More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_1937 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3155  DNA mismatch repair protein  66.55 
 
 		 566 aa  767    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.290609 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2630  DNA mismatch repair protein MutL  59.86 
 
 		 565 aa  690    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0856  DNA mismatch repair protein  62.37 
 
 		 563 aa  722    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0504  DNA mismatch repair protein  55.61 
 
 		 587 aa  678    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.768235  normal  0.47016 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1937  DNA mismatch repair protein  100 
 
 		 561 aa  1150    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1964  DNA mismatch repair protein  99.47 
 
 		 561 aa  1145    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.176062 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3702  DNA mismatch repair protein  52.71 
 
 		 575 aa  590  1e-167  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1780  DNA mismatch repair protein  50.36 
 
 		 541 aa  529  1e-149  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.644143 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1114  DNA mismatch repair protein MutL  31.39 
 
 		 620 aa  243  5e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000422632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1951  DNA mismatch repair protein  32.33 
 
 		 585 aa  240  4e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.448925  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0293  DNA mismatch repair protein MutL  32.17 
 
 		 532 aa  238  2e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4855  DNA mismatch repair protein  29.16 
 
 		 595 aa  235  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1692  DNA mismatch repair protein  30.89 
 
 		 611 aa  234  3e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0800  DNA mismatch repair protein MutL  31.46 
 
 		 586 aa  234  3e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1703  DNA mismatch repair protein MutL  30.16 
 
 		 603 aa  234  3e-60  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1217  DNA mismatch repair protein  30.84 
 
 		 612 aa  234  4.0000000000000004e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.469734  normal  0.0661873 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4176  DNA mismatch repair protein  29.56 
 
 		 597 aa  231  3e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.285632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0934  DNA mismatch repair protein  31.39 
 
 		 603 aa  230  5e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.540426 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1389  DNA mismatch repair protein  29.69 
 
 		 599 aa  229  8e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.41073  normal  0.777612 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0157  DNA mismatch repair protein MutL  29 
 
 		 559 aa  229  1e-58  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3169  DNA mismatch repair protein  29.43 
 
 		 603 aa  227  4e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.484911  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3219  DNA mismatch repair protein MutL  28.66 
 
 		 647 aa  227  5.0000000000000005e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.428383  normal  0.251683 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2053  DNA mismatch repair protein  28.08 
 
 		 622 aa  226  6e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00117239  hitchhiker  0.0000000712721 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1084  DNA mismatch repair protein MutL  29.05 
 
 		 630 aa  224  3e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.967595  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0014  DNA mismatch repair protein  28.89 
 
 		 610 aa  224  3e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4032  DNA mismatch repair protein  28.74 
 
 		 597 aa  224  4.9999999999999996e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.733731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0571  DNA mismatch repair protein MutL  29.49 
 
 		 636 aa  223  6e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.707368  hitchhiker  0.00000000963067 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0100  DNA mismatch repair protein MutL  30.34 
 
 		 605 aa  223  7e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2701  DNA mismatch repair protein MutL  28.93 
 
 		 626 aa  222  9.999999999999999e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00383046  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2548  DNA mismatch repair protein  30.76 
 
 		 603 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.17269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0034  DNA mismatch repair protein MutL  28.74 
 
 		 590 aa  221  3e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2001  DNA mismatch repair protein  27.95 
 
 		 606 aa  220  6e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0369313  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1626  DNA mismatch repair protein  30.91 
 
 		 603 aa  219  7e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.951242 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1936  DNA mismatch repair protein MutL  29.84 
 
 		 612 aa  219  8.999999999999998e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000687656 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3225  DNA mismatch repair protein MutL  30.03 
 
 		 599 aa  218  2e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.142793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0491  DNA mismatch repair protein  29.64 
 
 		 594 aa  217  4e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0595243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1770  DNA mismatch repair protein  29.08 
 
 		 602 aa  217  5e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00259733  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2031  DNA mismatch repair protein MutL  30.36 
 
 		 604 aa  216  9.999999999999999e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.440642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3308  DNA mismatch repair protein MutL  29.67 
 
 		 664 aa  216  9.999999999999999e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0895  DNA mismatch repair protein MutL  28.83 
 
 		 611 aa  215  1.9999999999999998e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.347619  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3811  DNA mismatch repair protein MutL  29.24 
 
 		 629 aa  215  1.9999999999999998e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.248482 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4548  DNA mismatch repair protein MutL  30.29 
 
 		 605 aa  214  4.9999999999999996e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1924  DNA mismatch repair protein MutL  30.23 
 
 		 560 aa  213  5.999999999999999e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0963  DNA mismatch repair protein MutL  30.35 
 
 		 608 aa  213  7e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_978  DNA mismatch repair protein, MutL/HexB family  28.72 
 
 		 566 aa  212  1e-53  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1157  DNA mismatch repair protein MutL  29.35 
 
 		 644 aa  212  1e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1168  DNA mismatch repair protein  29.28 
 
 		 588 aa  212  2e-53  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.985109  normal  0.444607 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1144  DNA mismatch repair protein MutL  28.39 
 
 		 616 aa  210  5e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.513301  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3466  DNA mismatch repair protein MutL  30.16 
 
 		 622 aa  209  1e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.52693  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0993  DNA mismatch repair protein  29.04 
 
 		 589 aa  208  2e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.139394  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1006  DNA mismatch repair protein MutL  28.99 
 
 		 566 aa  208  2e-52  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1384  DNA mismatch repair protein MutL  28.05 
 
 		 613 aa  206  7e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.664684 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2962  DNA mismatch repair protein  28.3 
 
 		 608 aa  206  9e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000126227  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0539  DNA mismatch repair protein  29.02 
 
 		 600 aa  204  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.111991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0845  DNA mismatch repair protein  28.99 
 
 		 574 aa  203  5e-51  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00243998  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1087  DNA mismatch repair protein MutL  29.8 
 
 		 582 aa  203  7e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0917186  normal  0.0241297 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0496  DNA mismatch repair protein  28.99 
 
 		 600 aa  203  7e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.170626 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4047  DNA mismatch repair protein  31.72 
 
 		 610 aa  202  9.999999999999999e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1195  MutL/HexB family DNA mismatch repair protein  28.21 
 
 		 566 aa  202  1.9999999999999998e-50  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0321912  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1186  DNA mismatch repair protein  28.82 
 
 		 575 aa  202  1.9999999999999998e-50  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00913008  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1078  DNA mismatch repair protein MutL  28.99 
 
 		 572 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2015  DNA mismatch repair protein MutL  28.07 
 
 		 617 aa  200  5e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0293  DNA mismatch repair protein  28.52 
 
 		 602 aa  200  7e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4687  DNA mismatch repair protein  29.04 
 
 		 633 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0433  DNA mismatch repair protein MutL  32.75 
 
 		 544 aa  199  2.0000000000000003e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.397658  normal  0.543427 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4948  DNA mismatch repair protein  28.93 
 
 		 632 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.167425  normal  0.037125 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0428  DNA mismatch repair protein  27.71 
 
 		 605 aa  198  2.0000000000000003e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.329312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0149  DNA mismatch repair protein MutL  28.85 
 
 		 605 aa  198  2.0000000000000003e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4896  DNA mismatch repair protein  28.86 
 
 		 632 aa  198  3e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2758  DNA mismatch repair protein  29.86 
 
 		 616 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2088  DNA mismatch repair protein  28.73 
 
 		 601 aa  197  4.0000000000000005e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.02775 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1331  DNA mismatch repair protein MutL  29.73 
 
 		 579 aa  197  4.0000000000000005e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4772  DNA mismatch repair protein  28.93 
 
 		 633 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2933  DNA mismatch repair protein  29.52 
 
 		 612 aa  196  1e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.169061 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1478  DNA mismatch repair protein MutL  28.57 
 
 		 557 aa  196  1e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.064699  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0494  DNA mismatch repair protein MutL  29.07 
 
 		 626 aa  194  2e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.220055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2669  DNA mismatch repair protein  27.57 
 
 		 630 aa  194  3e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.680786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0628  DNA mismatch repair protein MutL  29.12 
 
 		 582 aa  194  4e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.100256  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1521  DNA mismatch repair protein MutL  31.52 
 
 		 540 aa  194  5e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0769  DNA mismatch repair protein MutL  25.81 
 
 		 551 aa  193  8e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1095  DNA mismatch repair protein  29.97 
 
 		 632 aa  192  1e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.045837  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0102  DNA mismatch repair protein  29.59 
 
 		 644 aa  192  1e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1711  DNA mismatch repair protein MutL  26.57 
 
 		 588 aa  191  4e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.619498  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1927  mismatch repair protein MutL  30.36 
 
 		 595 aa  191  4e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1599  DNA mismatch repair protein MutL  30.36 
 
 		 595 aa  191  4e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.907039  normal  0.222038 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0521  DNA mismatch repair protein  27.76 
 
 		 635 aa  190  5e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0525121  normal  0.511532 
 
 
-
 
NC_002950  PG0412  DNA mismatch repair protein MutL  37.69 
 
 		 618 aa  189  1e-46  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1499  DNA mismatch repair protein MutL  25.17 
 
 		 589 aa  188  2e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2227  MutL dimerisation  29.01 
 
 		 584 aa  188  2e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.000451621  normal  0.617767 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1517  DNA mismatch repair protein MutL  27.44 
 
 		 598 aa  187  4e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.249931 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0554  DNA mismatch repair protein MutL  27.52 
 
 		 565 aa  187  5e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0821  DNA mismatch repair protein MutL  34.59 
 
 		 630 aa  185  2.0000000000000003e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000117941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0363  DNA mismatch repair protein  28.32 
 
 		 621 aa  185  2.0000000000000003e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.127252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1538  DNA mismatch repair protein MutL  29.19 
 
 		 549 aa  183  9.000000000000001e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.186199  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0509  DNA mismatch repair protein  27.04 
 
 		 598 aa  180  4.999999999999999e-44  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.587743  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0901  DNA mismatch repair protein MutL  27.73 
 
 		 516 aa  180  8e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2713  DNA mismatch repair protein  28.43 
 
 		 606 aa  179  1e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1304  DNA mismatch repair protein  33.24 
 
 		 628 aa  178  3e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0761454  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3617  DNA mismatch repair protein  34.23 
 
 		 626 aa  177  4e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.552847  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3904  DNA mismatch repair protein  34.23 
 
 		 626 aa  177  4e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.595251  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>