295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_19530 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_19530  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  100 
 
 		 442 aa  873    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000946719  hitchhiker  0.00000162886 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1095  NLP/P60 protein  41.8 
 
 		 371 aa  130  6e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00180307  hitchhiker  0.0000000000000270751 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2136  NLP/P60 protein  39.89 
 
 		 389 aa  129  1.0000000000000001e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000118144  normal  0.895402 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19600  hypothetical protein  54.7 
 
 		 411 aa  127  4.0000000000000003e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.652812  hitchhiker  0.00117043 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13280  NlpC/P60 family protein  38.51 
 
 		 371 aa  123  6e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.401944  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0385  NLP/P60 protein  40.98 
 
 		 360 aa  117  5e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13270  hypothetical protein  39.89 
 
 		 389 aa  113  6e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.265233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1506  NLP/P60 protein  54 
 
 		 524 aa  102  1e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.483483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18950  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  49.57 
 
 		 556 aa  95.5  2e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.10475 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0792  NLP/P60 protein  48.7 
 
 		 535 aa  95.1  2e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0773  NLP/P60 protein  44.44 
 
 		 256 aa  84  0.000000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1987  NLP/P60 protein  43.12 
 
 		 271 aa  75.1  0.000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2429  NLP/P60 protein  37.27 
 
 		 278 aa  73.2  0.00000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.328079 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1132  NLP/P60 protein  37.68 
 
 		 556 aa  72.4  0.00000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000155845  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1008  cell wall-associated hydrolase  43.14 
 
 		 197 aa  72  0.00000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000147737  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1679  NLP/P60 protein  40.18 
 
 		 210 aa  72  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8562  NLP/P60 protein  43.36 
 
 		 373 aa  70.5  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0614213  hitchhiker  0.0073147 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8103  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  42.86 
 
 		 393 aa  68.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0643  cell wall-associated hydrolase  40.85 
 
 		 487 aa  68.6  0.0000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0011775  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1303  NLP/P60 protein  36.23 
 
 		 319 aa  68.2  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0103745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1699  cell wall-associated hydrolase  42.31 
 
 		 400 aa  67.8  0.0000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.26912e-16 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6095  NLP/P60 protein  42.71 
 
 		 366 aa  66.6  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2844  NLP/P60 protein  40.2 
 
 		 259 aa  66.6  0.0000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3070  NLP/P60 protein  42.72 
 
 		 306 aa  62.8  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00281193  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0883  NLP/P60 protein  39.51 
 
 		 257 aa  61.2  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.201792 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10740  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  43.56 
 
 		 332 aa  61.6  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3453  NLP/P60 protein  38.18 
 
 		 394 aa  61.2  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0980  NLP/P60 protein  40 
 
 		 230 aa  61.2  0.00000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.475517  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0173  NlpC/P60 family protein  31 
 
 		 458 aa  60.8  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000388548  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1427  NLP/P60 protein  37.62 
 
 		 301 aa  60.8  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.107588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30760  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  40 
 
 		 261 aa  60.5  0.00000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.787895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2262  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  37.38 
 
 		 388 aa  60.1  0.00000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1605  NLP/P60 protein  31.82 
 
 		 279 aa  59.3  0.0000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2976  PgdS peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C40  26.79 
 
 		 523 aa  59.3  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1816  NLP/P60 protein  36.88 
 
 		 859 aa  59.7  0.0000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32150  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  37.96 
 
 		 475 aa  59.3  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0191937  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1371  cell wall-associated hydrolase/invasion-associated protein  33.33 
 
 		 273 aa  58.5  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1658  hypothetical protein  31.82 
 
 		 287 aa  58.9  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.110646  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2593  NLP/P60 protein  36.92 
 
 		 476 aa  58.2  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1655  Lytic transglycosylase catalytic  39.05 
 
 		 368 aa  57.8  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  40.86 
 
 		 372 aa  57.8  0.0000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3095  NLP/P60 protein  36.45 
 
 		 452 aa  57  0.0000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0142  NLP/P60 protein  36.11 
 
 		 370 aa  56.6  0.0000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4740  Peptidase M23  24.38 
 
 		 377 aa  56.6  0.0000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1380  NLP/P60 protein  36.64 
 
 		 343 aa  56.6  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07830  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  41.18 
 
 		 372 aa  56.6  0.0000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2139  NLP/P60 protein  46.59 
 
 		 374 aa  55.8  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.606148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4498  NLP/P60 protein  40.38 
 
 		 398 aa  56.2  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.0701003 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0388  NLP/P60 protein  37.69 
 
 		 480 aa  55.8  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2110  NLP/P60 protein  37.19 
 
 		 491 aa  55.8  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0361918  normal  0.848147 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  40.22 
 
 		 391 aa  55.1  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0122  NLP/P60 protein  39.29 
 
 		 264 aa  55.5  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0060  NLP/P60 protein  32.12 
 
 		 337 aa  55.1  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.306663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8534  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  36.36 
 
 		 438 aa  55.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0174309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  34.38 
 
 		 265 aa  55.1  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0055  NLP/P60 protein  30.77 
 
 		 337 aa  54.7  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.275537  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3043  NLP/P60 protein  38.89 
 
 		 274 aa  53.9  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.166608  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  36.07 
 
 		 232 aa  53.9  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6205  NLP/P60 protein  36.21 
 
 		 417 aa  53.9  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0502801 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4384  NLP/P60 protein  35.43 
 
 		 556 aa  53.9  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000240419  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01906  outer membrane lipoprotein  33.62 
 
 		 221 aa  53.5  0.000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.211693  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5359  cell wall endopeptidase and peptidase, C40, NLP/P60 family fusion protein  22.07 
 
 		 485 aa  53.5  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1508  NLP/P60 protein  37.38 
 
 		 348 aa  53.5  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0978  NLP/P60 protein  40 
 
 		 384 aa  53.5  0.000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0373  NLP/P60 protein  37.38 
 
 		 208 aa  53.1  0.000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2692  NLP/P60 protein  36 
 
 		 162 aa  53.1  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2342  Lytic transglycosylase catalytic  34.97 
 
 		 327 aa  53.1  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.920192  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0973  Lytic transglycosylase catalytic  36.19 
 
 		 318 aa  52.8  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0605  PgdS peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C40  37.5 
 
 		 370 aa  52.8  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000243263  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1561  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  29.18 
 
 		 337 aa  52.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.308616  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5301  endopeptidase lytE, putative  32.84 
 
 		 513 aa  52  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3144  NLP/P60 protein  30.7 
 
 		 334 aa  52.4  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0327841  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4873  cell wall endopeptidase  32.33 
 
 		 440 aa  52.4  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5314  putative cell wall endopeptidase, NlpC/P60 family  38.32 
 
 		 473 aa  52  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00085857  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0781  NLP/P60 protein  33.61 
 
 		 260 aa  52  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.110248 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0175  cell wall endopeptidase, family M23/M37  34.55 
 
 		 1048 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.131665  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1816  NLP/P60 protein  36.27 
 
 		 330 aa  52  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00581974  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0286  peptidase M23B  24.66 
 
 		 374 aa  52.4  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7119  NLP/P60 protein  43.21 
 
 		 182 aa  52  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4965  NLP/P60 protein  35.43 
 
 		 208 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3731  NLP/P60 protein  36.04 
 
 		 409 aa  51.6  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000196287  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0613  NLP/P60 protein  44.78 
 
 		 502 aa  51.2  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.322284 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3124  NLP/P60 protein  36.45 
 
 		 327 aa  51.6  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0606455  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5763  NLP/P60 protein  37.37 
 
 		 362 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.223466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3656  NLP/P60 protein  37.4 
 
 		 469 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01625  predicted lipoprotein  25.81 
 
 		 271 aa  51.2  0.00004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.712982  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1985  NLP/P60 protein  25.81 
 
 		 271 aa  51.2  0.00004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.778309  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5092  NLP/P60 protein  35.24 
 
 		 207 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5142  NLP/P60 protein  36.45 
 
 		 208 aa  51.2  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0699781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8043  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  35.78 
 
 		 210 aa  50.8  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.433259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1974  NLP/P60 protein  25.81 
 
 		 271 aa  51.2  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00117191 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01615  hypothetical protein  25.81 
 
 		 271 aa  51.2  0.00004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.749344  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1734  NlpC/P60 family protein  25.81 
 
 		 271 aa  51.2  0.00004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.252215  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1852  NlpC/P60 family protein  25.81 
 
 		 271 aa  51.2  0.00004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000302623  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1868  NlpC/P60 family protein  25.81 
 
 		 271 aa  51.2  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000206609  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5716  NLP/P60 protein  36.64 
 
 		 469 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5292  NLP/P60 protein  36.64 
 
 		 469 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.308075  normal  0.186714 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4966  NLP/P60 protein  33.33 
 
 		 169 aa  51.2  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.774801  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1892  NLP/P60 protein  37.11 
 
 		 319 aa  50.8  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1402  NLP/P60 protein  35.25 
 
 		 175 aa  50.8  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>