More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_5000 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_5000  signal-transduction protein  100 
 
 		 130 aa  256  9e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000125843 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4486  CBS domain-containing protein  96.03 
 
 		 129 aa  240  6e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0214678 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1395  putative signal transduction protein with CBS domains  61.34 
 
 		 138 aa  163  5.9999999999999996e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.319409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6392  putative signal transduction protein with CBS domains  64.46 
 
 		 133 aa  155  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1100  signal-transduction protein  61.9 
 
 		 152 aa  151  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1905  putative signal transduction protein with CBS domains  60.33 
 
 		 139 aa  151  2.9999999999999998e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3630  signal-transduction protein  62.5 
 
 		 122 aa  151  4e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.30892 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0532  signal-transduction protein  57.72 
 
 		 126 aa  148  2e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.392409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1108  signal-transduction protein  37.17 
 
 		 144 aa  74.3  0.0000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1745  hypothetical protein  33.05 
 
 		 144 aa  73.2  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.87888 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1394  signal-transduction protein  35 
 
 		 135 aa  71.2  0.000000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.136388 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1479  signal-transduction protein  35.2 
 
 		 238 aa  70.9  0.000000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.543565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3316  CBS domain-containing protein  33.62 
 
 		 144 aa  70.1  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00011902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0876  signal-transduction protein  33.06 
 
 		 141 aa  69.3  0.00000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0914  putative signal transduction protein with CBS domains  34.45 
 
 		 131 aa  69.3  0.00000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0000312526  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4635  signal-transduction protein  35.09 
 
 		 143 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.574258  normal  0.318433 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0633  signal-transduction protein  33.9 
 
 		 141 aa  67.8  0.00000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.96504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  28.46 
 
 		 148 aa  67.8  0.00000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2812  CBS domain containing membrane protein  37.31 
 
 		 201 aa  67.4  0.00000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000718769  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1339  signal-transduction protein  38.39 
 
 		 160 aa  67  0.00000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.44426 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1915  signal-transduction protein  30.51 
 
 		 144 aa  66.2  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.414103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2203  hypothetical protein  35.48 
 
 		 144 aa  66.6  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0939  signal-transduction protein  34.68 
 
 		 135 aa  65.5  0.0000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.120432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0382  CBS domain-containing protein  35.34 
 
 		 645 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.263171 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4097  CBS domain-containing protein  33.03 
 
 		 643 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5476  putative signal transduction protein with CBS domains  34.23 
 
 		 145 aa  65.9  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  29.91 
 
 		 147 aa  65.9  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0964  putative signal transduction protein with CBS domains  34.17 
 
 		 132 aa  65.5  0.0000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0447  signal-transduction protein  30.77 
 
 		 145 aa  65.1  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.285729  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1425  signal-transduction protein  36.13 
 
 		 144 aa  65.1  0.0000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.316039 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2661  signal-transduction protein  35.07 
 
 		 177 aa  65.1  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.63207  normal  0.665873 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1395  signal-transduction protein  39.22 
 
 		 141 aa  65.5  0.0000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0871644 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0415  signal-transduction protein  38.24 
 
 		 145 aa  65.1  0.0000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.682078  normal  0.0782148 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06340  putative signal-transduction protein with CBS domains  32.5 
 
 		 141 aa  64.3  0.0000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000465197  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2219  putative signal-transduction protein with CBS domains  33.04 
 
 		 143 aa  63.9  0.0000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0827472 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1474  signal transduction protein  37.29 
 
 		 128 aa  63.9  0.0000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2880  signal-transduction protein  37.38 
 
 		 145 aa  63.9  0.0000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.982708  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0254  signal-transduction protein  39.52 
 
 		 136 aa  63.2  0.000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00659332  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3231  signal-transduction protein  34.51 
 
 		 143 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00933533  normal  0.19525 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1046  signal-transduction protein  36.04 
 
 		 142 aa  63.2  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.460697  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0354  CBS domain-containing protein  36.94 
 
 		 645 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.466174 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1580  signal-transduction protein  36.04 
 
 		 143 aa  62.4  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0967784 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1229  signal-transduction protein  35.25 
 
 		 136 aa  62.4  0.000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0771  signal-transduction protein  33.08 
 
 		 164 aa  62  0.000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.411579  normal  0.0544722 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3725  signal-transduction protein  31.93 
 
 		 143 aa  62.8  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5213  hypothetical protein  38.74 
 
 		 142 aa  62  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.995327  normal  0.0487848 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1597  signal-transduction protein  29.82 
 
 		 141 aa  62  0.000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2362  signal-transduction protein  34.82 
 
 		 143 aa  62.4  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.67854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0239  signal transduction protein  33.61 
 
 		 128 aa  62  0.000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.371768 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0380  CBS domain-containing protein  36.94 
 
 		 645 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.488205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0628  signal-transduction protein  34.91 
 
 		 141 aa  62.4  0.000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4848  CBS domain-containing protein  35.45 
 
 		 645 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.602391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0362  signal-transduction protein  38.68 
 
 		 139 aa  62  0.000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0188  signal-transduction protein  33.86 
 
 		 128 aa  61.2  0.000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.885258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0389  signal-transduction protein  32.8 
 
 		 150 aa  61.6  0.000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0637  signal-transduction protein  33.93 
 
 		 140 aa  61.6  0.000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0673  signal-transduction protein  31.75 
 
 		 165 aa  61.2  0.000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0416  signal-transduction protein  34.15 
 
 		 130 aa  61.2  0.000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.498724  normal  0.0778746 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2537  putative signal transduction protein with CBS domains  31.53 
 
 		 143 aa  60.8  0.000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.482232 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2262  CBS domain-containing protein  31.53 
 
 		 143 aa  60.8  0.000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.175418 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0446  putative signal transduction protein with CBS domains  39.17 
 
 		 136 aa  60.8  0.000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0212406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3250  signal-transduction protein  33.04 
 
 		 174 aa  60.8  0.000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0271263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2400  CBS domain containing protein  32.5 
 
 		 143 aa  60.8  0.000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000190312  decreased coverage  0.0000946646 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1332  signal-transduction protein  31.78 
 
 		 139 aa  60.8  0.000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.660277  normal  0.443449 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1844  hypothetical protein  33.33 
 
 		 144 aa  60.5  0.000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0765  CBS  31.82 
 
 		 224 aa  60.5  0.000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0417  signal transduction protein  33.88 
 
 		 139 aa  60.5  0.000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.694858  normal  0.0742839 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0663  signal-transduction protein  32.26 
 
 		 127 aa  60.5  0.000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0255  signal-transduction protein  32.04 
 
 		 142 aa  60.5  0.000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0155982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1825  signal-transduction protein  36.61 
 
 		 139 aa  60.1  0.00000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1107  signal-transduction protein  35.45 
 
 		 143 aa  59.7  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5185  cyclic nucleotide-binding (cNMP-bd) protein  31.31 
 
 		 646 aa  59.3  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.255954  normal  0.285696 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3744  signal transduction protein  38.05 
 
 		 148 aa  59.7  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1449  signal transduction protein  34.45 
 
 		 153 aa  60.1  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3268  CBS domain-containing protein  30.89 
 
 		 142 aa  60.1  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1548  cyclic nucleotide-binding protein  33.61 
 
 		 615 aa  60.1  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2374  signal-transduction protein  33.6 
 
 		 146 aa  59.7  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.425597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0253  signal-transduction protein  31.4 
 
 		 140 aa  60.1  0.00000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.00276555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0381  CBS domain-containing protein  28.21 
 
 		 688 aa  59.7  0.00000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0243844 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0397  putative signal transduction protein with CBS domains  34 
 
 		 142 aa  58.9  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0148627  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1479  signal-transduction protein  29.51 
 
 		 126 aa  58.9  0.00000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0004  signal-transduction protein  31.09 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0565  signal-transduction protein  28.1 
 
 		 188 aa  58.9  0.00000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3328  putative signal transduction protein with CBS domains  35.29 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0804  putative signal transduction protein with CBS domains  32.77 
 
 		 129 aa  59.3  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1217  CBS domain-containing protein  31.71 
 
 		 143 aa  58.9  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0338  signal-transduction protein  34.26 
 
 		 145 aa  58.9  0.00000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1393  signal transduction protein  32.2 
 
 		 136 aa  58.5  0.00000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.137975 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1143  signal-transduction protein  31.45 
 
 		 138 aa  58.2  0.00000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.430444 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0095  putative signal transduction protein with CBS domains  31.86 
 
 		 135 aa  58.2  0.00000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0410  putative CBS domain-containing signal transduction protein  35.29 
 
 		 124 aa  57.8  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.269207  normal  0.258379 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0100  putative signal transduction protein with CBS domains  32.54 
 
 		 143 aa  57.8  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2051  putative signal transduction protein with CBS domains  31.71 
 
 		 124 aa  57.8  0.00000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.787742  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1225  signal-transduction protein  29.6 
 
 		 127 aa  57.4  0.00000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.276884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0568  signal-transduction protein  30.53 
 
 		 133 aa  57.4  0.00000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.706815 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1488  signal-transduction protein  34.26 
 
 		 142 aa  57.4  0.00000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.661715 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0620  signal-transduction protein  31.4 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1849  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  29.41 
 
 		 633 aa  57  0.00000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2052  putative signal transduction protein with CBS domains  33.63 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2352  signal-transduction protein  31.09 
 
 		 142 aa  57.4  0.00000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.103406  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>