14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_06750 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_06750  hypothetical protein  100 
 
 		 369 aa  735    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2362  hypothetical protein  40.17 
 
 		 391 aa  226  4e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07340  hypothetical protein  55.36 
 
 		 390 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.471719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00270  hypothetical protein  41.46 
 
 		 246 aa  73.6  0.000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19600  hypothetical protein  30.19 
 
 		 411 aa  63.9  0.000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.652812  hitchhiker  0.00117043 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1075  hypothetical protein  32.06 
 
 		 413 aa  60.8  0.00000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.855575 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04880  hypothetical protein  28.32 
 
 		 360 aa  58.5  0.0000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2136  NLP/P60 protein  27.86 
 
 		 389 aa  57.8  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000118144  normal  0.895402 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0380  hypothetical protein  28.03 
 
 		 370 aa  53.5  0.000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.468235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2398  Peptidase M23  29.13 
 
 		 474 aa  50.4  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0487248 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13280  NlpC/P60 family protein  24.35 
 
 		 371 aa  48.5  0.0002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.401944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1120  peptidase M23B  27.38 
 
 		 398 aa  45.4  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0045  peptidase M23B  28.86 
 
 		 387 aa  45.4  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0189  M24/M37 family peptidase  23.21 
 
 		 399 aa  43.1  0.008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>