13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0380 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0380  hypothetical protein  100 
 
 		 370 aa  754    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.468235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04880  hypothetical protein  41.83 
 
 		 360 aa  227  2e-58  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0249  hypothetical protein  62.4 
 
 		 271 aa  161  2e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0756  NLP/P60 protein  31.03 
 
 		 398 aa  56.6  0.0000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.640011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06750  hypothetical protein  25.67 
 
 		 369 aa  54.7  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1075  hypothetical protein  26.56 
 
 		 413 aa  52.4  0.00001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.855575 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2362  hypothetical protein  27.32 
 
 		 391 aa  52.4  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1095  NLP/P60 protein  30.34 
 
 		 371 aa  52  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00180307  hitchhiker  0.0000000000000270751 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2199  aspartate protease family protein  24.28 
 
 		 377 aa  49.3  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.312004  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13280  NlpC/P60 family protein  26.52 
 
 		 371 aa  49.3  0.0001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.401944  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1169  chromosome segregation protein SMC  21.89 
 
 		 1177 aa  45.1  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3002  Peptidase M23  24.09 
 
 		 448 aa  44.3  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00185035  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0473  Peptidase M23  24.05 
 
 		 372 aa  43.5  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>