More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3058 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_3058  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  100 
 
 		 418 aa  833    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.700588  hitchhiker  0.00347473 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0681  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  60.35 
 
 		 416 aa  422  1e-117  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3425  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  37.59 
 
 		 431 aa  224  2e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.569361  normal  0.792047 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3734  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  37.84 
 
 		 428 aa  224  3e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3620  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  37.34 
 
 		 429 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0244678 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0113  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  36.54 
 
 		 442 aa  216  8e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0528354  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2511  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  30.95 
 
 		 416 aa  203  5e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0098  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  35.25 
 
 		 440 aa  201  9.999999999999999e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2435  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  37.66 
 
 		 412 aa  193  4e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0136  pyridoxal-dependent decarboxylase, exosortase system type 1 associated  36.5 
 
 		 402 aa  188  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2669  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  34.26 
 
 		 410 aa  186  5e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.499942  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0486  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  38.04 
 
 		 417 aa  183  6e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.252649  normal  0.657753 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2078  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  36.39 
 
 		 428 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.192664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3879  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  37.34 
 
 		 508 aa  181  2.9999999999999997e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00597643  normal  0.0295865 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2019  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  33.08 
 
 		 419 aa  180  4e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.225254 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1110  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  34.72 
 
 		 397 aa  179  4.999999999999999e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.585964  normal  0.770001 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3255  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  28.57 
 
 		 415 aa  178  2e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1392  pyridoxal-dependent decarboxylase, exosortase system type 1 associated  35.14 
 
 		 415 aa  177  3e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0214918  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0421  putative Orn/DAP/Arg decarboxylase  35.55 
 
 		 402 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0126  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  34.03 
 
 		 411 aa  174  2.9999999999999996e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1957  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  33.33 
 
 		 410 aa  173  5e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.47769  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1565  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  34.62 
 
 		 411 aa  172  1e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00881  diaminopimelate decarboxylase protein  35.75 
 
 		 413 aa  171  2e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0145136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0494  diaminopimelate decarboxylase  32.57 
 
 		 416 aa  170  5e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4274  pyridoxal-dependent decarboxylase, exosortase system type 1 associated  35.03 
 
 		 402 aa  168  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000282467 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0700  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  34.55 
 
 		 414 aa  166  5e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7006  pyridoxal-dependent decarboxylase, exosortase system type 1 associated  36.34 
 
 		 408 aa  166  5.9999999999999996e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0015439 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1290  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  32.75 
 
 		 414 aa  163  5.0000000000000005e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0858  diaminopimelate decarboxylase  32.99 
 
 		 415 aa  161  2e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.168666  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3735  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  34.37 
 
 		 388 aa  158  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0413562  normal  0.130406 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0522  diaminopimelate decarboxylase  27.47 
 
 		 420 aa  158  2e-37  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000495897  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4030  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  34.26 
 
 		 413 aa  158  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.157056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0114  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  28.65 
 
 		 400 aa  157  3e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0110  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  28.65 
 
 		 400 aa  157  3e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1835  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  33.33 
 
 		 430 aa  155  1e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.59311  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0584  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  29.64 
 
 		 405 aa  155  1e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000391397  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3112  diaminopimelate decarboxylase  32.48 
 
 		 418 aa  155  2e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.507719  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2528  pyridoxal-dependent decarboxylase, exosortase system type 1 associated  32.91 
 
 		 416 aa  154  2e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0397628 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0554  diaminopimelate decarboxylase  26.67 
 
 		 419 aa  154  2.9999999999999998e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0720  diaminopimelate decarboxylase  29.87 
 
 		 429 aa  153  5e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00473762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5288  diaminopimelate decarboxylase  32.29 
 
 		 415 aa  152  7e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0351  diaminopimelate decarboxylase  32.48 
 
 		 420 aa  152  7e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0103305 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2910  diaminopimelate decarboxylase  32.08 
 
 		 423 aa  152  1e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00334908 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5227  diaminopimelate decarboxylase  32.29 
 
 		 415 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4782  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  34.2 
 
 		 408 aa  151  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.49913  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4145  diaminopimelate decarboxylase  27.93 
 
 		 417 aa  151  2e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5136  diaminopimelate decarboxylase  32.29 
 
 		 415 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.206313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3740  diaminopimelate decarboxylase  32.01 
 
 		 419 aa  150  3e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000793006 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2443  diaminopimelate decarboxylase  30.28 
 
 		 445 aa  150  5e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000493249  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2420  diaminopimelate decarboxylase  29.07 
 
 		 417 aa  149  6e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.04804e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3656  diaminopimelate decarboxylase  31.75 
 
 		 457 aa  149  7e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0075  diaminopimelate decarboxylase  30.77 
 
 		 416 aa  149  9e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1916  diaminopimelate decarboxylase  32.27 
 
 		 430 aa  149  9e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3139  diaminopimelate decarboxylase  31.33 
 
 		 419 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.167339  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3257  diaminopimelate decarboxylase  31.58 
 
 		 423 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.314031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0041  diaminopimelate decarboxylase  31.81 
 
 		 414 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3816  diaminopimelate decarboxylase  32.28 
 
 		 422 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.010832 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5498  diaminopimelate decarboxylase  31.64 
 
 		 415 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0267  diaminopimelate decarboxylase  30.42 
 
 		 415 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3140  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  30.96 
 
 		 392 aa  147  3e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4055  diaminopimelate decarboxylase  27.2 
 
 		 417 aa  147  3e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0834  diaminopimelate decarboxylase  28.61 
 
 		 418 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3213  diaminopimelate decarboxylase  30.3 
 
 		 432 aa  146  6e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.399743 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0245  diaminopimelate decarboxylase  31.64 
 
 		 415 aa  146  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.377243  normal  0.537295 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3606  diaminopimelate decarboxylase  32.05 
 
 		 420 aa  145  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00198954  hitchhiker  0.0000000450016 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47700  diaminopimelate decarboxylase  30.75 
 
 		 415 aa  145  1e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2979  diaminopimelate decarboxylase protein  32.4 
 
 		 451 aa  145  2e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.492096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2585  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2:Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  31.81 
 
 		 402 aa  144  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.126508  decreased coverage  0.000677908 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2862  diaminopimelate decarboxylase  30.62 
 
 		 423 aa  145  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0197535  normal  0.0614086 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3495  diaminopimelate decarboxylase  30.28 
 
 		 421 aa  145  2e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.844313 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3040  diaminopimelate decarboxylase  31.31 
 
 		 421 aa  144  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.365095  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1301  diaminopimelate decarboxylase  25.77 
 
 		 412 aa  144  3e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3116  diaminopimelate decarboxylase  33.66 
 
 		 424 aa  144  4e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0675356 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1740  diaminopimelate decarboxylase  32.32 
 
 		 422 aa  143  5e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.309969  normal  0.840232 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0997  diaminopimelate decarboxylase  32 
 
 		 421 aa  143  6e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.877632  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3805  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  33.08 
 
 		 404 aa  143  7e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3567  diaminopimelate decarboxylase  30.91 
 
 		 422 aa  142  9e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.67276  normal  0.379648 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1240  diaminopimelate decarboxylase  27.92 
 
 		 420 aa  142  9.999999999999999e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0634  diaminopimelate decarboxylase  29.57 
 
 		 433 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2802  diaminopimelate decarboxylase  31.28 
 
 		 420 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69670  diaminopimelate decarboxylase  30.63 
 
 		 415 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6020  diaminopimelate decarboxylase  30.48 
 
 		 415 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.422247  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0353  diaminopimelate decarboxylase  32.42 
 
 		 422 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.336132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3059  diaminopimelate decarboxylase  30.05 
 
 		 431 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.038181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1713  diaminopimelate decarboxylase  27.5 
 
 		 417 aa  141  1.9999999999999998e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.283347  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2020  diaminopimelate decarboxylase  30.15 
 
 		 421 aa  140  3e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0398534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0209  diaminopimelate decarboxylase  29.97 
 
 		 415 aa  140  3.9999999999999997e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0182  diaminopimelate decarboxylase  29.57 
 
 		 415 aa  139  1e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0314  diaminopimelate decarboxylase  28.89 
 
 		 417 aa  139  1e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2384  diaminopimelate decarboxylase  30.26 
 
 		 421 aa  139  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.193755  normal  0.99015 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1721  diaminopimelate decarboxylase  30.58 
 
 		 422 aa  139  1e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3031  diaminopimelate decarboxylase  30.65 
 
 		 423 aa  138  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2394  diaminopimelate decarboxylase  29.41 
 
 		 417 aa  137  3.0000000000000003e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.362349  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0348  diaminopimelate decarboxylase  29.17 
 
 		 445 aa  137  3.0000000000000003e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000869616  hitchhiker  0.0000188674 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0717  diaminopimelate decarboxylase  33.42 
 
 		 402 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0591874 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4130  diaminopimelate decarboxylase  29.57 
 
 		 414 aa  137  4e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.638139 
 
 
-
 
NC_004310  BR1983  diaminopimelate decarboxylase  30.45 
 
 		 421 aa  137  4e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0729  diaminopimelate decarboxylase  30 
 
 		 421 aa  137  4e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1787  diaminopimelate decarboxylase  30.83 
 
 		 422 aa  137  4e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.16455 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4020  diaminopimelate decarboxylase  31.82 
 
 		 423 aa  137  4e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>