More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0809 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0809  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 321 aa  645    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3736  transcriptional regulator, LysR family  48.29 
 
 		 309 aa  301  1e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0810  transcriptional regulator, LysR family  34.65 
 
 		 307 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3737  transcriptional regulator, LysR family  32.04 
 
 		 307 aa  154  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.295793  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2673  LysR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 303 aa  133  3.9999999999999996e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1826  transcriptional regulator, LysR family  27.41 
 
 		 327 aa  119  6e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0360  LysR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 313 aa  112  6e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4866  transcriptional regulator, LysR family  24.92 
 
 		 304 aa  95.1  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0084  LysR family transcriptional regulator  23.89 
 
 		 311 aa  92.8  7e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.446413  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1912  transcriptional regulator, LysR family  23.57 
 
 		 301 aa  92  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000315182  normal  0.0709139 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2450  transcriptional regulator, LysR family  32.89 
 
 		 311 aa  91.3  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4911  transcriptional regulator, LysR family  25.79 
 
 		 303 aa  90.5  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000218109  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0091  transcriptional regulator, LysR family  25.11 
 
 		 311 aa  90.1  4e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00035  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  28.08 
 
 		 302 aa  89.7  6e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0650  transcriptional regulator, LysR family  29.53 
 
 		 313 aa  89.4  9e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.344002 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2323  oxidative stress transcriptional regulator  21.4 
 
 		 301 aa  88.6  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.523521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0101  transcriptional regulator, LysR family  24.67 
 
 		 311 aa  89  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2213  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  29.19 
 
 		 297 aa  89  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02139  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 289 aa  87.8  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0757  LysR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 307 aa  87.4  3e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0649321  hitchhiker  0.00000000000185675 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002320  Transcriptional regulator, LysR family  27.59 
 
 		 303 aa  87  3e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.726256  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08961  transcriptional regulator, LysR family protein  29.87 
 
 		 312 aa  87  4e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003682  transcriptional regulator LysR family  32.68 
 
 		 289 aa  86.3  6e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1224  LysR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 289 aa  85.9  8e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00292  DNA-binding transcriptional dual regulator  29.53 
 
 		 299 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3268  transcriptional regulator, LysR family  29.53 
 
 		 299 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00296  hypothetical protein  29.53 
 
 		 299 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3225  transcriptional regulator, LysR family  25.37 
 
 		 300 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.456811 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2428  transcriptional regulator CysB  27 
 
 		 323 aa  85.1  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1115  transcriptional regulator, LysR family  23.72 
 
 		 301 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6511  transcriptional regulator, LysR family  32.89 
 
 		 315 aa  84.7  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000105391  normal  0.0531961 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1405  LysR family transcriptional regulator  24.81 
 
 		 302 aa  84.7  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.893483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5024  LysR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 311 aa  84.3  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0432035  normal  0.889367 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4615  transcriptional regulator, LysR family  23.39 
 
 		 307 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.40562  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1036  transcriptional regulator, LysR family  25 
 
 		 300 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0901  putative metCcysK operon transcriptional activator  28.83 
 
 		 302 aa  83.6  0.000000000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.176333  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2850  LysR family substrate binding transcriptional regulator  30.65 
 
 		 290 aa  83.2  0.000000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.46504  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5655  transcriptional regulator, LysR family  31.76 
 
 		 310 aa  83.2  0.000000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1778  hydrogen peroxide-inducible genes activator  23.18 
 
 		 296 aa  82.8  0.000000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2223  transcriptional regulator, LysR family  23.4 
 
 		 302 aa  82.8  0.000000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1779  hydrogen peroxide-inducible genes activator  22.57 
 
 		 296 aa  82  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2818  transcriptional regulator CysB-like protein  29.77 
 
 		 313 aa  82  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5225  transcriptional regulator, LysR family  28.48 
 
 		 316 aa  82.4  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1045  transcriptional regulator, LysR family  26.17 
 
 		 303 aa  82  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2698  transcriptional regulator CysB-like protein  29.11 
 
 		 313 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1389  LysR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 295 aa  81.6  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.148304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0403  DNA-binding transcriptional regulator CynR  28.5 
 
 		 299 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0369  DNA-binding transcriptional regulator CynR  28.5 
 
 		 299 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1615  LysR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 311 aa  81.3  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0196883 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1553  LysR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 305 aa  81.6  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0362  DNA-binding transcriptional regulator CynR  28.5 
 
 		 299 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.709016  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2714  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  29.33 
 
 		 302 aa  80.5  0.00000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3287  DNA-binding transcriptional regulator CynR  28.5 
 
 		 299 aa  80.9  0.00000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2851  transcriptional regulator, LysR family  24.81 
 
 		 314 aa  80.9  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3244  LysR family transcriptional regulator  21.63 
 
 		 306 aa  80.5  0.00000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0055  LysR family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 309 aa  80.9  0.00000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2427  transcriptional regulator CysB-like protein  26.39 
 
 		 313 aa  80.5  0.00000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1684  LysR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 299 aa  80.5  0.00000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00688867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3416  DNA-binding transcriptional regulator CynR  33.06 
 
 		 288 aa  80.1  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.144678  normal  0.641219 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2396  transcriptional regulator, LysR family  26.89 
 
 		 300 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2937  transcriptional regulator, LysR family  26.52 
 
 		 300 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0387356  hitchhiker  0.00000808392 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4220  LysR substrate-binding  28.86 
 
 		 310 aa  80.1  0.00000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.829195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5151  LysR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 302 aa  80.1  0.00000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.606064  normal  0.58822 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0520  hydrogen peroxide-inducible genes activator  29.29 
 
 		 311 aa  80.1  0.00000000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.454545  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0222  LysR family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 307 aa  79.7  0.00000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3761  redox-sensitive transcriptional activator OxyR  24.07 
 
 		 314 aa  79.7  0.00000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3534  LysR substrate-binding protein  35.57 
 
 		 292 aa  79.3  0.00000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2787  LysR family transcriptional regulator  24.81 
 
 		 305 aa  79.3  0.00000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5763  LysR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 316 aa  79  0.00000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2747  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 305 aa  79  0.00000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.437645  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0036  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  23.92 
 
 		 304 aa  79.3  0.00000000000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1654  hydrogen peroxide-inducible genes activator  28.79 
 
 		 311 aa  78.6  0.0000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00724333  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4465  transcriptional regulator, LysR family  33.11 
 
 		 319 aa  78.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00192923  normal  0.232029 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1555  LysR family transcriptional regulator  23.76 
 
 		 318 aa  79  0.0000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214293  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0898  transcriptional regulator, LysR family  25.86 
 
 		 293 aa  79  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0383  transcriptional regulator, LysR family  25.45 
 
 		 297 aa  78.6  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.715241  normal  0.903063 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1708  LysR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 311 aa  78.6  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00211796 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4402  transcriptional regulator, LysR family  33.11 
 
 		 319 aa  78.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2691  transcriptional regulator CysB-like protein  26.02 
 
 		 313 aa  79  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.644017  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06000  transcriptional regulator  31.28 
 
 		 311 aa  78.6  0.0000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.271316 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1351  LysR family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 325 aa  77.8  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0368  transcriptional regulator, LysR family  27.62 
 
 		 304 aa  78.2  0.0000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0411  DNA-binding transcriptional regulator CynR  27.6 
 
 		 299 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0711  transcriptional regulator, LysR family  27.5 
 
 		 319 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2522  LysR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 319 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0196222  normal  0.718346 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1050  LysR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 304 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.389314 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3987  LysR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 319 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.273719 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4028  LysR family transcriptional regulator  23.45 
 
 		 323 aa  78.2  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0835  LysR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 282 aa  78.2  0.0000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0836  transcriptional regulator, LysR family  26.91 
 
 		 304 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.192255  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1976  transcriptional regulator, LysR family  22.85 
 
 		 343 aa  77.8  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.66022  normal  0.44727 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01251  DNA-binding transcriptional dual regulator, O-acetyl-L-serine-binding  23.98 
 
 		 324 aa  77.8  0.0000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.255079  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0748  LysR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 310 aa  77.4  0.0000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1475  transcriptional regulator CysB  23.98 
 
 		 324 aa  77.8  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00044374  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1384  transcriptional regulator CysB  23.98 
 
 		 324 aa  77.8  0.0000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01261  hypothetical protein  23.98 
 
 		 324 aa  77.8  0.0000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.234561  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3739  LysR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 307 aa  77.4  0.0000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.717698  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1907  transcriptional regulator CysB  23.98 
 
 		 324 aa  77.8  0.0000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0524894  hitchhiker  2.34231e-17 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68920  LysR family transcriptional regulator  23.26 
 
 		 304 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.196948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1501  transcriptional regulator CysB  23.98 
 
 		 324 aa  77.8  0.0000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.7918  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>