More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_3804 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_3320  SNF2 family helicase  44.7 
 
 		 951 aa  765    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4171  helicase domain-containing protein  42.02 
 
 		 947 aa  682    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1945  helicase domain protein  42.84 
 
 		 949 aa  698    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0933  DEAD/DEAH box helicase  43.46 
 
 		 932 aa  693    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.599756  normal  0.787262 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3658  SNF2 family helicase  42.65 
 
 		 960 aa  665    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.041395  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2069  SNF2-related protein  40.69 
 
 		 964 aa  647    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4903  type III restriction enzyme, res subunit  40.06 
 
 		 963 aa  682    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.891445  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0513  helicase domain-containing protein  43.45 
 
 		 942 aa  743    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1983  SNF2-related protein  41.52 
 
 		 966 aa  689    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.094528  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1538  helicase domain-containing protein  41.25 
 
 		 963 aa  685    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1953  helicase domain-containing protein  40.93 
 
 		 967 aa  674    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3804  SNF2-related protein  100 
 
 		 961 aa  1969    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.502587  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52390  helicase, Snf2 family  43.23 
 
 		 929 aa  665    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0592  helicase domain-containing protein  40.53 
 
 		 955 aa  648    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0958  SNF2-related protein  39.47 
 
 		 975 aa  634  1e-180  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.106346  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0779  DEAD/DEAH box helicase-like  46.37 
 
 		 665 aa  582  1.0000000000000001e-165  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05330  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  39.05 
 
 		 961 aa  562  1e-158  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2524  SNF2-related helicase-like  42.56 
 
 		 915 aa  468  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.180515  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1341  helicase domain-containing protein  42.56 
 
 		 921 aa  468  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.134377 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1426  helicase domain protein  42.41 
 
 		 915 aa  463  1e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1328  helicase domain protein  42.41 
 
 		 916 aa  462  1e-129  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0387  helicase domain protein  29.34 
 
 		 584 aa  219  2e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.358987  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2756  helicase domain protein  29.2 
 
 		 584 aa  209  2e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2362  SNF2-related protein  29.88 
 
 		 555 aa  207  1e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0213  SNF2-related protein  30.67 
 
 		 554 aa  200  9e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4306  helicase, putative  29.08 
 
 		 560 aa  199  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2916  SNF2-related protein  29.12 
 
 		 560 aa  198  4.0000000000000005e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08850  helicase domain protein  28.89 
 
 		 467 aa  196  1e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000230967  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3989  helicase domain-containing protein  31.51 
 
 		 1145 aa  193  1e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.164502 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1801  SNF2-related protein  29.4 
 
 		 572 aa  193  1e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0724538  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3286  helicase domain protein  26.89 
 
 		 988 aa  188  3e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2075  hypothetical protein  28.68 
 
 		 835 aa  184  8.000000000000001e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.989433  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2010  hypothetical protein  28.68 
 
 		 1144 aa  184  1e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3187  helicase domain protein  25.91 
 
 		 969 aa  181  4.999999999999999e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3559  helicase domain-containing protein  28.09 
 
 		 941 aa  181  4.999999999999999e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.895393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1176  helicase domain-containing protein  28.09 
 
 		 941 aa  181  4.999999999999999e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0503  helicase domain-containing protein  28.83 
 
 		 1147 aa  177  9.999999999999999e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1877  helicase domain-containing protein  28.96 
 
 		 1172 aa  172  2e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.464999  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1609  helicase domain-containing protein  29.43 
 
 		 1129 aa  171  9e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0640  helicase-like  29.65 
 
 		 972 aa  170  1e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.060382 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4276  helicase-like  27.66 
 
 		 1138 aa  169  2e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.209171 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1492  helicase domain protein  28.64 
 
 		 969 aa  167  6.9999999999999995e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1920  helicase domain protein  26.69 
 
 		 971 aa  167  9e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1660  helicase/SNF2 family domain protein  29.23 
 
 		 805 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1312  helicase domain-containing protein  28.9 
 
 		 1046 aa  167  1.0000000000000001e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.372927  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1123  helicase domain protein  28.17 
 
 		 1169 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2682  prophage LambdaMc01, SNF2 family helicase  28.32 
 
 		 925 aa  165  4.0000000000000004e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.354251  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0816  helicase domain-containing protein  29.7 
 
 		 933 aa  165  4.0000000000000004e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0970467  normal  0.111384 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1123  helicase domain protein  27.73 
 
 		 966 aa  164  7e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0214668  normal  0.0288722 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2718  helicase domain-containing protein  28.57 
 
 		 1170 aa  163  1e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00349209 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0633  helicase domain-containing protein  27.36 
 
 		 1169 aa  163  2e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1234  helicase domain protein  29.51 
 
 		 1170 aa  161  5e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0795356  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3005  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  29.51 
 
 		 1212 aa  161  6e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0063  Type III restriction enzyme, res subunit  28.36 
 
 		 962 aa  159  2e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0240  helicase domain-containing protein  27.14 
 
 		 1116 aa  159  2e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956133  hitchhiker  0.00192271 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0017  helicase/SNF2 family domain protein  28.23 
 
 		 801 aa  159  3e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2959  helicase domain-containing protein  28.04 
 
 		 937 aa  159  3e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.789708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0196  helicase domain-containing protein  28.37 
 
 		 1167 aa  156  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.037499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1846  helicase domain-containing protein  28.43 
 
 		 1170 aa  156  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2189  type III restriction enzyme, res subunit  28.59 
 
 		 1172 aa  155  2.9999999999999998e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0811  helicase-like protein  27.87 
 
 		 1201 aa  155  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0827  helicase domain-containing protein  27.87 
 
 		 1201 aa  155  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2144  helicase domain protein  29.12 
 
 		 1160 aa  154  7e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.270016  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3098  helicase domain protein  28.79 
 
 		 922 aa  154  1e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.348218  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0202  helicase domain protein  28.19 
 
 		 1170 aa  153  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0567319 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3376  helicase domain-containing protein  26.68 
 
 		 877 aa  152  4e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1019  helicase domain protein  28.9 
 
 		 1160 aa  152  4e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.180274  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2726  helicase domain protein  29.52 
 
 		 1057 aa  151  5e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.48932 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0288  helicase domain protein  27.49 
 
 		 1037 aa  150  8e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1301  helicase domain protein  27.99 
 
 		 1062 aa  150  9e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.483393  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2988  helicase domain-containing protein  27.02 
 
 		 1167 aa  150  9e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.249556  normal  0.0303963 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2099  helicase domain protein  28.84 
 
 		 1194 aa  150  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0680  helicase domain-containing protein  27.94 
 
 		 1167 aa  149  3e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.272356 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0637  helicase domain protein  27.36 
 
 		 1168 aa  149  3e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2324  helicase domain protein  26.43 
 
 		 1095 aa  146  2e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1096  helicase domain-containing protein  27.15 
 
 		 964 aa  144  8e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0233  Type III restriction enzyme, res subunit  26.98 
 
 		 900 aa  143  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.179652  decreased coverage  0.00064314 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1325  SNF2-related helicase  26.97 
 
 		 1082 aa  143  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1706  helicase domain protein  27 
 
 		 952 aa  143  1.9999999999999998e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.703418  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0036  hypothetical protein  33.15 
 
 		 363 aa  139  2e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.922282  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03240  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  26.18 
 
 		 1028 aa  139  3.0000000000000003e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1596  helicase domain-containing protein  26.38 
 
 		 1137 aa  138  6.0000000000000005e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2729  helicase-like  27.83 
 
 		 1165 aa  137  8e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.36993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0826  helicase domain-containing protein  27.77 
 
 		 1136 aa  136  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1086  helicase-like  27.33 
 
 		 829 aa  135  3e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_231  predicted protein  26.18 
 
 		 970 aa  131  7.000000000000001e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5353  helicase domain protein  24.78 
 
 		 894 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.157102 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2545  helicase domain protein  25.82 
 
 		 1038 aa  127  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0721063  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3846  helicase domain-containing protein  26.58 
 
 		 1058 aa  126  2e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.064852 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1355  helicase domain-containing protein  25.44 
 
 		 954 aa  124  8e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2198  helicase domain-containing protein  26.35 
 
 		 1046 aa  124  8e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.33194  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3352  hypothetical protein  26.42 
 
 		 919 aa  124  9.999999999999999e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.14559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1177  helicase domain-containing protein  25.7 
 
 		 1031 aa  124  9.999999999999999e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.304258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3680  SNF2-related:helicase, C-terminal  26.23 
 
 		 1045 aa  122  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1236  helicase domain-containing protein  25.15 
 
 		 940 aa  120  9.999999999999999e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.546222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1416  helicase domain protein  25.4 
 
 		 945 aa  119  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4248  putative helicase  35.84 
 
 		 560 aa  119  3e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3982  SNF2 family helicase  35.84 
 
 		 560 aa  119  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4359  putative helicase  35.84 
 
 		 560 aa  119  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4083  non-specific serine/threonine protein kinase  35.84 
 
 		 560 aa  119  3.9999999999999997e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>