More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_0497 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_0496  ABC transporter related  95.98 
 
 		 348 aa  675    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.630223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3534  ABC transporter related  96.55 
 
 		 348 aa  679    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0497  ABC transporter related  100 
 
 		 348 aa  708    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0487  copper ABC transporter, ATP-binding protein  74.17 
 
 		 332 aa  494  1e-139  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3358  ABC transporter related  58.58 
 
 		 344 aa  379  1e-104  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.348903  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3869  ABC transporter related  60.95 
 
 		 345 aa  359  4e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3994  ABC transporter related  61.27 
 
 		 345 aa  358  5e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0511  ABC transporter related  49.67 
 
 		 302 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0487  ABC transporter related  47.52 
 
 		 325 aa  273  3e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0501  ABC transporter-related protein  47.04 
 
 		 300 aa  272  5.000000000000001e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0490  ABC transporter-related protein  46.89 
 
 		 302 aa  272  8.000000000000001e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4469  ABC transporter related  47.39 
 
 		 302 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4448  ABC transporter related  45.1 
 
 		 327 aa  263  2e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0356  ABC transporter-related protein  49.29 
 
 		 309 aa  250  3e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3402  ABC transporter-related protein  41.72 
 
 		 322 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00371017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1736  nitrous oxide reductase maturation ATPase NosF  45.89 
 
 		 304 aa  229  8e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.42445  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20180  NosF protein  46.23 
 
 		 304 aa  228  9e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.423742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1076  ABC transporter related  42.61 
 
 		 308 aa  225  1e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1426  ABC transporter for copper ATP-binding protein  41.92 
 
 		 303 aa  219  5e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2217  ABC transporter related  41.23 
 
 		 327 aa  217  2e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4734  copper ABC transporter, ATP-binding protein  42.07 
 
 		 304 aa  216  4e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4344  ABC transporter related  38.7 
 
 		 310 aa  210  2e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3144  ABC transporter related  40 
 
 		 301 aa  210  3e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4914  putative ABC transporter ATP-binding protein  38.54 
 
 		 316 aa  209  4e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000429083 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0660  ABC transporter related  38.49 
 
 		 313 aa  209  8e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.946314  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0214  ABC transporter related  38.14 
 
 		 303 aa  208  9e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000423562  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3201  ABC transporter related  39.53 
 
 		 303 aa  207  2e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.528814  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3076  ABC transporter related  42.86 
 
 		 310 aa  207  2e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.591298  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0430  ABC transporter related  40.34 
 
 		 301 aa  206  4e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2566  ABC transporter related  42.32 
 
 		 310 aa  206  4e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.2512  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0253  copper ABC transporter, ATP-binding protein  37.61 
 
 		 331 aa  206  5e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3196  copper transport ATP-binding protein NosF  40.69 
 
 		 298 aa  205  1e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.361058  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0277  copper ABC transporter, ATP-binding protein  39.19 
 
 		 316 aa  204  2e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.122603  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2859  ABC transporter related  39.26 
 
 		 301 aa  204  2e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2353  ABC transporter related  37.41 
 
 		 301 aa  195  1e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1057  ABC transporter related  37.54 
 
 		 310 aa  194  2e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4062  ABC transporter related  40.2 
 
 		 318 aa  194  2e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.603136  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4174  ABC transporter related  40.2 
 
 		 318 aa  194  2e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1136  ABC transporter related  37.54 
 
 		 310 aa  194  2e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0444125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1480  ABC transporter-related protein  39.17 
 
 		 338 aa  194  3e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.132633 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6010  copper ABC transporter, ATP-binding protein NosF  34.98 
 
 		 306 aa  194  3e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00601626  normal  0.07018 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4217  ABC transporter related  38.62 
 
 		 299 aa  192  9e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.175008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1392  ABC transporter ATPase  36.33 
 
 		 318 aa  189  5e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1371  copper ATP-binding ABC transporter protein  37.74 
 
 		 314 aa  189  8e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2323  copper ABC transporter, ATP-binding protein  37.29 
 
 		 304 aa  177  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.797197  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2062  copper ABC transporter, ATP-binding protein  35.1 
 
 		 309 aa  176  4e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.947517  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2257  putative copper-related ABC transport system, ATP-binding protein  35.64 
 
 		 747 aa  176  6e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  42.22 
 
 		 316 aa  173  3.9999999999999995e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0993  copper ABC transporter, ATP-binding protein  35.25 
 
 		 304 aa  173  5e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.193362  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2117  copper ABC transporter, ATP-binding protein  35.25 
 
 		 304 aa  173  5e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1624  ABC transporter related protein  42.2 
 
 		 309 aa  167  2e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0610867  normal  0.950566 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  41.33 
 
 		 309 aa  167  2.9999999999999998e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2875  ABC transporter related  41.55 
 
 		 315 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0648  ABC transporter related  37.1 
 
 		 308 aa  166  6.9999999999999995e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3370  ABC transporter, ATP-binding protein  38.43 
 
 		 356 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0614768  decreased coverage  0.00407786 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2937  ABC transporter related  38.01 
 
 		 279 aa  160  3e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1342  ABC transporter-related protein  34.67 
 
 		 301 aa  160  4e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.240118  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2411  ABC transporter related  31.56 
 
 		 299 aa  159  5e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0293991  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2366  ABC transporter related  31.56 
 
 		 299 aa  159  5e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2557  ABC transporter related  39.19 
 
 		 259 aa  159  9e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000637535  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3287  ABC transporter related protein  40.72 
 
 		 261 aa  158  1e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0726  ABC transporter related  39.47 
 
 		 316 aa  158  1e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0395  ABC transporter-related protein  36.99 
 
 		 295 aa  158  1e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2285  ABC transporter related  37.73 
 
 		 296 aa  158  1e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3209  ABC transporter related  37.87 
 
 		 337 aa  158  2e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.101264  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0295  ABC transporter related  34.11 
 
 		 298 aa  157  3e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.520917  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7158  ABC transporter related  41.67 
 
 		 258 aa  156  4e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0636  ABC transporter, ATPase subunit  39.07 
 
 		 318 aa  156  6e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0785  ABC transporter related  30.69 
 
 		 300 aa  155  1e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0789  ABC transporter related protein  32.79 
 
 		 302 aa  154  2e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3549  ABC transporter related protein  31.89 
 
 		 308 aa  154  2e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.156149 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7020  ABC transporter related  40.58 
 
 		 306 aa  154  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4202  ABC transporter related  32.68 
 
 		 335 aa  154  2e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.933672  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2796  ABC transporter related  39.23 
 
 		 326 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.982119 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2202  ABC transporter related protein  37.24 
 
 		 261 aa  154  2.9999999999999998e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0905  ABC transporter related  39.34 
 
 		 250 aa  154  2.9999999999999998e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1485  ABC transporter related protein  37.89 
 
 		 332 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1669  ABC transporter related  31.55 
 
 		 338 aa  153  4e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.700006  hitchhiker  0.00242494 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3755  ABC transporter related  32.32 
 
 		 306 aa  153  4e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0461  ABC transporter related protein  33.33 
 
 		 305 aa  153  4e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2050  ABC transporter related  39.09 
 
 		 236 aa  153  4e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.492019  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06380  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  36.56 
 
 		 247 aa  153  5e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0323  ABC transporter related  30.51 
 
 		 302 aa  153  5e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.309009 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1577  ABC transporter related protein  37.74 
 
 		 318 aa  152  8.999999999999999e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0670  ABC transporter related  38.6 
 
 		 318 aa  152  8.999999999999999e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0427  ABC transporter related  37.39 
 
 		 317 aa  152  1e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0670  ABC transporter-related protein  38.6 
 
 		 318 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.708326  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2467  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  29.61 
 
 		 305 aa  152  1e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0145  ABC transporter related  37.44 
 
 		 295 aa  151  1e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0967597  decreased coverage  0.0026708 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2865  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  30.87 
 
 		 333 aa  151  2e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2556  ABC transporter related protein  39 
 
 		 272 aa  151  2e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.90963  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2057  ABC transporter related  37.39 
 
 		 257 aa  150  2e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.01402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2586  ABC transporter related protein  40 
 
 		 287 aa  150  2e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3411  ABC transporter related  35.31 
 
 		 342 aa  150  3e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0395155  hitchhiker  0.000120901 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3749  ABC transporter related protein  37.66 
 
 		 310 aa  150  3e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2521  ABC transporter related  40.49 
 
 		 284 aa  150  3e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.436198 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1411  ABC transporter-related protein  37.55 
 
 		 303 aa  150  3e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3073  ABC transporter related  33.11 
 
 		 307 aa  150  3e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0012  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  32.55 
 
 		 308 aa  150  4e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1462  ABC transporter related  36.28 
 
 		 252 aa  149  5e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.936224  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>