More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1184 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1184  TPR domain-containing protein  100 
 
 		 222 aa  451  1.0000000000000001e-126  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.441654  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1711  TPR repeat-containing protein  71.17 
 
 		 222 aa  332  4e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1677  TPR repeat-containing protein  71.17 
 
 		 222 aa  332  4e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0721  TPR domain protein  37.56 
 
 		 219 aa  141  7e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4515  TPR domain protein  37.56 
 
 		 219 aa  141  8e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.037102  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3107  TPR repeat-containing protein  38.42 
 
 		 219 aa  141  9e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4475  TPR domain protein  37.56 
 
 		 219 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000190548 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4290  TPR domain-containing protein  37.56 
 
 		 219 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4127  TPR repeat-containing protein  37.56 
 
 		 219 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0499017  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4138  TPR repeat-containing protein  37.56 
 
 		 219 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4624  TPR domain-containing protein  37.56 
 
 		 219 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.472019  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4242  TPR repeat-containing protein  36.95 
 
 		 219 aa  138  6e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4478  TPR domain-containing protein  37.07 
 
 		 219 aa  138  7e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.404717  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4528  TPR domain protein  37.07 
 
 		 219 aa  138  7e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000798973  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2496  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.27 
 
 		 222 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0955  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.6 
 
 		 220 aa  122  4e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  29.74 
 
 		 878 aa  83.6  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  27.92 
 
 		 4079 aa  83.6  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  29.85 
 
 		 543 aa  80.9  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  26.88 
 
 		 730 aa  79.7  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0163  TPR repeat-containing protein  33.53 
 
 		 356 aa  79.3  0.00000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00233758  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.65 
 
 		 810 aa  78.2  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  31.25 
 
 		 1694 aa  76.6  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1483  TPR repeat-containing protein  27.83 
 
 		 221 aa  75.5  0.0000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  30.66 
 
 		 795 aa  75.1  0.0000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4605  TPR repeat-containing protein  26.32 
 
 		 279 aa  74.7  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  30.72 
 
 		 685 aa  73.6  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  27.1 
 
 		 1979 aa  73.9  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5110  TPR repeat-containing protein  24.87 
 
 		 288 aa  72.4  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  27.72 
 
 		 340 aa  72.4  0.000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  29.21 
 
 		 576 aa  71.6  0.000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.61 
 
 		 632 aa  70.9  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0607  TPR repeat-containing protein  28.78 
 
 		 227 aa  70.1  0.00000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2005  TPR repeat-containing protein  28.35 
 
 		 512 aa  69.7  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.915591 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  26.04 
 
 		 397 aa  69.7  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  30.11 
 
 		 505 aa  69.7  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  29.52 
 
 		 725 aa  68.9  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2320  TPR repeat-containing protein  29.38 
 
 		 617 aa  69.3  0.00000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  28.02 
 
 		 762 aa  68.9  0.00000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  24.63 
 
 		 620 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  26.19 
 
 		 1276 aa  68.6  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  25.26 
 
 		 465 aa  68.2  0.00000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.74 
 
 		 689 aa  68.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  27.18 
 
 		 927 aa  67.8  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  27.49 
 
 		 1007 aa  68.2  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  23.65 
 
 		 620 aa  67  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2405  hypothetical protein  26.4 
 
 		 577 aa  67  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  24.61 
 
 		 3560 aa  66.6  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1603  TPR repeat-containing protein  28.19 
 
 		 804 aa  67.4  0.0000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0755  TPR repeat-containing protein  27.23 
 
 		 421 aa  67  0.0000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4981  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.7 
 
 		 384 aa  66.6  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.389941 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  29.09 
 
 		 362 aa  66.6  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  26.37 
 
 		 626 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  26.2 
 
 		 1676 aa  66.2  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1653  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.02 
 
 		 758 aa  66.2  0.0000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.82 
 
 		 1056 aa  65.9  0.0000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.27 
 
 		 988 aa  65.5  0.0000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  24.87 
 
 		 615 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  30.37 
 
 		 603 aa  65.5  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.87 
 
 		 818 aa  65.1  0.0000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  27.44 
 
 		 1297 aa  65.1  0.0000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2549  hypothetical protein  25.89 
 
 		 577 aa  64.7  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  29.7 
 
 		 681 aa  64.3  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  30.86 
 
 		 267 aa  64.7  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4945  TPR repeat-containing protein  28.32 
 
 		 750 aa  64.3  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  25.91 
 
 		 486 aa  64.7  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1518  TPR repeat-containing protein  28.71 
 
 		 597 aa  64.3  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00971618 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  25 
 
 		 837 aa  63.5  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_002950  PG0982  TPR domain-containing protein  25.62 
 
 		 750 aa  63.9  0.000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.682285 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1536  TPR domain-containing protein  30.85 
 
 		 174 aa  63.9  0.000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.87 
 
 		 784 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1449  tetratricopeptide TPR_2  30.63 
 
 		 1067 aa  63.9  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2953  TPR repeat-containing protein  27.38 
 
 		 711 aa  63.9  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0781794 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.75 
 
 		 1022 aa  63.5  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3466  TPR repeat-containing protein  27.66 
 
 		 374 aa  63.5  0.000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2196  sulfotransferase  25.96 
 
 		 648 aa  63.5  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.8 
 
 		 1056 aa  62.8  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  22.5 
 
 		 561 aa  62.8  0.000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  26.97 
 
 		 909 aa  62.4  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2243  TPR repeat-containing protein  26.54 
 
 		 311 aa  62.4  0.000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.6122  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1955  TPR repeat-containing protein  26.54 
 
 		 311 aa  62.4  0.000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0490064  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  23.58 
 
 		 1737 aa  62.4  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2672  TPR domain-containing protein  29.38 
 
 		 446 aa  62.4  0.000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.306988  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.57 
 
 		 1034 aa  62  0.000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2367  protein kinase  23.84 
 
 		 623 aa  62.4  0.000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  31.29 
 
 		 750 aa  62  0.000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  26.09 
 
 		 828 aa  62  0.000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  23.88 
 
 		 718 aa  62  0.000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  28.8 
 
 		 733 aa  62  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  26.09 
 
 		 828 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  27.57 
 
 		 1005 aa  61.6  0.000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  25.16 
 
 		 561 aa  61.6  0.000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2985  sulfotransferase  24.87 
 
 		 1077 aa  61.2  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1947  tetratricopeptide TPR_2  23.27 
 
 		 564 aa  61.2  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0106408 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1704  TPR repeat-containing protein  28.4 
 
 		 265 aa  60.8  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12979e-21 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0151  TPR repeat-containing protein  31.78 
 
 		 833 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  24.61 
 
 		 740 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2328  TPR repeat-containing protein  23.41 
 
 		 363 aa  60.1  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.759887 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  24.53 
 
 		 614 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  24.53 
 
 		 614 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>