More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0901 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008532  STER_0901  putative metCcysK operon transcriptional activator  100 
 
 		 302 aa  614  1e-175  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.176333  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1176  LysR family transcriptional regulator  78.6 
 
 		 290 aa  472  1e-132  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0935  LysR-type transcriptional regulator  61.22 
 
 		 307 aa  380  1e-104  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1649  fhu operon transcription regulator  55.22 
 
 		 317 aa  340  2.9999999999999998e-92  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.133546  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0368  transcriptional regulator, LysR family  53.4 
 
 		 304 aa  338  7e-92  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1728  transcriptional regulator, LysR family  48.64 
 
 		 313 aa  309  2.9999999999999997e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0157868 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0849  transcriptional regulator, LysR family  48.3 
 
 		 310 aa  306  3e-82  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0525  fhu operon transcriptional regulator  47.96 
 
 		 307 aa  306  3e-82  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.262224  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0408  transcriptional regulator, MarR family  47.62 
 
 		 307 aa  293  2e-78  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.469679  hitchhiker  0.00908682 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1229  MarR family transcriptional regulator  46.78 
 
 		 301 aa  285  5e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08410  transcriptional regulator  46.26 
 
 		 308 aa  284  2.0000000000000002e-75  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00913981  normal  0.237754 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0486  LysR family transcriptional regulator  36.03 
 
 		 298 aa  183  4.0000000000000006e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0375  LysR family transcriptional regulator  33 
 
 		 301 aa  175  8e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.104168  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1367  LysR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 301 aa  171  1e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000461256  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0552  LysR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 301 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000594224  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0410  hypothetical protein  35.12 
 
 		 219 aa  145  8.000000000000001e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.340572  hitchhiker  0.00753399 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08390  LysR family regulator  35.1 
 
 		 217 aa  141  9.999999999999999e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0347693  normal  0.270686 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3736  transcriptional regulator, LysR family  30.16 
 
 		 309 aa  108  9.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0757  LysR family transcriptional regulator  27.39 
 
 		 307 aa  107  3e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0649321  hitchhiker  0.00000000000185675 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0858  transcriptional regulator, LysR family  28.06 
 
 		 309 aa  100  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000521501  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2055  LysR family transcriptional regulator  26.05 
 
 		 302 aa  99  9e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.505103  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1553  LysR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 305 aa  95.1  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3737  transcriptional regulator, LysR family  29.19 
 
 		 307 aa  92.8  6e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.295793  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0810  transcriptional regulator, LysR family  27.42 
 
 		 307 aa  90.9  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2673  LysR family transcriptional regulator  24.27 
 
 		 303 aa  89.7  6e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0382  transcriptional regulator, LysR family  26.03 
 
 		 302 aa  88.2  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3044  LysR family transcriptional regulator  24.6 
 
 		 301 aa  85.9  8e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.727695 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4615  transcriptional regulator, LysR family  26.76 
 
 		 307 aa  84  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.40562  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0809  transcriptional regulator, LysR family  28.83 
 
 		 321 aa  83.6  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0360  LysR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 313 aa  82.8  0.000000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08730  transcriptional regulator  25.68 
 
 		 303 aa  81.6  0.00000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.188975 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2118  LysR family transcriptional regulator  24.24 
 
 		 294 aa  81.6  0.00000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0933  transcriptional regulator, LysR family  25.89 
 
 		 305 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3007  LysR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 308 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1543  transcriptional regulator, LysR family  23.2 
 
 		 298 aa  80.5  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.114968 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1238  LysR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 301 aa  80.5  0.00000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1434  transcriptional regulator, LysR family  23.53 
 
 		 308 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6428  LysR family transcriptional regulator  24.17 
 
 		 301 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.410616 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1351  LysR family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 325 aa  79.3  0.00000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3915  LysR family transcriptional regulator  23.7 
 
 		 301 aa  79  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5544  LysR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 301 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.899335 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6822  LysR family transcriptional regulator  24.89 
 
 		 299 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2618  LysR substrate-binding  26.81 
 
 		 292 aa  77.4  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1798  transcriptional regulator, LysR family  31.61 
 
 		 318 aa  77  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.103195  normal  0.329714 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2565  LysR family transcriptional regulator  26.81 
 
 		 292 aa  77.4  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0362  LysR family transcriptional regulator  24.68 
 
 		 301 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1585  LysR family transcriptional regulator  23.49 
 
 		 323 aa  77  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4872  LysR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 295 aa  77.4  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.511733  normal  0.704501 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6140  LysR family transcriptional regulator  25.17 
 
 		 301 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1845  transcriptional regulator, LysR family  28.43 
 
 		 308 aa  76.6  0.0000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.313803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4520  Transcriptional regulator-like protein  40 
 
 		 291 aa  76.6  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.629454 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2000  LysR family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 289 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.504431  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3260  LysR family transcriptional regulator  22.85 
 
 		 305 aa  76.3  0.0000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.444883 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2385  LysR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 313 aa  75.9  0.0000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1875  LysR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 307 aa  75.9  0.0000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.219767  normal  0.699734 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3225  LysR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 315 aa  75.9  0.0000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.996696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09290  transcriptional regulator  26.96 
 
 		 316 aa  75.5  0.000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.240748  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1735  LysR family transcriptional regulator  25.1 
 
 		 289 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.173814  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6604  LysR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 315 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0610737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0055  LysR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 309 aa  75.1  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3338  transcriptional regulator, LysR family  24.75 
 
 		 312 aa  74.3  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1538  transcriptional regulator, LysR family  25.66 
 
 		 299 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0429395 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3776  transcriptional regulator, LysR family  25.66 
 
 		 299 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0225  transcriptional regulator, LysR family  23.95 
 
 		 313 aa  74.7  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000929785  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1778  LysR family transcriptional regulator  25.48 
 
 		 289 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000761412  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3231  LysR family transcriptional regulator  26.82 
 
 		 297 aa  74.7  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1356  LysR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 329 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.79958  normal  0.0413241 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1916  LysR family transcriptional regulator  25.48 
 
 		 289 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0657607  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3479  transcriptional regulator, LysR family  23.93 
 
 		 297 aa  74.7  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1383  transcriptional regulator, LysR family  25.08 
 
 		 300 aa  74.3  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2994  LysR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 295 aa  74.7  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0317639  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1287  transcriptional regulator CysB-like protein  26.62 
 
 		 319 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.767639  normal  0.313196 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2090  LysR family transcriptional regulator  26.82 
 
 		 293 aa  74.3  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.115384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1790  LysR family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 289 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000399419  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0579  LysR substrate-binding protein  23.19 
 
 		 299 aa  74.7  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1757  LysR family transcriptional regulator  24.71 
 
 		 289 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3416  DNA-binding transcriptional regulator CynR  34.38 
 
 		 288 aa  73.9  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.144678  normal  0.641219 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0535  LysR family transcriptional regulator  24.2 
 
 		 296 aa  73.9  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.524385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2573  LysR family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 320 aa  73.9  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4959  LysR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 298 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2533  LysR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 340 aa  73.9  0.000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.572705 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1224  transcriptional regulator CysB-like protein  26.62 
 
 		 319 aa  73.9  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.178615  normal  0.191747 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4360  LysR family transcriptional regulator  23.45 
 
 		 299 aa  73.6  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.623991  normal  0.557987 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3354  LysR family transcriptional regulator  25 
 
 		 302 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.910894  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2625  transcriptional regulator, LysR family  37.97 
 
 		 299 aa  73.6  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000460304  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2330  LysR family transcriptional regulator  23.61 
 
 		 303 aa  73.2  0.000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3423  transcriptional regulator, LysR family  26.25 
 
 		 289 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000235779 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3562  LysR family transcriptional regulator  23.76 
 
 		 296 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5976  LysR family transcriptional regulator  26.05 
 
 		 316 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0380  transcriptional regulator LysR family  25.55 
 
 		 309 aa  72.8  0.000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0222  LysR family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 307 aa  73.2  0.000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1826  transcriptional regulator, LysR family  24.76 
 
 		 327 aa  72.8  0.000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1225  LysR family transcriptional regulator  24.01 
 
 		 306 aa  72.8  0.000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0147  LysR family transcriptional regulator  25.9 
 
 		 312 aa  72.8  0.000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.951871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0835  LysR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 282 aa  72.4  0.000000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1778  hydrogen peroxide-inducible genes activator  24.52 
 
 		 296 aa  72.4  0.000000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2512  transcriptional regulator, LysR family protein  43.84 
 
 		 299 aa  72.4  0.000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02660  LysR family transcriptional regulator  24.66 
 
 		 306 aa  72.4  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.319663  normal  0.331966 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0303  putative transcriptional regulator  24.66 
 
 		 306 aa  72.4  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2215  LysR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 293 aa  72.4  0.000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>