162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_4366 on replicon NC_009432
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009432  Rsph17025_4366  TnpA family transposase  100 
 
 		 112 aa  231  3e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.914851 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2667  transposase Tn3  74.77 
 
 		 961 aa  182  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.277321  normal  0.799372 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0072  transposase  74.77 
 
 		 546 aa  181  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.520579  normal  0.363066 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4311  TOBE domain-containing protein  69.64 
 
 		 573 aa  170  6.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3676  transposase Tn3 family protein  68.47 
 
 		 772 aa  162  2.0000000000000002e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.635368 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5790  transposase Tn3 family protein  54.46 
 
 		 1015 aa  135  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4894  transposase Tn3 family protein  52.29 
 
 		 999 aa  126  9.000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2321  transposase Tn3 family protein  51.79 
 
 		 988 aa  125  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5337  transposase  51.79 
 
 		 988 aa  125  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1576  transposase  51.79 
 
 		 203 aa  125  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0122395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0030  transposase  51.79 
 
 		 606 aa  125  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000301486  normal  0.581594 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0150  Tn1721 transposase  51.79 
 
 		 310 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.751061 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0035  transposase  51.79 
 
 		 255 aa  125  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.401081  normal  0.351265 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4794  transposase Tn3 family protein  53.21 
 
 		 991 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4458  transposase Tn3 family protein  51.79 
 
 		 988 aa  123  8.000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.386666  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4289  transposase Tn3 family protein  51.79 
 
 		 988 aa  123  8.000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4189  transposase Tn3 family protein  51.79 
 
 		 988 aa  123  8.000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.346248  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4378  transposase Tn3  52.29 
 
 		 991 aa  123  9e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4554  transposase Tn3  52.29 
 
 		 991 aa  123  9e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3718  transposase Tn3 family protein  52.29 
 
 		 305 aa  123  1e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.396342  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0141  transposon Tn21 transposase TnpA  50 
 
 		 990 aa  122  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0036  Tn3 family transposase  50 
 
 		 990 aa  122  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.296904 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4318  transposase Tn3 family protein  50.89 
 
 		 964 aa  121  3e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5432  transposase Tn3 family protein  50 
 
 		 985 aa  121  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.478575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2998  transposase Tn3  50 
 
 		 755 aa  121  4e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.645323 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3828  transposase Tn3 family protein  50 
 
 		 990 aa  120  5e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3845  transposase Tn3 family protein  50 
 
 		 990 aa  120  5e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1913  transposase Tn3 family protein  50 
 
 		 990 aa  120  5e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3983  transposase Tn3 family protein  50 
 
 		 988 aa  120  5e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.948733  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3995  Tn3 family transposase  52.88 
 
 		 126 aa  120  5e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0630  transposase Tn3 family protein  50 
 
 		 988 aa  120  5e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1257  transposase Tn3 family protein  50 
 
 		 990 aa  120  5e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1277  Tn3 family transposase  52.88 
 
 		 126 aa  120  5e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3243  Tn3 family transposase  52.88 
 
 		 126 aa  120  5e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.744119  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4420  transposase Tn3 family protein  50.46 
 
 		 994 aa  120  5e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00420695  normal  0.0856947 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2174  transposase Tn3 family protein  50.46 
 
 		 994 aa  120  5e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2183  transposase Tn3 family protein  50.46 
 
 		 862 aa  120  5e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6179  TnpA transposase Tn4380 mercury transposon Tn3 family  50 
 
 		 988 aa  120  6e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.646837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6188  transposase Tn3  50 
 
 		 989 aa  120  6e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.480567  hitchhiker  0.0000297094 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4474  transposase Tn6050  50 
 
 		 988 aa  120  6e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.199867  decreased coverage  0.00670356 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4598  transposase Tn6050  50 
 
 		 988 aa  120  6e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0210751  hitchhiker  0.00941907 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0124  Tn3 family transposase  50 
 
 		 988 aa  120  6e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.906843 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2082  transposase Tn3 family protein  50.46 
 
 		 550 aa  120  6e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.981814  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4224  transposase Tn3 family protein  50.46 
 
 		 994 aa  120  7e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.398551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0355  transposase  53.21 
 
 		 224 aa  120  7e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1495  transposase Tn3  50.89 
 
 		 988 aa  120  8e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.487839 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2145  transposase Tn3 family protein  50.89 
 
 		 988 aa  120  8e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2679  transposase Tn3 family protein  50 
 
 		 990 aa  120  9e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.669766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2345  transposase Tn3 family protein  50.89 
 
 		 988 aa  119  9.999999999999999e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1205  transposase Tn3 family protein  50 
 
 		 988 aa  119  9.999999999999999e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0016  ISSod9, transposase  50 
 
 		 988 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0167  ISSod9, transposase  50 
 
 		 988 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3347  transposase Tn3  50.89 
 
 		 161 aa  119  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.0077216  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0052  Tn3 family transposase  50 
 
 		 988 aa  118  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.469648 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2317  transposase Tn3  51.38 
 
 		 339 aa  118  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000027108  hitchhiker  0.0000324498 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0010  Tn3 family transposase  49.54 
 
 		 989 aa  116  9e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5050  TnpA family transposase  50 
 
 		 264 aa  115  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4776  transposase Tn3 family protein  45.54 
 
 		 988 aa  114  3e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4669  transposase Tn3 family protein  45.54 
 
 		 988 aa  114  3e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3496  transposase Tn3 family protein  51.38 
 
 		 996 aa  114  3.9999999999999997e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0968755  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3568  transposase Tn3 family protein  51.38 
 
 		 996 aa  114  3.9999999999999997e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3605  transposase Tn3 family protein  51.38 
 
 		 996 aa  114  3.9999999999999997e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1105  transposase Tn3 family protein  51.38 
 
 		 996 aa  114  3.9999999999999997e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4684  transposase Tn3 family protein  47.71 
 
 		 988 aa  114  5e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.238188  n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5425  transposase Tn3 family protein  52.29 
 
 		 992 aa  114  6e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5458  hypothetical protein  52.29 
 
 		 992 aa  114  6e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0154  transposase x  42.2 
 
 		 992 aa  110  6e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8035  transposase  44.04 
 
 		 179 aa  105  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0069  transposase  47.75 
 
 		 983 aa  102  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.197495  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5092  transposase Tn3 family protein  44.04 
 
 		 983 aa  100  6e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2047  transposase  47.27 
 
 		 217 aa  99  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0196  transposase  46.79 
 
 		 338 aa  98.2  3e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0202  transposase  46.79 
 
 		 246 aa  98.6  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.295684  hitchhiker  6.17068e-17 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0239  transposase  46.79 
 
 		 246 aa  98.2  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0147  transposase  42.2 
 
 		 987 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.857028 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1822  transposase Tn3 family protein  38.53 
 
 		 371 aa  85.1  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0088  transposase  38.39 
 
 		 771 aa  82  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.560561 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0111  transposase  40.78 
 
 		 997 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0079  transposase  34.86 
 
 		 435 aa  73.9  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.776565  normal  0.783345 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3470  transposase Tn3 family protein  30.36 
 
 		 1028 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0192  transposase Tn3 family protein  30.36 
 
 		 1026 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1989  transposase Tn3 family protein  30.36 
 
 		 1026 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4556  transposase Tn3 family protein  30.36 
 
 		 1028 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.875652 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0116  transposase Tn3 family protein  31.53 
 
 		 1018 aa  68.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0215  transposase  31.19 
 
 		 1015 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  0.20757 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1962  transposase Tn3 family protein  30.28 
 
 		 929 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1704  transposase Tn3  31.19 
 
 		 1006 aa  65.9  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.019193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2705  transposase Tn3 family protein  33.02 
 
 		 991 aa  64.3  0.0000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.347757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2941  transposase Tn3 family protein  33.02 
 
 		 991 aa  64.3  0.0000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.360292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01406  Transposase Tn3  29.57 
 
 		 267 aa  62.4  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0069  TnpA family transposase  33.94 
 
 		 946 aa  62  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.724381  hitchhiker  0.00503767 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0570  TnpA family transposase  33.94 
 
 		 946 aa  62  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0569559 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0418  TnpA family transposase  33.94 
 
 		 969 aa  62  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.524573  normal  0.229677 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0454  TnpA family transposase  33.94 
 
 		 969 aa  62  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0489  TnpA family transposase  33.94 
 
 		 969 aa  62  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.384834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5398  transposase Tn3 family protein  32.71 
 
 		 1029 aa  61.6  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0815937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1323  transposase Tn3 family protein  31.19 
 
 		 989 aa  60.5  0.000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.32373 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4723  transposase, Tn3 family  38.1 
 
 		 1075 aa  60.1  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4775  transposase Tn3 family protein  35.16 
 
 		 838 aa  58.2  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.855357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6590  transposase Tn3  30.09 
 
 		 978 aa  57  0.00000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.138466  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>