More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0414 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0414  hypothetical protein  100 
 
 		 458 aa  947    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4444  hypothetical protein  47.49 
 
 		 444 aa  375  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0725807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3321  hypothetical protein  45.12 
 
 		 443 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56170  hypothetical protein  45.91 
 
 		 443 aa  353  5e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4334  hypothetical protein  45.65 
 
 		 447 aa  352  1e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4892  hypothetical protein  45.38 
 
 		 443 aa  349  6e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.645052  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4026  hypothetical protein  44.06 
 
 		 429 aa  342  7e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0725636 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38380  hypothetical protein  40.37 
 
 		 444 aa  311  2e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3848  protein of unknown function DUF58  38.92 
 
 		 432 aa  305  1.0000000000000001e-81  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0614  protein of unknown function DUF58  31.85 
 
 		 436 aa  219  1e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0075  hypothetical protein  26.62 
 
 		 436 aa  195  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.258844  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2508  hypothetical protein  29.43 
 
 		 440 aa  176  7e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2227  hypothetical protein  25.65 
 
 		 428 aa  172  7.999999999999999e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4966  protein of unknown function DUF58  28.03 
 
 		 450 aa  171  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000197556  hitchhiker  0.000000000000243349 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1836  hypothetical protein  29.1 
 
 		 440 aa  171  3e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.255887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0238  protein of unknown function DUF58  25.32 
 
 		 448 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1687  protein of unknown function DUF58  26.89 
 
 		 446 aa  164  3e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0036  protein of unknown function DUF58  26.17 
 
 		 444 aa  162  2e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.764731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2137  hypothetical protein  24.8 
 
 		 444 aa  158  2e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09793  hypothetical protein  24.12 
 
 		 443 aa  153  7e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0685361  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2294  hypothetical protein  26.78 
 
 		 436 aa  146  6e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.284249  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1714  protein of unknown function DUF58  29.52 
 
 		 469 aa  145  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.155953  hitchhiker  0.00648309 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2448  protein of unknown function DUF58  29.25 
 
 		 430 aa  137  4e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000184548 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2677  hypothetical protein  29.1 
 
 		 429 aa  133  7.999999999999999e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3127  protein of unknown function DUF58  27.61 
 
 		 444 aa  129  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.427692 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4822  protein of unknown function DUF58  24.71 
 
 		 430 aa  126  7e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3576  protein of unknown function DUF58  30.31 
 
 		 444 aa  124  3e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.22964  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2717  hypothetical protein  26.92 
 
 		 412 aa  124  5e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0463  hypothetical protein  28.04 
 
 		 428 aa  122  1.9999999999999998e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1833  protein of unknown function DUF58  27.23 
 
 		 430 aa  121  3e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.341692  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2337  protein of unknown function DUF58  27.52 
 
 		 437 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0476401  hitchhiker  0.0000275371 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1844  hypothetical protein  24.64 
 
 		 436 aa  115  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3750  protein of unknown function DUF58  28.57 
 
 		 434 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.237776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2966  hypothetical protein  27.53 
 
 		 436 aa  114  3e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.436518  normal  0.0431026 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3911  hypothetical protein  26.42 
 
 		 430 aa  113  5e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0824882  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09290  hypothetical protein  24.09 
 
 		 430 aa  113  7.000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2501  hypothetical protein  27.39 
 
 		 433 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4049  protein of unknown function DUF58  29.46 
 
 		 430 aa  108  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5847  hypothetical protein  25.63 
 
 		 432 aa  105  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.426804 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13724  hypothetical protein  26.95 
 
 		 454 aa  103  7e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.499476 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1407  hypothetical protein  24.81 
 
 		 455 aa  103  7e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.707739  decreased coverage  0.00764846 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20700  hypothetical protein  25.85 
 
 		 432 aa  101  2e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.338835  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2519  protein of unknown function DUF58  27.48 
 
 		 473 aa  98.2  2e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.938144  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0758  hypothetical protein  27.54 
 
 		 431 aa  96.3  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.877651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1336  hypothetical protein  25.22 
 
 		 440 aa  94.7  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.429273 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2454  hypothetical protein  28.11 
 
 		 296 aa  93.2  8e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0188  hypothetical protein  27.49 
 
 		 412 aa  90.1  8e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3820  protein of unknown function DUF58  25.12 
 
 		 444 aa  89.7  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.534668  normal  0.0329552 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1590  hypothetical protein  27.8 
 
 		 429 aa  86.7  8e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2653  hypothetical protein  28.8 
 
 		 296 aa  86.3  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4861  hypothetical protein  26.36 
 
 		 449 aa  84.7  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4950  hypothetical protein  26.36 
 
 		 449 aa  84.7  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2294  protein of unknown function DUF58  26.49 
 
 		 297 aa  85.1  0.000000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1780  protein of unknown function DUF58  28.26 
 
 		 296 aa  84.3  0.000000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.226086 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5229  hypothetical protein  26.82 
 
 		 449 aa  84.3  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.421211  normal  0.269494 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  26.8 
 
 		 302 aa  84  0.000000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1642  hypothetical protein  25.94 
 
 		 290 aa  82.4  0.00000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3912  hypothetical protein  31.16 
 
 		 415 aa  80.9  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0491324  normal  0.116114 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2205  hypothetical protein  25.74 
 
 		 291 aa  80.5  0.00000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.129755  normal  0.0892574 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5456  hypothetical protein  26.65 
 
 		 441 aa  80.5  0.00000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.467237 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0193  hypothetical protein  28.24 
 
 		 432 aa  79  0.0000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.0000145617  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0040  hypothetical protein  31.94 
 
 		 286 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.659881  normal  0.473933 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0878  hypothetical protein  33.52 
 
 		 286 aa  77.8  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.627027  normal  0.715968 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0547  protein of unknown function DUF58  28.21 
 
 		 310 aa  77.8  0.0000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2088  protein of unknown function DUF58  28.74 
 
 		 296 aa  77  0.0000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0218  protein of unknown function DUF58  26.23 
 
 		 295 aa  76.6  0.0000000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000041699  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0165  hypothetical protein  26.95 
 
 		 410 aa  76.6  0.0000000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0344  protein of unknown function DUF58  29.75 
 
 		 391 aa  75.9  0.000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.396918  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1089  hypothetical protein  25.87 
 
 		 284 aa  76.3  0.000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0112  von Willebrand factor, type A  24.58 
 
 		 309 aa  74.3  0.000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2450  protein of unknown function DUF58  31.89 
 
 		 298 aa  74.3  0.000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.675441  decreased coverage  0.00731515 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3182  hypothetical protein  23.01 
 
 		 404 aa  74.3  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1077  protein of unknown function DUF58  26.82 
 
 		 426 aa  73.6  0.000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2343  von Willebrand factor type A  25.13 
 
 		 292 aa  73.2  0.000000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2133  hypothetical protein  22.7 
 
 		 405 aa  73.2  0.000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1807  protein of unknown function DUF58  27.27 
 
 		 295 aa  73.2  0.000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.451702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4278  hypothetical protein  27.86 
 
 		 303 aa  73.2  0.000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0234  hypothetical protein  22.64 
 
 		 292 aa  73.2  0.000000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0846  hypothetical protein  25 
 
 		 467 aa  73.2  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.421105 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1349  hypothetical protein  23.97 
 
 		 308 aa  72.8  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0903  hypothetical protein  25.26 
 
 		 466 aa  73.2  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0716  hypothetical protein  27.57 
 
 		 287 aa  72.8  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1973  hypothetical protein  22.74 
 
 		 404 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2648  hypothetical protein  23.47 
 
 		 308 aa  71.6  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.178415 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2121  hypothetical protein  22.74 
 
 		 362 aa  72  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2130  protein of unknown function DUF58  31.9 
 
 		 297 aa  71.6  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000676568 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2373  hypothetical protein  33.51 
 
 		 358 aa  72.4  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0432  hypothetical protein  23.57 
 
 		 287 aa  71.6  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1479  hypothetical protein  27.15 
 
 		 291 aa  71.2  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.760748  normal  0.45052 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0601  hypothetical protein  27.62 
 
 		 433 aa  71.2  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.007011  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2039  protein of unknown function DUF58  28.97 
 
 		 528 aa  71.2  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4903  hypothetical protein  25.51 
 
 		 295 aa  71.2  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190776  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02160  hypothetical protein  24.9 
 
 		 288 aa  71.2  0.00000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2031  hypothetical protein  28.74 
 
 		 318 aa  70.5  0.00000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.439807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7599  protein of unknown function DUF58  26.65 
 
 		 457 aa  70.5  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00295352  hitchhiker  0.00519262 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1315  hypothetical protein  25 
 
 		 340 aa  70.5  0.00000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629782  normal  0.23782 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2156  hypothetical protein  22.74 
 
 		 404 aa  70.5  0.00000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0465  conserved repeat domain protein  27.78 
 
 		 448 aa  70.5  0.00000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3760  hypothetical protein  30.72 
 
 		 314 aa  70.1  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.227641  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2373  protein of unknown function DUF58  26.01 
 
 		 575 aa  70.1  0.00000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  0.131149 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>