protein  37.43 
 
 		 419 aa  115  7.999999999999999e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.450798 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0190  ATPase central domain-containing protein  40 
 
 		 425 aa  115  8.999999999999998e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.384028  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3431  AAA ATPase central domain protein  31.39 
 
 		 477 aa  115  1.0000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1395  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  32.88 
 
 		 759 aa  114  3e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1017  hypothetical protein  31.71 
 
 		 427 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0735  AAA ATPase central domain protein  31.39 
 
 		 459 aa  113  5e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2338  AAA ATPase, central region  36.49 
 
 		 425 aa  113  5e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0486  ATPase central domain-containing protein  35.89 
 
 		 424 aa  111  1.0000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1958  AAA ATPase central domain protein  31.51 
 
 		 468 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.268075 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2089  ATPase central domain-containing protein  32.66 
 
 		 428 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0529  cell division cycle protein 48-like protein  33.93 
 
 		 426 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2326  ATPase central domain-containing protein  33.48 
 
 		 419 aa  107  4e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4143  ATPase central domain-containing protein  29.44 
 
 		 243 aa  103  5e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.802818  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4255  AAA ATPase, central region  32.1 
 
 		 688 aa  101  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1809  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.11 
 
 		 736 aa  101  2e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2237  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  30.59 
 
 		 760 aa  101  2e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.714919  hitchhiker  0.00116509 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31786  peroxisomal assembly protein  29.82 
 
 		 1178 aa  100  5e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0210  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  29.49 
 
 		 768 aa  99.8  6e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.798334  normal  0.0460927 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4244  AAA ATPase, central region  37.86 
 
 		 686 aa  99.4  8e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000108013 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07254  Cell division control protein 48 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AWS6]  31.65 
 
 		 814 aa  98.6  1e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.385633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2344  Vesicle-fusing ATPase  32.27 
 
 		 703 aa  99  1e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.935246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1658  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  30.7 
 
 		 737 aa  98.6  1e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.814127 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_35070  predicted protein  31.73 
 
 		 417 aa  98.6  1e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0746786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0973  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31.03 
 
 		 852 aa  98.2  2e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0684344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00580  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.77 
 
 		 630 aa  98.2  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119838  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1619  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  30.7 
 
 		 737 aa  97.4  3e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29008  predicted protein  28.44 
 
 		 804 aa  96.7  5e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0920  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31.36 
 
 		 723 aa  96.3  6e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB03930  endopeptidase, putative  29.72 
 
 		 414 aa  95.9  7e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0534334  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0001  Vesicle-fusing ATPase  37.08 
 
 		 699 aa  95.1  1e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0010  AAA ATPase central domain protein  32.96 
 
 		 333 aa  95.1  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283039 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5040  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.7 
 
 		 685 aa  94.7  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0541  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.2 
 
 		 735 aa  94.7  2e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.716512  normal  0.437699 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4120  AAA ATPase central domain protein  34.04 
 
 		 466 aa  94.4  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0052109  hitchhiker  0.000242019 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0854  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.68 
 
 		 621 aa  94.4  2e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.946153  normal  0.500418 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1013  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.68 
 
 		 621 aa  94.7  2e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1810  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  31.48 
 
 		 715 aa  94  3e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>