More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_1627 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_1828  acriflavin resistance protein  76.44 
 
 		 1025 aa  1625    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0227595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1638  acriflavin resistance protein  39.01 
 
 		 1026 aa  690    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.643434 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1779  acriflavin resistance protein  78.15 
 
 		 1025 aa  1658    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1923  AcrB/AcrD/AcrF family protein  93.52 
 
 		 1020 aa  1949    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2516  acriflavin resistance protein  92.34 
 
 		 1015 aa  1876    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.560727  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2636  acriflavin resistance protein  92.34 
 
 		 1015 aa  1876    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2277  acriflavin resistance protein  91.94 
 
 		 1015 aa  1915    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1828  acriflavin resistance protein  92.34 
 
 		 1015 aa  1876    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.575203 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1647  acriflavin resistance protein  78.05 
 
 		 1015 aa  1655    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2194  acriflavin resistance protein  77.13 
 
 		 1030 aa  1628    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01075  AcrB/AcrD/AcrF family protein  53.1 
 
 		 1026 aa  1049    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2231  acriflavin resistance protein  51.33 
 
 		 1040 aa  1011    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1627  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1018 aa  2063    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1702  acriflavin resistance protein  99.31 
 
 		 1018 aa  2049    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2383  acriflavin resistance protein  77.55 
 
 		 1021 aa  1650    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1702  acriflavin resistance protein  98.62 
 
 		 1018 aa  2041    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1419  AcrB/AcrD/AcrF family protein  73.82 
 
 		 1019 aa  1548    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.446935 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2822  acriflavin resistance protein  78.07 
 
 		 1027 aa  1667    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000227615  normal  0.366957 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2523  acriflavin resistance protein  92.34 
 
 		 1015 aa  1876    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00322  RND superfamily protein  37.86 
 
 		 823 aa  527  1e-148  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  31.1 
 
 		 1011 aa  434  1e-120  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1350  acriflavin resistance protein  28.85 
 
 		 1024 aa  397  1e-109  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0568344 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2528  acriflavin resistance protein  28.2 
 
 		 1053 aa  398  1e-109  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.263443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  28.48 
 
 		 1050 aa  392  1e-107  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  27.8 
 
 		 1044 aa  387  1e-106  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1579  acriflavin resistance protein  27.93 
 
 		 1046 aa  389  1e-106  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1942  acriflavin resistance protein  28.3 
 
 		 1040 aa  384  1e-105  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.211904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2950  acriflavin resistance protein  27.93 
 
 		 1044 aa  377  1e-103  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  29.37 
 
 		 1034 aa  375  1e-102  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  28.05 
 
 		 1038 aa  372  1e-101  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  25.7 
 
 		 1043 aa  372  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0979  acriflavin resistance protein  27.29 
 
 		 1009 aa  373  1e-101  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.650548  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1907  acriflavin resistance protein  27.08 
 
 		 1038 aa  369  1e-100  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1937  acriflavin resistance protein  28.2 
 
 		 1034 aa  367  1e-100  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.256217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0165  acriflavin resistance protein  27.15 
 
 		 1032 aa  363  8e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0752  acriflavin resistance protein  26.98 
 
 		 1071 aa  361  4e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1732  acriflavin resistance protein  28.99 
 
 		 1027 aa  361  4e-98  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  27.88 
 
 		 1470 aa  353  8.999999999999999e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1842  acriflavin resistance protein  25.12 
 
 		 1058 aa  352  2e-95  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.844387  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2518  acriflavin resistance protein  28.16 
 
 		 1041 aa  349  2e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00118511  normal  0.514323 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0965  AcrB/AcrD/AcrF family protein  28.54 
 
 		 1024 aa  349  2e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00708155  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0030  acriflavin resistance protein  27.34 
 
 		 1027 aa  348  3e-94  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0439457  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  28.09 
 
 		 1496 aa  347  6e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1383  acriflavin resistance protein  26.15 
 
 		 1014 aa  346  1e-93  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000121579  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0971  NolG efflux transporter  26.3 
 
 		 1036 aa  345  2e-93  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1675  acriflavin resistance protein  26.72 
 
 		 1034 aa  343  8e-93  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.640028  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2099  acriflavin resistance protein  26.74 
 
 		 1043 aa  343  8e-93  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1876  acriflavin resistance protein  26.01 
 
 		 1017 aa  342  2e-92  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0815  acriflavin resistance protein  26.67 
 
 		 1036 aa  341  2.9999999999999998e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1613  acriflavin resistance protein  26.3 
 
 		 1041 aa  340  5.9999999999999996e-92  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2523  acriflavin resistance protein  27.47 
 
 		 1026 aa  340  5.9999999999999996e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.199891 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2480  acriflavin resistance protein  27.28 
 
 		 1028 aa  340  5.9999999999999996e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2809  cation efflux protein  25.82 
 
 		 1050 aa  340  7e-92  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.354726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3296  acriflavin resistance protein  26.58 
 
 		 1006 aa  338  3.9999999999999995e-91  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0229109  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1025  acriflavin resistance protein  27.82 
 
 		 1050 aa  335  2e-90  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1383  acriflavin resistance protein  26.99 
 
 		 1022 aa  334  4e-90  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0763  acriflavin resistance protein  27.41 
 
 		 1039 aa  334  5e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2827  acriflavin resistance protein  27.76 
 
 		 1041 aa  333  8e-90  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2392  acriflavin resistance protein  26.84 
 
 		 1028 aa  331  4e-89  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.430925  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2664  acriflavin resistance protein  24.33 
 
 		 1039 aa  330  6e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2296  putative integral membrane efflux protein  27.05 
 
 		 1064 aa  330  9e-89  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2359  acriflavin resistance protein  27.3 
 
 		 1028 aa  326  1e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.995142  normal  0.101465 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1043  nodulation protein precursor  27.09 
 
 		 1069 aa  326  1e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3708  acriflavin resistance protein  25.48 
 
 		 1063 aa  325  2e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1268  acriflavin resistance protein  25.29 
 
 		 1058 aa  325  3e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0354  acriflavin resistance protein  27.28 
 
 		 1101 aa  324  4e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00649102  unclonable  0.0000000737583 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2817  acriflavin resistance protein  24.76 
 
 		 1053 aa  324  7e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6179  acriflavin resistance protein  26.46 
 
 		 1065 aa  322  1.9999999999999998e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0960  acriflavin resistance protein  26.56 
 
 		 1047 aa  322  1.9999999999999998e-86  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4494  acriflavin resistance protein  26.02 
 
 		 1049 aa  319  2e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.45729 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0237  acriflavin resistance protein  26.83 
 
 		 1054 aa  319  2e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2024  acriflavin resistance protein  24.67 
 
 		 1058 aa  319  2e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000109059  normal  0.508224 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0248  acriflavin resistance protein  26.48 
 
 		 1054 aa  318  3e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1637  acriflavin resistance protein  25.31 
 
 		 1173 aa  318  4e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0211  acriflavin resistance protein  26.41 
 
 		 1026 aa  317  5e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.824478 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3179  acriflavin resistance protein  26.29 
 
 		 1023 aa  317  7e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000434633  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1183  acriflavin resistance protein  26.3 
 
 		 1038 aa  315  1.9999999999999998e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.317348  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0608  acriflavin resistance protein  24.59 
 
 		 1059 aa  315  2.9999999999999996e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0300308  normal  0.48397 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0238  acriflavin resistance protein  26.34 
 
 		 1067 aa  315  2.9999999999999996e-84  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3171  acriflavin resistance protein  26.62 
 
 		 1074 aa  315  2.9999999999999996e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1622  hitchhiker  0.0000000446015 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4164  acriflavin resistance protein  25.72 
 
 		 1040 aa  314  3.9999999999999997e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0666932  normal  0.648782 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0226  acriflavin resistance protein  26.48 
 
 		 1054 aa  313  1e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.38584  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2287  acriflavin resistance protein  27.29 
 
 		 1075 aa  313  1e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00014609 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1006  acriflavin resistance plasma membrane protein  26.06 
 
 		 1040 aa  311  2.9999999999999997e-83  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.236802  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0160  acriflavin resistance protein  27 
 
 		 1033 aa  311  2.9999999999999997e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0063  acriflavin resistance protein  24.9 
 
 		 1033 aa  310  5.9999999999999995e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0948  acriflavin resistance protein  26.06 
 
 		 1015 aa  310  6.999999999999999e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2704  multidrug efflux system subunit MdtC  25.31 
 
 		 1030 aa  310  1.0000000000000001e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2349  acriflavin resistance protein  25.12 
 
 		 1070 aa  310  1.0000000000000001e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.253914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2982  acriflavin resistance protein  26.89 
 
 		 1028 aa  308  3e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.05054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0641  acriflavin resistance protein  25.1 
 
 		 1041 aa  308  3e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3717  acriflavin resistance protein  25.07 
 
 		 1055 aa  308  4.0000000000000004e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.530646  normal  0.0294121 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2180  acriflavin resistance protein  25.71 
 
 		 1030 aa  308  4.0000000000000004e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000146343  normal  0.137669 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1667  acriflavin resistance protein  25.84 
 
 		 1095 aa  308  4.0000000000000004e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2378  acriflavin resistance protein  26.36 
 
 		 1044 aa  307  7e-82  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.856569  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2503  acriflavin resistance protein  25 
 
 		 1016 aa  306  1.0000000000000001e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000075994  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0140  acriflavine resistance protein  26.5 
 
 		 1071 aa  306  1.0000000000000001e-81  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3888  acriflavin resistance protein  25.87 
 
 		 1048 aa  305  2.0000000000000002e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.471381  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4170  acriflavin resistance protein  26.37 
 
 		 1171 aa  305  4.0000000000000003e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00460578  normal  0.0104573 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0559  acriflavin resistance protein  24.52 
 
 		 1062 aa  303  8.000000000000001e-81  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>