More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0901 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0923  DNA mismatch repair protein MutL  94.77 
 
 		 516 aa  989    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0901  DNA mismatch repair protein MutL  100 
 
 		 516 aa  1036    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1711  DNA mismatch repair protein MutL  35.54 
 
 		 588 aa  322  9.999999999999999e-87  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.619498  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0769  DNA mismatch repair protein MutL  35.66 
 
 		 551 aa  314  2.9999999999999996e-84  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0157  DNA mismatch repair protein MutL  33.45 
 
 		 559 aa  285  2.0000000000000002e-75  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2223  DNA mismatch repair protein  30.13 
 
 		 607 aa  261  3e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.38556  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0599  DNA mismatch repair protein MutL  42.39 
 
 		 621 aa  255  1.0000000000000001e-66  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0798741  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2133  DNA mismatch repair protein  29.92 
 
 		 607 aa  255  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2053  DNA mismatch repair protein  30.35 
 
 		 622 aa  253  5.000000000000001e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00117239  hitchhiker  0.0000000712721 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4176  DNA mismatch repair protein  29.88 
 
 		 597 aa  250  5e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.285632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1384  DNA mismatch repair protein MutL  29.56 
 
 		 613 aa  249  9e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.664684 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1078  DNA mismatch repair protein MutL  33.8 
 
 		 572 aa  248  1e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1304  DNA mismatch repair protein  40.92 
 
 		 628 aa  248  2e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0761454  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4032  DNA mismatch repair protein  30.07 
 
 		 597 aa  248  2e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.733731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0293  DNA mismatch repair protein MutL  33.27 
 
 		 532 aa  247  4.9999999999999997e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0978  DNA mismatch repair protein  38.95 
 
 		 647 aa  246  4.9999999999999997e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0100042  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1174  hypothetical protein  37.5 
 
 		 628 aa  246  6e-64  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0643431 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3282  DNA mismatch repair protein  39.82 
 
 		 650 aa  246  6.999999999999999e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0149  DNA mismatch repair protein MutL  40.06 
 
 		 605 aa  241  2e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4855  DNA mismatch repair protein  29.48 
 
 		 595 aa  241  2e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1770  DNA mismatch repair protein  38.53 
 
 		 602 aa  238  1e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00259733  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1692  DNA mismatch repair protein  30.22 
 
 		 611 aa  238  2e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0554  DNA mismatch repair protein MutL  31.33 
 
 		 565 aa  237  3e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2962  DNA mismatch repair protein  38.86 
 
 		 608 aa  237  4e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000126227  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2001  DNA mismatch repair protein  39.09 
 
 		 606 aa  236  5.0000000000000005e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0369313  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0293  DNA mismatch repair protein  29.12 
 
 		 602 aa  237  5.0000000000000005e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1087  DNA mismatch repair protein MutL  30.64 
 
 		 582 aa  236  1.0000000000000001e-60  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0917186  normal  0.0241297 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1599  DNA mismatch repair protein MutL  28.16 
 
 		 595 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.907039  normal  0.222038 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1927  mismatch repair protein MutL  28.16 
 
 		 595 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1884  DNA mismatch repair protein  38.15 
 
 		 640 aa  234  4.0000000000000004e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1715  DNA mismatch repair protein  37.95 
 
 		 608 aa  232  1e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.233899  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1703  DNA mismatch repair protein MutL  40.25 
 
 		 603 aa  231  3e-59  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1186  DNA mismatch repair protein  29.97 
 
 		 575 aa  229  9e-59  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00913008  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0539  DNA mismatch repair protein  28.86 
 
 		 600 aa  229  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.111991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1478  DNA mismatch repair protein MutL  31.91 
 
 		 557 aa  229  1e-58  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.064699  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0376  DNA mismatch repair protein MutL  39.41 
 
 		 709 aa  228  2e-58  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.13305  normal  0.32452 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0845  DNA mismatch repair protein  30.02 
 
 		 574 aa  228  2e-58  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00243998  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0172  DNA mismatch repair protein MutL  38.89 
 
 		 624 aa  228  3e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2430  DNA mismatch repair protein  37.96 
 
 		 635 aa  227  3e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2836  DNA mismatch repair protein  37.28 
 
 		 647 aa  227  4e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0014  DNA mismatch repair protein  37.04 
 
 		 610 aa  227  4e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1083  DNA mismatch repair protein  39.87 
 
 		 615 aa  227  4e-58  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0993  DNA mismatch repair protein  39.32 
 
 		 589 aa  227  4e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.139394  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4044  DNA mismatch repair protein MutL  39.3 
 
 		 628 aa  226  8e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0816003  normal  0.310643 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1838  DNA mismatch repair protein MutL  37.27 
 
 		 692 aa  226  9e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.0019765  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2563  DNA mismatch repair protein  36.99 
 
 		 636 aa  226  1e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3811  DNA mismatch repair protein MutL  35.22 
 
 		 629 aa  225  2e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.248482 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1144  DNA mismatch repair protein MutL  39.26 
 
 		 616 aa  224  2e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.513301  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1499  DNA mismatch repair protein MutL  29.57 
 
 		 589 aa  225  2e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1919  DNA mismatch repair protein MutL  38.96 
 
 		 670 aa  225  2e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.770906  hitchhiker  0.00107591 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1924  DNA mismatch repair protein MutL  31.54 
 
 		 560 aa  224  3e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2701  DNA mismatch repair protein MutL  38.7 
 
 		 626 aa  224  4e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00383046  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3240  DNA mismatch repair protein MutL  39.23 
 
 		 628 aa  223  4.9999999999999996e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1951  DNA mismatch repair protein  29.38 
 
 		 585 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.448925  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0496  DNA mismatch repair protein  28.86 
 
 		 600 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.170626 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1006  DNA mismatch repair protein MutL  30.53 
 
 		 566 aa  223  8e-57  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1823  DNA mismatch repair protein MutL  39.01 
 
 		 628 aa  223  9e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000270616  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0145  DNA mismatch repair protein  37.07 
 
 		 644 aa  222  9.999999999999999e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3217  DNA mismatch repair protein MutL  37.76 
 
 		 762 aa  221  1.9999999999999999e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0687703 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2548  DNA mismatch repair protein  36.98 
 
 		 603 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.17269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2088  DNA mismatch repair protein  37.04 
 
 		 601 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.02775 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3169  DNA mismatch repair protein  34.9 
 
 		 603 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.484911  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0963  DNA mismatch repair protein MutL  29.33 
 
 		 608 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00410  DNA mismatch repair protein  39.16 
 
 		 625 aa  221  3e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2754  DNA mismatch repair protein  38.34 
 
 		 634 aa  220  3.9999999999999997e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.679624 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_978  DNA mismatch repair protein, MutL/HexB family  31.4 
 
 		 566 aa  220  3.9999999999999997e-56  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0211  DNA mismatch repair protein MutL  37.61 
 
 		 644 aa  220  5e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1040  DNA mismatch repair protein MutL  36.1 
 
 		 632 aa  219  6e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.619157 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2933  DNA mismatch repair protein  28.31 
 
 		 612 aa  219  7e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.169061 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1494  DNA mismatch repair protein MutL  39.76 
 
 		 692 aa  219  7.999999999999999e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2758  DNA mismatch repair protein  28.24 
 
 		 616 aa  219  7.999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0660  DNA mismatch repair protein  37.23 
 
 		 661 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0412  DNA mismatch repair protein MutL  36.73 
 
 		 618 aa  219  1e-55  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1095  DNA mismatch repair protein  27.8 
 
 		 632 aa  219  1e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.045837  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1195  MutL/HexB family DNA mismatch repair protein  31.23 
 
 		 566 aa  218  2e-55  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0321912  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0734  DNA mismatch repair protein  37.35 
 
 		 667 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0281  DNA mismatch repair protein  37.35 
 
 		 667 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11660  DNA mismatch repair protein MutL  37.85 
 
 		 644 aa  218  2e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1729  DNA mismatch repair protein MutL  39.4 
 
 		 763 aa  218  2e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0765  DNA mismatch repair protein  37.35 
 
 		 667 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0685  DNA mismatch repair protein  36.92 
 
 		 661 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0302  DNA mismatch repair protein MutL  37.35 
 
 		 624 aa  218  2.9999999999999998e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000565974  hitchhiker  0.00985332 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1041  DNA mismatch repair protein MutL  39.23 
 
 		 606 aa  217  2.9999999999999998e-55  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0215  DNA mismatch repair protein MutL  29.52 
 
 		 608 aa  217  2.9999999999999998e-55  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.137951 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0100  DNA mismatch repair protein MutL  27.85 
 
 		 605 aa  217  5e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2485  DNA mismatch repair protein  37.35 
 
 		 691 aa  216  7e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.933999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2621  DNA mismatch repair protein  37.23 
 
 		 662 aa  216  9e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2769  DNA mismatch repair protein  36.92 
 
 		 652 aa  215  9.999999999999999e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286219  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0977  DNA mismatch repair ATPase  30.55 
 
 		 584 aa  216  9.999999999999999e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0710055  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2713  DNA mismatch repair protein  27.86 
 
 		 606 aa  214  1.9999999999999998e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1289  DNA mismatch repair protein MutL  40.12 
 
 		 765 aa  214  1.9999999999999998e-54  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3853  DNA mismatch repair protein  36.73 
 
 		 661 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.558268  normal  0.998912 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3219  DNA mismatch repair protein MutL  36.16 
 
 		 647 aa  214  1.9999999999999998e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.428383  normal  0.251683 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5569  DNA mismatch repair protein MutL  34.89 
 
 		 685 aa  215  1.9999999999999998e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.590077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1114  DNA mismatch repair protein MutL  33.64 
 
 		 620 aa  214  2.9999999999999995e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000422632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1389  DNA mismatch repair protein  35 
 
 		 599 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.41073  normal  0.777612 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2328  DNA mismatch repair protein MutL  38.51 
 
 		 629 aa  214  2.9999999999999995e-54  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07070  putative DNA mismatch repair protein  36.67 
 
 		 617 aa  213  4.9999999999999996e-54  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.748012  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0023  DNA mismatch repair protein MutL  36.95 
 
 		 621 aa  213  5.999999999999999e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000493473  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1320  DNA mismatch repair protein  36.73 
 
 		 705 aa  213  7.999999999999999e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>