More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1538 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1538  DNA mismatch repair protein MutL  100 
 
 		 549 aa  1055    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.186199  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1521  DNA mismatch repair protein MutL  48.61 
 
 		 540 aa  434  1e-120  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0433  DNA mismatch repair protein MutL  48.07 
 
 		 544 aa  425  1e-118  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.397658  normal  0.543427 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0157  DNA mismatch repair protein MutL  31.25 
 
 		 559 aa  291  2e-77  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2227  MutL dimerisation  39.02 
 
 		 584 aa  276  9e-73  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.000451621  normal  0.617767 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0800  DNA mismatch repair protein MutL  33.05 
 
 		 586 aa  271  2.9999999999999997e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_978  DNA mismatch repair protein, MutL/HexB family  33.98 
 
 		 566 aa  270  7e-71  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1195  MutL/HexB family DNA mismatch repair protein  33.92 
 
 		 566 aa  266  7e-70  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0321912  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1951  DNA mismatch repair protein  35.56 
 
 		 585 aa  262  1e-68  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.448925  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1006  DNA mismatch repair protein MutL  33.98 
 
 		 566 aa  261  2e-68  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0149  DNA mismatch repair protein MutL  33.72 
 
 		 605 aa  255  1.0000000000000001e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0628  DNA mismatch repair protein MutL  37.26 
 
 		 582 aa  252  1e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.100256  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0934  DNA mismatch repair protein  32.26 
 
 		 603 aa  246  6.999999999999999e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.540426 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0554  DNA mismatch repair protein MutL  35.82 
 
 		 565 aa  243  5e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1936  DNA mismatch repair protein MutL  34.42 
 
 		 612 aa  243  7e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000687656 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3225  DNA mismatch repair protein MutL  32.1 
 
 		 599 aa  243  7.999999999999999e-63  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.142793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1924  DNA mismatch repair protein MutL  37.15 
 
 		 560 aa  242  1e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4548  DNA mismatch repair protein MutL  34.76 
 
 		 605 aa  242  1e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2001  DNA mismatch repair protein  31.34 
 
 		 606 aa  241  2.9999999999999997e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0369313  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0293  DNA mismatch repair protein MutL  38.46 
 
 		 532 aa  241  2.9999999999999997e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1217  DNA mismatch repair protein  31.3 
 
 		 612 aa  236  8e-61  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.469734  normal  0.0661873 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2053  DNA mismatch repair protein  30.49 
 
 		 622 aa  236  1.0000000000000001e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00117239  hitchhiker  0.0000000712721 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1478  DNA mismatch repair protein MutL  32.08 
 
 		 557 aa  229  1e-58  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.064699  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1770  DNA mismatch repair protein  31.11 
 
 		 602 aa  226  1e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00259733  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0963  DNA mismatch repair protein MutL  33.33 
 
 		 608 aa  224  2e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1499  DNA mismatch repair protein MutL  27.49 
 
 		 589 aa  224  3e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1078  DNA mismatch repair protein MutL  27.77 
 
 		 572 aa  223  7e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0856  DNA mismatch repair protein  32.7 
 
 		 563 aa  219  1e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1168  DNA mismatch repair protein  31.12 
 
 		 588 aa  218  2e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.985109  normal  0.444607 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1087  DNA mismatch repair protein MutL  33.22 
 
 		 582 aa  218  2.9999999999999998e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0917186  normal  0.0241297 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1331  DNA mismatch repair protein MutL  33.1 
 
 		 579 aa  215  1.9999999999999998e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0072  DNA mismatch repair protein  39.76 
 
 		 647 aa  215  1.9999999999999998e-54  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0977  DNA mismatch repair ATPase  28.96 
 
 		 584 aa  214  3.9999999999999995e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0710055  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2999  DNA mismatch repair protein MutL  40.71 
 
 		 631 aa  212  1e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1599  DNA mismatch repair protein MutL  32.15 
 
 		 595 aa  208  2e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.907039  normal  0.222038 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1927  mismatch repair protein MutL  32.15 
 
 		 595 aa  208  2e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0993  DNA mismatch repair protein  29.66 
 
 		 589 aa  206  1e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.139394  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2630  DNA mismatch repair protein MutL  30.9 
 
 		 565 aa  205  1e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1203  DNA mismatch repair protein  38.59 
 
 		 619 aa  206  1e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.288753  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1711  DNA mismatch repair protein MutL  26.48 
 
 		 588 aa  204  3e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.619498  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1692  DNA mismatch repair protein  31.73 
 
 		 611 aa  204  4e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0901  DNA mismatch repair protein MutL  30.37 
 
 		 516 aa  204  4e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3702  DNA mismatch repair protein  30.54 
 
 		 575 aa  203  5e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0923  DNA mismatch repair protein MutL  29.82 
 
 		 516 aa  203  6e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0293  DNA mismatch repair protein  31.36 
 
 		 602 aa  203  7e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2420  DNA mismatch repair protein  38.27 
 
 		 649 aa  202  9e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.323655  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3617  DNA mismatch repair protein  40.07 
 
 		 626 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.552847  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3904  DNA mismatch repair protein  40.07 
 
 		 626 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.595251  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1186  DNA mismatch repair protein  31.09 
 
 		 575 aa  202  9.999999999999999e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00913008  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3802  DNA mismatch repair protein  40.07 
 
 		 647 aa  202  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.618994  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3509  DNA mismatch repair protein  40.07 
 
 		 647 aa  202  1.9999999999999998e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3527  DNA mismatch repair protein  40.07 
 
 		 647 aa  202  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0491  DNA mismatch repair protein  32.45 
 
 		 594 aa  202  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0595243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2713  DNA mismatch repair protein  31.55 
 
 		 606 aa  201  1.9999999999999998e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3867  DNA mismatch repair protein  40.07 
 
 		 647 aa  202  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3815  DNA mismatch repair protein  40.07 
 
 		 647 aa  202  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3155  DNA mismatch repair protein  30.15 
 
 		 566 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.290609 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0845  DNA mismatch repair protein  30.57 
 
 		 574 aa  201  3e-50  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00243998  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3780  DNA mismatch repair protein  40.07 
 
 		 647 aa  201  3e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0217989 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4772  DNA mismatch repair protein  30.67 
 
 		 633 aa  201  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3539  DNA mismatch repair protein  40.07 
 
 		 644 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2098  DNA mismatch repair protein  36.39 
 
 		 659 aa  200  5e-50  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1432  DNA mismatch repair protein  40.07 
 
 		 647 aa  200  6e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.980701 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4948  DNA mismatch repair protein  30.35 
 
 		 632 aa  200  6e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.167425  normal  0.037125 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0100  DNA mismatch repair protein MutL  41.99 
 
 		 605 aa  199  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4896  DNA mismatch repair protein  30.67 
 
 		 632 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1114  DNA mismatch repair protein MutL  42.77 
 
 		 620 aa  199  1.0000000000000001e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000422632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4687  DNA mismatch repair protein  30.14 
 
 		 633 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4047  DNA mismatch repair protein  33.11 
 
 		 610 aa  198  2.0000000000000003e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2517  DNA mismatch repair protein  37.77 
 
 		 656 aa  198  3e-49  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2548  DNA mismatch repair protein  32.57 
 
 		 603 aa  196  9e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.17269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0769  DNA mismatch repair protein MutL  25.94 
 
 		 551 aa  195  2e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1095  DNA mismatch repair protein  34.4 
 
 		 632 aa  194  3e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.045837  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2758  DNA mismatch repair protein  34.62 
 
 		 616 aa  193  6e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2088  DNA mismatch repair protein  33.33 
 
 		 601 aa  193  6e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.02775 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4855  DNA mismatch repair protein  31.39 
 
 		 595 aa  193  6e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1715  DNA mismatch repair protein  32.52 
 
 		 608 aa  192  1e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.233899  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0504  DNA mismatch repair protein  27.12 
 
 		 587 aa  191  2e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.768235  normal  0.47016 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4032  DNA mismatch repair protein  32.11 
 
 		 597 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.733731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2133  DNA mismatch repair protein  32.68 
 
 		 607 aa  191  4e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1696  DNA mismatch repair protein MutL  33.54 
 
 		 665 aa  190  5.999999999999999e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.930861  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11660  DNA mismatch repair protein MutL  36.04 
 
 		 644 aa  190  5.999999999999999e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1937  DNA mismatch repair protein  29.12 
 
 		 561 aa  190  5.999999999999999e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2096  DNA mismatch repair protein  39.51 
 
 		 630 aa  190  7e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1964  DNA mismatch repair protein  29.19 
 
 		 561 aa  190  7e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.176062 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2127  DNA mismatch repair protein  32.41 
 
 		 603 aa  189  1e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.633502  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1389  DNA mismatch repair protein  31.51 
 
 		 599 aa  189  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.41073  normal  0.777612 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0895  DNA mismatch repair protein MutL  31.39 
 
 		 611 aa  188  2e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.347619  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1626  DNA mismatch repair protein  32.78 
 
 		 603 aa  188  3e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.951242 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1780  DNA mismatch repair protein  31.48 
 
 		 541 aa  187  4e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.644143 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2128  DNA mismatch repair protein  36.71 
 
 		 639 aa  186  7e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000120986  normal  0.021871 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4044  DNA mismatch repair protein MutL  38 
 
 		 628 aa  185  1.0000000000000001e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0816003  normal  0.310643 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1497  DNA mismatch repair protein MutL  33.62 
 
 		 680 aa  185  2.0000000000000003e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.997649  hitchhiker  0.00000153643 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0629  DNA mismatch repair protein MutL  39.89 
 
 		 767 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0413  DNA mismatch repair protein  34.56 
 
 		 630 aa  184  3e-45  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0526  DNA mismatch repair protein  37.66 
 
 		 668 aa  184  4.0000000000000006e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1382  DNA mismatch repair protein  35.19 
 
 		 669 aa  183  6e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0932721  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3542  DNA mismatch repair protein  35.64 
 
 		 628 aa  183  8.000000000000001e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2732  DNA mismatch repair protein MutL  35.01 
 
 		 730 aa  183  9.000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0867295  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2031  DNA mismatch repair protein MutL  32.55 
 
 		 604 aa  182  2e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.440642  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>