More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0433 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_0433  DNA mismatch repair protein MutL  100 
 
 		 544 aa  1061    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.397658  normal  0.543427 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1521  DNA mismatch repair protein MutL  72.34 
 
 		 540 aa  758    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1538  DNA mismatch repair protein MutL  48.07 
 
 		 549 aa  414  1e-114  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.186199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0800  DNA mismatch repair protein MutL  31.97 
 
 		 586 aa  291  3e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1924  DNA mismatch repair protein MutL  36.56 
 
 		 560 aa  289  8e-77  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1703  DNA mismatch repair protein MutL  31.66 
 
 		 603 aa  278  2e-73  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0554  DNA mismatch repair protein MutL  35.4 
 
 		 565 aa  277  4e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1951  DNA mismatch repair protein  34.75 
 
 		 585 aa  268  2e-70  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.448925  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1078  DNA mismatch repair protein MutL  30.53 
 
 		 572 aa  267  2.9999999999999995e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0628  DNA mismatch repair protein MutL  36.75 
 
 		 582 aa  265  1e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.100256  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2227  MutL dimerisation  36.75 
 
 		 584 aa  265  2e-69  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.000451621  normal  0.617767 
 
 
-
 
NC_002936  DET1195  MutL/HexB family DNA mismatch repair protein  34.39 
 
 		 566 aa  263  6e-69  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0321912  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1006  DNA mismatch repair protein MutL  34.28 
 
 		 566 aa  263  6.999999999999999e-69  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_978  DNA mismatch repair protein, MutL/HexB family  34.22 
 
 		 566 aa  261  3e-68  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3225  DNA mismatch repair protein MutL  31.77 
 
 		 599 aa  260  5.0000000000000005e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.142793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2053  DNA mismatch repair protein  32.21 
 
 		 622 aa  257  4e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00117239  hitchhiker  0.0000000712721 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0293  DNA mismatch repair protein MutL  38.01 
 
 		 532 aa  255  2.0000000000000002e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1217  DNA mismatch repair protein  32.78 
 
 		 612 aa  254  3e-66  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.469734  normal  0.0661873 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2223  DNA mismatch repair protein  34.26 
 
 		 607 aa  252  1e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.38556  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2133  DNA mismatch repair protein  34.26 
 
 		 607 aa  251  3e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0934  DNA mismatch repair protein  31.83 
 
 		 603 aa  250  5e-65  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.540426 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2001  DNA mismatch repair protein  31.89 
 
 		 606 aa  249  6e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0369313  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1770  DNA mismatch repair protein  30.22 
 
 		 602 aa  248  2e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00259733  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1168  DNA mismatch repair protein  33.22 
 
 		 588 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.985109  normal  0.444607 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1478  DNA mismatch repair protein MutL  33.27 
 
 		 557 aa  243  6e-63  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.064699  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0149  DNA mismatch repair protein MutL  32.12 
 
 		 605 aa  241  2.9999999999999997e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0977  DNA mismatch repair ATPase  30.43 
 
 		 584 aa  240  4e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0710055  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0157  DNA mismatch repair protein MutL  29.11 
 
 		 559 aa  240  5e-62  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2088  DNA mismatch repair protein  34.39 
 
 		 601 aa  240  5.999999999999999e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.02775 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1186  DNA mismatch repair protein  32.99 
 
 		 575 aa  239  1e-61  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00913008  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1692  DNA mismatch repair protein  34.28 
 
 		 611 aa  237  4e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0845  DNA mismatch repair protein  32.82 
 
 		 574 aa  236  7e-61  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00243998  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0769  DNA mismatch repair protein MutL  31.08 
 
 		 551 aa  233  6e-60  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1087  DNA mismatch repair protein MutL  32.76 
 
 		 582 aa  229  1e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0917186  normal  0.0241297 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0993  DNA mismatch repair protein  31.36 
 
 		 589 aa  227  5.0000000000000005e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.139394  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0491  DNA mismatch repair protein  32.44 
 
 		 594 aa  226  7e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0595243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1331  DNA mismatch repair protein MutL  31.38 
 
 		 579 aa  226  7e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2758  DNA mismatch repair protein  32.62 
 
 		 616 aa  224  3e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2962  DNA mismatch repair protein  29.24 
 
 		 608 aa  223  9.999999999999999e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000126227  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0539  DNA mismatch repair protein  32.28 
 
 		 600 aa  220  5e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.111991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1626  DNA mismatch repair protein  32.07 
 
 		 603 aa  219  8.999999999999998e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.951242 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1095  DNA mismatch repair protein  31.95 
 
 		 632 aa  218  2.9999999999999998e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.045837  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0428  DNA mismatch repair protein  31.02 
 
 		 605 aa  214  2.9999999999999995e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.329312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2933  DNA mismatch repair protein  31.83 
 
 		 612 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.169061 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0963  DNA mismatch repair protein MutL  31.05 
 
 		 608 aa  214  3.9999999999999995e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2548  DNA mismatch repair protein  31.93 
 
 		 603 aa  212  1e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.17269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1599  DNA mismatch repair protein MutL  30.74 
 
 		 595 aa  212  2e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.907039  normal  0.222038 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1927  mismatch repair protein MutL  30.74 
 
 		 595 aa  212  2e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1499  DNA mismatch repair protein MutL  26.2 
 
 		 589 aa  210  5e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0901  DNA mismatch repair protein MutL  31.21 
 
 		 516 aa  209  1e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4176  DNA mismatch repair protein  31.96 
 
 		 597 aa  209  1e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.285632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4855  DNA mismatch repair protein  31.62 
 
 		 595 aa  208  2e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4032  DNA mismatch repair protein  32.89 
 
 		 597 aa  207  3e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.733731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3702  DNA mismatch repair protein  33.17 
 
 		 575 aa  206  7e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4047  DNA mismatch repair protein  31.09 
 
 		 610 aa  206  9e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0923  DNA mismatch repair protein MutL  30.91 
 
 		 516 aa  201  3.9999999999999996e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0293  DNA mismatch repair protein  30.02 
 
 		 602 aa  200  5e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1201  DNA mismatch repair protein  28.9 
 
 		 611 aa  199  9e-50  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.894444  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1030  DNA mismatch repair protein MutL  32.02 
 
 		 560 aa  199  9e-50  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.110896  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1494  DNA mismatch repair protein MutL  37.16 
 
 		 692 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1144  DNA mismatch repair protein MutL  31.23 
 
 		 616 aa  199  1.0000000000000001e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.513301  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2713  DNA mismatch repair protein  30.43 
 
 		 606 aa  199  1.0000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1937  DNA mismatch repair protein  32.75 
 
 		 561 aa  199  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0267  DNA mismatch repair protein MutL  36.09 
 
 		 610 aa  197  3e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1964  DNA mismatch repair protein  32.75 
 
 		 561 aa  198  3e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.176062 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1114  DNA mismatch repair protein MutL  39.81 
 
 		 620 aa  194  5e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000422632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3155  DNA mismatch repair protein  30.98 
 
 		 566 aa  194  5e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.290609 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2630  DNA mismatch repair protein MutL  29.71 
 
 		 565 aa  192  1e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3164  DNA mismatch repair protein MutL  30.44 
 
 		 615 aa  192  1e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0856  DNA mismatch repair protein  30.14 
 
 		 563 aa  192  1e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1384  DNA mismatch repair protein MutL  28.94 
 
 		 613 aa  192  2e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.664684 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2563  DNA mismatch repair protein  40.24 
 
 		 636 aa  191  2.9999999999999997e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1780  DNA mismatch repair protein  32.49 
 
 		 541 aa  191  4e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.644143 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0363  DNA mismatch repair protein  30.9 
 
 		 621 aa  190  7e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.127252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1289  DNA mismatch repair protein MutL  35.88 
 
 		 765 aa  189  1e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2128  DNA mismatch repair protein  36.25 
 
 		 639 aa  188  2e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000120986  normal  0.021871 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0864  DNA mismatch repair protein  35.96 
 
 		 645 aa  188  2e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.23826  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0376  DNA mismatch repair protein MutL  36.09 
 
 		 709 aa  188  2e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.13305  normal  0.32452 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2430  DNA mismatch repair protein  39.63 
 
 		 635 aa  188  2e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2836  DNA mismatch repair protein  39.63 
 
 		 647 aa  186  7e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2732  DNA mismatch repair protein MutL  35.71 
 
 		 730 aa  186  1.0000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0867295  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1936  DNA mismatch repair protein MutL  37.79 
 
 		 612 aa  185  2.0000000000000003e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000687656 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2769  DNA mismatch repair protein  38.7 
 
 		 652 aa  185  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286219  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0100  DNA mismatch repair protein MutL  38.3 
 
 		 605 aa  184  3e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0413  DNA mismatch repair protein  35.06 
 
 		 630 aa  184  3e-45  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2908  DNA mismatch repair protein  38.39 
 
 		 655 aa  184  4.0000000000000006e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2098  DNA mismatch repair protein  31.75 
 
 		 659 aa  184  5.0000000000000004e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1382  DNA mismatch repair protein  35.4 
 
 		 669 aa  183  6e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0932721  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1715  DNA mismatch repair protein  38.35 
 
 		 608 aa  183  7e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.233899  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2485  DNA mismatch repair protein  38.74 
 
 		 691 aa  183  8.000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.933999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2621  DNA mismatch repair protein  39.22 
 
 		 662 aa  183  9.000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2420  DNA mismatch repair protein  34.27 
 
 		 649 aa  182  1e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.323655  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0734  DNA mismatch repair protein  37.84 
 
 		 667 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0281  DNA mismatch repair protein  37.84 
 
 		 667 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2517  DNA mismatch repair protein  35.38 
 
 		 656 aa  182  1e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0765  DNA mismatch repair protein  37.84 
 
 		 667 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3853  DNA mismatch repair protein  37.54 
 
 		 661 aa  182  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.558268  normal  0.998912 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1083  DNA mismatch repair protein  35.76 
 
 		 615 aa  182  2e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4044  DNA mismatch repair protein MutL  35.23 
 
 		 628 aa  181  2.9999999999999997e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0816003  normal  0.310643 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0526  DNA mismatch repair protein  32.34 
 
 		 668 aa  181  2.9999999999999997e-44  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>