More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_1155 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009052  Sbal_1246  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  81.03 
 
 		 522 aa  876    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1324  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  80.84 
 
 		 522 aa  873    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0159359 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1290  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  80.65 
 
 		 522 aa  874    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1156  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  95.41 
 
 		 523 aa  1005    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1155  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 		 523 aa  1076    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1226  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  95.03 
 
 		 523 aa  1002    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2723  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  80.84 
 
 		 522 aa  881    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.471128  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3064  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  80.84 
 
 		 522 aa  874    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000699577 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3399  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  69.47 
 
 		 526 aa  630  1e-179  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4961  methyl-accepting chemotaxis protein  47.87 
 
 		 527 aa  415  1e-114  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3042  methyl-accepting chemotaxis protein  45.64 
 
 		 527 aa  397  1e-109  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1460  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.83 
 
 		 534 aa  382  1e-104  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.695651  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03575  methyl-accepting chemotaxis protein  39.01 
 
 		 525 aa  360  3e-98  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1808  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.52 
 
 		 514 aa  349  6e-95  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2839  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.09 
 
 		 546 aa  343  4e-93  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3326  chemotaxis sensory transducer  37.77 
 
 		 534 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3261  chemotaxis sensory transducer  38.58 
 
 		 534 aa  325  1e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3480  methyl-accepting chemotaxis protein  35.84 
 
 		 533 aa  320  3e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0820031  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4857  methyl-accepting chemotaxis protein  36.82 
 
 		 535 aa  310  5e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55750  putative chemotaxis transducer  37.5 
 
 		 538 aa  309  8e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4367  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.8 
 
 		 524 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2939  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.64 
 
 		 696 aa  281  3e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000015868 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4401  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.14 
 
 		 695 aa  279  1e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.896591  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0385  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.43 
 
 		 698 aa  278  2e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0817491  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0582  methyl-accepting chemotaxis protein  36.97 
 
 		 696 aa  273  7e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0467  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.21 
 
 		 693 aa  264  3e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.285916  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0484  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.21 
 
 		 693 aa  261  2e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000150879 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0932  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.51 
 
 		 707 aa  233  7.000000000000001e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.1893  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0496  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.54 
 
 		 470 aa  226  6e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.453159 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0561  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.22 
 
 		 505 aa  226  6e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0509  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.54 
 
 		 470 aa  226  8e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.856427  normal  0.10181 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1152  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.05 
 
 		 484 aa  223  9e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.26629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3097  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.11 
 
 		 602 aa  218  2e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1275  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.98 
 
 		 470 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.233006 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1954  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.14 
 
 		 511 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.249155  normal  0.44726 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1958  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.74 
 
 		 598 aa  212  1e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.57626  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2304  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.46 
 
 		 468 aa  211  2e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.816033 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1554  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.08 
 
 		 495 aa  208  2e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1985  methyl-accepting chemotaxis protein (MCP)  30.6 
 
 		 715 aa  204  5e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1014  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.23 
 
 		 482 aa  199  7e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2227  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.83 
 
 		 481 aa  199  1.0000000000000001e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.237535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2241  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  35.39 
 
 		 598 aa  195  1e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.130389  normal  0.394001 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5132  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.43 
 
 		 468 aa  194  4e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.202601  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2475  methyl-accepting chemotaxis protein  34.96 
 
 		 598 aa  194  5e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0390427  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0041  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.05 
 
 		 573 aa  194  5e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3236  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.43 
 
 		 476 aa  193  5e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.315544  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5149  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.17 
 
 		 468 aa  192  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.853292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0535  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.11 
 
 		 487 aa  189  8e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1623  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.96 
 
 		 454 aa  185  2.0000000000000003e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00717627 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1837  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.94 
 
 		 578 aa  182  1e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00718884 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2381  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.31 
 
 		 578 aa  179  8e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6912  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.21 
 
 		 475 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.18628  normal  0.2896 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0009  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.32 
 
 		 511 aa  172  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4170  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.71 
 
 		 578 aa  169  1e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3082  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.44 
 
 		 448 aa  168  2.9999999999999998e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.802467  normal  0.530433 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6911  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.29 
 
 		 584 aa  168  2.9999999999999998e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.900499  normal  0.411338 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0071  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.46 
 
 		 525 aa  164  5.0000000000000005e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.603344  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1153  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.5 
 
 		 474 aa  160  6e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1641  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.54 
 
 		 480 aa  155  2e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0715397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0443  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.09 
 
 		 541 aa  152  2e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1286  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.66 
 
 		 583 aa  136  9e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0142  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.78 
 
 		 540 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0808523  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2530  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  34.64 
 
 		 533 aa  134  3e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.616311  hitchhiker  0.00580613 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1793  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.64 
 
 		 533 aa  135  3e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0175347  normal  0.776493 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4274  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.66 
 
 		 583 aa  134  3e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3980  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.5 
 
 		 468 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.330272 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4808  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.09 
 
 		 584 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2347  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.63 
 
 		 533 aa  130  8.000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0750  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  32.62 
 
 		 539 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2652  methyl-accepting chemotaxis protein  32.18 
 
 		 392 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2521  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.5 
 
 		 533 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000172201 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1963  chemotaxis sensory transducer  36.26 
 
 		 535 aa  128  3e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0149  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33 
 
 		 533 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3147  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.33 
 
 		 540 aa  127  5e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0302394  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2828  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.96 
 
 		 550 aa  126  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000014913 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3066  chemotaxis sensory transducer  34.35 
 
 		 488 aa  125  1e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.301784  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0339  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.51 
 
 		 558 aa  126  1e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3282  methyl-accepting chemotaxis protein  34.72 
 
 		 667 aa  125  2e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2825  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.73 
 
 		 570 aa  125  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000443347 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4172  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.95 
 
 		 584 aa  125  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0908  methyl-accepting chemotaxis protein  32.44 
 
 		 633 aa  125  3e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000172893  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2083  methyl-accepting chemotaxis protein  44.03 
 
 		 505 aa  124  4e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2471  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.6 
 
 		 425 aa  124  4e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.817651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48030  putative methyl-accepting chemotaxis transducer  33.22 
 
 		 541 aa  124  4e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.478475 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4675  methyl-accepting chemotaxis protein  36.16 
 
 		 701 aa  124  5e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.595763  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3345  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.99 
 
 		 542 aa  124  5e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0226154 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0713  methyl-accepting chemotaxis protein  34.54 
 
 		 473 aa  124  5e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1041  methyl-accepting chemotaxis protein  32.62 
 
 		 541 aa  124  6e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.893443  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0042  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.88 
 
 		 565 aa  123  6e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.121118  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1630  chemotaxis sensory transducer  38.73 
 
 		 541 aa  123  8e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0250136 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2845  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.37 
 
 		 549 aa  123  9e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000597879  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0529  methyl-accepting chemotaxis protein-like protein  35.1 
 
 		 677 aa  123  9e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3600  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.51 
 
 		 546 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2942  methyl-accepting chemotaxis protein  35.84 
 
 		 544 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0170  methyl-accepting chemotaxis protein  34.68 
 
 		 543 aa  122  1.9999999999999998e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3709  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  33.1 
 
 		 546 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4266  chemotaxis sensory transducer  29.28 
 
 		 546 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.261421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1488  methyl-accepting chemotaxis protein  35.96 
 
 		 672 aa  121  1.9999999999999998e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.619219  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3611  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.68 
 
 		 540 aa  121  3e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03417  methyl-accepting chemotaxis protein  37.5 
 
 		 674 aa  121  3e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.617562  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>