More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0383 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0836  translation initiation factor IF-2  59.14 
 
 		 720 aa  793    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3860  translation initiation factor IF-2  65.25 
 
 		 686 aa  783    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000141928  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3851  translation initiation factor IF-2  65.25 
 
 		 686 aa  783    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.970916  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0381  translation initiation factor IF-2  73.56 
 
 		 927 aa  1284    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3664  translation initiation factor IF-2  64.91 
 
 		 686 aa  781    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3554  translation initiation factor IF-2  65.25 
 
 		 686 aa  783    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3572  translation initiation factor IF-2  65.25 
 
 		 686 aa  783    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0457  translation initiation factor IF-2  54.67 
 
 		 1161 aa  648    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0699  translation initiation factor IF-2  60.54 
 
 		 752 aa  804    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000680705  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1355  translation initiation factor IF-2  63.88 
 
 		 705 aa  768    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.657841  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3911  translation initiation factor IF-2  63.44 
 
 		 686 aa  782    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1155  translation initiation factor IF-2  66.16 
 
 		 732 aa  803    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000874472  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1333  translation initiation factor IF-2  64.4 
 
 		 688 aa  776    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0112644  hitchhiker  0.000569775 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3950  translation initiation factor IF-2  64.91 
 
 		 686 aa  781    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.373868  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1050  translation initiation factor 2  41.65 
 
 		 903 aa  650    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000107022  unclonable  0.0000000303018 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1329  translation initiation factor IF-2  63.88 
 
 		 705 aa  768    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1435  translation initiation factor IF-2  59.13 
 
 		 860 aa  712    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0755934  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1957  translation initiation factor IF-2  45.98 
 
 		 985 aa  681    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2465  translation initiation factor IF-2  65.42 
 
 		 689 aa  783    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000966946  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3676  translation initiation factor IF-2  55.41 
 
 		 971 aa  669    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156109  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0817  translation initiation factor IF-2  71.45 
 
 		 950 aa  951    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0433  translation initiation factor IF-2  62.06 
 
 		 829 aa  739    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0814  translation initiation factor IF-2  48.71 
 
 		 882 aa  835    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0318288 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1355  translation initiation factor IF-2  57.06 
 
 		 834 aa  762    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.723459  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0383  translation initiation factor IF-2  100 
 
 		 943 aa  1912    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3635  translation initiation factor IF-2  64.22 
 
 		 688 aa  776    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0196676  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2047  translation initiation factor IF-2  65.48 
 
 		 739 aa  789    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1302  translation initiation factor IF-2  47.37 
 
 		 986 aa  628  1e-178  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.454709  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1051  translation initiation factor IF-2  55.56 
 
 		 845 aa  628  1e-178  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3188  translation initiation factor IF-2  49.12 
 
 		 1029 aa  628  1e-178  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000140569  normal  0.29235 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2981  translation initiation factor IF-2  47.81 
 
 		 980 aa  628  1e-178  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.22631e-28 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1555  translation initiation factor IF-2  48.38 
 
 		 947 aa  625  1e-177  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000482401  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1586  translation initiation factor IF-2  52.56 
 
 		 884 aa  624  1e-177  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000230757  normal  0.126599 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1662  translation initiation factor IF-2  52.22 
 
 		 822 aa  620  1e-176  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.775404  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1901  translation initiation factor IF-2  52.9 
 
 		 882 aa  621  1e-176  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.650972  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1940  translation initiation factor IF-2  53.61 
 
 		 679 aa  622  1e-176  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.995818  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1658  translation initiation factor IF-2  53.61 
 
 		 679 aa  621  1e-176  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1810  translation initiation factor IF-2  53.01 
 
 		 920 aa  621  1e-176  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0893364  normal  0.24179 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1588  translation initiation factor IF-2  52.22 
 
 		 883 aa  614  9.999999999999999e-175  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0169841  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1309  translation initiation factor IF-2  53.23 
 
 		 924 aa  614  9.999999999999999e-175  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0121044  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0900  translation initiation factor IF-2  51.27 
 
 		 882 aa  612  9.999999999999999e-175  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.437883  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl295  translation initiation factor IF-2  52.63 
 
 		 629 aa  609  1e-173  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000364465  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1669  translation initiation factor IF-2  52.33 
 
 		 949 aa  607  9.999999999999999e-173  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0991  translation initiation factor 2  57.04 
 
 		 1035 aa  606  9.999999999999999e-173  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0315386  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0963  translation initiation factor IF-2  46.52 
 
 		 921 aa  607  9.999999999999999e-173  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1106  translation initiation factor IF-2  51.95 
 
 		 896 aa  602  1.0000000000000001e-171  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1645  translation initiation factor IF-2  53.29 
 
 		 692 aa  605  1.0000000000000001e-171  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0509218  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07840  translation initiation factor IF-2  53.2 
 
 		 686 aa  603  1.0000000000000001e-171  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2774  translation initiation factor IF-2  54.23 
 
 		 1131 aa  601  1e-170  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0650084  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03396  translation initiation factor IF-2  46.58 
 
 		 894 aa  600  1e-170  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0926  translation initiation factor IF-2  48.96 
 
 		 888 aa  598  1e-169  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0148793  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3781  translation initiation factor IF-2  46.26 
 
 		 873 aa  597  1e-169  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.322768  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0489  translation initiation factor IF-2  47.75 
 
 		 895 aa  594  1e-168  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.160314 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2316  translation initiation factor IF-2  51.21 
 
 		 1116 aa  592  1e-168  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.100815  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2827  translation initiation factor IF-2  50.57 
 
 		 885 aa  593  1e-168  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00613346 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0609  translation initiation factor IF-2  51.96 
 
 		 711 aa  594  1e-168  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000891187  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2561  translation initiation factor IF-2  51.05 
 
 		 943 aa  590  1e-167  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.334789  normal  0.0201615 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2203  translation initiation factor IF-2  47.98 
 
 		 889 aa  590  1e-167  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1247  translation initiation factor IF-2  51.22 
 
 		 943 aa  592  1e-167  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0182707  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0174  translation initiation factor IF-2  52.59 
 
 		 898 aa  590  1e-167  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00015566  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0367  translation initiation factor IF-2  51.89 
 
 		 936 aa  592  1e-167  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000368497  normal  0.59996 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2134  translation initiation factor IF-2  51.73 
 
 		 978 aa  592  1e-167  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.149988  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01335  putative translation initiation factor  49.68 
 
 		 943 aa  591  1e-167  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1261  translation initiation factor IF-2  51.72 
 
 		 945 aa  592  1e-167  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.817984  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002609  translation initiation factor 2  53.45 
 
 		 902 aa  590  1e-167  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0255  translation initiation factor IF-2  51.87 
 
 		 979 aa  586  1e-166  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0830  translation initiation factor IF-2  52.07 
 
 		 879 aa  588  1e-166  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.122611  unclonable  0.0000000598475 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0697  translation initiation factor IF-2  50.08 
 
 		 922 aa  587  1e-166  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.248102  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2011  translation initiation factor IF-2  51.31 
 
 		 992 aa  589  1e-166  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.577771  normal  0.890025 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2748  translation initiation factor IF-2  53.25 
 
 		 984 aa  587  1e-166  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1779  translation initiation factor IF-2  50.86 
 
 		 915 aa  583  1.0000000000000001e-165  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0123912  normal  0.0703365 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3162  translation initiation factor IF-2  48.71 
 
 		 984 aa  582  1.0000000000000001e-165  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2426  translation initiation factor IF-2  52.62 
 
 		 968 aa  582  1.0000000000000001e-165  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0271781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3596  translation initiation factor IF-2  46.57 
 
 		 892 aa  585  1.0000000000000001e-165  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000160504  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1444  translation initiation factor 2 (bIF-2)  51.2 
 
 		 673 aa  582  1.0000000000000001e-165  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000295252  normal  0.305972 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2990  translation initiation factor IF-2  51.63 
 
 		 953 aa  583  1.0000000000000001e-165  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.292743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0990  translation initiation factor IF-2  45.06 
 
 		 881 aa  585  1.0000000000000001e-165  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.106597  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3730  translation initiation factor IF-2  46.57 
 
 		 892 aa  585  1.0000000000000001e-165  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.187768  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3389  translation initiation factor IF-2  48.66 
 
 		 896 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.479948  hitchhiker  0.00172114 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0141  translation initiation factor IF-2  50.85 
 
 		 1010 aa  580  1e-164  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0067  translation initiation factor 2  49.6 
 
 		 907 aa  579  1e-164  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00109363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3060  translation initiation factor IF-2  51.19 
 
 		 896 aa  582  1e-164  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.382802  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3930  translation initiation factor IF-2  51.96 
 
 		 856 aa  580  1e-164  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1026  translation initiation factor IF-2  46.95 
 
 		 885 aa  581  1e-164  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.748082  hitchhiker  0.0000041871 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1091  translation initiation factor IF-2  46.95 
 
 		 885 aa  581  1e-164  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.193665  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0402  translation initiation factor IF-2  51.37 
 
 		 911 aa  581  1e-164  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000176778  normal  0.341297 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3727  translation initiation factor 2  48.9 
 
 		 949 aa  580  1e-164  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1030  translation initiation factor IF-2  47.75 
 
 		 889 aa  581  1e-164  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000967139 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3561  translation initiation factor IF-2  49.05 
 
 		 894 aa  582  1e-164  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000180014 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1630  translation initiation factor IF-2  46.33 
 
 		 956 aa  582  1e-164  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0961  translation initiation factor IF-2  46.36 
 
 		 882 aa  580  1e-164  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.875845  normal  0.117843 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2433  translation initiation factor IF-2  50.68 
 
 		 1079 aa  582  1e-164  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.189984  normal  0.802602 
 
 
-
 
NC_004310  BR2165  translation initiation factor IF-2  50.34 
 
 		 959 aa  576  1.0000000000000001e-163  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.34369  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1204  translation initiation factor IF-2  46.57 
 
 		 885 aa  579  1.0000000000000001e-163  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2077  translation initiation factor IF-2  50.34 
 
 		 990 aa  577  1.0000000000000001e-163  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.146331  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3383  translation initiation factor IF-2  50 
 
 		 943 aa  577  1.0000000000000001e-163  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.121659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2834  translation initiation factor IF-2  47.88 
 
 		 880 aa  576  1.0000000000000001e-163  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1007  translation initiation factor IF-2  46.96 
 
 		 884 aa  578  1.0000000000000001e-163  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.605303  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0598  translation initiation factor IF-2  52.15 
 
 		 891 aa  578  1.0000000000000001e-163  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.223745  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0369  translation initiation factor IF-2  50.34 
 
 		 991 aa  578  1.0000000000000001e-163  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0109319  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>