More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1127 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001308  ANIA_00887  Putative urea carboxylase (EC 6.3.4.6)(Urea amidolyase)(Lactam utilization protein lamA) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P38095]  37.78 
 
 		 1241 aa  822    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.547459  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2748  urea carboxylase  50.57 
 
 		 1204 aa  1216    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0703  urea amidolyase related protein  52.15 
 
 		 1209 aa  1248    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2680  urea carboxylase  57.58 
 
 		 1200 aa  1405    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5228  urea carboxylase  55.63 
 
 		 1203 aa  1337    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.120809  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4243  urea amidolyase-related protein  56.5 
 
 		 1226 aa  1388    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6105  urea carboxylase  53.35 
 
 		 1179 aa  1256    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.164711  normal  0.417784 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2606  urea carboxylase  54.04 
 
 		 1172 aa  1281    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0287573 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3728  urea carboxylase  49.35 
 
 		 1220 aa  1119    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0435399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0904  Urea carboxylase  50.24 
 
 		 1204 aa  1115    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.332628  normal  0.0380086 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3977  Urea amidolyase-related protein  57.64 
 
 		 1488 aa  942    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0074  allophanate hydrolase subunit 2  56.88 
 
 		 1201 aa  1342    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.755435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3722  urea carboxylase  52.16 
 
 		 1176 aa  1200    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.848646  normal  0.673189 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4883  allophanate hydrolase subunit 2  57.6 
 
 		 1233 aa  1355    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.104085  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6517  urea carboxylase  52.56 
 
 		 1179 aa  1249    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1338  allophanate hydrolase subunit 2  57.66 
 
 		 1210 aa  1400    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0387482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4017  urea carboxylase  52.16 
 
 		 1176 aa  1199    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.877001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4449  urea carboxylase  53.18 
 
 		 1238 aa  1263    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2304  urea carboxylase  56.3 
 
 		 1209 aa  1376    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.198231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1892  Urea carboxylase  54.95 
 
 		 1205 aa  1364    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.434507  normal  0.299649 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3089  urea carboxylase  57.34 
 
 		 1204 aa  1393    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.176139  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2502  urea carboxylase  50.98 
 
 		 1204 aa  1248    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1792  allophanate hydrolase subunit 2  52.58 
 
 		 1206 aa  1261    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.73882  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3888  urea amidolyase related protein  53.12 
 
 		 677 aa  695    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0446544  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0943  allophanate hydrolase subunit 2  56.85 
 
 		 1212 aa  1391    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.648902  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1821  biotin carboxylation domain-containing protein  50.08 
 
 		 1205 aa  1133    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.234186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1419  Urea carboxylase  50.81 
 
 		 1207 aa  1218    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1588  urea carboxylase  53.58 
 
 		 1182 aa  1278    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1594  urea amidolyase related protein  51.57 
 
 		 663 aa  664    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2393  urea carboxylase  57.57 
 
 		 1201 aa  1390    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0606  allophanate hydrolase subunit 2  53.11 
 
 		 1197 aa  1283    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0957568  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3792  urea amidolyase related protein  54.09 
 
 		 1228 aa  1293    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1127  putative allophanate hydrolase  100 
 
 		 1209 aa  2502    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0798  urea carboxylase  58.57 
 
 		 1208 aa  1416    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.467421  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1358  biotin carboxylation domain-containing protein  56.84 
 
 		 1231 aa  1375    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.306676  normal  0.336229 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2361  urea amidolyase related protein  56.18 
 
 		 1200 aa  1372    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4531  allophanate hydrolase subunit 2  53.17 
 
 		 1183 aa  1266    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1384  Urea amidolyase-related protein  56.07 
 
 		 1205 aa  1314    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.578782  normal  0.0177378 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2727  biotin carboxylation domain-containing protein  49.3 
 
 		 1162 aa  1102    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.321905  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2188  allophanate hydrolase subunit 2  53.83 
 
 		 1183 aa  1260    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1105  urea carboxylase  50.45 
 
 		 1208 aa  1190    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.480964  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0036  biotin carboxylation domain-containing protein  57.17 
 
 		 1203 aa  1388    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.879734 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3669  urea amidolyase related protein  49.15 
 
 		 1234 aa  1118    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0710  urea carboxylase  46.68 
 
 		 1212 aa  1006    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000013863 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6430  urea carboxylase  56.49 
 
 		 1205 aa  1329    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.646743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5558  allophanate hydrolase subunit 2  56.41 
 
 		 1205 aa  1323    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.453459  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1840  allophanate hydrolase  50 
 
 		 1205 aa  1130    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1222  Urea carboxylase  52.82 
 
 		 1180 aa  1221    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5923  biotin carboxylation region  56.41 
 
 		 1205 aa  1323    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.559652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3979  urea carboxylase  58.75 
 
 		 1203 aa  1400    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3900  urea carboxylase  51.87 
 
 		 1179 aa  1186    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.201135 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2502  propionyl-coenzyme A carboxylase alpha polypeptide  51.31 
 
 		 1243 aa  1250    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2163  urea carboxylase  51.1 
 
 		 1204 aa  1256    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.278684  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28452  urea amidolyase  43.84 
 
 		 1822 aa  1054    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.407983 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0045  urea carboxylase  60.76 
 
 		 1197 aa  1447    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1887  biotin carboxylation domain-containing protein  50 
 
 		 1205 aa  1130    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0766  urea carboxylase  49.59 
 
 		 1201 aa  1167    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2549  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  46.74 
 
 		 445 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.569347  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2604  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  46.97 
 
 		 445 aa  409  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.189257  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2370  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  46.97 
 
 		 445 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.17472  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2328  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  46.97 
 
 		 445 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.611182  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2286  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  46.97 
 
 		 445 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1840  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  46.33 
 
 		 450 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2548  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  46.97 
 
 		 445 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1803  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  46.52 
 
 		 445 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.220445  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2512  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  46.74 
 
 		 445 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2561  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  46.97 
 
 		 445 aa  409  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5537800000000004e-18 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2811  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  46.74 
 
 		 445 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000387379 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12523  acetyl-/propionyl-coenzyme A carboxylase subunit alpha  45.78 
 
 		 654 aa  404  1e-111  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.881887 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0521  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  43.52 
 
 		 448 aa  404  1e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0922671  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2356  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  46.74 
 
 		 445 aa  406  1e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.488234  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1544  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase  44.67 
 
 		 447 aa  394  1e-108  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.111795  hitchhiker  0.00898283 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1793  hypothetical protein  46.51 
 
 		 654 aa  395  1e-108  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30510  acetyl/propionyl-CoA carboxylase, alpha subunit  45.66 
 
 		 665 aa  396  1e-108  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.434229 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1792  hypothetical protein  45.85 
 
 		 654 aa  390  1e-107  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3703  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  46.44 
 
 		 662 aa  390  1e-107  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0198  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  43.11 
 
 		 447 aa  393  1e-107  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000243254  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6229  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP- binding  44.42 
 
 		 643 aa  391  1e-107  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2677  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  42.45 
 
 		 447 aa  393  1e-107  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.229585  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3630  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding protein  46.44 
 
 		 662 aa  390  1e-107  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0290  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  42.67 
 
 		 448 aa  390  1e-106  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0124015 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1960  Acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  41.79 
 
 		 453 aa  389  1e-106  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00135614  normal  0.658873 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0359  Acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  41.92 
 
 		 447 aa  390  1e-106  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.476375  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3635  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  46.37 
 
 		 662 aa  388  1e-106  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.165726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3819  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  43.45 
 
 		 446 aa  384  1e-105  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000013347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0235  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  41.79 
 
 		 448 aa  384  1e-105  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0962  biotin carboxylase  45.32 
 
 		 661 aa  384  1e-105  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1070  methylcrotonyl-CoA carboxylase biotin-containing subunit  45.32 
 
 		 661 aa  384  1e-105  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5245  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  43.01 
 
 		 447 aa  382  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2022  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  43.36 
 
 		 446 aa  381  1e-104  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0711095  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1358  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP- binding protein  45.85 
 
 		 680 aa  382  1e-104  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.410164  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1271  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  44.49 
 
 		 450 aa  382  1e-104  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.247395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00691  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  42.29 
 
 		 449 aa  381  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.36167  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2441  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  44.27 
 
 		 450 aa  382  1e-104  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0321  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  43.65 
 
 		 447 aa  382  1e-104  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0373504  normal  0.0139821 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0466  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  43.39 
 
 		 445 aa  382  1e-104  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0174688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4207  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  45.29 
 
 		 588 aa  380  1e-104  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1386  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  43.01 
 
 		 752 aa  383  1e-104  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4090  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  45.34 
 
 		 660 aa  378  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.734303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00721  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  41.85 
 
 		 449 aa  377  1e-103  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.249054  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>