90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2727 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2727  extracellular repeat protein, HAF family  100 
 
 		 468 aa  941    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2382  extracellular repeat protein, HAF family  43.77 
 
 		 364 aa  226  8e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2726  extracellular repeat protein, HAF family  39.7 
 
 		 475 aa  204  3e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0329  extracellular repeat protein, HAF family  31.35 
 
 		 468 aa  146  8.000000000000001e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.181776  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1424  extracellular repeat protein, HAF family  30.74 
 
 		 386 aa  99.8  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000371296 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1986  extracellular HAF  36.13 
 
 		 489 aa  97.8  4e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0338613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1849  extracellular HAF  34.82 
 
 		 349 aa  94.7  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1071  hypothetical protein  47.73 
 
 		 668 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2471  hypothetical protein  48.86 
 
 		 578 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2394  hypothetical protein  40.5 
 
 		 520 aa  85.9  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.201637  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6689  extracellular HAF  34.3 
 
 		 389 aa  85.1  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1981  extracellular HAF  31.56 
 
 		 344 aa  82.8  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0721  hypothetical protein  47.78 
 
 		 741 aa  83.2  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0743  hypothetical protein  34.5 
 
 		 353 aa  81.3  0.00000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.890074  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0354  hypothetical protein  47.96 
 
 		 287 aa  80.5  0.00000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0589799  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0987  hypothetical protein  31.49 
 
 		 358 aa  77  0.0000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.779307  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1484  hypothetical protein  42.72 
 
 		 294 aa  75.9  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000295365  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4152  hypothetical protein  33.21 
 
 		 363 aa  75.5  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2442  hypothetical protein  43.62 
 
 		 516 aa  75.5  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.498861  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2820  FG-GAP repeat protein  37.07 
 
 		 902 aa  72  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.517376  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0524  Alkaline phosphatase  36.84 
 
 		 676 aa  71.2  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1429  two component regulator propeller domain protein  33.53 
 
 		 695 aa  70.9  0.00000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.191766  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2669  integral membrane protein  35.41 
 
 		 392 aa  69.7  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.652758  normal  0.165313 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3422  twin-arginine translocation pathway signal  31.91 
 
 		 388 aa  68.6  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0744  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  46.67 
 
 		 1092 aa  67  0.0000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0783948  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1158  hypothetical protein  34.17 
 
 		 525 aa  65.9  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0067  extracellular repeat protein, HAF family  42.98 
 
 		 391 aa  65.1  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.899594  normal  0.0302964 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0295  Laminin G sub domain 2  37.36 
 
 		 545 aa  64.3  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.252604  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1895  hypothetical protein  38.79 
 
 		 615 aa  64.7  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2393  hypothetical protein  39.77 
 
 		 851 aa  63.9  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.922519  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1003  hypothetical protein  32.04 
 
 		 152 aa  64.3  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126891  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0284  hypothetical protein  36.89 
 
 		 679 aa  62.8  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2390  hypothetical protein  41.18 
 
 		 489 aa  61.6  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.520688  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2651  hypothetical protein  41.88 
 
 		 433 aa  60.8  0.00000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0200  hypothetical protein  39.09 
 
 		 763 aa  60.8  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0953  hypothetical protein  42.72 
 
 		 1347 aa  60.5  0.00000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1280  CHRD domain containing protein  40.91 
 
 		 479 aa  60.5  0.00000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1386  hypothetical protein  35.42 
 
 		 966 aa  59.7  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000313408  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0285  alpha amylase catalytic region  38.14 
 
 		 990 aa  59.3  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1069  glycoside hydrolase family 10  44.94 
 
 		 997 aa  59.7  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000326536  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1460  hypothetical protein  39.22 
 
 		 1270 aa  58.5  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.453436  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2023  peptidase M12B ADAM/reprolysin  37.08 
 
 		 1061 aa  57.8  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0538769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2687  Propeptide peptidase M4 and M36  41.3 
 
 		 931 aa  57  0.0000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1150  hypothetical protein  36.9 
 
 		 1162 aa  57  0.0000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0597  hypothetical protein  30.37 
 
 		 730 aa  56.6  0.000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.094399  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1677  hypothetical protein  40.38 
 
 		 288 aa  56.2  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0162  hypothetical protein  30.34 
 
 		 1634 aa  56.2  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2566  extracellular repeat protein, HAF family  33.01 
 
 		 516 aa  55.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0506  Kelch repeat-containing protein  41.38 
 
 		 430 aa  55.1  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2561  hypothetical protein  40.43 
 
 		 554 aa  55.5  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.339311  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5267  PKD domain containing protein  32.29 
 
 		 426 aa  53.9  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.477377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2344  HAF family protein  25 
 
 		 403 aa  53.5  0.000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.734179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1480  Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  32.86 
 
 		 492 aa  52.8  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0552  autotransporter beta-domain-containing protein  30.48 
 
 		 733 aa  52.4  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0260  hypothetical protein  34.48 
 
 		 527 aa  51.6  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1121  hypothetical protein  26.58 
 
 		 333 aa  51.6  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.156672  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2974  PKD domain-containing protein  28.85 
 
 		 833 aa  51.2  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2797  hypothetical protein  33.62 
 
 		 1343 aa  51.2  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0976  hypothetical protein  39.13 
 
 		 844 aa  49.7  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.495512  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0068  fibronectin, type III domain-containing protein  37.7 
 
 		 1695 aa  49.7  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2211  hypothetical protein  36.71 
 
 		 595 aa  49.3  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.173352  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1862  hypothetical protein  34.41 
 
 		 829 aa  49.7  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.499944  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1204  hypothetical protein  31.58 
 
 		 398 aa  49.3  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05470  hypothetical protein  27.52 
 
 		 1279 aa  49.3  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4775  hypothetical protein  26.56 
 
 		 446 aa  49.3  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.222464 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1464  autotransporter beta-domain-containing protein  30.19 
 
 		 731 aa  48.5  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0611426  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2009  Cellulase  32.63 
 
 		 748 aa  48.9  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.428719  normal  0.0728263 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7108  protein of unknown function DUF1501  31.82 
 
 		 524 aa  48.9  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1556  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1278 aa  48.5  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3915  flagellar hook capping protein  42.62 
 
 		 221 aa  48.1  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0387265 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1189  protein of unknown function DUF1501  38.36 
 
 		 513 aa  47.8  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.605021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2212  hypothetical protein  44.44 
 
 		 562 aa  47.8  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0977559  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  29.5 
 
 		 1523 aa  47.4  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3237  hypothetical protein  30.77 
 
 		 1296 aa  47.4  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5627  flagellar basal body rod modification protein  42.11 
 
 		 226 aa  46.6  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1568  hypothetical protein  27.42 
 
 		 1685 aa  45.8  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.518804  normal  0.238693 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2020  hypothetical protein  35.66 
 
 		 260 aa  45.4  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0973  hypothetical protein  34.52 
 
 		 258 aa  45.4  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0258  flagellar hook capping protein  37.29 
 
 		 224 aa  45.8  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0256  flagellar hook capping protein  37.29 
 
 		 224 aa  45.4  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3736  flagellar basal body rod modification protein  41.07 
 
 		 222 aa  44.7  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0291  isochorismatase hydrolase  50 
 
 		 181 aa  44.3  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0838  integral membrane protein-like protein  40.7 
 
 		 425 aa  43.5  0.008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0356  isochorismatase family protein  50 
 
 		 181 aa  43.1  0.009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4923  hypothetical protein  25.56 
 
 		 178 aa  43.5  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.366855 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1182  hypothetical protein  29.73 
 
 		 1125 aa  43.5  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1292  flagellar hook capping protein  36.51 
 
 		 221 aa  43.1  0.01  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4831  extracellular HAF  27.5 
 
 		 428 aa  43.1  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0943414  normal  0.0197145 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4964  isochorismatase family protein  50 
 
 		 181 aa  43.1  0.01  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0283  isochorismatase (isochorismatase hydrolase) (2,3 dihydro-2,3 dihydroxybenzoate synthase)  50 
 
 		 187 aa  43.1  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>