11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_04880 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_04880  hypothetical protein  100 
 
 		 360 aa  728    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0380  hypothetical protein  41.78 
 
 		 370 aa  258  1e-67  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.468235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0249  hypothetical protein  62.7 
 
 		 271 aa  180  4e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1095  NLP/P60 protein  28.06 
 
 		 371 aa  55.1  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00180307  hitchhiker  0.0000000000000270751 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06750  hypothetical protein  26.83 
 
 		 369 aa  53.9  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2362  hypothetical protein  30.53 
 
 		 391 aa  49.7  0.00008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19530  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  26.17 
 
 		 442 aa  49.3  0.00009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000946719  hitchhiker  0.00000162886 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19600  hypothetical protein  23.53 
 
 		 411 aa  47  0.0005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.652812  hitchhiker  0.00117043 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2976  PgdS peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C40  22.75 
 
 		 523 aa  44.7  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2136  NLP/P60 protein  22.67 
 
 		 389 aa  44.3  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000118144  normal  0.895402 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13280  NlpC/P60 family protein  21.74 
 
 		 371 aa  43.9  0.004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.401944  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>