More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3315 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_3315  protoheme IX farnesyltransferase  100 
 
 		 317 aa  626  1e-178  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000327669 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3088  protoheme IX farnesyltransferase  92.19 
 
 		 342 aa  559  1e-158  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.604618  normal  0.308497 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2423  protoheme IX farnesyltransferase  63.41 
 
 		 341 aa  378  1e-104  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.516292 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2060  protoheme IX farnesyltransferase  53.27 
 
 		 306 aa  301  1e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1979  protoheme IX farnesyltransferase  55.93 
 
 		 317 aa  298  8e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.969251 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5185  protoheme IX farnesyltransferase  52.63 
 
 		 307 aa  296  4e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.264459  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2542  protoheme IX farnesyltransferase  51.3 
 
 		 314 aa  295  9e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.988716  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15990  protoheme IX farnesyltransferase  52.49 
 
 		 326 aa  293  2e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.37638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1649  protoheme IX farnesyltransferase  56.03 
 
 		 289 aa  293  3e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2247  protoheme IX farnesyltransferase  52.24 
 
 		 328 aa  291  1e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000151822 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13220  protoheme IX farnesyltransferase  52.41 
 
 		 312 aa  287  2e-76  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.670624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6012  protoheme IX farnesyltransferase  53.21 
 
 		 317 aa  285  5.999999999999999e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00798701  normal  0.725662 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2973  protoheme IX farnesyltransferase  47.35 
 
 		 321 aa  283  3.0000000000000004e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1558  protoheme IX farnesyltransferase  52.67 
 
 		 304 aa  280  2e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.14299  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2075  protoheme IX farnesyltransferase  52.79 
 
 		 313 aa  278  1e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0259319  normal  0.255924 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2263  protoheme IX farnesyltransferase  49.84 
 
 		 317 aa  276  4e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000348066  normal  0.0917465 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2160  protoheme IX farnesyltransferase  54.83 
 
 		 293 aa  268  7e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1265  protoheme IX farnesyltransferase  51.6 
 
 		 332 aa  265  5.999999999999999e-70  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2215  protoheme IX farnesyltransferase  55.52 
 
 		 328 aa  264  1e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000125005  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11479  protoheme IX farnesyltransferase  49.67 
 
 		 308 aa  265  1e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.0489299999999998e-105  normal  0.920568 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2921  protoheme IX farnesyltransferase  51.51 
 
 		 339 aa  264  2e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19930  protoheme IX farnesyltransferase  54.86 
 
 		 294 aa  263  4e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.440013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2375  protoheme IX farnesyltransferase  46.82 
 
 		 335 aa  259  3e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15280  protoheme IX farnesyltransferase  51.56 
 
 		 294 aa  255  8e-67  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0625707  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11440  protoheme IX farnesyltransferase  47.98 
 
 		 326 aa  254  1.0000000000000001e-66  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0124066  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2415  protoheme IX farnesyltransferase  48.64 
 
 		 333 aa  253  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2461  protoheme IX farnesyltransferase  48.64 
 
 		 333 aa  253  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.751171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2001  protoheme IX farnesyltransferase  45.4 
 
 		 325 aa  252  6e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0149749  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2455  protoheme IX farnesyltransferase  48.64 
 
 		 310 aa  252  6e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3691  protoheme IX farnesyltransferase  48.82 
 
 		 313 aa  249  4e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.358596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2721  protoheme IX farnesyltransferase  48.21 
 
 		 313 aa  247  2e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201425 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2098  protoheme IX farnesyltransferase  46.15 
 
 		 315 aa  240  2.9999999999999997e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.562695  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1839  protoheme IX farnesyltransferase  47.37 
 
 		 319 aa  238  8e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000154836 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3571  protoheme IX farnesyltransferase  44 
 
 		 317 aa  238  1e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.882357  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2521  protoheme IX farnesyltransferase  45.77 
 
 		 328 aa  237  2e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.352077  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1128  protoheme IX farnesyltransferase  50.35 
 
 		 307 aa  237  2e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0340852 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1933  protoheme IX farnesyltransferase  50 
 
 		 342 aa  235  9e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1711  protoheme IX farnesyltransferase  51.42 
 
 		 297 aa  228  7e-59  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0253  protoheme IX farnesyltransferase  43.6 
 
 		 323 aa  221  9e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0548443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0255  protoheme IX farnesyltransferase  43.25 
 
 		 323 aa  221  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0526  protoheme IX farnesyltransferase  43.19 
 
 		 318 aa  217  2e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1781  protoheme IX farnesyltransferase  41.64 
 
 		 328 aa  215  5.9999999999999996e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.641415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4304  protoheme IX farnesyltransferase  41.95 
 
 		 535 aa  209  4e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1209  protoheme IX farnesyltransferase  40.2 
 
 		 324 aa  209  7e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.444038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0224  protoheme IX farnesyltransferase  43.45 
 
 		 534 aa  207  1e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.478514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1505  protoheme IX farnesyltransferase  41.35 
 
 		 622 aa  203  2e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3688  protoheme IX farnesyltransferase  40.74 
 
 		 323 aa  202  4e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0408  protoheme IX farnesyltransferase  43.69 
 
 		 312 aa  203  4e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0708  protoheme IX farnesyltransferase  43.77 
 
 		 296 aa  200  3e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0830  protoheme IX farnesyltransferase  40.55 
 
 		 312 aa  196  3e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0147164  normal  0.292197 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1908  protoheme IX farnesyltransferase  44.88 
 
 		 302 aa  196  6e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0816  protoheme IX farnesyltransferase  42.4 
 
 		 313 aa  195  9e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.566736  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0627  protoheme IX farnesyltransferase  45.2 
 
 		 624 aa  194  1e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.234547 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0623  protoheme IX farnesyltransferase  40 
 
 		 302 aa  193  3e-48  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0491007  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3154  protoheme IX farnesyltransferase  39.48 
 
 		 309 aa  192  5e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4586  protoheme IX farnesyltransferase  40.99 
 
 		 313 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2487  protoheme IX farnesyltransferase  40.58 
 
 		 478 aa  186  4e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.316472  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2798  protoheme IX farnesyltransferase  39.33 
 
 		 472 aa  186  6e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.400427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3662  protoheme IX farnesyltransferase  44.1 
 
 		 586 aa  185  8e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0763  protoheme IX farnesyltransferase  39.34 
 
 		 353 aa  185  1.0000000000000001e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.467386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0225  protoheme IX farnesyltransferase  40.21 
 
 		 312 aa  182  6e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0583  protoheme IX farnesyltransferase  37.1 
 
 		 315 aa  182  7e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.0000491835  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0604  protoheme IX farnesyltransferase  37.54 
 
 		 316 aa  181  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0257  protoheme IX farnesyltransferase  41.1 
 
 		 328 aa  180  2e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.430018  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3461  protoheme IX farnesyltransferase  41.1 
 
 		 328 aa  180  2e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1403  protoheme IX farnesyltransferase  39.58 
 
 		 308 aa  181  2e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0901  protoheme IX farnesyltransferase  42.01 
 
 		 312 aa  180  2e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.110093  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0475  protoheme IX farnesyltransferase  37.59 
 
 		 312 aa  179  4e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.100765  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0469  protoheme IX farnesyltransferase  37.59 
 
 		 315 aa  179  4.999999999999999e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.362812  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0644  protoheme IX farnesyltransferase  37.25 
 
 		 316 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.211966 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3708  protoheme IX farnesyltransferase  40.27 
 
 		 443 aa  179  7e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00051278  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1042  protoheme IX farnesyltransferase  38.43 
 
 		 325 aa  177  3e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0671  protoheme IX farnesyltransferase  35.96 
 
 		 318 aa  176  4e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.613215 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1827  protoheme IX farnesyltransferase  37.19 
 
 		 310 aa  176  6e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0766556  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4646  protoheme IX farnesyltransferase  40.7 
 
 		 315 aa  176  6e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.372407  normal  0.111817 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0475  protoheme IX farnesyltransferase  37.19 
 
 		 310 aa  176  6e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0728  protoheme IX farnesyltransferase  38.52 
 
 		 321 aa  175  8e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.147557 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2600  protoheme IX farnesyltransferase  44.79 
 
 		 276 aa  175  9.999999999999999e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.400593 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0743  protoheme IX farnesyltransferase  34.8 
 
 		 310 aa  174  9.999999999999999e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.120936  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0062  protoheme IX farnesyltransferase  39.01 
 
 		 298 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.291941  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3003  protoheme IX farnesyltransferase  39.43 
 
 		 302 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.523448  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2165  protoheme IX farnesyltransferase  39.67 
 
 		 317 aa  172  5e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0270  protoheme IX farnesyltransferase  37.67 
 
 		 312 aa  172  5e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.80654 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0405  protoheme IX farnesyltransferase  35.07 
 
 		 311 aa  172  5.999999999999999e-42  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.789326  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0070  protoheme IX farnesyltransferase  39.3 
 
 		 306 aa  172  5.999999999999999e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.915118  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0044  protoheme IX farnesyltransferase  36.92 
 
 		 303 aa  172  6.999999999999999e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4789  protoheme IX farnesyltransferase  39.1 
 
 		 313 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0319  protoheme IX farnesyltransferase  44.7 
 
 		 315 aa  171  2e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0628217  normal  0.314061 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1181  protoheme IX farnesyltransferase  39.41 
 
 		 482 aa  171  2e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0286  protoheme IX farnesyltransferase  38.46 
 
 		 301 aa  171  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2302  protoheme IX farnesyltransferase  41.7 
 
 		 495 aa  170  3e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6167  protoheme IX farnesyltransferase  40 
 
 		 300 aa  169  4e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.455458  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2852  protoheme IX farnesyltransferase  41.93 
 
 		 483 aa  169  4e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0302  protoheme IX farnesyltransferase  37.68 
 
 		 295 aa  169  6e-41  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  decreased coverage  0.00437405  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2848  protoheme IX farnesyltransferase  39.65 
 
 		 300 aa  169  8e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.273412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2224  protoheme IX farnesyltransferase  39.65 
 
 		 300 aa  169  8e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2837  protoheme IX farnesyltransferase  39.65 
 
 		 300 aa  169  8e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0228  protoheme IX farnesyltransferase  37.89 
 
 		 313 aa  168  1e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3799  protoheme IX farnesyltransferase  38.93 
 
 		 300 aa  168  1e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2894  protoheme IX farnesyltransferase  39.3 
 
 		 300 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>