More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2383 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_1828  acriflavin resistance protein  74.68 
 
 		 1025 aa  1597    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0227595  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1923  AcrB/AcrD/AcrF family protein  76.57 
 
 		 1020 aa  1636    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2516  acriflavin resistance protein  77.35 
 
 		 1015 aa  1602    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.560727  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2523  acriflavin resistance protein  77.35 
 
 		 1015 aa  1602    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1828  acriflavin resistance protein  77.35 
 
 		 1015 aa  1602    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.575203 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1779  acriflavin resistance protein  75.76 
 
 		 1025 aa  1617    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2636  acriflavin resistance protein  77.16 
 
 		 1015 aa  1598    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2194  acriflavin resistance protein  80.63 
 
 		 1030 aa  1709    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1647  acriflavin resistance protein  77.72 
 
 		 1015 aa  1655    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1638  acriflavin resistance protein  38.71 
 
 		 1026 aa  682    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.643434 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2231  acriflavin resistance protein  51.08 
 
 		 1040 aa  1016    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1627  acriflavin resistance protein  77.55 
 
 		 1018 aa  1629    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1702  acriflavin resistance protein  77.45 
 
 		 1018 aa  1626    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2822  acriflavin resistance protein  74.61 
 
 		 1027 aa  1612    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000227615  normal  0.366957 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2383  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1021 aa  2080    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1702  acriflavin resistance protein  77.55 
 
 		 1018 aa  1609    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2277  acriflavin resistance protein  77.06 
 
 		 1015 aa  1642    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1419  AcrB/AcrD/AcrF family protein  73.53 
 
 		 1019 aa  1559    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.446935 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01075  AcrB/AcrD/AcrF family protein  51.39 
 
 		 1026 aa  1015    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00322  RND superfamily protein  36.09 
 
 		 823 aa  498  1e-139  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  30.98 
 
 		 1011 aa  429  1e-119  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2528  acriflavin resistance protein  28.68 
 
 		 1053 aa  406  1.0000000000000001e-112  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.263443  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1579  acriflavin resistance protein  27.33 
 
 		 1046 aa  394  1e-108  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  27.51 
 
 		 1043 aa  393  1e-108  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  28.95 
 
 		 1044 aa  395  1e-108  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  29.28 
 
 		 1050 aa  390  1e-107  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1350  acriflavin resistance protein  30.03 
 
 		 1024 aa  381  1e-104  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0568344 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1876  acriflavin resistance protein  28.54 
 
 		 1017 aa  380  1e-104  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1907  acriflavin resistance protein  26.38 
 
 		 1038 aa  374  1e-102  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0979  acriflavin resistance protein  28.14 
 
 		 1009 aa  373  1e-101  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.650548  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0165  acriflavin resistance protein  27.53 
 
 		 1032 aa  363  7.0000000000000005e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0030  acriflavin resistance protein  28.24 
 
 		 1027 aa  362  1e-98  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0439457  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  28.42 
 
 		 1034 aa  361  3e-98  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1842  acriflavin resistance protein  26.32 
 
 		 1058 aa  361  4e-98  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.844387  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  27.77 
 
 		 1038 aa  359  9.999999999999999e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1937  acriflavin resistance protein  27.29 
 
 		 1034 aa  358  3.9999999999999996e-97  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.256217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1383  acriflavin resistance protein  28.22 
 
 		 1022 aa  355  2.9999999999999997e-96  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0971  NolG efflux transporter  27.54 
 
 		 1036 aa  353  8.999999999999999e-96  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1675  acriflavin resistance protein  27.03 
 
 		 1034 aa  352  3e-95  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.640028  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3179  acriflavin resistance protein  27.21 
 
 		 1023 aa  350  8e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000434633  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2950  acriflavin resistance protein  27.04 
 
 		 1044 aa  350  8e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0752  acriflavin resistance protein  26.48 
 
 		 1071 aa  346  1e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0815  acriflavin resistance protein  26.8 
 
 		 1036 aa  344  5e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0763  acriflavin resistance protein  27.72 
 
 		 1039 aa  344  5.999999999999999e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2827  acriflavin resistance protein  28.39 
 
 		 1041 aa  343  9e-93  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2099  acriflavin resistance protein  27.98 
 
 		 1043 aa  341  4e-92  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  25.77 
 
 		 1496 aa  338  1.9999999999999998e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3296  acriflavin resistance protein  26.91 
 
 		 1006 aa  338  1.9999999999999998e-91  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0229109  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2809  cation efflux protein  26.23 
 
 		 1050 aa  338  2.9999999999999997e-91  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.354726  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1383  acriflavin resistance protein  25.92 
 
 		 1014 aa  337  9e-91  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000121579  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  26.62 
 
 		 1470 aa  336  1e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2480  acriflavin resistance protein  26.7 
 
 		 1028 aa  335  2e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3708  acriflavin resistance protein  26.04 
 
 		 1063 aa  334  5e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2518  acriflavin resistance protein  26.31 
 
 		 1041 aa  334  6e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00118511  normal  0.514323 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0608  acriflavin resistance protein  25.81 
 
 		 1059 aa  333  1e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0300308  normal  0.48397 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0641  acriflavin resistance protein  26.5 
 
 		 1041 aa  330  7e-89  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2817  acriflavin resistance protein  24.88 
 
 		 1053 aa  330  8e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1613  acriflavin resistance protein  27.08 
 
 		 1041 aa  329  2.0000000000000001e-88  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1732  acriflavin resistance protein  28.17 
 
 		 1027 aa  326  1e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2783  acriflavin resistance protein  26.82 
 
 		 1045 aa  325  2e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0544081  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4170  acriflavin resistance protein  26.91 
 
 		 1171 aa  324  5e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00460578  normal  0.0104573 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1043  nodulation protein precursor  27.16 
 
 		 1069 aa  324  6e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2664  acriflavin resistance protein  25.51 
 
 		 1039 aa  323  8e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0960  acriflavin resistance protein  27.44 
 
 		 1047 aa  323  9.999999999999999e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2392  acriflavin resistance protein  26.43 
 
 		 1028 aa  323  9.999999999999999e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.430925  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4494  acriflavin resistance protein  25.61 
 
 		 1049 aa  322  1.9999999999999998e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.45729 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0354  acriflavin resistance protein  27.48 
 
 		 1101 aa  322  1.9999999999999998e-86  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00649102  unclonable  0.0000000737583 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6213  acriflavin resistance protein  26.98 
 
 		 1055 aa  322  1.9999999999999998e-86  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1268  acriflavin resistance protein  24.66 
 
 		 1058 aa  322  3e-86  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2688  acriflavin resistance protein  27.33 
 
 		 1044 aa  322  3e-86  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.405984  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0806  acriflavin resistance protein  26.5 
 
 		 1042 aa  322  3e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.326964 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2024  acriflavin resistance protein  24.55 
 
 		 1058 aa  321  5e-86  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000109059  normal  0.508224 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3717  acriflavin resistance protein  25.14 
 
 		 1055 aa  321  6e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.530646  normal  0.0294121 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4303  acriflavin resistance protein  27.31 
 
 		 1177 aa  320  7e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.763591  normal  0.628382 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1183  acriflavin resistance protein  26.53 
 
 		 1038 aa  320  1e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.317348  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3171  acriflavin resistance protein  27.22 
 
 		 1074 aa  317  9e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1622  hitchhiker  0.0000000446015 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0527  acriflavin resistance protein  27.05 
 
 		 1067 aa  315  1.9999999999999998e-84  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.64955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4164  acriflavin resistance protein  26.15 
 
 		 1040 aa  315  1.9999999999999998e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0666932  normal  0.648782 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0948  acriflavin resistance protein  25.95 
 
 		 1015 aa  315  1.9999999999999998e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0160  acriflavin resistance protein  26.83 
 
 		 1033 aa  315  1.9999999999999998e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0237  acriflavin resistance protein  27.1 
 
 		 1054 aa  315  3.9999999999999997e-84  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2180  acriflavin resistance protein  25.1 
 
 		 1030 aa  314  4.999999999999999e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000146343  normal  0.137669 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0559  acriflavin resistance protein  25.59 
 
 		 1062 aa  313  9e-84  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2523  acriflavin resistance protein  26.64 
 
 		 1026 aa  313  9e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.199891 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0248  acriflavin resistance protein  26.93 
 
 		 1054 aa  313  1e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6179  acriflavin resistance protein  25.8 
 
 		 1065 aa  312  2e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160015  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1882  AcrB/AcrD/AcrF family protein  26.29 
 
 		 1031 aa  310  1.0000000000000001e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2296  putative integral membrane efflux protein  28.14 
 
 		 1064 aa  310  1.0000000000000001e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0226  acriflavin resistance protein  26.91 
 
 		 1054 aa  309  2.0000000000000002e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.38584  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2409  acriflavin resistance protein  26.09 
 
 		 1031 aa  308  4.0000000000000004e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.677885  normal  0.0307662 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2337  acriflavin resistance protein  25.99 
 
 		 1031 aa  307  5.0000000000000004e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0120926  hitchhiker  0.000298899 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1659  acriflavin resistance protein  25.99 
 
 		 1031 aa  308  5.0000000000000004e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.178159  normal  0.998047 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0140  acriflavine resistance protein  26.67 
 
 		 1071 aa  306  2.0000000000000002e-81  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2558  acriflavin resistance protein  24.74 
 
 		 1048 aa  306  2.0000000000000002e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.181919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2287  acriflavin resistance protein  27.58 
 
 		 1075 aa  304  5.000000000000001e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00014609 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1699  acriflavin resistance protein  26.41 
 
 		 1044 aa  304  5.000000000000001e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.920783  normal  0.0913661 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1983  acriflavin resistance protein  25.43 
 
 		 1034 aa  302  2e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000463224  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3888  acriflavin resistance protein  24.61 
 
 		 1048 aa  302  2e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.471381  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2549  acriflavin resistance protein  25.51 
 
 		 1031 aa  301  3e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0932297  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1667  acriflavin resistance protein  25.4 
 
 		 1095 aa  301  3e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.954276 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>