248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2093 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_2093  auxin efflux carrier  100 
 
 		 308 aa  614  1e-175  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0633524 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1531  auxin efflux carrier  31.91 
 
 		 307 aa  138  1e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.767129 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0926  auxin efflux carrier  29.43 
 
 		 315 aa  122  5e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0966  auxin efflux carrier  29.1 
 
 		 313 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.842847  normal  0.0576497 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0932  auxin efflux carrier  29.1 
 
 		 313 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4289  auxin efflux carrier  29.43 
 
 		 313 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1956  permease  30.69 
 
 		 317 aa  113  3e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4170  auxin efflux carrier  27.3 
 
 		 316 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.91017  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4479  hypothetical protein  28.67 
 
 		 316 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1536  Auxin Efflux Carrier  28.9 
 
 		 315 aa  108  1e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000311444  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0831  auxin efflux carrier  27.18 
 
 		 313 aa  105  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.319812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2471  auxin efflux carrier  25.86 
 
 		 315 aa  100  4e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12580  membrane protein, Auxin Efflux Carrier family  28.28 
 
 		 313 aa  99.8  6e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1484  auxin efflux carrier  27.92 
 
 		 309 aa  99  8e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02940  Auxin Efflux Carrier  24.12 
 
 		 306 aa  97.8  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1182  auxin efflux carrier  24.32 
 
 		 316 aa  97.8  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.491116  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0404  Auxin Efflux Carrier  29.45 
 
 		 313 aa  95.9  8e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.989352  normal  0.549528 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2151  Auxin Efflux Carrier  30.95 
 
 		 302 aa  91.3  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0360  auxin efflux carrier  28.48 
 
 		 311 aa  89.7  5e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.335711  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2873  auxin efflux carrier  26.16 
 
 		 318 aa  89.4  7e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.393378  normal  0.0178409 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0872  auxin efflux carrier  28.01 
 
 		 308 aa  89.4  7e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1654  auxin efflux carrier  26.56 
 
 		 318 aa  89  9e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000818504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0985  membrane transport protein, putative auxin efflux carrier  27.15 
 
 		 318 aa  88.2  1e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.34086  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1729  auxin efflux carrier  26.56 
 
 		 318 aa  88.6  1e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000582172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1759  hypothetical protein  26.56 
 
 		 318 aa  89  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00915167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3912  Auxin Efflux Carrier  24.21 
 
 		 302 aa  87.8  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2221  auxin efflux carrier  26.56 
 
 		 318 aa  87.8  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000697769  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0849  auxin efflux carrier  25.17 
 
 		 313 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.589934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0537  auxin efflux carrier  27.34 
 
 		 313 aa  86.3  6e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2459  auxin efflux carrier  26.14 
 
 		 318 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000221957  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4791  auxin efflux carrier  25.88 
 
 		 302 aa  85.5  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.309639  normal  0.321284 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1263  Auxin Efflux Carrier  27.97 
 
 		 319 aa  85.1  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.508295  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2579  auxin efflux carrier  26.54 
 
 		 318 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000223779  normal  0.0899714 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1885  Auxin Efflux Carrier  26.21 
 
 		 318 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000274794  hitchhiker  0.00457022 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2620  hypothetical protein  26.23 
 
 		 318 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2466  auxin efflux carrier  26.14 
 
 		 318 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000408156  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1750  Auxin Efflux Carrier  24.59 
 
 		 297 aa  84  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.614347  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3124  auxin efflux carrier  30.63 
 
 		 309 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.757065  hitchhiker  0.00154101 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3009  Auxin Efflux Carrier  25.91 
 
 		 319 aa  80.1  0.00000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0840632  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0886  auxin efflux carrier  23.36 
 
 		 316 aa  79.7  0.00000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.41857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0009  auxin efflux carrier  29.44 
 
 		 315 aa  79  0.0000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000222862 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0153  Auxin Efflux Carrier  27.99 
 
 		 316 aa  78.6  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0051  auxin efflux carrier  27.51 
 
 		 313 aa  77.8  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0109  hypothetical protein  27.69 
 
 		 330 aa  78.2  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0308  Auxin Efflux Carrier  22.65 
 
 		 305 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000511331  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0613  Auxin Efflux Carrier  25.75 
 
 		 302 aa  77.4  0.0000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0289  Auxin Efflux Carrier  23.47 
 
 		 305 aa  77  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0732  permease  26.86 
 
 		 319 aa  76.6  0.0000000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6839  Auxin Efflux Carrier  25.69 
 
 		 309 aa  76.6  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0109  auxin efflux carrier  27.54 
 
 		 311 aa  75.5  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003892  transporter  25.59 
 
 		 318 aa  75.1  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72140  hypothetical protein  24.75 
 
 		 314 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.58281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6264  hypothetical protein  24.92 
 
 		 304 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0121  auxin efflux carrier  25.08 
 
 		 305 aa  74.3  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4150  putative malonate transporter  25.16 
 
 		 317 aa  74.7  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.172625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0851  AEC family transporter  28.57 
 
 		 309 aa  73.9  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0399976  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2559  auxin efflux carrier  26.35 
 
 		 309 aa  74.3  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.324352 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2510  auxin efflux carrier  28.57 
 
 		 309 aa  73.9  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.894975 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1207  permease  27.63 
 
 		 310 aa  73.6  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2844  auxin efflux carrier  26.27 
 
 		 317 aa  73.2  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3242  Auxin Efflux Carrier  25.99 
 
 		 301 aa  72.8  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1694  Auxin Efflux Carrier  26.87 
 
 		 303 aa  72.8  0.000000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1893  auxin efflux carrier  26.54 
 
 		 302 aa  72.8  0.000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.288901  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1095  hypothetical protein  21.99 
 
 		 310 aa  72.4  0.000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.384627 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1422  auxin efflux carrier  24.35 
 
 		 320 aa  72.4  0.000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0882088  normal  0.0189888 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0128  permease  24.23 
 
 		 315 aa  71.6  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4440  auxin efflux carrier  26.06 
 
 		 301 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3182  auxin efflux carrier  28.71 
 
 		 308 aa  70.5  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4040  Auxin Efflux Carrier  27.66 
 
 		 318 aa  70.9  0.00000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2484  auxin efflux carrier  22.98 
 
 		 305 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0808073 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3450  auxin efflux carrier  26.09 
 
 		 307 aa  70.1  0.00000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.476606 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3424  auxin efflux carrier  25.74 
 
 		 314 aa  70.1  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1828  Auxin Efflux Carrier  25.32 
 
 		 320 aa  69.7  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.255201  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0130  Auxin Efflux Carrier  28.2 
 
 		 318 aa  69.3  0.00000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0122  Auxin Efflux Carrier  28.76 
 
 		 318 aa  69.3  0.00000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0523  auxin efflux carrier  24.31 
 
 		 350 aa  69.3  0.00000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0807881  hitchhiker  0.00301444 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5865  Auxin Efflux Carrier  25.72 
 
 		 306 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01768  hypothetical protein  24.42 
 
 		 318 aa  68.2  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1694  auxin efflux carrier  25.43 
 
 		 339 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.598022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2042  auxin efflux carrier  24.13 
 
 		 313 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00987949  normal  0.16087 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4559  auxin efflux carrier  22.88 
 
 		 372 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.418234  normal  0.987668 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3856  Auxin Efflux Carrier  26.62 
 
 		 318 aa  67.4  0.0000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2840  auxin efflux carrier  25.48 
 
 		 304 aa  67.8  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2164  auxin efflux carrier  25.85 
 
 		 321 aa  67.4  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.232164  normal  0.102668 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2945  Auxin Efflux Carrier  26.13 
 
 		 318 aa  67  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2139  auxin efflux carrier  25.4 
 
 		 294 aa  66.6  0.0000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.207426  normal  0.170483 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2628  auxin efflux carrier  26.13 
 
 		 340 aa  66.2  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.926353  decreased coverage  0.0000380487 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1027  putative permease  24.03 
 
 		 306 aa  66.6  0.0000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000190415  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1673  auxin efflux carrier  25.3 
 
 		 321 aa  66.2  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.719295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4049  auxin efflux carrier  25.43 
 
 		 336 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4317  auxin efflux carrier  25.43 
 
 		 336 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0671  auxin efflux carrier  26.86 
 
 		 299 aa  65.9  0.0000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.181249 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0581  auxin efflux carrier  27.21 
 
 		 312 aa  65.5  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2360  auxin efflux carrier  24.22 
 
 		 305 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.630214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1641  Auxin Efflux Carrier  24.84 
 
 		 320 aa  65.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.206131  normal  0.299432 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0152  Auxin Efflux Carrier  26.18 
 
 		 311 aa  64.7  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.357013  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0241  malonate transporter  24.75 
 
 		 314 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2040  Auxin Efflux Carrier  25.58 
 
 		 291 aa  64.7  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0068  Auxin Efflux Carrier  27.6 
 
 		 302 aa  63.9  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.723406  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4206  auxin efflux carrier  25.09 
 
 		 310 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.220524 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>