More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1102 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008532  STER_1102  peptide chain release factor 2  100 
 
 		 337 aa  696    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.437069  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1057  peptide chain release factor 2  67.06 
 
 		 365 aa  484  1e-136  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0184  peptide chain release factor 2  64.2 
 
 		 372 aa  441  9.999999999999999e-123  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3194  hypothetical protein  59.09 
 
 		 367 aa  411  1e-114  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2206  hypothetical protein  56.42 
 
 		 373 aa  394  1e-109  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0554  peptide chain release factor 2  59.41 
 
 		 372 aa  396  1e-109  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0168531  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5351  peptide chain release factor 2  56.25 
 
 		 380 aa  393  1e-108  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5293  peptide chain release factor 2  55.95 
 
 		 380 aa  391  1e-108  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5276  peptide chain release factor 2  55.95 
 
 		 380 aa  391  1e-108  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.438705 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5651  peptide chain release factor 2  55.65 
 
 		 380 aa  392  1e-108  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0587322 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0366  peptide chain release factor 2  58.54 
 
 		 332 aa  392  1e-108  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3725  peptide chain release factor 2  56.44 
 
 		 327 aa  386  1e-106  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4867  peptide chain release factor 2  56.13 
 
 		 326 aa  383  1e-105  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4882  peptide chain release factor 2  56.13 
 
 		 326 aa  383  1e-105  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3007  hypothetical protein  57.4 
 
 		 367 aa  384  1e-105  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000736881  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5037  peptide chain release factor 2  55.83 
 
 		 326 aa  380  1e-104  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4980  peptide chain release factor 2  55.21 
 
 		 326 aa  378  1e-104  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0795  peptide chain release factor 2  54.01 
 
 		 369 aa  375  1e-103  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1242  peptide chain release factor 2  51.85 
 
 		 367 aa  372  1e-102  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00779593  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1213  peptide chain release factor 2  51.36 
 
 		 367 aa  374  1e-102  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000166431  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2552  hypothetical protein  52.82 
 
 		 383 aa  372  1e-102  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0478  peptide chain release factor 2  57.54 
 
 		 330 aa  373  1e-102  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000728254  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0365  peptide chain release factor 2  54.88 
 
 		 357 aa  373  1e-102  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0778  peptide chain release factor 2  54.74 
 
 		 331 aa  374  1e-102  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4746  hypothetical protein  52.99 
 
 		 368 aa  369  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2103  hypothetical protein  52.63 
 
 		 372 aa  370  1e-101  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.117234  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1330  protein chain release factor B  55.18 
 
 		 332 aa  368  1e-101  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000274876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3077  peptide chain release factor 2  53.4 
 
 		 332 aa  369  1e-101  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00097655  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0421  peptide chain release factor 2  54.14 
 
 		 371 aa  368  1e-100  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3970  peptide chain release factor 2  50.6 
 
 		 366 aa  365  1e-100  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000632573  unclonable  0.000000000161468 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0864  peptide chain release factor 2  51.96 
 
 		 366 aa  366  1e-100  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0550001  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1762  peptide chain release factor 2  52.12 
 
 		 364 aa  360  2e-98  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000512072  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0230  peptide chain release factor 2  51.38 
 
 		 330 aa  357  1.9999999999999998e-97  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.413245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0467  PE-PGRS family protein  50.15 
 
 		 377 aa  356  3.9999999999999996e-97  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1356  peptide chain release factor 2  52.08 
 
 		 369 aa  353  2.9999999999999997e-96  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0131185  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0544  peptide chain release factor 2  51.51 
 
 		 356 aa  347  2e-94  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00703964  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1305  LigA  51.48 
 
 		 371 aa  345  5e-94  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.926199  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2428  peptide chain release factor 2  50.3 
 
 		 362 aa  345  7e-94  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1248  peptide chain release factor 2  50.15 
 
 		 367 aa  344  1e-93  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.631536  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2138  peptide chain release factor 2  50.3 
 
 		 364 aa  344  1e-93  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1549  peptide chain release factor 2  51.25 
 
 		 369 aa  343  2e-93  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.168139  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0054  peptide chain release factor 2  52.4 
 
 		 371 aa  343  2.9999999999999997e-93  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_509  peptide chain release factor 2  50.3 
 
 		 357 aa  342  4e-93  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231762  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0570  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  50.6 
 
 		 362 aa  342  5e-93  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000011559  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16430  peptide chain release factor 2  52.47 
 
 		 331 aa  342  5.999999999999999e-93  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000953459  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5165  peptide chain release factor 2  48.8 
 
 		 361 aa  341  1e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.847657 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0245  peptide chain release factor 2  50.15 
 
 		 329 aa  340  2.9999999999999998e-92  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1031  peptide chain release factor 2  50.6 
 
 		 379 aa  340  2.9999999999999998e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.158177  normal  0.214686 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2278  peptide chain release factor 2  48.94 
 
 		 372 aa  337  9.999999999999999e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2340  peptide chain release factor 2  48.95 
 
 		 343 aa  337  9.999999999999999e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.538916  normal  0.0748941 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1869  hypothetical protein  49.39 
 
 		 371 aa  335  7e-91  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00638967 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2366  peptide chain release factor 2  49.85 
 
 		 364 aa  334  1e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0020  peptide chain release factor 2  50.62 
 
 		 375 aa  333  2e-90  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00724435  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2079  peptide chain release factor 2  50.46 
 
 		 330 aa  333  2e-90  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2216  peptide chain release factor 2 (bRF-2)  52.66 
 
 		 344 aa  331  1e-89  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00549966  hitchhiker  0.00000471368 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1620  peptide chain release factor 2  48.37 
 
 		 366 aa  331  1e-89  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00133375  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2678  hypothetical protein  50 
 
 		 367 aa  330  2e-89  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.4010800000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2031  peptide chain release factor 2  51.2 
 
 		 363 aa  330  2e-89  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0138456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1369  peptide chain release factor 2  50.61 
 
 		 369 aa  330  3e-89  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0813  peptide chain release factor 2  47.16 
 
 		 374 aa  329  4e-89  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1247  peptide chain release factor 2  51.24 
 
 		 326 aa  328  9e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.0405299999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0328  peptide chain release factor 2  50.94 
 
 		 362 aa  328  1.0000000000000001e-88  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2784  peptide chain release factor 2  49.7 
 
 		 363 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.785261  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0241  peptide chain release factor 2  46.08 
 
 		 334 aa  326  3e-88  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0524747  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0653  peptide chain release factor 2  48.77 
 
 		 369 aa  324  2e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2538  peptide chain release factor 2  49.7 
 
 		 363 aa  323  2e-87  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0437  peptide chain release factor 2  49.38 
 
 		 364 aa  322  5e-87  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0360  peptide chain release factor 2  47.72 
 
 		 365 aa  322  6e-87  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0238  peptide chain release factor 2  49.85 
 
 		 363 aa  321  9.000000000000001e-87  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000385966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1805  peptide chain release factor 2  45.92 
 
 		 358 aa  319  3.9999999999999996e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.361195  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5492  peptide chain release factor 2  48.2 
 
 		 362 aa  319  5e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0496262 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1938  hypothetical protein  46.15 
 
 		 370 aa  318  1e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.374727  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1409  peptide chain release factor 2  50 
 
 		 330 aa  317  2e-85  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0056831  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2879  hypothetical protein  44.64 
 
 		 367 aa  315  9e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0818313  normal  0.0522954 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1172  peptide chain release factor 2  48.95 
 
 		 375 aa  312  4.999999999999999e-84  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.073088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2715  peptide chain release factor 2  48.17 
 
 		 360 aa  312  5.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3258  hypothetical protein  48.01 
 
 		 371 aa  311  7.999999999999999e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1786  peptide chain release factor 2  53.68 
 
 		 317 aa  311  9e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000314162  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2442  peptide chain release factor 2  46.79 
 
 		 356 aa  311  1e-83  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0209  peptide chain release factor 2  49.08 
 
 		 381 aa  311  1e-83  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2314  peptide chain release factor 2  48.34 
 
 		 375 aa  311  1e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00391464  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2038  peptide chain release factor 2  46.99 
 
 		 361 aa  310  2e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.763789  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4596  peptide chain release factor 2  47.13 
 
 		 372 aa  310  2.9999999999999997e-83  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.786099 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2124  peptide chain release factor 2  46.48 
 
 		 356 aa  310  2.9999999999999997e-83  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.66989  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0796  peptide chain release factor 2  48.5 
 
 		 354 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.570581  normal  0.0161038 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0912  peptide chain release factor 2  46.57 
 
 		 375 aa  310  2.9999999999999997e-83  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.779276  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0251  peptide chain release factor 2  50.94 
 
 		 372 aa  309  4e-83  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00360033  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0421  hypothetical protein  47.66 
 
 		 365 aa  309  5e-83  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0257  peptide chain release factor 2  50.62 
 
 		 333 aa  309  5e-83  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000258105  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0584  peptide chain release factor 2  50 
 
 		 366 aa  309  5e-83  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6050  hypothetical protein  45.65 
 
 		 375 aa  308  8e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0534782  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1461  peptide chain release factor 2  48.3 
 
 		 364 aa  307  1.0000000000000001e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2694  hypothetical protein  48.96 
 
 		 375 aa  307  1.0000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.352296 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3422  hypothetical protein  48.96 
 
 		 365 aa  308  1.0000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0748  peptide chain release factor 2  47.88 
 
 		 372 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1216  peptide chain release factor 2  48.5 
 
 		 347 aa  307  2.0000000000000002e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000777998  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1396  peptide chain release factor 2  47.75 
 
 		 376 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0145542  normal  0.663768 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0939  hypothetical protein  46.93 
 
 		 376 aa  307  2.0000000000000002e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2731  hypothetical protein  49.09 
 
 		 376 aa  306  3e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1302  peptide chain release factor 2  50.65 
 
 		 310 aa  306  4.0000000000000004e-82  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.240882  normal  0.14728 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>