More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1411 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1411  hypothetical protein  100 
 
 		 369 aa  708    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0908  hypothetical protein  54.39 
 
 		 355 aa  308  8e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0708322  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5351  protein of unknown function UPF0118  36.22 
 
 		 364 aa  173  5e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0138969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2262  hypothetical protein  32.51 
 
 		 381 aa  142  8e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0141033  normal  0.407022 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4585  putative transport protein/permease  27.99 
 
 		 382 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1751  hypothetical protein  33.87 
 
 		 353 aa  136  5e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.903333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1450  hypothetical protein  31.65 
 
 		 350 aa  134  3.9999999999999996e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.996482  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0340  hypothetical protein  35 
 
 		 340 aa  133  5e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1984  hypothetical protein  35 
 
 		 340 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.372704  normal  0.185401 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0956  hypothetical protein  34.06 
 
 		 349 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0392869 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1787  protein of unknown function UPF0118  33.62 
 
 		 392 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.190485  normal  0.0890558 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1905  hypothetical protein  28.4 
 
 		 379 aa  130  3e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.358826 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1508  hypothetical protein  33.62 
 
 		 401 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0662165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1508  protein of unknown function UPF0118  32.57 
 
 		 395 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.634886  normal  0.895228 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2700  hypothetical protein  27.81 
 
 		 368 aa  129  6e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0306531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3832  protein of unknown function UPF0118  30.65 
 
 		 372 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3895  hypothetical protein  33.22 
 
 		 340 aa  122  9.999999999999999e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0467618  normal  0.207617 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2235  hypothetical protein  28.81 
 
 		 395 aa  120  3e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.55122  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3110  protein of unknown function UPF0118  28.39 
 
 		 383 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2711  hypothetical protein  28.3 
 
 		 395 aa  119  6e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.569285 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0244  protein of unknown function UPF0118  30.53 
 
 		 376 aa  111  2.0000000000000002e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2675  hypothetical protein  27.3 
 
 		 391 aa  109  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.173775  normal  0.141253 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2554  hypothetical protein  31.8 
 
 		 356 aa  105  9e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0915  hypothetical protein  28.71 
 
 		 346 aa  97.8  3e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3439  hypothetical protein  29.89 
 
 		 370 aa  91.3  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.190134  normal  0.242294 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0783  hypothetical protein  29.6 
 
 		 365 aa  89  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.930721  normal  0.646408 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4286  hypothetical protein  26.63 
 
 		 343 aa  88.2  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.573481  normal  0.303485 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3009  protein of unknown function UPF0118  29.8 
 
 		 382 aa  87  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0134  hypothetical protein  26.57 
 
 		 358 aa  83.6  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.980357  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2806  hypothetical protein  27.06 
 
 		 372 aa  83.6  0.000000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.217461  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  27.16 
 
 		 341 aa  81.6  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3863  hypothetical protein  28.25 
 
 		 347 aa  81.3  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.596541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4216  hypothetical protein  31.79 
 
 		 346 aa  81.3  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.329203  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02385  predicted inner membrane protein  34.29 
 
 		 353 aa  80.9  0.00000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0762767  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1176  protein of unknown function UPF0118  34.29 
 
 		 353 aa  80.9  0.00000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.412561  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3715  putative permease, PerM family  34.29 
 
 		 353 aa  80.9  0.00000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2640  PerM family permease  34.29 
 
 		 353 aa  80.9  0.00000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2627  PerM family permease  34.29 
 
 		 353 aa  80.9  0.00000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02347  hypothetical protein  34.29 
 
 		 353 aa  80.9  0.00000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.106827  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2775  PerM family permease  34.29 
 
 		 353 aa  80.9  0.00000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0215248  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1183  hypothetical protein  34.29 
 
 		 353 aa  80.9  0.00000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0538168 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2867  putative permease, PerM family  34.29 
 
 		 353 aa  80.9  0.00000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.697689  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2861  permease PerM  29.86 
 
 		 362 aa  80.1  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3926  protein of unknown function UPF0118  25.77 
 
 		 340 aa  80.1  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07661  permease  25.6 
 
 		 358 aa  80.5  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0677332 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2730  permease PerM  29.86 
 
 		 362 aa  80.1  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.659097  normal  0.956035 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1240  putative permease PerM  32.45 
 
 		 354 aa  79.7  0.00000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00935863  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3128  putative permease PerM  32.45 
 
 		 354 aa  79.7  0.00000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00611871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1357  hypothetical protein  32.45 
 
 		 354 aa  79.7  0.00000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2640  permease PerM  29.86 
 
 		 355 aa  80.1  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.419277  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2752  permease PerM  29.86 
 
 		 362 aa  80.1  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2688  permease PerM  29.86 
 
 		 355 aa  80.1  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07191  permease  24.64 
 
 		 359 aa  79.7  0.00000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.626992  normal  0.434396 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0873  hypothetical protein  24.02 
 
 		 347 aa  78.2  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.475897  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09321  permease  23.38 
 
 		 347 aa  78.6  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09331  permease  23.81 
 
 		 347 aa  78.2  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2867  permease PerM, putative  26.09 
 
 		 361 aa  76.3  0.0000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2977  hypothetical protein  31.43 
 
 		 353 aa  76.6  0.0000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.283703 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09400  predicted permease  30.04 
 
 		 357 aa  76.3  0.0000000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.291782 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4793  hypothetical protein  40.57 
 
 		 344 aa  76.3  0.0000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.560868 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6535  protein of unknown function UPF0118  27.96 
 
 		 394 aa  75.9  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.278292  normal  0.0349253 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1195  hypothetical protein  31.76 
 
 		 329 aa  75.9  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1697  hypothetical protein  26.76 
 
 		 360 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.588209  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0209  protein of unknown function UPF0118  27.38 
 
 		 399 aa  74.3  0.000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1792  hypothetical protein  25.76 
 
 		 360 aa  73.2  0.000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2493  protein of unknown function UPF0118  25.76 
 
 		 360 aa  73.2  0.000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.544644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1785  hypothetical protein  25.76 
 
 		 360 aa  73.2  0.000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.539102  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2392  hypothetical protein  23.13 
 
 		 349 aa  73.2  0.000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.89361 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1757  hypothetical protein  26.27 
 
 		 360 aa  73.2  0.000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.805933  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1829  hypothetical protein  25.76 
 
 		 360 aa  73.2  0.000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.2453  normal  0.256539 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3434  protein of unknown function UPF0118  31.9 
 
 		 345 aa  72.8  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1911  hypothetical protein  27.19 
 
 		 372 aa  73.2  0.000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.24805  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2670  protein of unknown function UPF0118  31.9 
 
 		 345 aa  72.8  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1973  hypothetical protein  25.97 
 
 		 369 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0953876  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2201  hypothetical protein  26.54 
 
 		 365 aa  72  0.00000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000750597  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2868  protein of unknown function UPF0118  25.93 
 
 		 400 aa  72.8  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.579917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2233  hypothetical protein  25.96 
 
 		 379 aa  71.6  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.195735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1713  hypothetical protein  25 
 
 		 371 aa  71.6  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.655848  normal  0.476202 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1694  hypothetical protein  28.35 
 
 		 360 aa  72  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.258631  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0823  protein of unknown function UPF0118  24.18 
 
 		 358 aa  71.6  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.74505  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2087  hypothetical protein  27.22 
 
 		 353 aa  71.2  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.257402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2006  hypothetical protein  25.15 
 
 		 363 aa  70.9  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000247505  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0518  hypothetical protein  28.48 
 
 		 387 aa  70.9  0.00000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2345  hypothetical protein  25.82 
 
 		 366 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000997744 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1651  hypothetical protein  26.32 
 
 		 366 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1990  protein of unknown function UPF0118  25.29 
 
 		 372 aa  70.1  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1649  hypothetical protein  31.39 
 
 		 360 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.673436  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2417  hypothetical protein  26.32 
 
 		 366 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.798484  hitchhiker  0.00111788 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7547  protein of unknown function UPF0118  25.91 
 
 		 392 aa  70.1  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.43907  normal  0.494892 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4330  protein of unknown function UPF0118  33.08 
 
 		 358 aa  69.7  0.00000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.490644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1731  protein of unknown function UPF0118  29.17 
 
 		 373 aa  69.3  0.00000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.90656  normal  0.570586 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1998  transporter, putative  29.05 
 
 		 370 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000649848  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1843  hypothetical protein  26.56 
 
 		 366 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.633644  normal  0.110752 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0123  hypothetical protein  26.38 
 
 		 338 aa  69.3  0.0000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0266583  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1330  protein of unknown function UPF0118  24.34 
 
 		 351 aa  68.9  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2957  hypothetical protein  22.91 
 
 		 366 aa  68.9  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0136  protein of unknown function UPF0118  26.62 
 
 		 387 aa  68.9  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.291617  normal  0.459798 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1275  hypothetical protein  29.52 
 
 		 329 aa  68.6  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1640  transport protein  24.58 
 
 		 336 aa  68.6  0.0000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1235  protein of unknown function UPF0118  26.83 
 
 		 354 aa  68.6  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>