140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0398 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_0398  Dynamin family protein  100 
 
 		 674 aa  1384    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2209  GTP-binding protein  34.93 
 
 		 615 aa  365  2e-99  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0438  GTP-binding protein  31.52 
 
 		 599 aa  292  2e-77  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0404  glucosamine fructose-6-phosphate aminotransferase (isomerizing)  29.36 
 
 		 610 aa  272  2e-71  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1545  GTP-binding protein  31.66 
 
 		 569 aa  267  4e-70  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.712051  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0860  GTP-binding protein  28.92 
 
 		 601 aa  245  1.9999999999999999e-63  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0337  conserved hypothetical protein, predicted ATP/GTP-binding protein  40.62 
 
 		 605 aa  190  8e-47  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0436  GTP-binding protein  41.45 
 
 		 569 aa  189  1e-46  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0461  GTP-binding protein  41.03 
 
 		 569 aa  182  1e-44  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0612543  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6880  Dynamin family protein  35.47 
 
 		 1164 aa  133  7.999999999999999e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2259  Dynamin family protein  26.47 
 
 		 444 aa  104  6e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000551632  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2994  dynamin family protein  27.86 
 
 		 614 aa  104  6e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.214598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3036  dynamin family protein  27.86 
 
 		 614 aa  104  6e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0241135  normal  0.688737 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2910  dynamin family protein  26.81 
 
 		 605 aa  102  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.518789  normal  0.400566 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6878  Dynamin family protein  28.92 
 
 		 620 aa  98.6  4e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1095  dynamin  29.55 
 
 		 588 aa  90.9  7e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.845511  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1439  Dynamin family protein  28.79 
 
 		 546 aa  90.1  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.784928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1273  Dynamin family protein  29.23 
 
 		 407 aa  89.4  2e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000146438  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2968  dynamin family protein  25 
 
 		 583 aa  87  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0322  Dynamin family protein  29.7 
 
 		 585 aa  85.9  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0914  Dynamin family protein  26.44 
 
 		 548 aa  85.5  0.000000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.440355 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2213  Dynamin family protein  28.36 
 
 		 587 aa  84.7  0.000000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1653  GTP-binding protein, HSR1-related  34.19 
 
 		 524 aa  84.7  0.000000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0754256  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0632  Dynamin family protein  27.75 
 
 		 589 aa  84  0.000000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0815  GTPase  22.7 
 
 		 712 aa  80.9  0.00000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3531  dynamin family protein  22.68 
 
 		 585 aa  79.7  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0830  hypothetical protein  26.4 
 
 		 712 aa  79.7  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00896739  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0272  isoniazid inductible gene protein IniC  27.07 
 
 		 468 aa  79.3  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0933  dynamin family protein  27.89 
 
 		 679 aa  79.3  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.807319  hitchhiker  0.00750508 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1193  hypothetical protein  27.87 
 
 		 614 aa  77.4  0.0000000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108086  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0625  isoniazid inductible gene protein IniC  25.91 
 
 		 496 aa  77.4  0.0000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0105414  normal  0.124728 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2106  dynamin  29.13 
 
 		 564 aa  76.6  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.78205 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10348  isoniazid inductible gene protein iniC  25.66 
 
 		 493 aa  76.6  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1377  dynamin family protein  23.41 
 
 		 585 aa  76.6  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.682843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0448  isoniazid inductible gene protein IniC  25.64 
 
 		 502 aa  75.5  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.608591  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0458  isoniazid inductible gene protein IniC  25.64 
 
 		 502 aa  75.5  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.148496  normal  0.646066 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0435  isoniazid inductible gene protein IniC  25.64 
 
 		 502 aa  75.1  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.495119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0787  dynamin family protein  27.63 
 
 		 655 aa  75.1  0.000000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0394271  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2546  hypothetical protein  29.17 
 
 		 719 aa  73.6  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0908682 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1096  GTP-binding protein, HSR1-related  33.33 
 
 		 664 aa  72.8  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2425  GTP-binding protein HSR1-related  32.84 
 
 		 533 aa  72.8  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44250  predicted protein  24.69 
 
 		 632 aa  71.6  0.00000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.755773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2545  dynamin  32.65 
 
 		 390 aa  71.2  0.00000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0649757  normal  0.0791445 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39120  GTPase of unknown function  29.45 
 
 		 536 aa  70.9  0.00000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.480255 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1350  dynamin  22.3 
 
 		 693 aa  70.9  0.00000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0228271 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3083  putative GTPase of unknown function  26.11 
 
 		 496 aa  70.5  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1351  heat shock protein DnaJ-like  26.61 
 
 		 741 aa  69.3  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0473185 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6053  hypothetical protein  30 
 
 		 570 aa  69.3  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7006  hypothetical protein  30.82 
 
 		 497 aa  68.2  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.707702  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0403  dynamin family protein  26.28 
 
 		 693 aa  68.2  0.0000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3727  hypothetical protein  30.88 
 
 		 503 aa  68.2  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0286482 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2196  dynamin family protein  28.16 
 
 		 506 aa  67.4  0.0000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000046764 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3725  hypothetical protein  26.79 
 
 		 569 aa  66.6  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.491681  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3459  hypothetical protein  26.59 
 
 		 568 aa  67  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.825542 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3240  hypothetical protein  26.67 
 
 		 537 aa  65.5  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.41085  normal  0.440891 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1306  dynamin family protein  28.57 
 
 		 1219 aa  65.5  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.604786  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1896  Dynamin family protein  28.26 
 
 		 1228 aa  64.3  0.000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00444431  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6055  hypothetical protein  26.58 
 
 		 696 aa  63.9  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3715  hypothetical protein  26.92 
 
 		 1219 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1451  GTP1/OBG family GTPase  26.92 
 
 		 1219 aa  62.8  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.472831  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1665  hypothetical protein  27.96 
 
 		 1219 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0397  Dynamin family protein  23.86 
 
 		 789 aa  62.8  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0111735  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1741  hypothetical protein  27.96 
 
 		 1219 aa  62.8  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000058782  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1630  hypothetical protein  27.96 
 
 		 1219 aa  62.8  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00254693  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1479  hypothetical protein  27.96 
 
 		 1219 aa  62.4  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1451  GTP1/OBG family GTPase  27.96 
 
 		 1219 aa  62.4  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1595  hypothetical protein  27.96 
 
 		 1219 aa  62.4  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1494  dynamin family protein  28.28 
 
 		 1219 aa  62.4  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.248245  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1701  hypothetical protein  27.96 
 
 		 1219 aa  61.2  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1510  GTP-binding protein HSR1-related  24.88 
 
 		 523 aa  61.2  0.00000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5963  hypothetical protein  25.68 
 
 		 610 aa  60.5  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0107791  normal  0.0849156 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0460  GTP-binding protein  24.9 
 
 		 728 aa  59.3  0.0000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.839985  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2547  dynamin  27.51 
 
 		 551 aa  59.3  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0273  hypothetical protein  29.93 
 
 		 608 aa  59.3  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1546  GTP-binding protein  24.79 
 
 		 728 aa  58.5  0.0000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0859  GTP-binding protein  24.37 
 
 		 692 aa  58.9  0.0000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.547864  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0813  hypothetical protein  28.9 
 
 		 516 aa  58.5  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0435  GTP-binding protein  24.9 
 
 		 728 aa  58.5  0.0000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1653  GTP-binding protein, HSR1-related  30 
 
 		 501 aa  57.8  0.0000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.481236  normal  0.975567 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2424  Dynamin family protein  30.95 
 
 		 666 aa  57.8  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0336  conserved hypothetical protein, predicted ATP/GTP-binding protein  24.66 
 
 		 741 aa  57.8  0.0000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1638  GTP-binding protein HSR1-related  30 
 
 		 501 aa  57  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.178731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1654  dynamin  28.76 
 
 		 686 aa  56.2  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0311974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0437  GTP-binding protein  24.37 
 
 		 692 aa  55.5  0.000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1501  hypothetical protein  22.76 
 
 		 1146 aa  55.5  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1530  hypothetical protein  22.76 
 
 		 1146 aa  55.5  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.532706  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1733  hypothetical protein  27.74 
 
 		 976 aa  55.5  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0373  hypothetical protein  42.03 
 
 		 737 aa  54.7  0.000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2392  Dynamin family protein  28 
 
 		 1249 aa  53.9  0.000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0624  hypothetical protein  27.27 
 
 		 602 aa  53.5  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.318926  normal  0.0782013 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0828  hypothetical protein  26.02 
 
 		 516 aa  52.8  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000529126  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5314  hypothetical protein  25.6 
 
 		 952 aa  52.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0372  hypothetical protein  24.46 
 
 		 587 aa  52.8  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3084  hypothetical protein  22.57 
 
 		 627 aa  51.6  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3429  hypothetical protein  24.88 
 
 		 802 aa  52  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.224896 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1013  hypothetical protein  29.57 
 
 		 1145 aa  50.8  0.00009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.445275  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2219  GTPase  21.28 
 
 		 673 aa  50.4  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0282  hypothetical protein  22.22 
 
 		 648 aa  50.4  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4146  hypothetical protein  26.4 
 
 		 283 aa  50.4  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.575249 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6054  hypothetical protein  36.25 
 
 		 747 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>