More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_22340 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_22340  aminotransferase  100 
 
 		 372 aa  766    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000310554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01640  aminotransferase  79.3 
 
 		 372 aa  626  1e-178  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.278296  hitchhiker  0.0000000160919 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0155  aminotransferase class I and II  69.35 
 
 		 372 aa  543  1e-153  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1384  transaminase  59.95 
 
 		 373 aa  491  9.999999999999999e-139  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2317  transaminase  50.27 
 
 		 376 aa  414  1e-114  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1453  transaminase  51.35 
 
 		 369 aa  409  1e-113  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000422446  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4257  transaminase  39.41 
 
 		 374 aa  286  5e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2069  transaminase  37.47 
 
 		 374 aa  270  4e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0152643 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05340  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  36.6 
 
 		 377 aa  265  1e-69  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5695  transaminase  36.93 
 
 		 374 aa  264  2e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.679406 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05193  aminotransferase function, hypothetical (Eurofung)  35.71 
 
 		 409 aa  238  1e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50446  Aspartate aminotransferase (Transaminase A) (AspAT)  31.62 
 
 		 404 aa  182  9.000000000000001e-45  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.566303 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1447  aminotransferase class I and II  30.7 
 
 		 368 aa  176  4e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0268591  normal  0.142096 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2143  aminotransferase class I and II  31.87 
 
 		 356 aa  173  3.9999999999999995e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0519  aminotransferase class I and II  30.86 
 
 		 377 aa  169  6e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0549  aminotransferase  30.29 
 
 		 380 aa  166  9e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_515  aminotransferase, DapL-like protein  31.27 
 
 		 382 aa  163  5.0000000000000005e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0576  aminotransferase, classes I and II  31.36 
 
 		 383 aa  155  2e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1405  aminotransferase, class I and II  31.03 
 
 		 362 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.269129  normal  0.550876 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3451  aminotransferase class I and II  28.99 
 
 		 380 aa  151  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00028237 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1580  aminotransferase class I and II  29.09 
 
 		 382 aa  144  2e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.12368 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2228  putative aminotransferase protein  28.19 
 
 		 379 aa  141  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1475  aminotransferase  29.19 
 
 		 363 aa  135  9.999999999999999e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1417  aspartate aminotransferase  27.54 
 
 		 400 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.557805 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4902  aminotransferase class I and II  26.04 
 
 		 375 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000774086 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0212  hypothetical protein  26.65 
 
 		 362 aa  130  4.0000000000000003e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3516  aspartate aminotransferase  29.12 
 
 		 385 aa  129  8.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1257  aspartate aminotransferase  29.58 
 
 		 390 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.823666  normal  0.0561409 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1411  aminotransferase class I and II  28.43 
 
 		 393 aa  127  3e-28  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1516  aminotransferase, class I and II  27.84 
 
 		 377 aa  127  3e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1565  aminotransferase class I and II  27.84 
 
 		 377 aa  127  3e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1377  aspartate aminotransferase  28.14 
 
 		 400 aa  122  9e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.489913  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1471  aspartate aminotransferase  27.25 
 
 		 400 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.219389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1479  aminotransferase  28.06 
 
 		 397 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1458  aminotransferase  30.64 
 
 		 404 aa  120  3.9999999999999996e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01913  aspartate aminotransferase  26.65 
 
 		 395 aa  119  7e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0779024 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1904  aminotransferase, class I and II  28.76 
 
 		 392 aa  119  7.999999999999999e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1760  aspartate aminotransferase  26.65 
 
 		 402 aa  119  9e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.801832  normal  0.0251287 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4784  aspartate aminotransferase  25.6 
 
 		 387 aa  119  9e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0962  aminotransferase  25.92 
 
 		 393 aa  119  9e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.124285 
 
 
-
 
NC_003296  RS01751  putative aminotransferase protein  30.85 
 
 		 374 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.267131  normal  0.787087 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0643  aminotransferase class I and II  27.38 
 
 		 399 aa  117  3e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1201  aminotransferase AlaT  30.23 
 
 		 413 aa  117  3e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.895209  normal  0.0291272 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0346  aspartate aminotransferase  26.88 
 
 		 399 aa  117  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.550604  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0832  aspartate aminotransferase  27.49 
 
 		 384 aa  117  3.9999999999999997e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0198108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0255  aminotransferase, class I and II  25.5 
 
 		 411 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1262  aminotransferase AlaT  29.65 
 
 		 429 aa  116  6e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.30879  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01072  aminotransferase AlaT  29.91 
 
 		 406 aa  116  7.999999999999999e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0755  aspartate aminotransferase  25.98 
 
 		 395 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0770  aminotransferase, class I and II  27.67 
 
 		 397 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0102863 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2387  aminotransferase AlaT  28.78 
 
 		 414 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07311  aminotransferases class-I  25.68 
 
 		 392 aa  114  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.719619  hitchhiker  0.00557892 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3263  aminotransferase class I and II  26.8 
 
 		 382 aa  114  2.0000000000000002e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1326  aminotransferase AlaT  28.2 
 
 		 413 aa  114  3e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0763036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0762  aspartate aminotransferase  26.33 
 
 		 400 aa  114  3e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.281955 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0106  L-aspartate aminotransferase  25.68 
 
 		 392 aa  114  3e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1128  aminotransferase class I and II  27 
 
 		 397 aa  114  3e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.472609  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1734  aspartate aminotransferase  27.42 
 
 		 410 aa  113  5e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0178  aminotransferase class I and II  26.43 
 
 		 396 aa  113  6e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.840691 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1014  aspartate aminotransferase  27.54 
 
 		 400 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1495  aspartate aminotransferase  27.54 
 
 		 400 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1182  aminotransferase class-I  27 
 
 		 393 aa  111  2.0000000000000002e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2419  aminotransferase  25.08 
 
 		 396 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.181004  normal  0.0698642 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1495  aspartate aminotransferase  25.85 
 
 		 388 aa  111  2.0000000000000002e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00201329 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2331  aspartate aminotransferase  24.39 
 
 		 388 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0127  aminotransferase class I and II  28.99 
 
 		 399 aa  111  2.0000000000000002e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1088  aminotransferase class I and II  27.54 
 
 		 399 aa  111  2.0000000000000002e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.226699  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3098  aminotransferase class I and II  28.57 
 
 		 388 aa  111  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00347911  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2382  aspartate aminotransferase  24.39 
 
 		 388 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.814332 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0405  aspartate aminotransferase  25.97 
 
 		 403 aa  110  5e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.152588  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2825  aspartate aminotransferase  24.41 
 
 		 408 aa  109  6e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0842  aminotransferase AlaT  29.04 
 
 		 426 aa  109  7.000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.387526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0624  aspartate aminotransferase  23.96 
 
 		 395 aa  109  7.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.68726  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0081  aminotransferase, class I and II  25.6 
 
 		 398 aa  109  9.000000000000001e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0376  aminotransferase, class I and II  25.67 
 
 		 373 aa  108  1e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.276364  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7544  aspartate aminotransferase  26.06 
 
 		 403 aa  108  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0701  aspartate aminotransferase  27.22 
 
 		 392 aa  108  1e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3898  aminotransferase, class I and II  27.41 
 
 		 409 aa  108  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.157846 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2208  aminotransferase class I and II  25.61 
 
 		 387 aa  108  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0513  aminotransferase class I and II  27.84 
 
 		 383 aa  108  2e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00548158 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0710  aspartate aminotransferase  26.81 
 
 		 382 aa  108  2e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1911  aminotransferase AlaT  27.94 
 
 		 426 aa  108  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0707  aspartate aminotransferase  27.22 
 
 		 392 aa  108  2e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.498645  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1237  aminotransferase AlaT  28.45 
 
 		 412 aa  108  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0169651 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2127  aspartate aminotransferase  25.23 
 
 		 388 aa  107  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0973  aminotransferase class I and II  27.42 
 
 		 379 aa  107  3e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2662  aminotransferase AlaT  27.86 
 
 		 409 aa  107  3e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1121  aminotransferase class I and II  25.52 
 
 		 381 aa  107  3e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1967  aminotransferase AlaT  28.21 
 
 		 409 aa  107  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000390932  normal  0.209887 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2232  aminotransferase AlaT  28.82 
 
 		 407 aa  107  3e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0248058  hitchhiker  0.00000226565 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0546  class I/II aminotransferase  23.28 
 
 		 456 aa  107  4e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1131  aminotransferase class I and II  25.36 
 
 		 384 aa  107  4e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000220252  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1973  aminotransferase, class I and II  28.75 
 
 		 429 aa  107  4e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.238227  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1108  aminotransferase, class I and II  25.36 
 
 		 384 aa  107  4e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00053469  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0027  alanine aminotransferase  30.97 
 
 		 400 aa  107  4e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1397  aspartate aminotransferase  25.36 
 
 		 388 aa  106  5e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.991404 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2717  aminotransferase  25 
 
 		 387 aa  107  5e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00629468 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1600  aminotransferase AlaT  29.55 
 
 		 404 aa  106  5e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0619302  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0293  aspartate aminotransferase  23.64 
 
 		 390 aa  106  6e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.422454 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1170  aminotransferase class I and II  27.91 
 
 		 412 aa  106  7e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>