81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_6211 on replicon NC_007972
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007972  Rmet_6211  hypothetical protein  100 
 
 		 351 aa  692    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.286118 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1523  hypothetical protein  87.18 
 
 		 351 aa  527  1e-148  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.300517  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1808  protein of unknown function DUF6 transmembrane  68.38 
 
 		 356 aa  436  1e-121  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7729  hypothetical protein  65.31 
 
 		 353 aa  429  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1582  protein of unknown function DUF6 transmembrane  76.34 
 
 		 352 aa  424  1e-117  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.85021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7079  protein of unknown function DUF6 transmembrane  67.42 
 
 		 353 aa  419  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1548  hypothetical protein  65.66 
 
 		 356 aa  413  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1737  hypothetical protein  68.66 
 
 		 350 aa  404  1e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.53806 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0196  DMT family permease  65.57 
 
 		 354 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1145  membrane protein  66.87 
 
 		 380 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.351229  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1721  putative transporter  64.48 
 
 		 356 aa  388  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0542336  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0280  membrane protein  64.48 
 
 		 396 aa  388  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1009  membrane protein  64.48 
 
 		 356 aa  388  1e-107  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6009  hypothetical protein  64.14 
 
 		 372 aa  385  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0288  membrane protein  64.18 
 
 		 358 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.212886  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1806  hypothetical protein  64.18 
 
 		 356 aa  383  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1308  membrane protein  64.18 
 
 		 356 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0090  hypothetical protein  66.19 
 
 		 354 aa  372  1e-102  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.196986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2217  protein of unknown function DUF6 transmembrane  61.29 
 
 		 348 aa  369  1e-101  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.760576  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5765  hypothetical protein  64.58 
 
 		 353 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125359  normal  0.809167 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1044  cobalt-nickel-resistance system transmembrane protein  73.01 
 
 		 352 aa  362  6e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.935622  normal  0.258004 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2405  hypothetical protein  57.39 
 
 		 352 aa  348  6e-95  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5819  hypothetical protein  63.55 
 
 		 353 aa  348  7e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0211958  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6184  hypothetical protein  63.55 
 
 		 353 aa  348  7e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2574  protein of unknown function DUF6 transmembrane  53.64 
 
 		 358 aa  339  4e-92  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.839971 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1993  integral membrane protein  54.55 
 
 		 372 aa  319  3.9999999999999996e-86  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.191087  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2356  integral membrane protein  54.83 
 
 		 372 aa  319  3.9999999999999996e-86  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0622211  normal  0.595644 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2103  hypothetical protein  54.83 
 
 		 372 aa  319  3.9999999999999996e-86  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6663  hypothetical protein  54.52 
 
 		 353 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.190616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2188  hypothetical protein  54.3 
 
 		 349 aa  304  1.0000000000000001e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00735696  normal  0.566417 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2249  hypothetical protein  56.07 
 
 		 350 aa  298  9e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.660047  normal  0.735627 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4009  hypothetical protein  54.81 
 
 		 372 aa  295  8e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0628944 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1711  protein of unknown function DUF6 transmembrane  51.88 
 
 		 349 aa  281  1e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2052  hypothetical protein  51.88 
 
 		 349 aa  281  1e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7402  hypothetical protein  51.9 
 
 		 356 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.718742  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3964  protein of unknown function DUF6 transmembrane  50.59 
 
 		 347 aa  261  2e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1945  twin-arginine translocation pathway signal  58.47 
 
 		 318 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.536601  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1337  hypothetical protein  43.31 
 
 		 344 aa  258  9e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.132774  normal  0.0206218 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0033  hypothetical protein  38.97 
 
 		 363 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.586052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3456  hypothetical protein  44.48 
 
 		 346 aa  240  2.9999999999999997e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3480  hypothetical protein  52.27 
 
 		 357 aa  238  9e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1678  hypothetical protein  39.08 
 
 		 355 aa  220  3e-56  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000385803 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0541  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.38 
 
 		 347 aa  206  4e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2204  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.56 
 
 		 330 aa  205  8e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000373443 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2294  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.92 
 
 		 350 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000455657  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0451  hypothetical protein  37.39 
 
 		 350 aa  194  2e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1362  hypothetical protein  42.75 
 
 		 280 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2015  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.43 
 
 		 323 aa  177  3e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0673  hypothetical protein  31.46 
 
 		 347 aa  174  1.9999999999999998e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5757  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.86 
 
 		 351 aa  145  9e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0016  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.77 
 
 		 302 aa  143  4e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0401705 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0661  hypothetical protein  36.15 
 
 		 312 aa  139  6e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1680  hypothetical protein  30.67 
 
 		 293 aa  97.8  2e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0463  hypothetical protein  27.67 
 
 		 333 aa  74.3  0.000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000101678 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5782  hypothetical protein  31.58 
 
 		 299 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6147  hypothetical protein  31.58 
 
 		 299 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.609004 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4940  hypothetical protein  50.77 
 
 		 92 aa  58.9  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6627  hypothetical protein  30.77 
 
 		 299 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.725322 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7691  hypothetical protein  30 
 
 		 299 aa  54.7  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.327195 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2212  hypothetical protein  27.4 
 
 		 315 aa  53.9  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.193478  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2425  hypothetical protein  28.38 
 
 		 313 aa  52  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.61547  normal  0.354813 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5882  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.38 
 
 		 299 aa  51.2  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6058  hypothetical protein  30.73 
 
 		 298 aa  49.3  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  25.76 
 
 		 315 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2723  hypothetical protein  22.44 
 
 		 309 aa  46.6  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.297419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1865  hypothetical protein  28.73 
 
 		 328 aa  46.2  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5832  hypothetical protein  29.47 
 
 		 298 aa  45.8  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.684234 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0334  hypothetical protein  27.46 
 
 		 313 aa  45.4  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1024  hypothetical protein  31.72 
 
 		 330 aa  44.7  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0568  DMT superfamily drug/metabolite efflux pump  31.93 
 
 		 311 aa  45.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0349448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0732  hypothetical protein  30.25 
 
 		 343 aa  44.3  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1412  membrane spanning protein  31.15 
 
 		 338 aa  43.9  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2944  hypothetical protein  28.25 
 
 		 311 aa  43.5  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0954249 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5896  hypothetical protein  33.33 
 
 		 321 aa  43.5  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.557426 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4883  transporter, EamA family  23.89 
 
 		 301 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0543  hypothetical protein  25.59 
 
 		 271 aa  43.5  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.530705 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4920  EamA family protein  26.98 
 
 		 301 aa  43.5  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.7 
 
 		 292 aa  42.7  0.008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3687  transporter, EamA family  25.14 
 
 		 301 aa  42.7  0.009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0968  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.89 
 
 		 314 aa  42.7  0.01  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0997  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.89 
 
 		 315 aa  42.7  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.848361  normal  0.602087 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>