More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3545 on replicon NC_009427
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009427  Saro_3545  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
260 aa  525  1e-148  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1514  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.46 
 
 
252 aa  161  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.411347  normal  0.744647 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0884  dehydrogenase  37.74 
 
 
257 aa  160  1e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1659  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.65 
 
 
251 aa  160  2e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3062  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.8 
 
 
255 aa  158  7e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.515672  normal  0.0696546 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4572  2,5-dichloro-2,5-cyclohexadiene-1,4-diol dehydrogenase  37.98 
 
 
258 aa  152  4e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1552  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.24 
 
 
255 aa  152  5.9999999999999996e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.747318  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1545  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.74 
 
 
254 aa  152  7e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.161777  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4062  short chain dehydrogenase  35.16 
 
 
257 aa  148  8e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.171649  normal  0.787909 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4553  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.82 
 
 
255 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.201856  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0818  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.8 
 
 
252 aa  146  4.0000000000000006e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.100065 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0242  Short-chain alcohol dehydrogenase  35.38 
 
 
253 aa  145  5e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3460  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 
245 aa  145  7.0000000000000006e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2079  short chain dehydrogenase  36.08 
 
 
255 aa  144  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3603  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.37 
 
 
249 aa  142  5e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2043  short chain dehydrogenase  33.98 
 
 
257 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2060  short chain dehydrogenase  33.98 
 
 
257 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.256692  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1028  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.53 
 
 
255 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0631303 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2106  short chain dehydrogenase  33.98 
 
 
257 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.077628 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2910  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 
251 aa  137  2e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.640216  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12873  short chain dehydrogenase  35.41 
 
 
258 aa  137  2e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.69 
 
 
246 aa  135  4e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1601  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.27 
 
 
258 aa  135  8e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2281  short chain dehydrogenase  33.2 
 
 
257 aa  135  9e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.121478 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1012  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 
251 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0198691  normal  0.370278 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.63 
 
 
246 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3961  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.05 
 
 
243 aa  133  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.985096  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0909  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.69 
 
 
244 aa  133  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.271894  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1425  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.4 
 
 
258 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.315018 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1758  hypothetical protein  35.29 
 
 
254 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.522329  normal  0.0728091 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12034  20-beta-hydroxysteroid dehydrogenase fabG3  38.61 
 
 
260 aa  133  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1800  short chain dehydrogenase  38.52 
 
 
260 aa  133  3.9999999999999996e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.837228 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4926  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.94 
 
 
250 aa  132  6.999999999999999e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4569  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.8 
 
 
244 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.998929  normal  0.700957 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4625  short chain dehydrogenase  36.4 
 
 
249 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.402352  normal  0.18483 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2039  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.02 
 
 
249 aa  131  1.0000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.292922  normal  0.566372 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2259  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.8 
 
 
256 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.654674 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5464  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.33 
 
 
253 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.852927  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4649  short chain dehydrogenase  36.54 
 
 
261 aa  130  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.21279  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1473  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.21 
 
 
249 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.162054  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5858  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.7 
 
 
244 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1634  short chain dehydrogenase  37.3 
 
 
265 aa  130  2.0000000000000002e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.213832  normal  0.261977 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2742  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.73 
 
 
246 aa  130  2.0000000000000002e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1368  short chain dehydrogenase  34.5 
 
 
261 aa  130  3e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1954  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  33.33 
 
 
250 aa  130  3e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3245  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.21 
 
 
246 aa  129  3e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1080  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.63 
 
 
246 aa  130  3e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.38691  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2585  short chain dehydrogenase  34.24 
 
 
259 aa  130  3e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.25122  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0514  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.41 
 
 
252 aa  129  4.0000000000000003e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1498  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.31 
 
 
256 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2508  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.36 
 
 
250 aa  129  5.0000000000000004e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.168106  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0852  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.73 
 
 
280 aa  129  6e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2217  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.72 
 
 
258 aa  129  7.000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0140674 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2627  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
268 aa  128  8.000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.335809  normal  0.150749 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6423  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.4 
 
 
244 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3357  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.98 
 
 
247 aa  128  8.000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.585241  normal  0.0114993 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1690  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.84 
 
 
248 aa  128  9.000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000504993 
 
 
-
 
NC_004310  BR1122  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.24 
 
 
246 aa  127  1.0000000000000001e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0726405  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2439  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.98 
 
 
249 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.427983  normal  0.121811 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4231  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.5 
 
 
255 aa  127  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2856  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.5 
 
 
255 aa  127  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.423234  normal  0.0918658 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2033  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.58 
 
 
270 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4695  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.63 
 
 
280 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0771  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.35 
 
 
280 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0642  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.46 
 
 
252 aa  127  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.220005 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2914  short chain dehydrogenase  36.02 
 
 
255 aa  127  2.0000000000000002e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.892644  normal  0.135282 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0512  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.25 
 
 
248 aa  126  3e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4637  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.11 
 
 
280 aa  125  5e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1096  glucose dehydrogenase  36 
 
 
244 aa  125  5e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0163868 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3738  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.16 
 
 
252 aa  125  5e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.87063  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3357  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.05 
 
 
253 aa  125  5e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00078495  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4593  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.16 
 
 
251 aa  125  6e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00700945 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1767  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.75 
 
 
246 aa  125  7e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000018635 
 
 
-
 
NC_004310  BR0243  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  36.76 
 
 
244 aa  125  9e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.550186  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2421  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.05 
 
 
259 aa  125  9e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0231267 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0236  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  36.76 
 
 
244 aa  125  9e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.117254  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1849  short chain dehydrogenase  33.59 
 
 
255 aa  125  9e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.838313 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2736  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.16 
 
 
255 aa  124  1e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.777047  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0729  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.23 
 
 
251 aa  124  1e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0262547  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1475  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.22 
 
 
266 aa  124  1e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.388787  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0268  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.4 
 
 
250 aa  124  1e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2371  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.92 
 
 
244 aa  124  1e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0541  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.68 
 
 
251 aa  124  1e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3367  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.6 
 
 
244 aa  124  1e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1136  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.99 
 
 
249 aa  124  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.399133  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1576  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.6 
 
 
268 aa  124  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.29701  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3804  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.68 
 
 
253 aa  124  2e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.33 
 
 
250 aa  124  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0435  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.17 
 
 
251 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0923902  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3121  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.81 
 
 
267 aa  123  2e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.780645 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2059  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.63 
 
 
252 aa  124  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2766  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.6 
 
 
244 aa  123  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.240645  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6998  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.8 
 
 
244 aa  124  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5146  short chain dehydrogenase  35.86 
 
 
249 aa  123  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.485132 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0788  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.92 
 
 
244 aa  123  3e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3498  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.1 
 
 
250 aa  123  3e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.27381  normal  0.321582 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0283  short chain dehydrogenase  33.46 
 
 
259 aa  122  4e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.879782  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2362  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36 
 
 
249 aa  123  4e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.876035 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3331  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.82 
 
 
246 aa  123  4e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1627  short chain dehydrogenase  33.46 
 
 
259 aa  122  4e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>