More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2804 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_2804  coenzyme A transferase  100 
 
 
280 aa  563  1e-160  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000211937 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2605  coenzyme A transferase  90.36 
 
 
280 aa  518  1e-146  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.315961  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2064  coenzyme A transferase  72.4 
 
 
286 aa  416  9.999999999999999e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.852286  normal  0.684027 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2354  coenzyme A transferase  69.29 
 
 
289 aa  398  9.999999999999999e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.20907  normal  0.0705771 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3827  coenzyme A transferase  66.43 
 
 
290 aa  391  1e-108  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1380  coenzyme A transferase  71.31 
 
 
261 aa  372  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161573  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2744  coenzyme A transferase  66.31 
 
 
293 aa  368  1e-101  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933072  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4619  coenzyme A transferase  63.77 
 
 
281 aa  358  6e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5267  coenzyme A transferase  58.45 
 
 
295 aa  328  4e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.174288 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5069  coenzyme A transferase  58.1 
 
 
295 aa  328  6e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.539559 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1489  coenzyme A transferase  58.8 
 
 
296 aa  328  8e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4684  coenzyme A transferase  58.1 
 
 
295 aa  327  9e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.537215  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4770  coenzyme A transferase  58.1 
 
 
295 aa  327  9e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0352343  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13584  CoA-transferase subunit alpha  57.54 
 
 
292 aa  315  7e-85  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.972  normal  0.101355 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2072  coenzyme A transferase  55.6 
 
 
294 aa  311  5.999999999999999e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3982  coenzyme A transferase  58.45 
 
 
297 aa  310  2e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3751  coenzyme A transferase  54.51 
 
 
298 aa  299  3e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1558  coenzyme A transferase  56.04 
 
 
296 aa  294  1e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3297  coenzyme A transferase  54.21 
 
 
293 aa  279  4e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0965913 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1432  coenzyme A transferase  54.15 
 
 
297 aa  275  5e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.768493  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2154  coenzyme A transferase  47.84 
 
 
291 aa  263  2e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4842  coenzyme A transferase  35.69 
 
 
305 aa  142  6e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.130717  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4813  coenzyme A transferase  37.17 
 
 
305 aa  142  8e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.168158  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2205  coenzyme A transferase  36.36 
 
 
599 aa  132  6e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.401277  normal  0.0481798 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2751  putative acyl CoA-transferase subunit A  34.81 
 
 
276 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000616772  normal  0.229124 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1040  putative coenzyme A transferase, subunit A  32.39 
 
 
302 aa  122  6e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000012559  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5072  coenzyme A transferase  34.57 
 
 
329 aa  121  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.000990125  normal  0.375198 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1472  coenzyme A transferase  32.27 
 
 
251 aa  114  2.0000000000000002e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2058  coenzyme A transferase  29.72 
 
 
268 aa  113  4.0000000000000004e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.599622  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1888  putative coenzyme A transferase  31.82 
 
 
276 aa  105  9e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.817278  normal  0.651618 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2969  coenzyme A transferase  30.22 
 
 
300 aa  103  4e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.177711  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1644  glutaconate CoA-transferase  32.28 
 
 
317 aa  99.4  6e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2837  3-oxoadipate CoA-transferase  32.41 
 
 
271 aa  92.8  5e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.351609  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4600  putative glutaconate CoA-transferase, subunit A  30.53 
 
 
269 aa  92.8  6e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3617  putative glutaconate CoA-transferase, subunit A  32.24 
 
 
272 aa  90.1  3e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.32721  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4180  3-oxoadipate CoA-transferase  28.74 
 
 
297 aa  89.4  6e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5087  coenzyme A transferase  33.08 
 
 
265 aa  87  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903463  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4013  glutaconate CoA-transferase  30.03 
 
 
285 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0148032 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1221  coenzyme A transferase  27.59 
 
 
272 aa  84  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2126  coenzyme A transferase  33.7 
 
 
313 aa  83.6  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4309  3-oxoadipate:succinyl-CoA transferase, subunit A  30.11 
 
 
285 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5132  coenzyme A transferase  29.58 
 
 
268 aa  83.2  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.914807  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0811  coenzyme A transferase  26.52 
 
 
332 aa  83.2  0.000000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.255875 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2285  coenzyme A transferase  32.41 
 
 
276 aa  82  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.275927  normal  0.260145 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2328  3-oxoadipate CoA-transferase  32.13 
 
 
295 aa  82  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.504192 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0403  glutaconate CoA-transferase  24.5 
 
 
326 aa  82  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.255219  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3923  3-oxoadipate CoA-transferase  30.25 
 
 
304 aa  81.6  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.99885  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12980  acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase, alpha subunit  31.23 
 
 
273 aa  80.9  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0312  putative CoA transferase, subunit A  29.35 
 
 
283 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38220  3-oxoadipate:succinyl-CoA transferase subunit A  29.21 
 
 
289 aa  81.3  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.722574  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02760  putative CoA transferase, subunit A  28.62 
 
 
283 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0433466 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1076  coenzyme A transferase  26.2 
 
 
272 aa  79.7  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.616034 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1267  coenzyme A transferase  27.62 
 
 
285 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7928  3-oxoadipate CoA-transferase  30.83 
 
 
273 aa  78.2  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.386225  normal  0.327959 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1134  coenzyme A transferase  27.31 
 
 
299 aa  75.9  0.0000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.012829  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1906  coenzyme A transferase  23.94 
 
 
325 aa  75.5  0.0000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0723821 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2497  coenzyme A transferase  31.2 
 
 
590 aa  74.7  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.501333  normal  0.32873 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0491  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  29.95 
 
 
246 aa  75.1  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1584  glutaconate CoA-transferase  29.41 
 
 
286 aa  73.9  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.803865  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0810  glutaconate CoA-transferase  24.57 
 
 
325 aa  73.9  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.417423 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3046  coenzyme A transferase  29.22 
 
 
271 aa  71.6  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.94721  normal  0.612276 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2696  Glutaconate CoA-transferase  25.09 
 
 
322 aa  70.9  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1203  putative CoA transferase, subunit A  24.45 
 
 
272 aa  69.7  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.917021 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0649  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  28.21 
 
 
238 aa  67  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18930  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  28.43 
 
 
237 aa  66.6  0.0000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0745996  normal  0.773659 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0299  coenzyme A transferase  27.24 
 
 
273 aa  65.9  0.0000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2060  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  29.29 
 
 
236 aa  65.1  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3037  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  30.34 
 
 
228 aa  65.5  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.625654  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1406  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  29.02 
 
 
255 aa  65.1  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000850531 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4356  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  26.96 
 
 
229 aa  64.7  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1269  coenzyme A transferase  26.67 
 
 
233 aa  64.3  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.703297  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3145  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  29.23 
 
 
245 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal  0.262067 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2608  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  28.65 
 
 
235 aa  64.3  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.357891 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2658  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  28.06 
 
 
272 aa  64.3  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2919  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  29.23 
 
 
245 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.522453 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2290  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  29.13 
 
 
219 aa  64.7  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2608  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase alpha subunit  27.6 
 
 
302 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3043  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  29.23 
 
 
255 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3086  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  30.17 
 
 
221 aa  63.2  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1877  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase alpha subunit  27.18 
 
 
234 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0683608  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0825  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  27.41 
 
 
233 aa  63.2  0.000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10495  coenzyme A transferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04120)  23.31 
 
 
506 aa  62.8  0.000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00529511  normal  0.309681 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0951  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  26.67 
 
 
234 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0890692  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1725  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  26.67 
 
 
234 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.796955  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1108  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase alpha subunit  26.67 
 
 
234 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.356707  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0526  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  30.35 
 
 
232 aa  62.4  0.000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0213  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  26.67 
 
 
234 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0677248  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1699  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  26.67 
 
 
234 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.288367  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1550  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  26.67 
 
 
234 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1570  fesuccinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit A protein  27.98 
 
 
232 aa  62  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3591  3-oxoadipate CoA-transferase, alpha subunit  24.18 
 
 
276 aa  62  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2597  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  29.41 
 
 
230 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.260319 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6364  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  26.67 
 
 
245 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0311035  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5092  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  24.89 
 
 
235 aa  61.6  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4312  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  26.89 
 
 
235 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.457397  normal  0.761681 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1153  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  29.81 
 
 
232 aa  62  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2823  coenzyme A transferase  26.59 
 
 
285 aa  61.6  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1984  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  27.18 
 
 
233 aa  62  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00015466 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1746  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  31.09 
 
 
232 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1730  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  31.09 
 
 
232 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>