146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_0363 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_0363  ERCC4 domain-containing protein  100 
 
 		 212 aa  435  1e-121  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0376  ERCC4 domain-containing protein  100 
 
 		 212 aa  435  1e-121  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.264016 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0365  ERCC4 domain-containing protein  95.28 
 
 		 212 aa  413  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3619  ERCC4 domain-containing protein  85.78 
 
 		 212 aa  368  1e-101  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0374  ERCC4 domain-containing protein  70.48 
 
 		 212 aa  302  3.0000000000000004e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000467735 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0291  ERCC4  72.48 
 
 		 170 aa  226  2e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.148147  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2438  ERCC4 domain-containing protein  39.51 
 
 		 234 aa  126  3e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.41003  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0228  Hef nuclease  39.58 
 
 		 749 aa  123  2e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1278  Hef nuclease  39.01 
 
 		 751 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.000986407  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0640  Hef nuclease  39.01 
 
 		 749 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0761737  hitchhiker  0.00497307 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0183  Hef nuclease  37.91 
 
 		 749 aa  108  8.000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.818144  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2546  Hef nuclease  33.5 
 
 		 836 aa  105  4e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.647176 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1103  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.28 
 
 		 756 aa  105  4e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.000000000146119  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1208  Hef nuclease  37.04 
 
 		 938 aa  105  7e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.599416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0706  Hef nuclease  37.36 
 
 		 776 aa  104  1e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.619505  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0131  Hef nuclease  35.41 
 
 		 808 aa  102  4e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00335055  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1486  Hef nuclease  32.86 
 
 		 833 aa  99.8  2e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5061  ERCC4  34.27 
 
 		 217 aa  99.4  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3723  ERCC4 domain protein  32.86 
 
 		 820 aa  99  4e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0800  Hef nuclease  33.33 
 
 		 851 aa  99.4  4e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.48491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1418  Hef nuclease  30.88 
 
 		 751 aa  98.6  5e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1060  Hef nuclease  36.36 
 
 		 754 aa  96.3  3e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.345165 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1708  Hef nuclease  35.65 
 
 		 750 aa  96.3  3e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1980  helicase domain protein  31.46 
 
 		 829 aa  95.5  5e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0437  ERCC4 domain-containing protein  33.98 
 
 		 228 aa  95.5  5e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000467796 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0813  Hef nuclease  32.85 
 
 		 745 aa  94  1e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0382801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1157  Hef nuclease  33.98 
 
 		 763 aa  92.8  3e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.931783 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0920  Hef nuclease  32.8 
 
 		 769 aa  91.7  8e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1786  ERCC4 domain protein  30.95 
 
 		 233 aa  91.3  1e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0169345  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0296  helicase-associated endonuclease for fork-structured DNA  29.95 
 
 		 216 aa  90.5  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0942206 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0877  ERCC4 domain-containing protein  28.84 
 
 		 246 aa  84.7  8e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1024  ERCC4 domain protein  29.44 
 
 		 215 aa  83.2  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0083  ERCC4 domain-containing protein  30.63 
 
 		 230 aa  80.5  0.00000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.131653  hitchhiker  0.0000430873 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2814  ERCC4 domain protein  28.97 
 
 		 220 aa  78.6  0.00000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0400  ERCC4 domain protein  31.39 
 
 		 221 aa  76.6  0.0000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1707  ERCC4 domain-containing protein  32.18 
 
 		 215 aa  75.1  0.0000000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0341786 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0726  ERCC4 domain-containing protein  26.82 
 
 		 219 aa  70.9  0.00000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0290  nuclease  71.43 
 
 		 51 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.179128  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0629  ERCC4 domain-containing protein  29.71 
 
 		 214 aa  69.3  0.00000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0772  ERCC4 domain-containing protein  25.86 
 
 		 216 aa  63.5  0.000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1706  ERCC4 domain-containing protein  30.07 
 
 		 211 aa  60.8  0.00000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09641  excinuclease ABC subunit C  24.58 
 
 		 644 aa  53.5  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5189  ERCC4 domain-containing protein  31.15 
 
 		 325 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2053  excinuclease ABC subunit C  33.77 
 
 		 612 aa  52.4  0.000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.747011 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2758  ERCC4 domain protein  26.04 
 
 		 343 aa  51.2  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.863848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5359  cyclic nucleotide-binding protein  30.94 
 
 		 321 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0905  hypothetical protein  29.06 
 
 		 158 aa  50.1  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0333285  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2133  excinuclease ABC subunit C  33.8 
 
 		 604 aa  49.3  0.00004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00985622  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0205  excinuclease ABC subunit C  35.21 
 
 		 614 aa  49.3  0.00004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0351181  normal  0.308964 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0256  excinuclease ABC subunit C  36.99 
 
 		 613 aa  49.3  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30660  excinuclease ABC subunit C  33.77 
 
 		 608 aa  48.5  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.385406  hitchhiker  0.0074174 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2614  excinuclease ABC subunit C  33.77 
 
 		 608 aa  48.5  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.137181  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09791  excinuclease ABC subunit C  34.72 
 
 		 652 aa  47.8  0.0001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09771  excinuclease ABC subunit C  34.72 
 
 		 652 aa  47.8  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2038  excinuclease ABC subunit C  32.39 
 
 		 603 aa  47  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.331579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15160  Excinuclease ABC subunit C  35.71 
 
 		 650 aa  47.4  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0022  excinuclease ABC subunit C  29.87 
 
 		 613 aa  47  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1783  excinuclease ABC subunit C  33.8 
 
 		 610 aa  46.6  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0533171  hitchhiker  0.000000162173 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0086  hypothetical protein  27.55 
 
 		 177 aa  46.6  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.176439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1640  excinuclease ABC subunit C  33.8 
 
 		 609 aa  46.6  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00105988  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2599  excinuclease ABC subunit C  33.8 
 
 		 609 aa  46.6  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00115318  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0581  excinuclease ABC subunit C  43.28 
 
 		 687 aa  46.6  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.9728  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2676  excinuclease ABC subunit C  33.8 
 
 		 609 aa  46.6  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00512611  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11300  excinuclease ABC subunit C  29.55 
 
 		 643 aa  45.8  0.0004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.222126  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1861  excinuclease ABC subunit C  33.8 
 
 		 609 aa  45.8  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0701  excinuclease ABC subunit C  32.47 
 
 		 598 aa  45.8  0.0005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.233077 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1548  excinuclease ABC subunit C  33.8 
 
 		 609 aa  45.8  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000704584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1615  excinuclease ABC subunit C  33.8 
 
 		 609 aa  45.8  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000543557  normal  0.3636 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1609  excinuclease ABC subunit C  33.8 
 
 		 609 aa  45.8  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000167064  normal  0.0818954 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0160  DNA ligase, NAD-dependent  40.68 
 
 		 775 aa  45.8  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1598  excinuclease ABC, C subunit  31.51 
 
 		 607 aa  45.8  0.0005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.735187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0918  excinuclease ABC subunit C  33.33 
 
 		 652 aa  45.4  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.312337  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2725  excinuclease ABC subunit C  37.93 
 
 		 592 aa  45.4  0.0007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1975  excinuclease ABC subunit C  33.75 
 
 		 653 aa  45.1  0.0008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1825  excinuclease ABC subunit C  35.21 
 
 		 609 aa  45.1  0.0008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.088783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2648  excinuclease ABC subunit C  35.21 
 
 		 610 aa  45.1  0.0009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.473447  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1252  excinuclease ABC, C subunit  28.57 
 
 		 647 aa  44.7  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1362  excinuclease ABC subunit C  31.51 
 
 		 611 aa  44.3  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.884945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0772  excinuclease ABC subunit C  29.59 
 
 		 633 aa  44.7  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00962744  normal  0.347624 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2078  excinuclease ABC, C subunit  40.38 
 
 		 604 aa  44.3  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1608  excinuclease ABC subunit C  32.39 
 
 		 606 aa  44.7  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00130294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0938  excinuclease ABC, C subunit  32.88 
 
 		 644 aa  44.7  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2561  excinuclease ABC subunit C  32.39 
 
 		 609 aa  44.7  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00257936  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2796  excinuclease ABC, C subunit  30.12 
 
 		 679 aa  44.3  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000172579  decreased coverage  0.00000392618 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1217  DNA ligase, NAD-dependent  38.98 
 
 		 711 aa  44.3  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.554816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20070  Excinuclease ABC subunit C  32.39 
 
 		 703 aa  44.3  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0431256  normal  0.99262 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2013  excinuclease ABC subunit C  32.39 
 
 		 614 aa  43.9  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.117598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1014  excinuclease ABC subunit C  43.4 
 
 		 700 aa  43.5  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00594805  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1403  excinuclease ABC subunit C  27.66 
 
 		 614 aa  43.5  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.252536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2316  excinuclease ABC subunit C  32.39 
 
 		 645 aa  43.9  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.682688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1109  DNA ligase, NAD-dependent  37.29 
 
 		 710 aa  43.9  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.822067  normal  0.0130408 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08821  excinuclease ABC subunit C  34.33 
 
 		 647 aa  43.5  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.23805  hitchhiker  0.000233595 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1907  excinuclease ABC subunit C  31.51 
 
 		 609 aa  43.9  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.791613  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0428  excinuclease ABC subunit C  33.8 
 
 		 746 aa  43.5  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0699  excinuclease ABC subunit C  31.71 
 
 		 690 aa  43.1  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2021  excinuclease ABC subunit C  33.33 
 
 		 656 aa  43.1  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.387091  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1363  excinuclease ABC subunit C  26.67 
 
 		 661 aa  43.1  0.003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.205269  normal  0.348926 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1777  excinuclease ABC, C subunit  33.33 
 
 		 636 aa  43.1  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0413401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1437  excinuclease ABC subunit C  35.21 
 
 		 609 aa  43.5  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0535013  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2374  excinuclease ABC subunit C  29.87 
 
 		 607 aa  43.1  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.483342  normal  0.0306932 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>