More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_4289 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_4289  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1055 aa  2121    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0104  acriflavin resistance protein  89.1 
 
 		 1056 aa  1851    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4429  acriflavin resistance protein  97.92 
 
 		 1059 aa  2015    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0111  acriflavin resistance protein  97.73 
 
 		 1059 aa  1984    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2405  acriflavin resistance protein  53.17 
 
 		 1051 aa  1095    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2381  acriflavin resistance protein D  33.84 
 
 		 1092 aa  593  1e-168  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.422424  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6349  acriflavin resistance protein  35.11 
 
 		 1064 aa  589  1e-166  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.945315 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0835  acriflavin resistance protein  34.48 
 
 		 1042 aa  581  1e-164  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.181435  normal  0.546259 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0917  acriflavin resistance protein  34.82 
 
 		 1054 aa  529  1e-148  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1961  AcrB/AcrD/AcrF family protein  32.48 
 
 		 1038 aa  510  1e-143  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4375  acriflavin resistance protein  30.51 
 
 		 1038 aa  490  1e-137  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000150121  normal  0.679218 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4767  acriflavin resistance protein  30.27 
 
 		 1037 aa  483  1e-135  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.300742  unclonable  0.0000000523741 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0140  acriflavin resistance protein  31.24 
 
 		 1026 aa  483  1e-135  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2667  AcrB/AcrD/AcrF family protein  30.97 
 
 		 1035 aa  476  1e-133  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0044  acriflavin resistance protein  30.69 
 
 		 1036 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3430  acriflavin resistance protein  30.27 
 
 		 1037 aa  459  1e-127  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1475  acriflavin resistance protein  31.33 
 
 		 1027 aa  454  1.0000000000000001e-126  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.521845  normal  0.0685081 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3726  acriflavin resistance protein  30.36 
 
 		 1061 aa  420  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.226552 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3672  acriflavin resistance protein  30.36 
 
 		 1061 aa  420  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  26.11 
 
 		 1050 aa  350  8e-95  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3179  acriflavin resistance protein  26.2 
 
 		 1023 aa  330  8e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000434633  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  24.31 
 
 		 1043 aa  326  1e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2382  acriflavin resistance protein  26.04 
 
 		 1083 aa  327  1e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2515  acriflavin resistance protein  26.75 
 
 		 1085 aa  321  3.9999999999999996e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0795793  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  24.88 
 
 		 1044 aa  317  8e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2950  acriflavin resistance protein  26.75 
 
 		 1044 aa  315  3.9999999999999997e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  24.55 
 
 		 1011 aa  311  4e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1905  AcrB/AcrD/AcrF family protein  25.99 
 
 		 1034 aa  311  5.9999999999999995e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.209576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2549  acriflavin resistance protein  26.08 
 
 		 1031 aa  310  6.999999999999999e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0932297  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1797  acriflavin resistance protein  26.08 
 
 		 1031 aa  310  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0223723  hitchhiker  0.000000350495 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2587  acriflavin resistance protein  26.08 
 
 		 1031 aa  309  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000412735  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2664  acriflavin resistance protein  25.99 
 
 		 1031 aa  308  3e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.192826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2276  acriflavin resistance protein  26.43 
 
 		 1083 aa  307  6e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.440839  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2337  acriflavin resistance protein  25.56 
 
 		 1031 aa  307  7e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0120926  hitchhiker  0.000298899 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0641  acriflavin resistance protein  25.09 
 
 		 1041 aa  307  7e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3737  acriflavin resistance protein  27.52 
 
 		 1014 aa  306  1.0000000000000001e-81  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2409  acriflavin resistance protein  25.35 
 
 		 1031 aa  306  1.0000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.677885  normal  0.0307662 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1659  acriflavin resistance protein  25.35 
 
 		 1031 aa  306  1.0000000000000001e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.178159  normal  0.998047 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1876  acriflavin resistance protein  28.65 
 
 		 1017 aa  306  2.0000000000000002e-81  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1420  AcrB/AcrD/AcrF family protein  26.7 
 
 		 1081 aa  305  3.0000000000000004e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0540  AcrB/AcrD/AcrF family protein  25.17 
 
 		 1049 aa  305  4.0000000000000003e-81  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1703  acriflavin resistance protein  26.22 
 
 		 1087 aa  305  4.0000000000000003e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1705  acriflavin resistance protein  25.16 
 
 		 1031 aa  304  7.000000000000001e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0236776  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  24.55 
 
 		 1034 aa  302  3e-80  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1703  acriflavin resistance protein  26.11 
 
 		 1087 aa  301  6e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1942  acriflavin resistance protein  25.48 
 
 		 1040 aa  300  1e-79  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.211904  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1882  AcrB/AcrD/AcrF family protein  24.88 
 
 		 1031 aa  299  2e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1006  acriflavin resistance protein  25.66 
 
 		 1058 aa  299  2e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00411218  normal  0.136084 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1350  acriflavin resistance protein  25.83 
 
 		 1024 aa  299  2e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0568344 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2180  acriflavin resistance protein  25 
 
 		 1030 aa  298  3e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000146343  normal  0.137669 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0902  acriflavin resistance protein  26.01 
 
 		 1029 aa  297  6e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.621432  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0267  acriflavin resistance protein  25.8 
 
 		 1040 aa  296  9e-79  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.856769 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1852  acriflavin resistance protein  25.24 
 
 		 1042 aa  296  1e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0174296  hitchhiker  0.000605557 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3610  acriflavin resistance protein  25.07 
 
 		 1040 aa  296  1e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.35819  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3031  acriflavin resistance protein  25.43 
 
 		 1042 aa  295  2e-78  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.050113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2427  acriflavin resistance protein  25.14 
 
 		 1031 aa  295  3e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000387519 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1732  acriflavin resistance protein  28.15 
 
 		 1027 aa  294  5e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2024  acriflavin resistance protein  24.93 
 
 		 1058 aa  293  1e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000109059  normal  0.508224 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1983  acriflavin resistance protein  25.7 
 
 		 1034 aa  291  4e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000463224  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2094  acriflavin resistance protein  25.95 
 
 		 1037 aa  290  1e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0652  acriflavin resistance protein  27.75 
 
 		 1027 aa  290  1e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.653108  normal  0.0388492 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1937  acriflavin resistance protein  24.47 
 
 		 1034 aa  290  1e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.256217  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1907  acriflavin resistance protein  24.37 
 
 		 1038 aa  289  2e-76  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1738  acriflavin resistance protein  24.91 
 
 		 1031 aa  289  2e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0173564  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1006  acriflavin resistance plasma membrane protein  23.08 
 
 		 1040 aa  288  4e-76  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.236802  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2392  acriflavin resistance protein  25.78 
 
 		 1028 aa  288  4e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.430925  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0880  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  23.97 
 
 		 1068 aa  288  4e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.288102  normal  0.231109 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0894  acriflavin resistance protein  25.1 
 
 		 1060 aa  288  5e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0965  AcrB/AcrD/AcrF family protein  25.28 
 
 		 1024 aa  285  3.0000000000000004e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00708155  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01735  RND family efflux transporter  25.86 
 
 		 1035 aa  285  3.0000000000000004e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1675  acriflavin resistance protein  23.5 
 
 		 1034 aa  285  3.0000000000000004e-75  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.640028  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0971  NolG efflux transporter  24.13 
 
 		 1036 aa  285  4.0000000000000003e-75  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2480  acriflavin resistance protein  25.57 
 
 		 1028 aa  283  9e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0427  acriflavin resistance protein  25.2 
 
 		 1039 aa  283  1e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.513566  normal  0.0142489 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2232  acriflavin resistance protein  26.28 
 
 		 1069 aa  283  1e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.977365 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1842  acriflavin resistance protein  23.2 
 
 		 1058 aa  283  2e-74  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.844387  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2131  AcrB/AcrD/AcrF family protein  23.76 
 
 		 1024 aa  281  4e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0608  acriflavin resistance protein  23.86 
 
 		 1059 aa  281  6e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0300308  normal  0.48397 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1579  acriflavin resistance protein  23.58 
 
 		 1046 aa  280  1e-73  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01699  RND family efflux transporter  25.19 
 
 		 1038 aa  278  5e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5161  acriflavin resistance protein  25.29 
 
 		 1050 aa  276  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.938326  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0754  transporter, AcrB/AcrD/AcrF family  24.36 
 
 		 1014 aa  276  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.156404  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1667  acriflavin resistance protein  25.07 
 
 		 1037 aa  276  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.29656  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1037  acriflavin resistance protein  25.35 
 
 		 1036 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1268  acriflavin resistance protein  23.69 
 
 		 1058 aa  276  2.0000000000000002e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0948  acriflavin resistance protein  26.04 
 
 		 1015 aa  275  3e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6179  acriflavin resistance protein  24.46 
 
 		 1065 aa  271  4e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2544  acriflavin resistance protein  24.91 
 
 		 1087 aa  271  5e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0694393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2033  acriflavin resistance protein  25.55 
 
 		 1044 aa  271  5e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1121  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  25.6 
 
 		 1044 aa  271  5.9999999999999995e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0175  acriflavin resistance protein  24.6 
 
 		 1046 aa  271  7e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.481543 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3708  acriflavin resistance protein  23.84 
 
 		 1063 aa  271  7e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3825  acriflavin resistance protein  25.81 
 
 		 1036 aa  270  8.999999999999999e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01076  AcrB/AcrD/AcrF family protein  24.01 
 
 		 1122 aa  270  8.999999999999999e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0629  acriflavin resistance protein  24.49 
 
 		 1014 aa  270  1e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1892  acriflavin resistance protein  24.78 
 
 		 1031 aa  270  1e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0606  acriflavin resistance protein  24.25 
 
 		 1014 aa  270  1e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0459502  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1338  acriflavin resistance protein  25.14 
 
 		 1044 aa  269  2e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1667  acriflavin resistance protein  23.93 
 
 		 1095 aa  269  2e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1029  acriflavin resistance protein  23.83 
 
 		 1034 aa  269  2e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.2741  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>