More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_4298 on replicon NC_009431
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009431  Rsph17025_4298  hypothetical protein  100 
 
 		 226 aa  441  1e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7746  Resolvase domain protein  52.53 
 
 		 217 aa  207  9e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1741  Resolvase domain  49.78 
 
 		 228 aa  201  7e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2281  resolvase-like protein  49.08 
 
 		 216 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00855121  normal  0.056664 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0275  resolvase domain-containing protein  47.27 
 
 		 224 aa  186  2e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4956  resolvase domain-containing protein  48.07 
 
 		 236 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.90554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3483  Resolvase domain  46.12 
 
 		 219 aa  179  2e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0893  Resolvase domain protein  47.53 
 
 		 227 aa  178  5.999999999999999e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.174131  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2725  Resolvase domain protein  47.95 
 
 		 228 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2499  resolvase, N-terminal  48.2 
 
 		 229 aa  172  2.9999999999999996e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.994531 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0802  resolvase, N-terminal  47.75 
 
 		 229 aa  169  4e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000162467  unclonable  0.000000072068 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2472  resolvase domain-containing protein  45.37 
 
 		 237 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2451  resolvase domain-containing protein  49.55 
 
 		 268 aa  162  3e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2996  Resolvase domain  45.45 
 
 		 221 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000012222  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4233  Resolvase domain  46.49 
 
 		 216 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0923  resolvase-like protein  45.81 
 
 		 234 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.916878 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1223  resolvase domain-containing protein  48.93 
 
 		 225 aa  153  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3656  resolvase-like protein  45.78 
 
 		 248 aa  151  7e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1482  resolvase domain-containing protein  45.58 
 
 		 233 aa  150  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.569487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7497  Resolvase domain protein  45.05 
 
 		 231 aa  147  9e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6912  resolvase domain-containing protein  60.28 
 
 		 243 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4942  putative DNA-invertase (site-specific recombinase)  43.44 
 
 		 214 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.406148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8811  Resolvase domain protein  48.64 
 
 		 227 aa  145  6e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2389  Resolvase domain  48.87 
 
 		 224 aa  142  5e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6747  putative resolvase (site-specific recombinase)  46.43 
 
 		 223 aa  140  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.232296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4152  resolvase domain-containing protein  47.53 
 
 		 231 aa  138  7.999999999999999e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_7010  Resolvase domain protein  41.55 
 
 		 216 aa  135  5e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.998314  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1116  resolvase family site-specific recombinase  39.57 
 
 		 236 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00106717 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3788  resolvase domain-containing protein  36.93 
 
 		 269 aa  122  4e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.692278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3000  Resolvase domain  49.25 
 
 		 197 aa  122  5e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6343  resolvase domain protein  38.1 
 
 		 211 aa  119  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8420  Resolvase domain protein  60 
 
 		 227 aa  115  5e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.875604  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3500  resolvase-like protein  36.84 
 
 		 248 aa  115  5e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.318802  normal  0.137861 
 
 
-
 
NC_009433  Rsph17025_4394  resolvase domain-containing protein  43.55 
 
 		 198 aa  111  9e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22080  resolvase  38.2 
 
 		 231 aa  106  4e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000105368  unclonable  3.95615e-22 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1421  Resolvase domain protein  40.17 
 
 		 231 aa  102  4e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.510042  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3478  resolvase domain-containing protein  34.17 
 
 		 242 aa  89  5e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3908  resolvase domain-containing protein  37.66 
 
 		 229 aa  89  5e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.582833 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1088  resolvase domain-containing protein  34.21 
 
 		 227 aa  89  6e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4374  Resolvase domain  34.51 
 
 		 216 aa  83.6  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0974  Resolvase domain protein  31.76 
 
 		 513 aa  80.9  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3649  resolvase domain-containing protein  35.65 
 
 		 380 aa  80.1  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.340945 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3786  Resolvase domain  32.92 
 
 		 242 aa  79  0.00000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.366578 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  27.54 
 
 		 462 aa  79  0.00000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0209  Resolvase domain  33.9 
 
 		 264 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2432  resolvase domain-containing protein  30.47 
 
 		 281 aa  74.3  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0183379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6307  resolvase domain-containing protein  41.26 
 
 		 209 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  38.56 
 
 		 182 aa  73.2  0.000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0155  resolvase domain-containing protein  28.26 
 
 		 510 aa  72.4  0.000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3862  resolvase domain-containing protein  38.27 
 
 		 194 aa  72.4  0.000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0506724  unclonable  0.00000235811 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4459  resolvase  39.47 
 
 		 190 aa  72  0.000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4290  resolvase  39.47 
 
 		 190 aa  72  0.000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4190  resolvase  39.47 
 
 		 190 aa  72  0.000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1424  Resolvase domain protein  32.46 
 
 		 215 aa  71.2  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00141617  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7341  Resolvase domain protein  31.47 
 
 		 295 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1152  Resolvase domain protein  34.3 
 
 		 460 aa  70.9  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  38.19 
 
 		 188 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4775  resolvase domain-containing protein  34.87 
 
 		 189 aa  70.1  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  40.28 
 
 		 197 aa  70.1  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4668  resolvase domain-containing protein  34.87 
 
 		 189 aa  70.1  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5598  DNA recombinase, putative  27.87 
 
 		 522 aa  69.3  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.318471  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0303  resolvase domain-containing protein  29.88 
 
 		 548 aa  69.3  0.00000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.637835  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1021  resolvase domain-containing protein  38.82 
 
 		 230 aa  68.6  0.00000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0963583 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1983  resolvase domain-containing protein  31.65 
 
 		 209 aa  68.6  0.00000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.528796 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  26.47 
 
 		 542 aa  68.6  0.00000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  26.47 
 
 		 542 aa  68.6  0.00000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5332  Resolvase domain protein  39.46 
 
 		 184 aa  68.6  0.00000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  26.05 
 
 		 542 aa  67.8  0.0000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1486  resolvase domain-containing protein  29.52 
 
 		 485 aa  67.8  0.0000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2944  resolvase domain-containing protein  36.36 
 
 		 307 aa  67.8  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.857733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2702  resolvase domain-containing protein  36.36 
 
 		 307 aa  67.8  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.264305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5431  Resolvase domain protein  36.91 
 
 		 185 aa  67  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3474  resolvase domain-containing protein  37.58 
 
 		 188 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2154  Resolvase domain protein  37.16 
 
 		 185 aa  66.6  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478214  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2967  DNA-invertase hin  37.2 
 
 		 188 aa  66.2  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000835062 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0302  DNA-invertase  37.34 
 
 		 184 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.623719 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3045  Resolvase domain protein  36.65 
 
 		 189 aa  66.6  0.0000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436524  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1154  hypothetical protein  30.59 
 
 		 213 aa  66.6  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.940122 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5704  resolvase domain-containing protein  30.09 
 
 		 283 aa  66.2  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2489  Resolvase domain protein  36.08 
 
 		 184 aa  65.9  0.0000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243262  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3976  resolvase domain-containing protein  27.05 
 
 		 415 aa  65.9  0.0000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2948  DNA-invertase hin  38.67 
 
 		 187 aa  65.9  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.3180099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9833  Resolvase Protein  39.46 
 
 		 210 aa  65.9  0.0000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6634  resolvase domain-containing protein  39.46 
 
 		 198 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000708994  hitchhiker  0.0000367715 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2913  DNA-invertase hin  38.67 
 
 		 190 aa  65.9  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.504047  normal  0.0309704 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0235  resolvase domain-containing protein  35.81 
 
 		 187 aa  65.9  0.0000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1562  recombinase  37.84 
 
 		 188 aa  65.5  0.0000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01209  bacteriocin production protein  33.33 
 
 		 198 aa  65.5  0.0000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000702686  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1403  resolvase domain-containing protein  37.16 
 
 		 185 aa  65.5  0.0000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1272  resolvase domain-containing protein  26.07 
 
 		 519 aa  65.1  0.0000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000672315  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2816  Resolvase domain protein  25.94 
 
 		 521 aa  65.1  0.0000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0749793  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0536  resolvase domain-containing protein  37.5 
 
 		 203 aa  65.1  0.0000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.201567  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0019  ISSod9, DNA-invertase  39.19 
 
 		 185 aa  64.3  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0170  ISSod9, DNA-invertase  39.19 
 
 		 185 aa  64.3  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.579928  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5360  resolvase domain protein  25.85 
 
 		 546 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000247289  hitchhiker  0.00000000017806 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4137  resolvase domain-containing protein  35.37 
 
 		 224 aa  64.3  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.130251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4154  resolvase domain-containing protein  37.84 
 
 		 199 aa  64.7  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3998  resolvase domain-containing protein  26.29 
 
 		 521 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0397  resolvase domain-containing protein  26.79 
 
 		 494 aa  63.5  0.000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0409  resolvase domain-containing protein  37.84 
 
 		 186 aa  63.9  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000318958  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>