144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_4480 on replicon NC_009038
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009038  Sbal_4480  hypothetical protein  100 
 
 		 615 aa  1219    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2195  triple helix repeat-containing collagen  100 
 
 		 615 aa  1219    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1748  hypothetical protein  39.13 
 
 		 1408 aa  148  2.0000000000000003e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1339  collagen-like protein  31.59 
 
 		 712 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2389  triple helix repeat-containing collagen  33.85 
 
 		 842 aa  125  2e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00549275  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1549  group-specific protein  29.66 
 
 		 512 aa  125  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000333718 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4635  collagen triple helix repeat domain protein  31.45 
 
 		 459 aa  125  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.179421  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4654  hypothetical protein  33.55 
 
 		 462 aa  125  3e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3456  triple helix repeat-containing collagen  35.29 
 
 		 1168 aa  125  3e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00439724  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4862  collagen triple helix repeat domain protein  33.24 
 
 		 1170 aa  124  3e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3469  triple helix repeat-containing collagen  33.97 
 
 		 748 aa  124  5e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1581  hypothetical protein  29.55 
 
 		 585 aa  122  3e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.322632  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3721  collagen triple helix repeat protein  33.13 
 
 		 706 aa  118  3e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.98705e-33 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4868  triple helix repeat-containing collagen  32.26 
 
 		 1321 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3739  hypothetical protein  35.58 
 
 		 1147 aa  115  3e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0102662  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4476  collagen-like protein  34.75 
 
 		 815 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.957246  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1866  hypothetical protein  35.62 
 
 		 835 aa  114  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3360  hypothetical protein  36.22 
 
 		 835 aa  113  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.888871  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3124  Collagen triple helix repeat protein  33.02 
 
 		 1580 aa  113  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3477  triple helix repeat-containing collagen  35.08 
 
 		 936 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00171179  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4557  triple helix repeat-containing collagen  35.22 
 
 		 934 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4844  collagen triple helix repeat domain protein  35.2 
 
 		 1219 aa  111  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3386  hypothetical protein  34.06 
 
 		 867 aa  110  6e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.12938  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3811  collagen triple helix repeat protein  34.28 
 
 		 1451 aa  110  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00707911  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1632  large adhesin  34.02 
 
 		 2914 aa  106  1e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4458  collagen-like protein  35.35 
 
 		 1055 aa  105  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4838  collagen triple helix repeat domain protein  33.61 
 
 		 1297 aa  105  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0444265  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1865  collagen triple helix repeat domain protein  33.22 
 
 		 838 aa  104  4e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.224261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3387  hypothetical protein  32.82 
 
 		 835 aa  104  4e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.265829  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3470  triple helix repeat-containing collagen  32.19 
 
 		 813 aa  102  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.943395  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1618  group-specific protein  33.1 
 
 		 643 aa  102  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.747405  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2569  hypothetical protein  34.17 
 
 		 442 aa  96.7  1e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1304  Collagen triple helix repeat protein  49.22 
 
 		 319 aa  96.7  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.174683  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0398  collagen triple helix repeat domain protein  30.59 
 
 		 951 aa  94.7  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.178342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0478  cell-surface large adhesin  32.09 
 
 		 2851 aa  94.4  6e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1008  Collagen triple helix repeat protein  51.24 
 
 		 380 aa  94  7e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3684  triple helix repeat-containing collagen  45.31 
 
 		 468 aa  94  8e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1924  triple helix repeat-containing collagen  45.31 
 
 		 466 aa  93.6  9e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0586  Collagen triple helix repeat protein  46.72 
 
 		 606 aa  92.8  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2925  collagen triple helix repeat protein  45.8 
 
 		 252 aa  92  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00742867 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0682  triple helix repeat-containing collagen  34.29 
 
 		 542 aa  92.4  2e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3508  tail fiber protein  34.24 
 
 		 645 aa  92.8  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.283696 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0713  Collagen triple helix repeat protein  45.26 
 
 		 322 aa  92  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3361  hypothetical protein  37.27 
 
 		 835 aa  91.7  4e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1426  triple helix repeat-containing collagen  39.68 
 
 		 473 aa  91.3  5e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.937607  normal  0.524919 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2406  collagen triple helix repeat protein  42.76 
 
 		 300 aa  91.3  5e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4912  collagen triple helix repeat protein  29.91 
 
 		 524 aa  89.7  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3685  triple helix repeat-containing collagen  48.44 
 
 		 493 aa  89  2e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1027  triple helix repeat-containing collagen  44.8 
 
 		 403 aa  89  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.155494  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3152  BclA protein  41.22 
 
 		 347 aa  88.2  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0005  BclA protein  41.22 
 
 		 347 aa  88.2  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1925  triple helix repeat-containing collagen  47.66 
 
 		 492 aa  88.2  5e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4978  triple helix repeat-containing collagen  48.33 
 
 		 469 aa  87.4  6e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4623  triple helix repeat-containing collagen  48.33 
 
 		 647 aa  87  8e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13970  collagen triple helix repeat protein  40.41 
 
 		 523 aa  87  9e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2697  hypothetical protein  43.94 
 
 		 382 aa  86.7  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4655  collagen triple helix repeat domain protein  43.75 
 
 		 426 aa  87  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0148  collagen triple helix repeat protein  46.85 
 
 		 639 aa  86.3  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2465  BclA protein  40.58 
 
 		 348 aa  86.3  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1704  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  43.88 
 
 		 689 aa  82.8  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3557  hypothetical protein  38.69 
 
 		 481 aa  81.6  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.285889  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3686  triple helix repeat-containing collagen  36.67 
 
 		 587 aa  81.6  0.00000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1202  triple helix repeat-containing collagen  39.2 
 
 		 400 aa  81.6  0.00000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000183423  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4370  triple helix repeat-containing collagen  41.6 
 
 		 344 aa  81.6  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.324657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3227  triple helix repeat-containing collagen  44.14 
 
 		 274 aa  81.3  0.00000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1926  triple helix repeat-containing collagen  36.73 
 
 		 582 aa  80.5  0.00000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3841  hypothetical protein  40.29 
 
 		 478 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000174288  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3403  triple helix repeat-containing collagen  44.54 
 
 		 582 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154784 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1380  triple helix repeat-containing collagen  50.52 
 
 		 474 aa  79  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0453849  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8979  hypothetical protein  42.66 
 
 		 307 aa  77.8  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2256  triple helix repeat-containing collagen  36.99 
 
 		 326 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0346745  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4263  triple helix repeat-containing collagen  44.74 
 
 		 390 aa  75.5  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2610  Collagen triple helix repeat protein  33.1 
 
 		 767 aa  75.5  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.965964  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3118  tail fiber protein  35.67 
 
 		 437 aa  75.1  0.000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.145222 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5054  Collagen triple helix repeat protein  37.16 
 
 		 298 aa  74.3  0.000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0339954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5836  Collagen triple helix repeat protein  48.42 
 
 		 1426 aa  73.6  0.000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.278516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0397  phage tail Collar  39.84 
 
 		 1873 aa  73.2  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4113  Collagen triple helix repeat  40.48 
 
 		 212 aa  73.2  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.366844  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1007  Collagen triple helix repeat protein  53.93 
 
 		 445 aa  72.8  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2758  tail fiber protein  44.04 
 
 		 439 aa  72.4  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.204827  normal  0.264951 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4285  Collagen triple helix repeat protein  38.82 
 
 		 648 aa  70.9  0.00000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.275713  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2280  triple helix repeat-containing collagen  48.19 
 
 		 299 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0151545  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2240  hypothetical protein  43.3 
 
 		 258 aa  67.8  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2241  BclA protein  47.62 
 
 		 285 aa  66.6  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0600  collagen triple helix repeat domain protein  39.42 
 
 		 300 aa  67  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.952581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0915  tail fiber protein  47.31 
 
 		 438 aa  66.6  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1203  tail fiber protein  47.31 
 
 		 451 aa  66.6  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1804  tail fiber protein  46.67 
 
 		 434 aa  66.6  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.982324  hitchhiker  0.00650595 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1338  group-specific protein  40 
 
 		 436 aa  66.2  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00783091  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2736  hypothetical protein  50.57 
 
 		 142 aa  66.2  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2599  triple helix repeat-containing collagen  41.82 
 
 		 222 aa  65.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0118729  normal  0.173421 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0025  triple helix repeat-containing collagen  37.34 
 
 		 366 aa  66.2  0.000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.123658  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2165  tail fiber protein  47.31 
 
 		 437 aa  66.2  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.468721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2871  tail fiber protein  47.31 
 
 		 437 aa  65.9  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0235495 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5064  Collagen triple helix repeat protein  33.33 
 
 		 839 aa  65.5  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.18046  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4578  Collagen triple helix repeat protein  40.88 
 
 		 444 aa  63.5  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.567616 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2198  hypothetical protein  46.15 
 
 		 240 aa  62.8  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1479  triple helix repeat-containing collagen  41.41 
 
 		 717 aa  62.8  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.289213  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2641  collagen triple helix repeat protein  36.03 
 
 		 497 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1937  triple helix repeat-containing collagen  36.97 
 
 		 219 aa  62  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.402337  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>