More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1191 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1191  YjeF-related protein-like protein  100 
 
 		 449 aa  848    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4659  carbohydrate kinase, YjeF related protein  51.45 
 
 		 457 aa  295  1e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.926939 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2232  hypothetical protein  42.89 
 
 		 499 aa  259  9e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.282439  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1902  hypothetical protein  42.38 
 
 		 499 aa  250  3e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.92371  normal  0.382809 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4579  hypothetical protein  41.46 
 
 		 499 aa  248  1e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.17787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7408  carbohydrate kinase, YjeF related protein  42.56 
 
 		 501 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117304  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6586  carbohydrate kinase, YjeF related protein  44.23 
 
 		 501 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.3812 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1786  YjeF-related protein-like  41.65 
 
 		 468 aa  240  2.9999999999999997e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0751  YjeF family protein  35.06 
 
 		 463 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.553827  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0322  sugar kinase  35.42 
 
 		 466 aa  232  9e-60  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1965  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.79 
 
 		 539 aa  228  2e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2850  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.14 
 
 		 485 aa  227  3e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.182796  normal  0.0582717 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2378  hypothetical protein  41.55 
 
 		 493 aa  226  8e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.946699  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3063  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.05 
 
 		 508 aa  225  1e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.099293  normal  0.0195061 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2191  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.04 
 
 		 522 aa  216  4e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.755695  normal  0.636409 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3587  carbohydrate kinase, YjeF related protein  42 
 
 		 496 aa  215  9.999999999999999e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.439263  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1922  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.7 
 
 		 490 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1006  YjeF family protein  39.61 
 
 		 501 aa  211  3e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0973  YjeF family protein  39.61 
 
 		 501 aa  211  3e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.826646  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1387  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.57 
 
 		 490 aa  210  5e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.470651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3236  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.52 
 
 		 510 aa  210  5e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.358876  normal  0.593017 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0048  carbohydrate kinase, YjeF related protein  43.58 
 
 		 468 aa  209  7e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2329  carbohydrate kinase, YjeF related protein  41.06 
 
 		 507 aa  209  8e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0896222  normal  0.257652 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2650  carbohydrate kinase, YjeF related protein  42.28 
 
 		 507 aa  207  2e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5131  carbohydrate kinase, YjeF related protein  43.36 
 
 		 500 aa  207  3e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2899  hypothetical protein  36.19 
 
 		 499 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.109338 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1837  yjeF related protein  39.8 
 
 		 523 aa  202  7e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1738  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.63 
 
 		 490 aa  202  9e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.203791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2388  hypothetical protein  38.83 
 
 		 499 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.400185 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2560  hypothetical protein  35.98 
 
 		 519 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.40713 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2373  carbohydrate kinase, YjeF related protein  41.46 
 
 		 507 aa  196  7e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.467623 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3313  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.49 
 
 		 499 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1517  YjeF-related protein-like  36.75 
 
 		 581 aa  190  5e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.126424 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2229  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.65 
 
 		 538 aa  187  2e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.355484 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1024  YjeF-related protein-like  38.18 
 
 		 528 aa  186  7e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4460  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.59 
 
 		 509 aa  185  2.0000000000000003e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2089  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.45 
 
 		 500 aa  179  1e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1546  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.93 
 
 		 496 aa  177  5e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.157969  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3322  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.91 
 
 		 492 aa  175  9.999999999999999e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0650972 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1332  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.75 
 
 		 476 aa  175  9.999999999999999e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.977936  normal  0.520853 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0592  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.21 
 
 		 499 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000415893 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0593  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.99 
 
 		 499 aa  172  1e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.320661  hitchhiker  0.00000405423 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1011  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.44 
 
 		 504 aa  171  3e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.311341  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3545  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.12 
 
 		 492 aa  169  6e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3437  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.2 
 
 		 499 aa  168  2e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.446111  normal  0.221498 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1547  hypothetical protein  40.35 
 
 		 526 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.831986  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00644  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.44 
 
 		 499 aa  166  6.9999999999999995e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0630  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.28 
 
 		 499 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.522163 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3285  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.28 
 
 		 499 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00260957  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0951  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.89 
 
 		 479 aa  164  3e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.431816 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0500  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.98 
 
 		 524 aa  164  4.0000000000000004e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0598  yjeF protein  33.91 
 
 		 499 aa  162  2e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0083  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.74 
 
 		 524 aa  160  3e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.452837 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0962  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.82 
 
 		 510 aa  160  3e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1364  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.46 
 
 		 490 aa  159  1e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0355  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.24 
 
 		 500 aa  157  3e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2910  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.79 
 
 		 504 aa  157  3e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.899807  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0461  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.35 
 
 		 528 aa  156  8e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.729395  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3410  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.37 
 
 		 556 aa  155  1e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.802721  normal  0.621844 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1647  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.33 
 
 		 524 aa  155  1e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0299074  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3237  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.05 
 
 		 546 aa  154  2e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.271613 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11168  putative YjeF-related sugar kinase  30.08 
 
 		 511 aa  154  2.9999999999999998e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.291128  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2608  hypothetical protein  37.21 
 
 		 490 aa  153  5.9999999999999996e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.518872  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0086  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.81 
 
 		 523 aa  153  7e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1346  hypothetical protein  35.12 
 
 		 458 aa  152  2e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.212301  hitchhiker  0.000869519 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3243  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.1 
 
 		 502 aa  152  2e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04570  yjeF-like protein, hydroxyethylthiazole kinase-related  37.42 
 
 		 481 aa  150  3e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0993142 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0648  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.45 
 
 		 518 aa  150  4e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1586  carbohydrate kinase  29.66 
 
 		 508 aa  150  6e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3772  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.55 
 
 		 494 aa  149  7e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00405966  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0436  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.59 
 
 		 480 aa  149  1.0000000000000001e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0723  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.52 
 
 		 511 aa  149  1.0000000000000001e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.191783  normal  0.257286 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3898  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.12 
 
 		 494 aa  147  3e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000196302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65390  hypothetical protein  36.97 
 
 		 502 aa  147  3e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1793  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.7 
 
 		 501 aa  146  7.0000000000000006e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0947  hypothetical protein  30.59 
 
 		 515 aa  146  8.000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0608  carbohydrate kinase, YjeF-like protein  34.12 
 
 		 497 aa  145  1e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.723842 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1802  YjeF family protein  33.33 
 
 		 519 aa  145  2e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0891524  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0792  carbohydrate kinase, YjeF-related protein  34.09 
 
 		 492 aa  144  2e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0035803 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4463  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.39 
 
 		 485 aa  145  2e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1264  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.2 
 
 		 527 aa  145  2e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0995  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.05 
 
 		 531 aa  144  4e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1860  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.99 
 
 		 531 aa  144  4e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000355774 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3715  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.9 
 
 		 494 aa  144  4e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5089  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.98 
 
 		 493 aa  143  8e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000420091  normal  0.19658 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3030  YjeF protein  32.91 
 
 		 496 aa  142  9e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1954  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.5 
 
 		 509 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0698225  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2696  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.48 
 
 		 515 aa  142  9.999999999999999e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.590974  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1583  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.87 
 
 		 512 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0797204 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01670  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.87 
 
 		 513 aa  142  9.999999999999999e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0487  hypothetical protein  35.83 
 
 		 513 aa  142  9.999999999999999e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000620084  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1527  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.4 
 
 		 531 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.643488  normal  0.335611 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2084  hypothetical protein  36.79 
 
 		 496 aa  141  1.9999999999999998e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0553  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.68 
 
 		 494 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000595011  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1301  YjeF-related protein  35.75 
 
 		 436 aa  141  3e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2619  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.45 
 
 		 536 aa  141  3e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0949888 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0976  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.92 
 
 		 512 aa  140  4.999999999999999e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000105274  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1482  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.89 
 
 		 470 aa  139  7.999999999999999e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1015  carbohydrate kinase YjeF related protein  35.89 
 
 		 476 aa  139  8.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00295738 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3658  hypothetical protein  32.92 
 
 		 504 aa  139  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000233957  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>