More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_2405 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_0104  acriflavin resistance protein  52.58 
 
 		 1056 aa  1066    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4429  acriflavin resistance protein  53.31 
 
 		 1059 aa  1068    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2381  acriflavin resistance protein D  36.84 
 
 		 1092 aa  646    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.422424  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0111  acriflavin resistance protein  53.51 
 
 		 1059 aa  1051    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2405  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1051 aa  2106    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4289  acriflavin resistance protein  53.17 
 
 		 1055 aa  1068    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0835  acriflavin resistance protein  36.59 
 
 		 1042 aa  601  1e-170  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.181435  normal  0.546259 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6349  acriflavin resistance protein  34.75 
 
 		 1064 aa  594  1e-168  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.945315 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0917  acriflavin resistance protein  38.05 
 
 		 1054 aa  575  1.0000000000000001e-162  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1961  AcrB/AcrD/AcrF family protein  31.86 
 
 		 1038 aa  511  1e-143  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4375  acriflavin resistance protein  30.36 
 
 		 1038 aa  496  1e-139  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000150121  normal  0.679218 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0044  acriflavin resistance protein  31.13 
 
 		 1036 aa  490  1e-137  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0140  acriflavin resistance protein  30.87 
 
 		 1026 aa  486  1e-136  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4767  acriflavin resistance protein  30.02 
 
 		 1037 aa  478  1e-133  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.300742  unclonable  0.0000000523741 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1475  acriflavin resistance protein  33.49 
 
 		 1027 aa  476  1e-132  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.521845  normal  0.0685081 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3672  acriflavin resistance protein  33.64 
 
 		 1061 aa  471  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3726  acriflavin resistance protein  33.64 
 
 		 1061 aa  471  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.226552 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3430  acriflavin resistance protein  31.37 
 
 		 1037 aa  451  1e-125  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2667  AcrB/AcrD/AcrF family protein  29.52 
 
 		 1035 aa  448  1.0000000000000001e-124  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  26.34 
 
 		 1011 aa  367  1e-100  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  27.63 
 
 		 1050 aa  363  6e-99  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2094  acriflavin resistance protein  26.31 
 
 		 1037 aa  335  2e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01735  RND family efflux transporter  26.81 
 
 		 1035 aa  334  5e-90  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1942  acriflavin resistance protein  25.52 
 
 		 1040 aa  334  6e-90  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.211904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3737  acriflavin resistance protein  28.61 
 
 		 1014 aa  333  1e-89  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1876  acriflavin resistance protein  28.74 
 
 		 1017 aa  332  2e-89  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1350  acriflavin resistance protein  27.04 
 
 		 1024 aa  330  1.0000000000000001e-88  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0568344 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01445  hypothetical protein  26.16 
 
 		 1037 aa  330  1.0000000000000001e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1637  acriflavin resistance protein  26.54 
 
 		 1173 aa  329  1.0000000000000001e-88  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1738  acriflavin resistance protein  28.5 
 
 		 1038 aa  328  3e-88  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0880  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  25.39 
 
 		 1068 aa  328  4.0000000000000003e-88  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.288102  normal  0.231109 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0175  acriflavin resistance protein  26.27 
 
 		 1046 aa  327  5e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.481543 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004021  RND multidrug efflux transporter  27.12 
 
 		 1037 aa  327  5e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0276647  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2427  acriflavin resistance protein  26.5 
 
 		 1031 aa  327  7e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000387519 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2815  acriflavin resistance protein  27.26 
 
 		 1051 aa  327  8.000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.874616  normal  0.995091 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2180  acriflavin resistance protein  25.95 
 
 		 1030 aa  326  1e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000146343  normal  0.137669 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  25.61 
 
 		 1043 aa  326  1e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1882  AcrB/AcrD/AcrF family protein  25.4 
 
 		 1031 aa  325  2e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1029  acriflavin resistance protein  25.59 
 
 		 1034 aa  325  3e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.2741  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2950  acriflavin resistance protein  25.85 
 
 		 1044 aa  324  5e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1983  acriflavin resistance protein  26.66 
 
 		 1034 aa  324  6e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000463224  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1732  acriflavin resistance protein  28.71 
 
 		 1027 aa  322  1.9999999999999998e-86  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2549  acriflavin resistance protein  25.73 
 
 		 1031 aa  322  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0932297  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2556  acriflavin resistance protein  26.57 
 
 		 1051 aa  322  3e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2337  acriflavin resistance protein  25.1 
 
 		 1031 aa  321  5e-86  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0120926  hitchhiker  0.000298899 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1659  acriflavin resistance protein  25.21 
 
 		 1031 aa  321  5e-86  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.178159  normal  0.998047 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2409  acriflavin resistance protein  25 
 
 		 1031 aa  320  7.999999999999999e-86  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.677885  normal  0.0307662 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2664  acriflavin resistance protein  25.64 
 
 		 1031 aa  320  9e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.192826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1037  acriflavin resistance protein  26.27 
 
 		 1036 aa  320  9e-86  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1797  acriflavin resistance protein  25.64 
 
 		 1031 aa  320  1e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0223723  hitchhiker  0.000000350495 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3888  acriflavin resistance protein  25.73 
 
 		 1048 aa  319  2e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.471381  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2587  acriflavin resistance protein  25.64 
 
 		 1031 aa  319  2e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000412735  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1907  acriflavin resistance protein  24.63 
 
 		 1038 aa  318  2e-85  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1705  acriflavin resistance protein  25 
 
 		 1031 aa  318  3e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0236776  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0540  AcrB/AcrD/AcrF family protein  26.37 
 
 		 1049 aa  318  4e-85  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0902  acriflavin resistance protein  26.36 
 
 		 1029 aa  318  5e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.621432  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2523  acriflavin resistance protein  27.7 
 
 		 1026 aa  316  1.9999999999999998e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.199891 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1905  AcrB/AcrD/AcrF family protein  26.02 
 
 		 1034 aa  316  1.9999999999999998e-84  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.209576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1178  acriflavin resistance protein  26.56 
 
 		 1042 aa  315  3.9999999999999997e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0439  putative multidrug resistance protein  26.97 
 
 		 1036 aa  315  3.9999999999999997e-84  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00223634  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01699  RND family efflux transporter  27.35 
 
 		 1038 aa  313  9e-84  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1155  acriflavin resistance protein  25.69 
 
 		 1036 aa  313  1e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00884759  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1579  acriflavin resistance protein  24.36 
 
 		 1046 aa  312  2.9999999999999997e-83  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1267  acriflavin resistance protein  26.79 
 
 		 1035 aa  311  5e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0368024  hitchhiker  0.0000615461 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3179  acriflavin resistance protein  27.18 
 
 		 1023 aa  311  5e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000434633  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1989  acriflavin resistance protein  26.96 
 
 		 1031 aa  311  5.9999999999999995e-83  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0473  acriflavin resistance protein  26.21 
 
 		 1033 aa  311  5.9999999999999995e-83  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.239628  normal  0.228728 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1852  acriflavin resistance protein  25.05 
 
 		 1042 aa  310  9e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0174296  hitchhiker  0.000605557 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2131  AcrB/AcrD/AcrF family protein  25.57 
 
 		 1024 aa  308  4.0000000000000004e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1439  acriflavin resistance protein  25.75 
 
 		 1035 aa  308  4.0000000000000004e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.100841  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2796  acriflavin resistance protein  26.82 
 
 		 1040 aa  308  4.0000000000000004e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1215  acriflavin resistance protein  25.96 
 
 		 1092 aa  307  7e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.735499  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1738  acriflavin resistance protein  25.62 
 
 		 1031 aa  307  9.000000000000001e-82  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0173564  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1366  acriflavin resistance protein  25.72 
 
 		 1035 aa  306  1.0000000000000001e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0602713  hitchhiker  0.00132005 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2033  acriflavin resistance protein  26.44 
 
 		 1044 aa  305  2.0000000000000002e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2321  acriflavin resistance protein  27.15 
 
 		 1052 aa  305  4.0000000000000003e-81  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0273304 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  24.34 
 
 		 1044 aa  305  4.0000000000000003e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1146  acriflavine resistance protein  23.83 
 
 		 1026 aa  304  5.000000000000001e-81  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.199335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2658  multidrug efflux membrane fusion protein  23.47 
 
 		 1030 aa  303  9e-81  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1892  acriflavin resistance protein  26.78 
 
 		 1031 aa  303  1e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  23.71 
 
 		 1034 aa  303  1e-80  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1496  acriflavin resistance protein  26.51 
 
 		 1025 aa  301  3e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.431205 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1937  acriflavin resistance protein  25.92 
 
 		 1034 aa  301  3e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.256217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2359  acriflavin resistance protein  27.15 
 
 		 1028 aa  300  1e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.995142  normal  0.101465 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0039  acriflavin resistance protein  26.31 
 
 		 1060 aa  300  1e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0948  acriflavin resistance protein  25.26 
 
 		 1015 aa  300  1e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1187  acriflavin resistance protein  26.21 
 
 		 1036 aa  300  1e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.359485  normal  0.0265423 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3889  acriflavin resistance protein  26.43 
 
 		 1018 aa  300  1e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0552128  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3484  AcrB/AcrD/AcrF family protein  26.77 
 
 		 1046 aa  299  2e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01921  acriflavin resistance protein  26.67 
 
 		 1041 aa  299  2e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.413816  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1149  acriflavin resistance protein  26.6 
 
 		 1051 aa  299  2e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.460529  normal  0.362909 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1025  acriflavin resistance protein  24.79 
 
 		 1050 aa  298  3e-79  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2503  acriflavin resistance protein  24.36 
 
 		 1016 aa  298  3e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000075994  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3171  acriflavin resistance protein  26.67 
 
 		 1047 aa  298  3e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0148776  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3314  acriflavin resistance protein  26.57 
 
 		 1047 aa  298  3e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.378933 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1200  acriflavin resistance protein  26.48 
 
 		 1047 aa  298  4e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.994972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2803  RND family multidrug/cation transporter  26.52 
 
 		 1025 aa  298  4e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3170  acriflavin resistance protein  26.57 
 
 		 1047 aa  298  4e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.130532  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1006  acriflavin resistance plasma membrane protein  24.29 
 
 		 1040 aa  297  7e-79  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.236802  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2787  acriflavin resistance protein  26.29 
 
 		 1046 aa  297  9e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000304862  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>