More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0293 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0293  DNA mismatch repair protein MutL  100 
 
 		 532 aa  1010    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0157  DNA mismatch repair protein MutL  33.87 
 
 		 559 aa  312  9e-84  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2088  DNA mismatch repair protein  39.9 
 
 		 601 aa  300  4e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.02775 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1186  DNA mismatch repair protein  34.61 
 
 		 575 aa  292  9e-78  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00913008  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0845  DNA mismatch repair protein  34.61 
 
 		 574 aa  291  1e-77  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00243998  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0628  DNA mismatch repair protein MutL  40.65 
 
 		 582 aa  288  2e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.100256  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0554  DNA mismatch repair protein MutL  39.18 
 
 		 565 aa  285  2.0000000000000002e-75  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0100  DNA mismatch repair protein MutL  35.97 
 
 		 605 aa  281  1e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1331  DNA mismatch repair protein MutL  36.23 
 
 		 579 aa  281  1e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_978  DNA mismatch repair protein, MutL/HexB family  35.04 
 
 		 566 aa  281  3e-74  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1924  DNA mismatch repair protein MutL  37.52 
 
 		 560 aa  279  9e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1195  MutL/HexB family DNA mismatch repair protein  34.98 
 
 		 566 aa  279  1e-73  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0321912  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0293  DNA mismatch repair protein  36.83 
 
 		 602 aa  276  6e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2053  DNA mismatch repair protein  35.68 
 
 		 622 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00117239  hitchhiker  0.0000000712721 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1478  DNA mismatch repair protein MutL  35.43 
 
 		 557 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.064699  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1078  DNA mismatch repair protein MutL  31.53 
 
 		 572 aa  270  4e-71  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2713  DNA mismatch repair protein  37.9 
 
 		 606 aa  268  2e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1006  DNA mismatch repair protein MutL  33.81 
 
 		 566 aa  265  2e-69  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1951  DNA mismatch repair protein  36.89 
 
 		 585 aa  264  4e-69  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.448925  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4855  DNA mismatch repair protein  35.91 
 
 		 595 aa  261  2e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1499  DNA mismatch repair protein MutL  28.3 
 
 		 589 aa  258  2e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2771  DNA mismatch repair protein  46.97 
 
 		 629 aa  256  5e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2634  DNA mismatch repair protein  45.12 
 
 		 641 aa  256  6e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00330895  unclonable  0.0000000000120627 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2669  DNA mismatch repair protein  46.25 
 
 		 630 aa  256  7e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.680786  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0800  DNA mismatch repair protein MutL  30.7 
 
 		 586 aa  256  1.0000000000000001e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1715  DNA mismatch repair protein  49.28 
 
 		 608 aa  255  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.233899  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2223  DNA mismatch repair protein  47.92 
 
 		 607 aa  255  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.38556  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0433  DNA mismatch repair protein MutL  38.01 
 
 		 544 aa  255  2.0000000000000002e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.397658  normal  0.543427 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0034  DNA mismatch repair protein MutL  50.16 
 
 		 590 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2133  DNA mismatch repair protein  50.15 
 
 		 607 aa  254  3e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1168  DNA mismatch repair protein  32.89 
 
 		 588 aa  254  3e-66  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.985109  normal  0.444607 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4548  DNA mismatch repair protein MutL  47.26 
 
 		 605 aa  253  7e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4948  DNA mismatch repair protein  45.66 
 
 		 632 aa  253  8.000000000000001e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.167425  normal  0.037125 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4772  DNA mismatch repair protein  44.88 
 
 		 633 aa  252  1e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209994  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4896  DNA mismatch repair protein  44.88 
 
 		 632 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1114  DNA mismatch repair protein MutL  45.68 
 
 		 620 aa  251  3e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000422632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4687  DNA mismatch repair protein  46.11 
 
 		 633 aa  250  6e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427145  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07520  DNA mismatch repair protein  46.53 
 
 		 641 aa  248  2e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5675  DNA mismatch repair protein  45.93 
 
 		 633 aa  248  3e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4047  DNA mismatch repair protein  35.94 
 
 		 610 aa  247  4e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0363  DNA mismatch repair protein  37.52 
 
 		 621 aa  247  4e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.127252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65350  DNA mismatch repair protein  45.64 
 
 		 633 aa  247  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0901  DNA mismatch repair protein MutL  33.27 
 
 		 516 aa  247  4.9999999999999997e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0668  DNA mismatch repair protein MutL  46.93 
 
 		 620 aa  246  6e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.422126  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0633  DNA mismatch repair protein  43.82 
 
 		 623 aa  246  6e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.211888 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0521  DNA mismatch repair protein  45.02 
 
 		 635 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0525121  normal  0.511532 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0963  DNA mismatch repair protein MutL  43.77 
 
 		 608 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1304  DNA mismatch repair protein  44.48 
 
 		 628 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0761454  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1084  DNA mismatch repair protein MutL  43.94 
 
 		 630 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.967595  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0895  DNA mismatch repair protein MutL  45.48 
 
 		 611 aa  245  1.9999999999999999e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.347619  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3542  DNA mismatch repair protein  44.07 
 
 		 628 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1692  DNA mismatch repair protein  46.13 
 
 		 611 aa  244  3e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0570  DNA mismatch repair protein  43.81 
 
 		 648 aa  244  3e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.963062 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0571  DNA mismatch repair protein MutL  45.45 
 
 		 636 aa  244  3e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.707368  hitchhiker  0.00000000963067 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1936  DNA mismatch repair protein MutL  44.41 
 
 		 612 aa  244  3.9999999999999997e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000687656 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0494  DNA mismatch repair protein MutL  45.7 
 
 		 626 aa  243  5e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.220055  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3155  DNA mismatch repair protein  32.22 
 
 		 566 aa  243  5e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.290609 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4944  DNA mismatch repair protein MutL  43.5 
 
 		 645 aa  243  6e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1083  DNA mismatch repair protein  39.45 
 
 		 615 aa  241  2e-62  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0923  DNA mismatch repair protein MutL  33.33 
 
 		 516 aa  241  2.9999999999999997e-62  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00410  DNA mismatch repair protein  44.85 
 
 		 625 aa  241  2.9999999999999997e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1838  DNA mismatch repair protein MutL  41.49 
 
 		 692 aa  240  4e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.0019765  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3921  DNA mismatch repair protein  41.52 
 
 		 661 aa  240  5e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0286731  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1964  DNA mismatch repair protein  32.39 
 
 		 561 aa  240  5e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.176062 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0564  DNA mismatch repair protein  43.94 
 
 		 631 aa  239  8e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.273606 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3811  DNA mismatch repair protein MutL  38.7 
 
 		 629 aa  239  9e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.248482 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2754  DNA mismatch repair protein  43.32 
 
 		 634 aa  239  1e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.679624 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0336  DNA mismatch repair protein  45.62 
 
 		 583 aa  239  1e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00211885  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0795  DNA mismatch repair protein  41.84 
 
 		 624 aa  239  1e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.741444  hitchhiker  0.00456525 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4044  DNA mismatch repair protein MutL  45.79 
 
 		 628 aa  238  1e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0816003  normal  0.310643 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3723  DNA mismatch repair protein  41.52 
 
 		 669 aa  238  2e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0150049  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1937  DNA mismatch repair protein  32.17 
 
 		 561 aa  238  2e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3769  DNA mismatch repair protein  42.55 
 
 		 630 aa  238  2e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00256823  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1884  DNA mismatch repair protein  42.02 
 
 		 640 aa  238  2e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3240  DNA mismatch repair protein MutL  39.64 
 
 		 628 aa  238  2e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3712  DNA mismatch repair protein  42.55 
 
 		 637 aa  238  3e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3282  DNA mismatch repair protein  41.54 
 
 		 641 aa  237  3e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.645074  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0556  DNA mismatch repair protein  42.55 
 
 		 638 aa  238  3e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000137773  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0533  DNA mismatch repair protein  42.73 
 
 		 629 aa  237  3e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000857622  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3207  DNA mismatch repair protein  40.85 
 
 		 665 aa  237  3e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000351816  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1521  DNA mismatch repair protein MutL  37.38 
 
 		 540 aa  237  4e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3313  DNA mismatch repair protein  41.16 
 
 		 619 aa  237  4e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0701  DNA mismatch repair protein  41.46 
 
 		 635 aa  237  4e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.138509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2732  DNA mismatch repair protein MutL  40.92 
 
 		 730 aa  237  4e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0867295  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3655  DNA mismatch repair protein  41.46 
 
 		 635 aa  237  5.0000000000000005e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0128216  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1174  hypothetical protein  39.32 
 
 		 628 aa  237  5.0000000000000005e-61  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0643431 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3801  DNA mismatch repair protein  41.46 
 
 		 635 aa  237  5.0000000000000005e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3434  DNA mismatch repair protein  41.84 
 
 		 644 aa  236  7e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0482547  normal  0.130022 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3895  DNA mismatch repair protein  42.25 
 
 		 638 aa  236  9e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.329435  normal  0.756046 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0596  DNA mismatch repair protein  41.84 
 
 		 644 aa  236  9e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0279132  decreased coverage  0.0000000183924 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0595  DNA mismatch repair protein  42.47 
 
 		 648 aa  236  9e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000232497 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2002  DNA mismatch repair protein  43.64 
 
 		 619 aa  235  1.0000000000000001e-60  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1538  DNA mismatch repair protein MutL  37.9 
 
 		 549 aa  235  1.0000000000000001e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.186199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2081  DNA mismatch repair protein  43.64 
 
 		 621 aa  236  1.0000000000000001e-60  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0490  DNA mismatch repair protein  43.37 
 
 		 649 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00424491  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1275  DNA mismatch repair protein  45.92 
 
 		 644 aa  235  2.0000000000000002e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1487  DNA mismatch repair protein MutL  46.42 
 
 		 622 aa  235  2.0000000000000002e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.101291  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2001  DNA mismatch repair protein  44.05 
 
 		 606 aa  234  3e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0369313  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0496  DNA mismatch repair protein  46.31 
 
 		 600 aa  234  3e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.170626 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0072  DNA mismatch repair protein  39.38 
 
 		 647 aa  234  3e-60  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>