76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_1075 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_1075  hypothetical protein  100 
 
 		 413 aa  831    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.855575 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14470  putative cell wall binding protein  44.35 
 
 		 512 aa  98.6  2e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.437968  normal  0.444931 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0756  NLP/P60 protein  30.53 
 
 		 398 aa  89.7  8e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.640011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0191  M24/M37 family peptidase  27.48 
 
 		 399 aa  85.1  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0189  M24/M37 family peptidase  27.2 
 
 		 399 aa  84.7  0.000000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3071  peptidase M23B  21.01 
 
 		 374 aa  75.9  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000167566  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1934  peptidase M23B  30.06 
 
 		 396 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000344038  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1921  Peptidase M23  27.23 
 
 		 398 aa  74.3  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000118753  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13280  NlpC/P60 family protein  23.08 
 
 		 371 aa  72  0.00000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.401944  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3187  Peptidase M23  26.33 
 
 		 432 aa  68.6  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  22.98 
 
 		 376 aa  67.8  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0286  peptidase M23B  20.48 
 
 		 374 aa  67.8  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4886  peptidase M23B  26.58 
 
 		 441 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04650  Peptidase M23B family  27.71 
 
 		 420 aa  65.1  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2994  Peptidase M23  25.56 
 
 		 397 aa  65.5  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.13009e-16 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2410  peptidase M23B  25.13 
 
 		 404 aa  64.3  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000521707  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1289  peptidase M23B  25.56 
 
 		 397 aa  64.3  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0135605  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5328  peptidase, M23/M37 family  25.32 
 
 		 440 aa  63.9  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1867  peptidase, M23/M37 family protein  23.64 
 
 		 441 aa  63.9  0.000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0957526  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0246  peptidase M23B  24.87 
 
 		 377 aa  63.5  0.000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4247  peptidase M23B  21.61 
 
 		 416 aa  63.5  0.000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.843239  normal  0.0136995 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0265  NlpC/P60 family protein  22.64 
 
 		 432 aa  63.2  0.000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.894472  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2136  NLP/P60 protein  25.77 
 
 		 389 aa  62.4  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000118144  normal  0.895402 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1854  peptidase M23B  23.59 
 
 		 394 aa  61.2  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00139977  normal  0.475417 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0274  SagA protein  22.89 
 
 		 432 aa  60.8  0.00000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1788  Peptidase M23  22.64 
 
 		 402 aa  61.2  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3731  NLP/P60 protein  21.08 
 
 		 409 aa  60.5  0.00000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000196287  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1587  peptidase, M23/M37 family protein  23.95 
 
 		 431 aa  60.1  0.00000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.454077  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4888  cell wall endopeptidase  20.92 
 
 		 440 aa  60.1  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4873  cell wall endopeptidase  20.68 
 
 		 440 aa  58.5  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0332  peptidase M23B  25.48 
 
 		 434 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19600  hypothetical protein  24.53 
 
 		 411 aa  57.4  0.0000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.652812  hitchhiker  0.00117043 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06750  hypothetical protein  30.72 
 
 		 369 aa  57.4  0.0000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1773  M23/M37 peptidase domain-containing protein  21.35 
 
 		 391 aa  57  0.0000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00471646  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5301  endopeptidase lytE, putative  22.55 
 
 		 513 aa  57  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  21.43 
 
 		 391 aa  56.6  0.0000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1437  3D domain-containing protein  21.59 
 
 		 410 aa  56.2  0.0000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00168198  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0385  NLP/P60 protein  25.51 
 
 		 360 aa  55.5  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5359  cell wall endopeptidase and peptidase, C40, NLP/P60 family fusion protein  21.63 
 
 		 485 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0380  hypothetical protein  26.56 
 
 		 370 aa  54.3  0.000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.468235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0045  peptidase M23B  23.08 
 
 		 387 aa  53.5  0.000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67790  putative membrane-bound metallopeptidase  22.17 
 
 		 428 aa  53.5  0.000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.498493  normal  0.610112 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4740  Peptidase M23  21.5 
 
 		 377 aa  53.5  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13270  hypothetical protein  26.67 
 
 		 389 aa  53.1  0.000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.265233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1243  hypothetical protein  24.69 
 
 		 410 aa  53.5  0.000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.015154  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5057  M24/M37 family peptidase  22.31 
 
 		 438 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1799  Peptidase M23  21.64 
 
 		 379 aa  52  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.935113  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2194  Peptidase M23  23.39 
 
 		 412 aa  52  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000181252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5108  peptidase M23B  22.31 
 
 		 438 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5644  putative cell wall endopeptidase, NlpC/P60 family  19.89 
 
 		 476 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000146181  decreased coverage  1.76624e-19 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0656  chromosome segregation ATPases-like protein  24.44 
 
 		 526 aa  51.2  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0611009  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4930  peptidase M23B  22.57 
 
 		 438 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1048  peptidase M23B  25 
 
 		 379 aa  51.2  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.038603  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5043  endopeptidase lytE  18.86 
 
 		 436 aa  50.8  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5427  endopeptidase lytE  18.86 
 
 		 436 aa  50.8  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.101585  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5283  putative cell wall endopeptidase, NlpC/P60 family  18.86 
 
 		 436 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000121595 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5314  putative cell wall endopeptidase, NlpC/P60 family  19.47 
 
 		 473 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00085857  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3002  Peptidase M23  23.46 
 
 		 448 aa  50.4  0.00006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00185035  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4988  NLP/P60 protein  20.94 
 
 		 448 aa  49.3  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1354  peptidase M23B  24.26 
 
 		 424 aa  49.7  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000810467  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0408  peptidase M23B  22.7 
 
 		 428 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.37343 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1674  hypothetical protein  21.89 
 
 		 388 aa  48.9  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3858  cell wall endopeptidase, family M23/M37  22.46 
 
 		 424 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000135417  hitchhiker  0.00000000000537806 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1486  cell wall endopeptidase, family M23/M37  21.74 
 
 		 421 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000596043  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0055  NLP/P60 protein  23.16 
 
 		 337 aa  47  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.275537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C65  surface antigen  23.83 
 
 		 434 aa  45.8  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0100  hypothetical protein  21.95 
 
 		 483 aa  45.8  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1152  peptidase M23B  25.95 
 
 		 414 aa  45.4  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000291008  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1816  NLP/P60 protein  27.91 
 
 		 859 aa  45.8  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2362  hypothetical protein  30.6 
 
 		 391 aa  45.1  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4365  hypothetical protein  23.08 
 
 		 433 aa  43.9  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1508  NLP/P60 protein  20.62 
 
 		 348 aa  43.5  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3167  peptidase M23B  19.89 
 
 		 366 aa  43.9  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.413148  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4084  hypothetical protein  21.88 
 
 		 433 aa  43.1  0.008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1427  NLP/P60 protein  28.27 
 
 		 301 aa  43.1  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.107588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07340  hypothetical protein  24.7 
 
 		 390 aa  43.1  0.01  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.471719  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>