More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_19600 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_19600  hypothetical protein  100 
 
 		 411 aa  829    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.652812  hitchhiker  0.00117043 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1095  NLP/P60 protein  37.6 
 
 		 371 aa  192  8e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00180307  hitchhiker  0.0000000000000270751 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13280  NlpC/P60 family protein  33.57 
 
 		 371 aa  181  2e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.401944  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2136  NLP/P60 protein  46.39 
 
 		 389 aa  165  1.0000000000000001e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000118144  normal  0.895402 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19530  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  54.62 
 
 		 442 aa  136  6.0000000000000005e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000946719  hitchhiker  0.00000162886 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13270  hypothetical protein  45.27 
 
 		 389 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.265233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1506  NLP/P60 protein  44.97 
 
 		 524 aa  111  3e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.483483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18950  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  46.22 
 
 		 556 aa  107  6e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.10475 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0792  NLP/P60 protein  50 
 
 		 535 aa  103  7e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4888  cell wall endopeptidase  24.05 
 
 		 440 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0265  NlpC/P60 family protein  25.75 
 
 		 432 aa  92  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.894472  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4873  cell wall endopeptidase  24.26 
 
 		 440 aa  90.1  6e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5301  endopeptidase lytE, putative  25.43 
 
 		 513 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0385  NLP/P60 protein  40 
 
 		 360 aa  87.4  4e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5359  cell wall endopeptidase and peptidase, C40, NLP/P60 family fusion protein  24.1 
 
 		 485 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2976  PgdS peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C40  46 
 
 		 523 aa  81.3  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3731  NLP/P60 protein  24.13 
 
 		 409 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000196287  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4384  NLP/P60 protein  41.67 
 
 		 556 aa  78.6  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000240419  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0773  NLP/P60 protein  43.18 
 
 		 256 aa  77  0.0000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  25.19 
 
 		 391 aa  75.5  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4909  NLP/P60 protein  46.74 
 
 		 335 aa  75.5  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0142  NLP/P60 protein  42.55 
 
 		 370 aa  74.3  0.000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1987  NLP/P60 protein  43.01 
 
 		 271 aa  73.6  0.000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0643  cell wall-associated hydrolase  42.02 
 
 		 487 aa  73.2  0.000000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0011775  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4077  NLP/P60 protein  34.91 
 
 		 308 aa  72.8  0.000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0063374  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0274  SagA protein  41.58 
 
 		 432 aa  72  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1008  cell wall-associated hydrolase  42.16 
 
 		 197 aa  71.6  0.00000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000147737  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1679  NLP/P60 protein  41.12 
 
 		 210 aa  71.6  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1215  NLP/P60 protein  38.94 
 
 		 532 aa  70.1  0.00000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2342  Lytic transglycosylase catalytic  40.35 
 
 		 327 aa  70.1  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.920192  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6205  NLP/P60 protein  39.17 
 
 		 417 aa  68.9  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0502801 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10740  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  39.29 
 
 		 332 aa  68.6  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  44.05 
 
 		 372 aa  68.6  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2692  NLP/P60 protein  40.21 
 
 		 162 aa  68.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0971  NLP/P60 protein  39.6 
 
 		 345 aa  68.2  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.230256 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6095  NLP/P60 protein  43.82 
 
 		 366 aa  68.6  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0883  NLP/P60 protein  43.68 
 
 		 257 aa  67.8  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.201792 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2429  NLP/P60 protein  40.43 
 
 		 278 aa  68.2  0.0000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.328079 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4127  NLP/P60 protein  38.94 
 
 		 532 aa  67.8  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8562  NLP/P60 protein  45.26 
 
 		 373 aa  67.4  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0614213  hitchhiker  0.0073147 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3000  NLP/P60 protein  44.35 
 
 		 463 aa  67  0.0000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.487438  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2750  NLP/P60 protein  37.93 
 
 		 190 aa  66.2  0.0000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.841293 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2844  NLP/P60 protein  38.78 
 
 		 259 aa  65.9  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2262  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  36.7 
 
 		 388 aa  65.9  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8534  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  38.32 
 
 		 438 aa  66.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0174309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4480  NLP/P60 protein  38.61 
 
 		 340 aa  65.9  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3076  NLP/P60 protein  36.62 
 
 		 231 aa  66.2  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3124  NLP/P60 protein  40.59 
 
 		 327 aa  65.1  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0606455  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8103  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  39.45 
 
 		 393 aa  65.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1371  cell wall-associated hydrolase/invasion-associated protein  38.61 
 
 		 273 aa  64.7  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0122  NLP/P60 protein  40.96 
 
 		 264 aa  64.7  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1303  NLP/P60 protein  37.76 
 
 		 319 aa  64.3  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0103745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1655  Lytic transglycosylase catalytic  39.58 
 
 		 368 aa  64.3  0.000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30760  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  39.77 
 
 		 261 aa  63.9  0.000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.787895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1699  cell wall-associated hydrolase  36.54 
 
 		 400 aa  63.9  0.000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.26912e-16 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5004  NLP/P60 protein  40.62 
 
 		 347 aa  63.5  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.549544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1427  NLP/P60 protein  36.22 
 
 		 301 aa  63.5  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.107588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1816  NLP/P60 protein  33.96 
 
 		 330 aa  63.2  0.000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00581974  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0973  Lytic transglycosylase catalytic  40.37 
 
 		 318 aa  63.2  0.000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3453  NLP/P60 protein  35 
 
 		 394 aa  62.4  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4498  NLP/P60 protein  37.04 
 
 		 398 aa  62.8  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.0701003 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0625  NLP/P60 protein  36.08 
 
 		 466 aa  62.4  0.00000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00171515  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2747  NLP/P60 protein  26.13 
 
 		 478 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.552726  normal  0.486637 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2017  NLP/P60 protein  36.28 
 
 		 536 aa  62.8  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.474847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3235  NLP/P60 protein  39.8 
 
 		 446 aa  62.4  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.177919  hitchhiker  0.000140663 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3095  NLP/P60 protein  35.71 
 
 		 452 aa  62.8  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7119  NLP/P60 protein  35.42 
 
 		 182 aa  61.6  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1696  NLP/P60  36.09 
 
 		 302 aa  62  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.033206  normal  0.040245 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  35.05 
 
 		 265 aa  61.6  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5879  NLP/P60 protein  39.18 
 
 		 333 aa  61.6  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.884921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0805  cell wall-associated hydrolase  37.62 
 
 		 395 aa  62  0.00000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0271814  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2555  NLP/P60 protein  37.14 
 
 		 199 aa  61.6  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.916687 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1364  NLP/P60 protein  37.74 
 
 		 420 aa  61.6  0.00000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.123178  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2986  NLP/P60 protein  34.04 
 
 		 216 aa  61.6  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0120192 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2028  NLP/P60 protein  34.58 
 
 		 233 aa  62  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07830  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  41.94 
 
 		 372 aa  61.2  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4740  Peptidase M23  22.96 
 
 		 377 aa  61.2  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1050  NLP/P60 protein  42.35 
 
 		 180 aa  61.2  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.816748  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2139  NLP/P60 protein  38.61 
 
 		 374 aa  61.2  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.606148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2333  NLP/P60 protein  36.11 
 
 		 432 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.554645  normal  0.0124113 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3958  NLP/P60 protein  41.07 
 
 		 323 aa  61.6  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.068937  normal  0.125379 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0978  NLP/P60 protein  41.1 
 
 		 384 aa  60.8  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0060  NLP/P60 protein  37.14 
 
 		 337 aa  60.8  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.306663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32150  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  34.48 
 
 		 475 aa  60.8  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0191937  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2683  NLP/P60 protein  39.09 
 
 		 348 aa  60.8  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.468332  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8582  NLP/P60 protein  39.8 
 
 		 180 aa  60.8  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0901428  normal  0.349112 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1508  NLP/P60 protein  41.9 
 
 		 348 aa  60.5  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5043  endopeptidase lytE  24.08 
 
 		 436 aa  60.5  0.00000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06750  hypothetical protein  29.93 
 
 		 369 aa  60.5  0.00000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5427  endopeptidase lytE  24.08 
 
 		 436 aa  60.5  0.00000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.101585  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5283  putative cell wall endopeptidase, NlpC/P60 family  24.08 
 
 		 436 aa  60.5  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000121595 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3070  NLP/P60 protein  37.38 
 
 		 306 aa  60.1  0.00000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00281193  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4013  NLP/P60 protein  41.67 
 
 		 236 aa  60.1  0.00000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1654  hypothetical protein  31.63 
 
 		 177 aa  60.1  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3552  NLP/P60 protein  36.19 
 
 		 378 aa  59.7  0.00000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0423  NLP/P60  35.04 
 
 		 459 aa  59.3  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19170  hypothetical protein  30.89 
 
 		 198 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4866  NLP/P60 protein  39.78 
 
 		 350 aa  59.3  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2096  NLP/P60 protein  26.1 
 
 		 375 aa  58.5  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.685486  normal  0.535161 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0754  lytic transglycosylase, catalytic  41 
 
 		 291 aa  58.9  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.970703  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>