66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_3218 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_3218  SapC family protein  100 
 
 		 234 aa  478  1e-134  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1137  SapC family protein  99.57 
 
 		 234 aa  476  1e-133  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.134042  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1077  SapC family protein  98.71 
 
 		 234 aa  472  1e-132  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2877  SapC family protein  56.52 
 
 		 233 aa  291  7e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.193841  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2701  SapC  54.35 
 
 		 236 aa  281  7.000000000000001e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0135847  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1307  SapC family protein  37.29 
 
 		 238 aa  161  6e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.537479 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0940  hypothetical protein  39.39 
 
 		 230 aa  156  3e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00274123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1099  SapC family protein  36.6 
 
 		 242 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.693688  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1114  SapC family protein  36 
 
 		 239 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0151  hypothetical protein  36.12 
 
 		 259 aa  147  1.0000000000000001e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.681081  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2202  SapC family protein  34.19 
 
 		 264 aa  143  2e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.504396  normal  0.230762 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1173  SapC family protein  35.4 
 
 		 228 aa  142  6e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.282711  normal  0.903795 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1024  hypothetical protein  34.67 
 
 		 233 aa  141  9.999999999999999e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1210  SapC family protein  33.8 
 
 		 239 aa  139  6e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.007094  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3512  hypothetical protein  35.84 
 
 		 229 aa  138  7e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3022  SapC family protein  34.96 
 
 		 229 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0318248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0026  SapC  32.76 
 
 		 264 aa  124  1e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0613  SapC-related protein  31.74 
 
 		 244 aa  122  4e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.397522  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2392  SapC related protein  32.91 
 
 		 241 aa  121  8e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00276727 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03269  SapC  33.05 
 
 		 256 aa  118  9.999999999999999e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3681  SapC  35.09 
 
 		 258 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0240  hypothetical protein  33.04 
 
 		 242 aa  112  4.0000000000000004e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03901  SapC related protein  33.03 
 
 		 244 aa  108  6e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0580  SapC family protein  28.88 
 
 		 283 aa  93.2  3e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.132466 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0305  SapC family protein  30.9 
 
 		 255 aa  89  6e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785352 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2386  SapC family protein  29.61 
 
 		 264 aa  88.2  9e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2181  SapC family protein  27.43 
 
 		 240 aa  87.8  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000117047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1708  hypothetical protein  29.69 
 
 		 461 aa  87  2e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3684  hypothetical protein  27.08 
 
 		 254 aa  86.3  4e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0659  SapC protein, putative  28.39 
 
 		 239 aa  83.2  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0131187  normal  0.604941 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4693  SapC family protein  30.25 
 
 		 264 aa  79.3  0.00000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3838  SapC family protein  27.51 
 
 		 242 aa  79  0.00000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0655  SapC family protein  27.95 
 
 		 237 aa  78.6  0.00000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.44406  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1947  SapC family protein  27.83 
 
 		 251 aa  76.6  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.257156  normal  0.0836073 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1963  SapC  26.84 
 
 		 245 aa  77  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.78249  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3736  hypothetical protein  25.42 
 
 		 243 aa  76.3  0.0000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1048  SapC  27.23 
 
 		 259 aa  75.1  0.0000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0951508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1261  VCBS  28.5 
 
 		 257 aa  74.3  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000118793 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1605  SapC  25.56 
 
 		 240 aa  72.8  0.000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.944293  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0084  SapC family protein  25.63 
 
 		 273 aa  70.5  0.00000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1142  SapC family protein  29.26 
 
 		 240 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02804  SapC  27.07 
 
 		 233 aa  70.9  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0137  SapC family protein  28.95 
 
 		 258 aa  68.9  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.459538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4287  SapC  26.97 
 
 		 244 aa  68.2  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2545  SapC  26.7 
 
 		 238 aa  67.8  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2367  SapC family protein  24.68 
 
 		 266 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02200  SapC superfamily  25.82 
 
 		 264 aa  67.4  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3054  hypothetical protein  24.68 
 
 		 236 aa  66.6  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000693301 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1211  SapC family protein  29.95 
 
 		 240 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.552472  normal  0.532412 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3179  SapC family protein  29.44 
 
 		 240 aa  65.5  0.0000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0187288 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1178  SapC family protein  28.93 
 
 		 240 aa  64.7  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.701461  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2408  SapC family protein  24.24 
 
 		 266 aa  63.5  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1311  SapC family protein  26.64 
 
 		 240 aa  62.8  0.000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1123  SapC family protein  26.32 
 
 		 240 aa  62.4  0.000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2830  SapC related protein  26.32 
 
 		 242 aa  62  0.000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.525847  hitchhiker  0.000912858 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1289  SapC  24.37 
 
 		 259 aa  61.6  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.369266  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2408  SapC family protein  26.88 
 
 		 225 aa  60.5  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000000281595  normal  0.323308 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3347  SapC family protein  22.88 
 
 		 255 aa  58.9  0.00000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.652681 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1399  hypothetical protein  26.32 
 
 		 238 aa  58.9  0.00000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129541 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0916  SapC  24.23 
 
 		 238 aa  58.2  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0460  SapC  31.54 
 
 		 380 aa  56.6  0.0000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0614463  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0596  SapC family protein  22.55 
 
 		 261 aa  53.9  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00347217 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1851  SapC family protein  21.85 
 
 		 242 aa  51.2  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.755163 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0917  hypothetical protein  21.37 
 
 		 247 aa  51.2  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0303  hypothetical protein  23.79 
 
 		 234 aa  49.3  0.00006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000548607  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1102  SapC related protein  26.74 
 
 		 235 aa  46.2  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>